Quinto Taller de Seguimiento Técnico de Proyectos FONTAGRO Junio 2, 3 y 4 de 2010, CIAT Cali, Colombia

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1 Proyecto FTG-8009/08: Selección asistida por marcadores moleculares para tolerancia al frío del arroz en el cono sur latinoamericano; una estrategia para enfrentar la inestabilidad climática Quinto Taller de Seguimiento Técnico de Proyectos FONTAGRO Junio 2, 3 y 4 de 2010, CIAT Cali, Colombia

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3 Problemática Leve incremento de las temperaturas mínimas Aumento en la variabilidad que puede provocar imprevisibilidad y eventos extremos

4 Temperaturas INIA URUGUAY* Temp. o C Jul Aug Sept Oct Nov Dec Jan Feb Mar Apr May Jun Media Max Min NARO - HOKKAIDO** Temp. o C Jan Feb Mar Apr May Jun Jul Aug Sept Oct Nov Dec Media Max Min * Fuente:Reporte anual INIA URUGUAY ** Fuente: NARO- JAPON M. Cruz

5 Fin del Proyecto Asegurar la estabilidad y sostenibilidad productiva de los arroceros de Argentina, Uruguay y Sur de Brasil frente a los posibles impactos del cambio climático, mediante la liberación de variedades tolerantes al frío de alto rendimiento, y de alta calidad, asegurando la demanda alimentaria regional e internacional.

6 Fin del Proyecto Asegurar la estabilidad y sostenibilidad técnica y logística en recursos humanos y equipos para el desarrollo del proyecto. Así como ajuste de la plataforma de trabajo con el consorcio.

7 Propósito Acelerar la selección por tolerancia al frío, mediante la incorporación de la SAM en los programas de mejoramiento genético de cada institución involucrada en el proyecto.

8 Componentes Componente 1 _ Validación y estandarización de marcadores y metodologías de SAM desarrolladas en Japón y las que están disponibles al público. Componente 2 _ Implementación de la SAM en los programas de mejoramiento de las instituciones del consorcio. Componente 3 _ Evaluación en condiciones naturales de estrés de frío de las poblaciones obtenidas por SAM. Componente 4 _ Capacitación y divulgación.

9 Componentes Componente 1 Validación y estandarización de marcadores y metodologías de SAM desarrolladas en Japón y las que están disponibles al público. Componente 4 Capacitación y divulgación (Fortalecimiento Institucional).

10 Capacitación Resultados Esperados Técnicos de las instituciones participantes entrenados en NARCH-Japón en evaluación fenotípica y genotípica. Alianzas entre instituciones regionales con centros de investigación avanzados. Red de información FLAR-CIAT-NARCH-INTA- INIA-IRGA establecida.

11 Capacitación

12 Capacitación M. Cruz

13 Capacitación Formación de capacidades en técnicas de evaluación fenotípica y genotípica para tolerancia al frío del arroz, especialmente en etapa reproductiva.

14 Capacitación Evaluación preliminar de los marcadores moleculares, desarrollados en el NARCH, en el germoplasma usado por los integrantes del consorcio.

15 Capacitación C J. Rosas

16 Capacitación Evaluación de la variabilidad alélica de 371 materiales de arroz, en 21 loci asociados a la tolerancia al frío, en etapa reproductiva.

17 Capacitación Marcadores moleculares ligados a QTLs de tolerancia al frío en etapa reproductiva. Marcador Primer F Primer R QTL Ubicación BAC1 N/D N/D Ctb1 Brazo L cr.4 BAC22 N/D N/D Ctb1 Brazo L cr.4 PNK10 CGTGCATCCCTCTGTAGCATATG GTGTCTGAACATCTCATATGACACC Ctb1 Brazo L cr.4 RM3819 N/D N/D qctb8 Brazo C cr.8 RM38-2 GCGCCATTGATGACTAATTG ATGGAAGAGGCAAGCAGAAG qctb8 Brazo C cr.8 N/D: No Disponible J. Rosas

18 Caracterización genotípica Pedigree Ctb1 Ctb2 Ctb8 BAC 1 PNK6 PNK10 BAC 22 PNK2 BAC28 SCAB 11 CB8 CB3 CB28 RM5434 RM5647 RM3819 RM38-2 PLA19 PLA 53 PLA 27 PLA 46 L 2825-CA T T T T T T S S T T T T T X T T T T 83 L 3616 X T T T T T S T T S T T T T T T T T 83 L 201 X T T T T T T? T X S T T T S T T T T 78 El Paso L48 X T T T T S T? T T S T T T S T T T S 72 L 1857 T T T T T T S T S S T T T S T T T. 72 FL TP-1P-5A. T T T T T T? T T S T T T S S T S. 67 L 2882-CA S T T S T T T? T X S T X T T T. T T 67 El Paso L94 T T T T T T S S? X S T X T X T T T H 61 FL TP-2P-4A S T T S T T T? T X S T X T T S. T T 61 FL TP-1P-1A S T T S T T T? T X S T X T T S X T T 61 FL TP-1P-4A T T T T T T S S X T T X T T X X S T 61 FL TP-3P-4A T T. T T T S S T S T X T T T X S T 61 L 1844 T T. T T T S S T S T T T S T T S. 61 FL TS-3P-7A S T T S T T S T T S X X T T S X T T 56 FL TP-3P-3A T T X T T T S S X S T T T S X T S. 50 FL P-4A T T T T T T S S T S X X S X X T T H 50 L 1764 T T S T T T S S X S X T T S. T T S 50 QUILA S T S T T S S T T S S X T T S T T. 50 QUILA S T S T T S S T T S S X T T S T T. 50 QUILA S T S T T S S T T S S X T T S T T. 50 QUILA S T S H T T S X X S S X T T S? T T T 44 QUILA X T S T T T S X X S S X S T S T T S 39 FL P-2P-2P X T S S T S S T X S X S H? T X X T H 28 QUILA S S S S S S S S T S S X T T S T T S 28 QUILA S S S S S S S S X S T X T X S T T T 28 QUILA S T S H T S S X X S S X T X S T S T 28 L 2435 S H X S H X S S X S T T T S S T S. 22 QUILA S S S S S S S S T S S X T X S T T S 22 QUILA S S S S S S S X T S T X T S X T X. 22 QUILA S S S S S S S X T S T X T S X T X. 22 Buli INIA S S X S S S S S X S X X T X S X T S 11 %T T: Tolerante, T?: Por confirmar, H: Heterocigoto y S:Susceptible M. Cruz

19 Publicaciones Cruz, R.P. da. O arroz no Japão. Lavoura Arrozeira, Porto Alegre, v.57, n.451, p.23-26, Dez.2009 Difusión del proyecto en : Difusión en Visita Técnica de Investigadores del IRRI, al CIAT.

20 Publicaciones Aceptación de resumen para presentar en el Congreso Internacional del IRRI, Noviembre 2010, Vietnam. Participación en la XI Conferencia Internacional de Arroz para América Latina y el Caribe, Septiembre 2010, Colombia.

21 Componentes Componente 1 Validación y estandarización de marcadores y metodologías de SAM desarrolladas en Japón y las que están disponibles al público. Componente 4 Capacitación y divulgación (Fortalecimiento Institucional).

22 Componente 1 Resultados esperados Manuales y protocolos de evaluación fenotípica y genotípica para tolerancia al frío; afinamiento de las condiciones experimentales de evaluación genotípica y fenotípica.

23 Evaluación Fenotípica M. Cruz

24 Evaluación Fenotípica M. Cruz

25 Evaluación Fenotípica I = IT x CP M. Cruz J. Rosas

26 Componente 1 Resultados esperados Manuales y protocolos de evaluación fenotípica y genotípica para tolerancia al frío disponibles; afinamiento de las condiciones experimentales de evaluación genotípica y fenotípica. Genotipos de arroz (30-50) seleccionados con base en información fenotípica y evaluados con 40 marcadores, para obtención de materiales que combinen ambas características.

27 Evaluación Fenotípica Confirmación de la respuesta al frío en etapa reproductiva de 50 cultivares o líneas de arroz. M. Cruz

28 Componente 1 Resultados esperados Marcadores moleculares con mayor potencial de ser integrados en un esquema de SAM, útiles para los objetivos del proyecto, identificados y seleccionados. Manuales y protocolos de evaluación fenotípica y genotípica para tolerancia al frío disponibles (afinamiento de las condiciones experimentales de evaluación genotípica y fenotípica) Genotipos de arroz (30-50) seleccionados con base en información fenotípica y evaluados con 40 marcadores, para obtención de materiales que combinen ambas características.

29 Evaluación Genotípica Protocolos A. Siembra y toma de muestras para selección asistida por marcadores moleculares. B. Estandarización de protocolos de extracción del ADN. C. Quintero

30 Evaluación Genotípica Protocolos Siembra y Toma de muestra Extracción de ADN C. Quintero

31 Evaluación Genotípica Protocolos C. Estandarización de PCR. D. Visualización de fragmentos en geles. C. Quintero

32 FL07587 FL07598 FL07610 FL07693 FL07728 FL05371 FL05511 L3616 FL07573 Inia Olimar IRGA 417 Silewah Quilla L2825-CA Evaluación Genotípica Protocolos BAC28 Ctb1 C. Quintero

33 Evaluación Genotípica Genotipado A. Marcadores de NARCH-Japón. B. Marcadores de UC Davis. C. Quintero

34 Formacion de poblaciones Confirmacion respuesta fenotipica y genotipica en condiciones controladas. Informacion del comportamiento en condiciones de campo de variedades y lineas del cono sur latinoamericano.

35 Formacion de poblaciones Segregación en las lineas F7-FLAR, para la tolerancia al frio en etapa reproductiva. Dificultad para el acceso a donantes con los principales marcadores y mejor tipo de planta.

36 Progenitores Tolerante Intermedio Susceptible Silewah Padi Labou Alumbis L 2825 CA L 3616 INIA TACUARI M 202 INIA OLIMAR IRGA 423 IRGA 424

37 Utilizacion de la informacion Identificacion de la presencia de marcadores moleculares en plantas F2, en poblaciones del proyecto. Programacion de 180 cruzamientos triples del programa FLAR-TEMPLADO.

38 POA

39 POA El FIN del Proyecto es: Asegurar la estabilidad y sostenibilidad productiva de los arroceros de Argentina, Uruguay y Sur de Brasil frente a los posibles impactos del cambio climático, mediante la liberación de variedades tolerantes al frío de alto rendimiento, y de alta calidad, asegurando la demanda alimentaria regional e internacional. Fin IOV MDV Supuestos Asegurar estabilidad y avance en la implementación de la SAM; en los programas de mejoramiento del consorcio Los programas de mejoramiento del consorcio incrementan el número de materiales evaluados fenotípicamente y genotípicamente por tolerancia al frío Cronograma de actividades ejecutado eficientemente Informe técnico Informes de avance Informe del Taller Las instituciones y personas del consorcio perduran en el tiempo

40 POA Propósito IOV MDV Supuestos Acelerar la selección por tolerancia al frío mediante la incorporación de la SAM en los programas del consorcio Conformación del equipo y ejecución de actividades de la SAM en los programas de mejoramiento INIA, IRGA y FLAR Informe de avance y adquisición de equipos por parte de uno o varios miembros del consorcio Las políticas macroeconómicas y de propiedad intelectual permiten o facilitan la adquisición de equipos y tecnologías avanzadas

41 POA Componente 1 IOV MDV Supuestos Validar y actualizar información sobre marcadores moleculares para tolerancia al frío Grupo de 20 progenitores caracterizados fenotípicamente y genotípicamente por tolerancia al frío Informe de avance, reporte de cruzamientos y base de datos Las políticas macroeconómicas y de propiedad intelectual permiten o facilitan la adquisición de equipos y tecnologías avanzadas

42 Componente 1 Resultados esperados Evaluación fenotípica por tolerancia al frío en etapa reproductiva de 20 cultivares por parte de los socios y 50 en FLAR. Marcadores moleculares integrados en un esquema de SAM, replicar resultados en laboratorio de los miembros del consorcio. Aplicar la SAM, en las poblaciones BC1F1, previo a efectuar el siguiente retrocruzamiento

43 Siembra BC1F1

44 Componente 1 Resultados esperados Avanzar por descendencia de semilla única tres poblaciones. Efectuar cruzamientos con los donantes (Japón), una vez se nacionalicen.

45 POA Componente 2 IOV MDV Supuestos Ejecutar los ajustes a las metodologías en los programas de mejoramiento del consorcio Identificar poblaciones de trabajo para el desarrollo de la SAM, en los programas del consorcio Uno de los programas del consorcio aplica la SAM para tolerancia al frío Cada miembro del consorcio identifica las poblaciones o genotipos para iniciar la SAM Informe de avance, reporte de cruzamientos y base de datos Las políticas macroeconómicas y de propiedad intelectual permiten o facilitan la adquisición de equipos y tecnologías avanzadas

46 Componente 2 Resultados esperados Metodologías de evaluación establecidas en las instituciones participantes. El equipo humano de las mismas aplica rutinariamente en sus programas de mejoramiento las metodologías de evaluación por tolerancia al frío en condiciones controladas, técnicas moleculares y análisis de datos.

47 Componente 2 Resultados esperados Poblaciones BC1F1 caracterizadas genotípicamente. Relación por tolerancia al frío en etapa reproductiva, entre fenotipo y genotipo verificada.

48 Componente 3 Resultados esperados Relacionar los resultados obtenidos en condiciones controladas con los del estrés por frío en campo. Seleccionar familias F3, con buena aceptabilidad fenotípica, dentro de las poblaciones F2 Simples Templado; sembradas en Treinta y Tres (Uruguay).

49 POA Componente 4 IOV MDV Supuestos Asistir a entrenamiento y actualización en CIAT-FLAR, en técnicas estandarizadas de SAM para tolerancia al frío Una persona por país miembro actualizada en SAM Informe de avance, reporte de cruzamientos y base de datos. Registro de siembra Las políticas macroeconómicas y de propiedad intelectual permiten o facilitan la adquisición de equipos y tecnologías avanzadas

50 POA Componente 4 IOV MDV Supuestos Realizar taller de implementación de la SAM, en el cono sur latinoamericano Tres personas por institución participando en el taller y personal invitado de universidades Informe de avance. Base de datos. Registro de asistencia. Informe de viaje Las políticas macroeconómicas y de propiedad intelectual permiten o facilitan la adquisición de equipos y tecnologías avanzadas

51 POA Componente 4 IOV MDV Supuestos Generar Base de Datos Participar en Congreso Publicaciones Red de información establecida Asistencia al menos a un congreso Una publicación en revista Base de datos. Registro de asistencia Informe de viaje Artículo publicado Las políticas macroeconómicas y de propiedad intelectual permiten o facilitan la adquisición de equipos y tecnologías avanzadas

52 Proyecto FTG-8009/08: Selección asistida por marcadores moleculares para tolerancia al frío del arroz en el cono sur latinoamericano; una estrategia para enfrentar la inestabilidad climática

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54 Gracias

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