Bioquímica MAT 2002 C. 15 (SEGÚN RESERVA) Sala: Domicilio: X N Carnet (RUN): Jaime Troncoso Mella

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1 Bioquímica EJEMPLO: Ficha solicitud Colección Reserva UNIVERSIDAD AUSTRAL DE CHILE SISTEMA DE BIBLIOTECAS Clasificación: MAT 2002 Vol. y/o Copia: Apellido Autor: Título: C. 15 (SEGÚN RESERVA) Mathews, Christopher Bioquímica Sala: Domicilio: X N Carnet (RUN): Nombre: Fecha: Jaime Troncoso Mella 03 / 12 / 2009 (SEGÚN FECHA RETIRO LIBRO) SE SOLICITA LLENAR LA FICHA CON TODOS LOS DATOS SOLICITADOS Y CON LETRA LEGIBLE O IMPRENTA Fichas disponibles para impresión en última hoja documento. DEVOLUCIÓN LIBRO DOMICILIO: Hasta las 14:00 hrs, del día HÁBIL siguiente de solicitado.

2 C O N T E N I D O Parte I. EL CAMPO DE LA BIOQUÍMICA Capítulo 1 El alcance de la bioquímica...3 Qué es la bioquímica?...5 La bioquímica como ciencia química...9 La bioquímica como ciencia biológica...14 Nuevas herramientas en la revolución biológica...22 Aplicaciones de la bioquímica...22 Resumen...23 Capítulo 2 La matriz de la vida: interacciones débiles en un medio acuoso...31 Naturaleza de las interacciones no covalentes...32 Misión del agua en los procesos biológicos...38 Equilibrios iónicos...45 Interacciones entre macroiones en solución...54 Resumen...57 Capítulo 3 Energética de la vida...65 Energía, calor y trabajo...65 La entropía y la segunda ley de la termodinámica...70 Energía libre: la segunda ley en sistemas abiertos...72 Energía libre y concentración...77 Energía libre y reacciones químicas: equilibrio químico...79 Compuestos de fosfato de energía elevada: fuentes de energía de los sistemas biológicos...83 Resumen...89

3 Parte II ARQUITECTURA MOLECULAR DE LA MATERIA VIVA Capítulo 4 Ácidos nucleicos...95 Naturaleza de los ácidos nucleicos...95 Estructura primaria de los ácidos nucleicos Estructura secundaria y terciaria de los ácidos nucleicos Funciones biológicas de los ácidos nucleicos: una visión preliminar de la biología molecular Plasticidad de la estructura secundaria y terciaria del DNA Estabilidad de la estructura secundaria y terciaria Resumen Capítulo 5 Introducción a las proteínas: nivel primario de la estructura proteica Aminoácidos Péptidos y enlace peptídico Proteínas: polipéptidos de secuencia definida Del gen a la proteína Resumen Capítulo 6 Estructura tridimensional de las proteínas Estructura secundaria: formas regulares de plegar la cadena polipeptídica Proteínas fibrosas: materiales estructurales de las células y los tejidos Proteínas globulares: estructura terciaria y diversidad funcional Factores que determinan las estructuras secundaria y terciaria Dinámica de la estructura de las proteínas globulares Predicción de la estructura proteica secundaria y terciaria Estructura cuaternaria de las proteínas Resumen...222

4 Capítulo 7 Función y evolución de las proteínas Transporte y almacenamiento de oxígeno: funciones de la hemoglobina y la mioglobina Mecanismo de unión del oxígeno por las hemoproteínas Transporte de oxígeno: hemoglobina Efectos de otros ligandos sobre el comportamiento alostérico de la hemoglobina Evolución proteica: los ejemplos de la mioglobina y la hemoglobina Variantes de la hemoglobina: la evolución en curso Inmunoglobulinas: la variabilidad de la estructura produce la versatilidad de la unión SIDA y respuesta inmunitaria Resumen Capítulo 8 Proteínas en movimiento: sistemas contráctiles y motores moleculares Los músculos y otros sistemas contráctiles de actina-miosina Sistemas de microtúbulos para la motilidad Motilidad bacteriana: proteínas rotatorias Resumen Capítulo 9 Hidratos de carbono Monosacáridos Derivados de los monosacáridos Oligosacáridos Polisacáridos Glucoproteínas Los oligosacáridos como marcadores celulares Resumen...348

5 Capítulo 10 Lípidos, membranas y transporte celular Estructura molecular y comportamiento de los lípidos Componentes lipídicos de las membranas biológicas Estructura y propiedades de las membranas y de las proteínas de la membrana Transporte a través de membranas Membranas excitables, potenciales de acción y neurotransmisión Resumen...394

6 Parte III DINÁMICA DE LA VIDA: CATÁLISIS Y CONTROL DE LAS RELACIONES BIOQUÍMICAS Capítulo 11 Enzimas: catalizadores biológicos Función de las enzimas Velocidades de las reacciones químicas y efectos de los catalizadores Cómo actúan las enzimas como catalizadores: principios y ejemplos Cinética de la catálisis enzimática Inhibición enzimática Coenzimas, vitaminas y metales esenciales Diversidad de la función enzimática Biocatalizadores no proteicos: ribozimas Regulación de la actividad enzimática: enzimas alostéricas Modificaciones covalentes utilizadas para regular la actividad enzimática Resumen Capítulo 12 Introducción al metabolismo Una primera mirada al metabolismo Autopistas del mapa de carreteras metabólico Algunas consideraciones bioenergéticas Principales mecanismos de control metabólico Análisis experimental del metabolismo Resumen...492

7 Parte IV DINÁMICA DE LA VIDA: ENERGÍA, BIOSÍNTESIS Y UTILIZACIÓN DE LOS PRECURSORES Capítulo 13 Metabolismo de los hidratos de carbono I: procesos anaerobios en la generación de energía metabólica Glucólisis: perspectiva Reacciones de la glucólisis Destinos metabólicos del piruvato Hojas de balance energético y electrónico Regulación de la glucólisis Entrada de otros azúcares en la ruta glucolítica Catabolismo de los polisacáridos Resumen Capítulo 14 Procesos oxidativos: ciclo del ácido cítrico y ruta de las pentosas fosfato Visión general de la oxidación del piruvato y del ciclo del ácido cítrico Oxidación del piruvato: ruta de entrada principal del carbono en el ciclo del ácido cítrico Coenzimas que intervienen en la oxidación del piruvato y en el ciclo del ácido cítrico Acción del complejo piruvato deshidrogenasa Ciclo del ácido cítrico Estequiometría y energética del ciclo del ácido cítrico Regulación de la piruvato deshidrogenasa y del ciclo del ácido cítrico Secuencias anapleróticas: necesidad de reponer los intermediarios del ciclo Ciclo del glioxilato: una variante anabólica del ciclo del ácido cítrico Una ruta de biosíntesis que oxida la glucosa: la ruta de las pentosas fosfato Resumen...579

8 Capítulo 15 Transporte electrónico, fosforilación oxidativa y metabolismo del oxígeno La mitocondria: el escenario de la acción Oxidaciones y generación de energía Transporte electrónico Fosforilación oxidativa Rendimientos energéticos del metabolismo oxidativo El oxígeno como sustrato para otras reacciones metabólicas Resumen Capítulo 16 Metabolismo de los hidratos de carbono II: biosíntesis Gluconeogénesis Regulación de la gluconeogénesis Biosíntesis de glucógeno Biosíntesis de otros polisacáridos Biosíntesis de los aminoazúcares Biosíntesis de los glucoconjugados Resumen Capítulo 17 Fotosíntesis Procesos básicos de la fotosíntesis El cloroplasto Reacciones luminosas Reacciones oscuras: ciclo de Calvin Resumen de las reacciones luminosa y oscura en la fotosíntesis de dos sistemas Fotorespiración y ciclo C Resumen...696

9 Capítulo 18 Metabolismo de los lípidos I: ácidos grasos, triacilgliceroles y lipoproteínas Utilización y transporte de las grasas y el colesterol Oxidación de los ácidos grasos Biosíntesis de los ácidos grasos Biosíntesis de los triacilgliceroles Conocimientos bioquímicos sobre la obesidad Resumen Capítulo 19 Metabolismo lipídico II: lípidos de membrana, esteroides, isoprenoides y eicosanoides Metabolismo de los glicerofosfolípidos Metabolismo de los esfingolípidos Metabolismo de los esteroides Otros compuestos isoprenoides Eicosanoides: prostaglandinas, tromboxanos y leucotrienos Resumen Capítulo 20 Metabolismo de los compuestos nitrogenados: principios de la biosíntesis, la utilización y el recambio Utilización del nitrógeno inorgánico: ciclo del nitrógeno Utilización del amoníaco: biogénesis del nitrógeno orgánico Economía del nitrógeno: aspectos de la síntesis y degradación de los aminoácidos Recambio proteico Degradación de los aminoácidos y metabolismo de los productos finales nitrogenados Coenzimas que intervienen fundamentalmente en el metabolismo del nitrógeno Resumen...830

10 Capítulo 21 Metabolismo de los compuestos nitrogenados: aminoácidos, porfirinas y neurotransmisores Aminoácidos relacionados con intermediarios del ciclo del ácido cítrico Metabolismo de los aminoácidos que contienen azufre Aminoácidos aromáticos Serina, glicina y treonina Valina, leucina, isoleucina y lisina Metabolismo de la porfirina y el hemo Los aminoácidos y sus metabolitos como neurotransmisores y reguladores biológicos Resumen Capítulo 22 Metabolismo de los nucleótidos Esquema de las rutas del metabolismo de los nucleótidos Biosíntesis de novo de los nucleótidos de purina Degradación de las purinas y trastornos clínicos del metabolismo de las purinas Metabolismo de los nucleótidos de pirimidina Biosíntesis y metabolismo de los desoxirribonucleótidos Timidilato cintaza: una enzima diana de la quimioterapia Alteraciones del metabolismo de los nucleótidos dirigidas por los virus Importancia biológica y médica de otros análogos de los nucleótidos Resumen Capítulo 23 Coordinación metabólica, control metabólico y transducción de señal Interdependencia de los principales órganos en el metabolismo de los combustibles en los vertebrados Regulación hormonal del metabolismo de los combustibles Mecanismos de acción hormonal Transducción de señal, oncogenes y cáncer Hormonas vegetales Resumen...977

11 Parte V INFORMACIÓN Capítulo 24 Copiado de la información: replicación Metabolismo de la información: procesos principales Visión general de la replicación del DNA Revisión de la terminología genética Primeros datos sobre la replicación del DNA DNA polimerasas: enzimas que catalizan la elongación de la cadena de polinucleótidos Otras proteínas de la replicación Reconstrucción de las máquinas de replicación Iniciación de la replicación del DNA Replicación de genomas lineales Fidelidad de la replicación del DNA Virus de RNA: la replicación de genomas de RNA Resumen Capítulo 25 Reestructuración de la información: restricción, reparación, recombinación, reordenamiento y amplificación Metilación del DNA Restricción y modificación Reparación del DNA Recombinación Reordenamientos génicos Amplificación génica Resumen

12 Capítulo 26 Lectura de la información: transcripción El DNA como molde para la síntesis de RNA Enzimología de la síntesis del RNA: RNA polimerasa Mecanismo de la transcripción Regulación de la transcripción Procesamiento posterior a la transcripción Resumen Capítulo 27 Descodificación de la información: traducción Visión general de la traducción El código genético Principales participantes en la traducción: mrna, trna y ribosomas Mecanismos de la traducción Inhibición de la traducción por antibióticos Velocidades y energética de la traducción Fases finales de la síntesis proteica: plegado y modificación covalente Regulación de la síntesis proteica en los procariotas Resumen

13 Capítulo 28 Los genes eucariotas y su expresión El genoma eucariota Organización física del DNA eurcariota: núcleo, cromosomas y cromatina Ciclo celular y replicación del DNA en los eucariotas La transcripción y su control en las células eucariotas Procesamiento del RNA mensajero eucariota Traducción en los eurcariotas Direccionamiento de las proteínas en los eurcariotas El destino de las proteínas: destrucción programada DNA eucariota y desarrollo: un breve ejemplo Resumen Respuestas a los problemas Glosario Índice

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