Abril-Junio /10. Estimados amigos:

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1 Estimados amigos: Una vez más y siguiendo las normas de gestión de la Plataforma de Resistencias de la RIS, os hacemos llegar un nuevo INFORME TRIMESTRAL, correspondiente al periodo comprendido entre los meses de ABRIL y JUNIO de Como sabéis, en estas circulares se incluye la información disponible en la base de datos ResRIS: número de genotipos, tipo de tratamiento, proporción de pacientes naive y tratados, seguimiento viro-inmunológico de los mismos, etc. Después de la actualización anual de datos que hemos ido recibiendo durante el mes de mayo, contamos con un total de 7223 secuencias en formato FASTA con seguimiento clínico, que pertenecen a un total de 4923 pacientes diferentes. Os rogamos tengáis muy en cuenta el punto 7 de esta circular, donde os resumimos las sugerencias realizadas por los evaluadores externos durante la reunión del pasado mes de junio. 1. SITUACIÓN ACTUAL DE LOS CENTROS A continuación se recoge el estado de cada uno de los centros integrantes de la Plataforma de Resistencias de la RIS (ResRIS) en relación a su compromiso de participación en el envío de datos. CENTROS H. de Donosita, San Sebastián H. Vall d Hebrón, Barcelona H. Clinic, Barcelona Fundación IrsiCaixa, H. Germans Trias i Pujol, Badalona H. Mutua, Terrassa H. Joan XXIII, Tarragona H. Juan Canalejo, A Coruña H. Conxo-CHUS, Santiago Compostela H. Meixoeiro, Vigo H. Xeral-Cies, Vigo H. Son Dureta, Palma de Mallorca H. Clínico San Carlos H. Ramón y Cajal, Madrid H. Carlos III, Madrid H. La Fe, Valencia H. Clínico, Valencia COMPROMISO PARTICIPACIÓN INSTALACIÓN BASE DATOS DATOS ENVIADOS PRÓXIMO ENVIO DATOS X X Abril-Junio /10 X X

2 H. General Universitario, Elche H. Virgen del Rocío, Sevilla H. Virgen Macarena H. Ntra. Sra. Valme H. Virgen de la Victoria, Málaga H. Clínico San Cecilio, Granada H. Universitario de Canarias, Tenerife X 2. SITUACIÓN ACTUAL DE LA BASE DE DATOS DE RESISTENCIAS Como sabéis, la base de datos de resistencias con seguimiento clínico recoge información epidemiológica de los pacientes, datos de tratamiento en el momento del estudio de resistencias (información al fracaso) y los datos de la intervención de tratamiento tras el estudio genotípico (rescate) junto con la información correspondiente de respuesta al mismo, carga viral y CD4, a los 3, 6 y 12 meses tras el genotipo basal. Tras recibir la actualización de datos de algunos de los centros participantes y realizar la actualización de la base global, a continuación se muestra la información acumulada y disponible hasta el momento: 2.1. DATOS EPIDEMIOLÓGICOS Hospital Pacientes Genotipos Situación en el fracaso Naive En En Desconocido tratamiento suspensión H. Donosita, San Sebastián H. Clinic, Barcelona H. Vall d Hebrón, Barcelona H. Germans Trias i Pujol, Badalona H. Joan XXIII, Tarragona H. Son Dureta, Palma de Mallorca H. Juan Canalejo, La Coruña H. Conxo-CHUS, Santiago de Compostela H. Ramón y Cajal, Madrid H. Carlos III, Madrid H. General Universitario, Elche H. San Cecilio, Granada H. Virgen del Rocío, Sevilla H. Virgen de la Victoria, Málaga H. Universitario de Canarias TOTAL Abril-Junio /10

3 2.2. DATOS DE TRATAMIENTO FRACASO: La información de tratamiento en el momento del estudio genotípico está disponible en 4382 GENOTIPOS. Los datos porcentuales se han calculado en base a esta cifra. - Fracasos con ITIAN: Didanosina: ,9 Lamivudina Estavudina ,9 Tenofovir Abacavir ,3 Truvada ,4 Zidovudina 433 9,9 Trizivir 332 7,6 Combivir 250 5,7 Kivexa 160 3,7 Emtricitavina 116 2,6 - Fracasos con ITINAN: Efavirenz: ,8 Nevirapina: Etravirina: 36 0,8 - Fracasos con IPs: Lopinavir: Atazanavir: 431 9,8 Fosamprenavir: 255 5,8 Saquinavir: 232 5,3 Indinavir: 196 4,5 Tipranavir: 136 3,1 Darunavir: 151 3,4 Abril-Junio /10

4 RESCATE: La información de tratamiento instaurado tras el estudio genotípico está disponible en 3300 GENOTIPOS, correspondientes a pacientes que inician TAR o que lo cambian tras la realización del genotipo. Los datos porcentuales se han calculado en base a esta cifra. - Tratamiento de rescate que incluye ITIAN: Tenofovir Truvada ,2 Didanosina ,1 Lamivudina ,3 Abacavir ,3 Estavudina 235 7,1 Zidovudina 229 6,9 Kivexa 220 6,7 Combivir 162 4,9 Emtricitavina 157 4,8 Trizivir 158 4,8 - Tratamiento de rescate que incluye ITINAN: Efavirenz: ,1 Nevirapina: 251 7,6 Etravirina: Tratamiento de rescate que incluye IPs: Lopinavir: ,3 Atazanavir: ,6 Fosamprenavir: 258 7,8 Darunavir: 309 9,4 Saquinavir: 177 5,4 Tipranavir: 150 4,5 Indinavir: 83 2,5 Abril-Junio /10

5 2.3. PREVALENCIA GLOBAL DE MUTACIONES DE RESISTENCIA: Secuencias RT 5976 % ITIAN M41L: ,8 D67N ,3 K70R ,3 L210W ,0 T215Y ,1 T215F 311 5,0 K219Q 388 6,2 K219E 299 4,8 5 TAMs 182 2,9 M184V ,1 M184I 101 1,6 K65R 144 2,3 L74V 351 5,6 L74I 125 2,0 Q151L 5 0,1 Q151M 86 1,4 67 Del Ins 142 2,3 ITINAN K103N ,2 Y181C 602 9,6 Y181I 16 0,3 G190A 497 8,0 G190S 63 1 V106A 49 0,8 V106M 22 0,4 V179D 94 1,5 V179E 54 0,9 V179F 15 0,2 V179M 11 0,2 Secuencias PRO 6281 % M46I/L ,9 L90M ,4 V82A/F/L/S/T I54V 608 9,3 I84A/V 365 5,6 G48A/M/S/T/V D30N 118 1,8 I47V 99 1,5 I50L 52 0,8 I50V 42 0,6 N88S 36 0,6 I47A 11 0,2 Abril-Junio /10

6 3. SITUACIÓN DE LOS ESTUDIOS PROPUESTOS Y EN MARCHA Os rogamos a todos los IPs de estos proyectos que nos comentéis el estado actualizado de los mismos, así como la aceptación de abstracts y/o publicaciones para poder reflejarlo en las circulares. [10-2] Evaluación del impacto del genotipo basal en la transcriptasa inversa del VIH-1 en la respuesta al tratamiento con etravirina en la base de datos de resistencia ResRIS: Caracterización genética de la resistencia en el fracaso a etravirina. Estudio propuesto por Eva Poveda y Josep Mª Llibre, del Hospital Carlos III y del Hospital Germans Trias i Pujol, Badalona. El estudio se ha aprobado hace unos días y está abierto a la participación de todos. [10-1] Mutaciones en el gen de la proteasa asociadas al fracaso virológico en regímenes de tratamiento antirretroviral de la práctica clínica habitual que contienen Lopinavir/ritonavir. Estudio propuesto por José Ramón Santos y Josep Mª Llibre, del Hospital Germans Trias i Pujol, Badalona. El estudio está en fase de recogida de datos [09-4] Características clínico-epidemiológicas y patrones de mutaciones de resistencia en pacientes inmigrantes VIH+ con fracaso virológico en España. Estudio propuesto por Angels Jaén y David Dalmau, de la Mutua de Tarrasa. El estudio está en fase de recogida de datos. [09-3] Frecuencia de polimorfismos en el subdominio thumb de la retrotranscriptasa del VIH en individuos que fracasan al tratamiento con combinaciones de análogos a nucleósidos. Estudio propuesto por Luis Menéndez, del CBM Severo Ochoa, Madrid. El estudio está en fase de análisis de datos y redacción del manuscrito correspondiente. [09-2] Validación clínica del algoritmo RIS en los TCEs (Treatment Change Episodes) de la base de datos de resistencias de la RIS. Estudio propuesto por David Dalmau y Federico García que se encuentra en fase de redacción de la publicación correspondiente. [09-1] Estudio de la Prevalencia de los subtipos del VIH-1 en los pacientes de la base de datos de resistencias, estudio propuesto por Lourdes Anta del Hospital Carlos III en colaboración con todos los centros participantes en la base de datos. Se presentaron 2 trabajos en el 8th European HIV Drug Resistance Workshop de Sorrento. Un tercer trabajo se presentará en el próximo 50th ICAAC en Boston el próximo mes de septiembre. Estamos preparando el manuscrito correspondiente que os remitiremos en breve. [08-5] Utilidad de los marcadores clínicos y biológicos en la predicción genotípica del tropismo celular del VIH-1. Proyecto propuesto por Victoria Sánchez, del Hospital General Universitario de Elche. Los primeros resultados de este estudio se presentaron en el CROI La idea es realizar la validación de este algoritmo en ResRIS. [08-4] Patrones de resistencia en pacientes en fracaso virológico a tipranavir/ritonavir y darunavir/ritonavir dentro de la base de datos de resistencias de la RIS, estudio coordinado por Eva Poveda en colaboración con el resto de miembros de ResRIS y que ya está terminado y acaba de ser publicado en la revista Antimicrobial Agents and Chemotherapy. [08-3] Prevalencia de mutaciones asociadas con resistencia a etravirina en pacientes VIH positivo con experiencia previa a NNRTI dentro de la base de datos de resistencias de la RIS. En este estudio coordinado por Eva Poveda del Hospital Carlos III de Madrid en colaboración con todos los centros de ResRIS. El trabajo ya está completado y publicado en la revista AIDS. Abril-Junio /10

7 [08-2] Incorporación del algoritmo RIS a la página web de Advanced Biological Laboratories (ABL). Trabajo propuesto por Federico García, en el que se incorpora el algoritmo RIS a esta web. ABL ya cuenta con la actualización 2010 de nuestro algoritmo. [8-1] Evaluación de la concordancia del algoritmo de resistencias de la Plataforma de Resistencias de la RIS con otros algoritmos disponibles. Estudio coordinado por Federico García y por David Dalmau de la Mutua de Terrassa. Los resultados de este trabajo se presentaron en el 7th European HIV Drug Resistance Workshop, y en ellos la concordancia obtenida entre el algoritmo de la RIS y el de Rega y Stanford fue muy buena. Se obtuvo un peor nivel de concordancia entre el algoritmo de la RIS y ANRS en algunos ITIAN como ABC y ddi, y en los IPs, excepto para LPV/r, donde la concordancia fue muy buena. [07-1] Estudio de resistencias primarias y subtipos del VIH-1 en los pacientes de la Cohorte de la Red de Investigación en SIDA (CoRIS), coordinado por Federico García, del Hospital Clínico San Cecilio de Granada y por Carmen de Mendoza del Hospital Carlos III de Madrid. Durante el pasado 8th European HIV Drug Resistance Workshop de Sorrento se presentó un trabajo, donde se observa que la prevalencia de subtipos no B en seroconvertores en España se ha incrementado desde 2001, siendo en la actualidad de 18,8%, mientras que la transmisión de mutaciones de resistencia permanece estable y relativamente elevada en torno al 14%. 4. COMUNICACIONES A CONGRESOS Anta L, De Mendoza C, on behalf of the Resistance Platform of the Spanish AIDS. Research Network. Resistance to the newest protease and non-nucleoside RT inhibitors in HIV-1 non-b subtypes - Analysis in ResRIS, The National Drug Resistance Database of the Spanish Aids Research Network. 50 th ICAAC; 2010 Boston. De Mendoza C, Rodríguez C, Aguilera A, Gutiérrez F, Leiva P, Eiros JM, García F, Caballero E, Lapaz M, Soriano V. Transmission of drug resistance, X4 variants and non-b subtypes in a large cohort of HIV recent seroconverters in Spain. 8th European HIV Drug Resistance Workshop; 2010 Sorrento [Abstract 69]. Anta L, Aguilera A, Blanco JL, García F, Iribarren JA, Pérez-Elías MJ, Sánchez-Hellín V, Leal M, Llibre JM, Soriano V, Mendoza C, on behalf of the Resistance Platform of the Spanish AIDS Research Network. Prevalence of HIV-1 subtypes and drug resistance mutations in ResRIS, the National drug resistance database of the Spanish AIDS Research Network. 8th European HIV Drug Resistance Workshop; 2010 Sorrento [Abstract 99]. Anta L, Blanco JL, Aguilera A, García F, Iribarren JA, Gutiérrez C, Gutiérrez, Leal M, Llibre JM, Soriano V, de Mendoza C, on behalf of the Resistance Platform of the Spanish AIDS Research Network. Identification of a new HIV-1 circulating recombinant form in Spain. 8th European HIV Drug Resistance Workshop; 2010 Sorrento [Abstract 97]. V Sánchez, C Robledano, B Lumbreras, S Padilla, E Poveda, V Soriano, C de Mendoza, M Masiá, F Gutiérrez. A highly sensitive and specific model for predicting HIV-1 tropism in treatment-experienced patients combining V3 loop sequences interpretation and clinical parameters. CROI; 2010 San Francisco. N chueca, V Sánchez, C rodríguez, D Dalmau, JC Palomares, MJ Pérez-Elías, MM Alonso, S Pérez-Cachafeiro, C de Mendoza, Fe García y Grupo del Estudio de Resistencias y Subtipos de CoRIS. Prevalencia de resistencias primarias y grupos de transmisión de subtipos no B circulantes en CoRIS. I Congreso Gesida; 2009 Madrid [Abstract PO-35]. Abril-Junio /10

8 L. Anta, JL. Blanco, MJ Pérez-Elías, F. Garcia, M leal, E Ribera, JA Iribarren, F Gutiérrez, I Viciana, A Aguilera, J Pedreira, JL Gómez-Sirvent, V Soriano, C. de Mendoza en nombre de la Plataforma de Resistencias de la Red de Investigación en SIDA (RIS). Aplicaciones de una base de datos nacional de resistencias del VIH a los antirretrovirales: Vigilancia y Desarrollo de Algoritmos genotípicos de interpretación. I Congreso Gesida; 2009 Madrid [Abstract PO-60]. V Guillot, S Pérez-Cachafeiro, AM Caro, S Moreno, J del Romero, V Soriano, JL Gómez, JA Pineda, D Dalmau, C de Mendoza, F García, CoRIS. High prevalence of HIV non B subtypes and primary drug resistance in the cohorte of the Sapnish AIDS Research Network (CoRIS). 5th IAS Conference on HIV Pathogenesis, Treatmen and Prevention; 2009 Cape Town [Abstract 201]. E Poveda, L Anta, JL Blanco, MJ Pérez-Elías, F García, JL Gómez-Sirvent, JA Iribarren, V Soriano, and C de Mendoza, on behalf of the Spanish Resistance Platform (ResRIS). Emerging Resistance Mutations in Antiretroviral-Experienced HIV Patients Failing Tipranavir or Darunavir in the Spanish Drug Resistance Database. XVIII International HIV Drug Resistance Workshop; 2009 Fort Myers, Florida [Abstract 51]. L. Anta, JL. Blanco, MJ. Pérez-Elías, F. Garcia, M. Leal, E. Ribera, JA Iribarren, F. Gutiérrez, I. Viciana, A. Aguilera, J. Pedreira, JL. Gómez-Sirvent, V. Soriano and C. de Mendoza on behalf of the Resistance Platform of the Spanish AIDS Research Network. Applications of a National HIV Drug Resistance Database: Surveillance and development of Genotypic Resistance Algorithms. 7th European HIV Drug Resistance Workshop; 2009 Stockholm [Abstract 16]. E Poveda, L Anta, JL Blanco, MJ Pérez-Elías, F García, M Leal, E Ribera, F Gutierrez, V Soriano and C de Mendoza, on behalf of the Spanish AIDS Research Network (RIS). Prevalence of Etravirine Resistance Mutations in HIV Patients Failing Efavirenz versus Nevirapine in the Spanish Resistance Database. 7th European HIV Drug Resistance Workshop; 2009 Stockholm [Abstract 69]. A Jaen, V Guillot, D Gonzalez, M Alvarez, M Xercavins, L Anta, C de Mendoza, R Boulmé, D Dalmau and F García. Performance of the Spanish HIV Research Network (RIS) Resistance Interpretation Algorithm. 7th European HIV Drug Resistance Workshop; 2009 Stockholm [Abstract 102]. V Guillot, S Pérez-Cachafeiro, J Oteo, J Berenguer, P Viciana, MJ Pérez-Elías, C Tural, C de Mendoza, F García, on behalf of CoRIS. The Prevalence of HIV non B subtypes and drug resistance is relatively high in the Spanish cohort of ARV naïve individuals (CoRIS). 7th European HIV Drug Resistance Workshop; 2009 Stockholm [Abstract 20]. 5. PUBLICACIONES Trabajos publicados: Poveda E, Anta L, Blanco JL, Casado JL, Gutiérrez F, García F, Gómez-Sirvent JL, Iribarren JA, Soriano V, de Mendoza C; on behalf of the Resistance Platform of the Spanish AIDS Research Network (ResRIS). Drug Resistance Mutations in HIV- Infected Patients Failing Tipranavir and Darunavir in the Spanish Drug Resistance Database. Antimicrob Agents Chemother 2010;54: Poveda E, Anta L, Blanco JL, Pérez-Elías MJ, García F, Leal M, Ribera E, Gutiérrez F, Soriano V, de Mendoza C; Resistance Platform of the Spanish AIDS Research Network (ResRIS). Etravirine resistance associated mutations in HIV-infected patients failing Abril-Junio /10

9 efavirenz or nevirapine in the Spanish antiretroviral resistance database. AIDS 2010; 24: C de Mendoza, L Anta, F García, MJ Pérez-Elías, F Gutiérrez, JM Llibre, L Menéndez- Arias, D Dalmau, V Soriano on behalf of Platform for Drug Resistance of the Spanish AIDS Research Network. HIV-1 Genotypic Drug Resistance Interpretation Rules Spanish Guidelines. AIDS Rev 2009; 11: Por otro lado, la Guía de Resistencias a los Antirretrovirales 2010 también ha sido ya editada por Permanyer. Aunque ya la habéis recibido por correo electrónico, en unos días recibiréis algunos ejemplares por correo postal. Recordad que también podéis acceder al documento en pdf a través de nuestro espacio de la página web de la RIS. 6. DOCUMENTOS EN LA PÁGINA WEB Para entrar en el espacio correspondiente a la Plataforma de Resistencias reservado en la web de la RIS ( debéis seleccionar en el menú de la página web la opción: Plataformas/Líneas y una vez allí, seleccionar de nuevo en el menú la opción: Resistencias. Como os acabamos de comentar, en el apartado de publicaciones, podéis encontrar la Guía de Interpretación de los genotipos de resistencia 2010 en pdf, los últimos trabajos publicados, tanto comunicaciones a congresos como artículos, los documentos de la plataforma, así como el sistema de interpretación a tiempo real de los genotipos de resistencia según los criterios de la RIS actualizado con el algoritmo de En el apartado de documentos, podéis encontrar todos los proyectos que se están desarrollando dentro de la base de datos, así como las circulares que os hemos remitido hasta el momento. 7. OTRAS NOTICIAS: EVALUACIÓN EXTERNA DE ResRIS Como muchos de vosotros sabéis, el pasado 4 de junio tuvo lugar en Barcelona la evaluación anual de la RIS a petición de los responsables de la misma. En ella, los evaluadores tuvieron la oportunidad de escuchar presentaciones detalladas de cada una de las plataformas y líneas de investigación, y de discutir distintos temas con los respectivos coordinadores y responsables. Entre los temas para mejorar nuestra plataforma y la base de datos se resaltaron los siguientes: - Intensificar la explotación de esta base única de genotipos con seguimiento clínico, mediante el planteamiento de estudios relacionados con subtipos, nuevos ARVS y niveles de ARVs. - Constituir el grupo control naive. - Continuar con el control de calidad de los datos. - Ampliación del número de centros implicados. - Actualizar la base con nuevos genotipos con el fin de disponer de datos referentes a los últimos fármacos disponibles y que la base no quede desfasada. - Inclusión definitiva del Grupo de VIH-2/HTLV y seroconvertores en la Plataforma. - Modificar nuestro espacio en la web de la RIS para acceder directamente a Stanford, REGA y ANRS, así como geno2pheno y PSSM con nuestros criterios para tropismo. Como veis, uno de los temas sobre los que incidieron los evaluadores y que nos gustaría resaltar fue el control de calidad de la base de datos, por ello os recordamos que: Abril-Junio /10

10 Además de las secuencias RT y PRO en formato FASTA, es imprescindible remitir siempre la información de seguimiento clínico de la forma más completa posible. Los datos a completar y enviar son los siguientes: DATOS FILIACIÓN Fecha de nacimiento País de origen Sexo Año de diagnóstico Subtipo VIH Grupo de riesgo ANALÍTICA (deben incluirse los datos basales y de seguimiento a los 3, 6 y 12 meses tras el rescate) Código de Laboratorio (Nº de muestra) Fecha de la muestra CV CD4 %CD4 GENOTIPO (en formato FASTA) Código de Laboratorio (Nº de muestra) Fecha de la muestra Tropismo genotipo (si está disponible) Tropismo fenotipo (si está disponible) TRATAMIENTO (en fracaso y en rescate) Fecha inicio Adherencia (buena; regular; mala) Tratamiento (naive; en TAR; sin TAR) Fármacos que lo componen REUNIÓN ANUAL DE LA PLATAFORMA DE RESISTENCIAS En el último trimestre del año está prevista la celebración de la reunión anual de la Plataforma de Resistencias. Probablemente se realizará en el Hospital Carlos III a finales del mes de octubre. Si tenéis alguna propuesta al respecto os rogaríamos nos la hicierais llegar. Por último desearos a todos que, disfrutéis de unas merecidas vacaciones. Después del verano esperamos reencontrarnos con muchos e interesantes proyectos para desarrollar dentro de la base de datos de resistencias (ResRIS). Si necesitáis información adicional o tenéis cualquier sugerencia, ya sabéis que podéis contactar con nosotros. Dra. L. Anta y Dra. C. de Mendoza (Coordinación de campo): lourdes.anta@hotmail.es; cmendoza@teleline.es Gustavo Manuzza (Informático): lucano65@gmail.com Dr. V. Soriano (Coordinador de la Plataforma): vsoriano@dragonet.es Abril-Junio /10