POLIMORFISMOS, MAPAS Y GENES EN LA ENFERMEDAD GENÉTICA

Transcripción

1 ª edición urso de Genética Humana de la SEG Valencia, - de Enero de 008 POLIMORFISMOS, MAPAS Y GENES EN LA ENFERMEDAD GENÉTIA armen Espinós Armero Unidad de Genética y Medicina Molecular (UGMM) Instituto de Biomedicina de Valencia (IBV) UGMM entro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Raras

2 Qué es una enfermedad mendeliana? arácter hereditario: cualidad susceptible de ser transmitida de generación en generación Enfermedad mendeliana o monogénica: herencia exclusivamente relacionada con un locus Leyes de Mendel ª Ley de segregación ª Ley de distribución independiente ª Ley de transmisión independiente de los genes OMIM Online Mendelian Inheritance in Men

3 Marcadores genéticos RFLPs P/BstXI, FRDA - Análisis restricción y Southern blot VNTRs, 987 p8rs.0/rsai, Rb - Análisis restricción y Southern blot Microsatélites o STRs, DYS-I, DMD - PR y PAGE..AAAAAAA....AAAAAA....AAA.. (A)n

4 SNPs SNP/00-00 bases Tasa de mutación SNPs

5 Tag-SNPs

6 NVR: copy number variable regions Redon et al. Nature 00

7 lonación posicional artografiado Genotipado Enfermedad Pacientes Familias Polimorfismos, mapas, ligamiento aptura de la variabilidad genética Localización cromosómica

8 Enfermedad de harcot-marie-tooth Es una neuropatía hereditaria sensitivo motora Prevalencia /500 Heterogeneidad clínica y genética (0 loci/genes) Síntomas Debilidad muscular progresiva comenzando en pies y piernas, pudiendo extenderse a manos y brazos. aída del pie (incapacidad para sostenerlo horizontalmente), marcha de tipo equina. Deformación del pie (pies cavos) Deformación progresiva de la pierna (botella invertida) Pérdida masa muscular de la extremidad inferior,delgadez de tobillos. Disminución de la sensibilidad o entumecimiento en el pie o pierna.

9 Enfermedad de harcot-marie-tooth RITERIOS ELETROFISIOLÓGIOS - MT desmielinizante o MT: VN < 8 m/s; sugiere lesión en la célula de Schwann. - MT axonal o MT: VN normal o ligeramente reducida; lesión neuronal con atrofia y degeneración.

10 Formas Autosómicas Recesivas de MT S. Dejerine-Sottas P0, PMP, EGR, PRX 5900 MTA GDAP MTB MTMR 055 MTB MT SBF SHT Desmielinizante MTD HSMN-Lom NDRG 055 HSMN-Russe 0q 0585 MTE EGR 055 MTF Periaxin 0575 AR-MTA Lamin A/ AR-MTB MTA 9q GDAP Axonal

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12 Pacientes Inicio precoz en la infancia Neuropatía axonal Disfonía por parálisis de cuerdas vocales Herencia autosómica recesiva MTA (PMP) MTB (MPZ) MTX (GJB) GENES MT MTA (8q-.) MTB (q) MT (5q-q) MTA (p5-) MTB (q-) LOI MT

13 Familia LF0 I II D8S79 D8S8 D8S D8S8 D8S75 D8S7

14 Familia LF9 5? D8S79 D8S8 D8S D8S8 D8S75 D8S7 Familia LF0

15 Familia LF8, cartografiado por homozigosidad Markers Lod Score (Z) (θ) = 0.0 D8S5. D8S. D8S8.9 D8S79.5

16 D8S75 D8S7 PMP- Análisis de haplotipos en la familia LF8 8qter D8S8 D8S5 D8S55 D8S570 D8S5 D8S807 D8S79 D8S8 8cen IV:, IV:, IV:9, IV:0, V: locus IV:9, IV:0, IV:, IV: IV: V: IV:, IV:

17 GDAP, gen candidato posicional GDAP se sobreexpresa en un sistema de diferenciación de células de la línea Neuroa derivada de neuroblastoma de ratón GDAP podría participar en el desarrollo neuronal GDAP tiene una expresión muy fuerte en cerebro de ratón D8S55 RHDM Inhibidor tripsina LO890 Proteína rica en ys,9 Mb HNFG Factor de transcripción hepático D8S5 st Human Genome draft, February 5, 00

18 Análisis de Haplotipos en-d8s79-d8s8-d8s55-d8s7-d8s5-d8s8-tel HAPLOTIPOS A: >>>> LF8 (homozigosis), LF0 B: >>>> LF9 : >>>> LF0 D:----- >>>> LF9

19 c.87>t Alelos Mutantes Silvestre LF8 p.qx homocigoto c.87>t c.580>g LF9 p.qx p.s9x c.87>t c.8_8insa LF0 p.qx p.t88fs p.qx p.t88fs

20 Análisis de Haplotipos en-d8s79-d8s8-d8s55-d8s7-d8s5-d8s8-tel HAPLOTIPOS A: >>>> LF8 (homozigosis), LF0 >>>> p.qx B: >>>> LF9 >>>> p.s9x : >>>> LF0 >>>> p.t88fs D:----- >>>> LF9 >>>> p.qx

21 p.qx, mutación fundadora? LF9 LF0 LF8 LF7 LF5 VAL VAL VAL VAL5 p.qx/p.s9x p.qx/p.t88fs p.qx/p.qx p.s9x/p.t88fs p.qx/p.qx p.qx/p.qx p.qx/p.qx p.qx/p.qx p.qx/p.efs uesta et al. Nature Genet 00 laramunt et al. J Med Genet 005

22 p.qx A B León G H I J K L M Guipúzcoa Alava Hispanic haplotypes N O P Q S R D E F Valencia Altea Distribución de haplotipos locus rs0598 D8S79

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24 Origen de la población romaní

25 Primer documento sobre la llegada de los gitanos a España Permiso de paso concedido por el rey Alfonso V de Aragón a Johannes de Egipto Menor y a quienes le acompañen. Zaragoza, de enero de 5

26 Distribución de la población romaní en Europa > Kalaydjeieva BM Medical Genetics, 00

27 Diseño estudio 0 familias de etnia gitana Locus HMSN-Lom Análisis de mutaciones en el gen NDRG- Análisis de segregación en el locus HMSN-Russe LOI ASOIADOS A POBLAIÓN GITANA AFETA DE MT

28 Resultados 0 familias de etnia gitana LOI ASOIADOS A POBLAIÓN GITANA AFETA DE MT Locus HMSN-Lom Análisis de mutaciones en el gen NDRG- p.r8x homozigosis familias Análisis de segregación en el locus HMSN-Russe fam: > casos con haplotipo similar > 7 familias descartadas > familias no concluyentes > casos aislados

29 Diseño estudio 0 familias de etnia gitana Locus HMSN-Lom Análisis de mutaciones en el gen NDRG- Análisis de segregación en el locus HMSN-Russe LOI ASOIADOS A POBLAIÓN GITANA AFETA DE MT Análisis de segregación en el locus MT Búsqueda de mutaciones en el gen SHT ASPETOS LÍNIOS MUY SIMILARES Frecuentes caídas Deformidades de los pies Escoliosis Atrofia muscular distal Ataxia sensorial Progresión agresiva

30 Análisis de ligamiento del locus MT (5q) Familias cromosomas D5S58 D5S80 D5S IVS+9/T D5S05 D5S D5S80 PED5 A B T PED D E PED F G PED7 H I PED8 J K PED9 L M PED0 N O PED P Q fmt- R S / 5, Mb,7 Mb

31 Análisis de ligamiento del locus MT (5q) Búsqueda de mutaciones en SHT D5S58 D5S80 D5S D5S05 D5S D5S80 p.7fsx78 (c._ del ) p.r09x (c. 5 >T)

32 Análisis de mutaciones Familias cromosomas D5S58 D5S80 D5S IVS+9/T D5S05 D5S D5S80 Mutación PED5 A B T 7_78 delinsx R09X R09X PED D E R09X R09X PED F G R09X R09X PED7 H I R09X R09X PED8 J K R09X R09X PED9 L M R09X R09X PED0 N O R09X R09X PED P Q R09X R09X fmt- R S / R09X R09X

33 Primeras conclusiones 0 familias de etnia gitana Familias de etnia gitana supervisadas en el H. La Fe Se seleccionan 0 familias para el estudio del locus MT >8 casos en homozigosis, p.r09x > caso p.r09x/p.7_78delinsx > caso descartado MT >>>> HETEROGENEIDAD GENÉTIA Locus HMSN-Lom, mutación NDRG- p.r8x en familias Locus HMSN-Russe, casos con haplotipo similar Familias de etnia gitana de fuera de la. Valenciana > familia MT, en homozigosis p.r09x > familias con resultados no concluyentes

34 Datación alélica de la mutación SHT p.r09x Aproximaciones: >bdmc (Slatkin & Rannala, Am. J. Hum Genet, 997) >DMLE+ (Reeve & Rannala, Am. J. Hum Genet, 00) Datos empleados: >Tasa de crecimiento de, (Hunter et al., Pediatr Res, 00) >Proporción muestral de 0,08 *Frecuencia de portadores /00 *Población actual romaní en España *romosomas portadores del haplotipo común 8 >bdmc: D5S80 y D5S05 >DMLE+: cen_d5s80-d5s-ivs+9/t-d5s05-d5s_tel

35 Datación alélica de la mutación SHT p.r09x Método bdmc -0-0 Log Likelihood , g (95% I 5,87-8,5) ~80 años N. de generaciones

36 Datación alélica de la mutación SHT p.r09x Método DMLE+ 8,5 g (95% I 8,8-0,8) ~ 00 años

37 onclusiones 0 Familias de etnia gitana MT >9 casos en homozigosis, p.r09x > caso en heterozigosis, p.r09x/p.7_78delinsx p.r09x, asociada a un haplotipo común Data de finales del s.xviii-principios del s.xix 7_78delinsX, más reciente

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