CARTERA DE SERVICIOS. (10ª edición) SERVICIO DE MICROBIOLOGÍA

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1 Página 1 de 29 CARTERA DE SERVICIOS (10ª edición) SERVICIO DE MICROBIOLOGÍA La cartera de servicios detallada a continuación se presenta en el formato histórico, empleado en la primera versión de fecha 10/10/04 y en sus posteriores revisiones. Esta revisión corresponde a la 10ª edición de la Cartera de Servicios.

2 Página 2 de 29 ELABORADO REVISADO Y APROBADO Jefe de Servicio Nombre/Firma Fecha Nombre/Firma Fecha Manuel Omeñaca Ana Isabel López 12/06/17 María José Revillo 12/06/17 Edición Fecha ALCANCE MODIFICACIONES /10/04 Edición inicial 02 17/01/06 Primera Revisión 03 30/04/08 Segunda Revisión (adenovirus en muestras respiratorias) 04 16/04/09 Tercera Revisión Modificar el tiempo de respuesta de Cultivo de virus, 14 días PCR de HSV,CMV;VVZ;VEB;VH6 ( 2 días) Carga viral de VHB ( 7 dias). PCR enterovirus en LCR ( 2 dias) Exudado de lesiones superficiales ( 5 días) s óseas y biopsias invasivas (7-10 días) Hongos dermatofitos 25 días Suprimir 3 pruebas reumáticas y PCR de VHC Añadir Serología de la enfermedad de Chagas Investigación de Schistosoma en orina Examen KOH en muestras hematológicas Investigación de metapneumovirus en muestras respiratorias Investigación de Ureaplasma y Micoplasma en muestras urogenitales y respiratorias 05 17/06/13 Modificar técnica Pneumocystis jirovecii Citomegalovirus Mycobacterium tuberculosis complex Micobacterias no tuberculosas Mycobacterium tuberculosis intra-complex de la sensibilidad de micobacterias no tuberculosas de la sensibilidad de M. tuberculosis a antibacterianos de 1ª línea Coxiella burnetti IgG e IgM Enterovirus Papilomavirus detección de alto riesgo Papilomavirus, genotipado 16,18,45 Chlamydia trachomatis Clostridium difficile (toxina) Borrelia burgdorferii (Lyme) Modificar tiempo de respuesta Borrelia burgdorferii (Lyme)

3 Página 3 de 29 Brucella Enterovirus Hongos dermatofitos Borrelia burgdorferi (ELISA) Brucella Hepatitis B, antígeno e (HbeAg) Hepatitis B, antígeno superficie (HbsAg) Treponema pallidum Yersinia enterocolitica (03 y 09 separadas) Yersinia pseudotuberculosis Toxoplasma gondii Trichinella spiralis Citomegalovirus Epstein Barr Epstein-Barr EBNA Hepatitis A Hepatitis D Herpes simple tipo 2 Herpes simple tipo 6 Parotiditis Sarampion Varicela Zoster Modificar muestra Mycobacterium tuberculosis complex Añadir Poliomavirus: carga viral de virus BK por PCR-TR Poliomavirus: detección de virus JC por PCR-TR Meningitis por Listeria Meningitis bacteriana del niño: E.coli+S.agalactiae Meningitis bacteriana del adulto: Haemophilus+S.pneumoniae Secuenciación 16S Secuenciación ITS Identificación de bacterias mediante espectrometría de masas Detección metalobetalactamasa Detección de carbapenemasa Tinción Auramina Micobacterias: resistencias a Rifampicina e Isoniacida Papilomavirus, genotipado 16,18,45 Gripe A Gripe A nueva Subtipado gripe: H1, H3, H Gripe B Gripe C Parainfluenza 1 Parainfluenza 2 Parainfluenza 3 Parainfluenza 4 Adenovirus Virus respiratorio sincitial A,B Coronavrirus 229E Coronavirus OC43 Virus respiratorio sincitial A Virus respiratorio sincitial B Rinovirus

4 Página 4 de 29 Enterovirus Sarampion Rubeola Parvovirus B19 Herpes simplex, Varicela zoster (PCR-TR) Epstein-Barr carga viral (PCR-TR) Suprimir Citomegalovirus, antigenemia Coxiella burnetti (Fiebre Q) por Fijación de Complemento (F de C) Mycoplasma pneumoniae por F de C Pruebas reumaticas: Anti Dnasa B Adenovirus por F de C Citomegalovirus por F de C Influenza A por F de C Influenza B por F de C Leptospira por aglutinación Parainfluenza 1 por F de C Parainfluenza 2 por F de C Parainfluenza 3 por F de C Parotiditis por F de C Respiratorio sincitial (VRS) por F de C Sarampión por F de C Papillomavirus detección y cualificación de bajo riesgo HTLV 2 Astrovirus Mycobacterium avium/intracellulare complex Mycobacterium kansasii de la sensibilidad de M. tuberculosis a antibacterianos de 1ª línea en medios sólidos Hepatitis A cuantificada post-vacunación automatizada Herpes simple tipo 1 IgG automatizado 06 27/10/14 Se incluye el nº de edición de la cartera de servicios en el título. Se indican mediante un asterisco (*) las determinaciones incluidas en el alcance de la acreditación. Se indica en el apartado de consideraciones, y se añade enlace al alcance de acreditación. Se sustituye etest por tiras en la tabla 2.4 Pruebas de sensibilidad antibiótica /01/15 Se corrigen algunas de las determinaciones marcadas como acreditadas con asterisco. Se modifica el enlace al alcance de acreditación. Se actualizan diferentes tiempos de respuesta de acuerdo a la rutina actual del laboratorio. Se incluye la columna técnica en las tablas del apartado 1.2 Detección de antígenos. Suprimir Haemophilus influenzae b (Ag en LCR) Neisseria meningitidis (Ag en LCR) Clostridium difficile (toxina) en heces Helicobacter pylori Ag en heces Virus neurotropos (Herpes simplex, Varicela, CMV, Herpes 6,Epstein-Barr) (PCR convencional) Pneumocystis jirovecii (nested PCR) Mycoplasma pneumoniae (IgM técnica rápida)

5 Página 5 de /12/15 Se cambia el código de formato PTP de nivel II al formato PTG de nivel III 09 06/07/16 Se incluye la tinción de Kinyoun y su tiempo de respuesta en el punto 1.1 Exámenes directos/tinciones /06/17 Se indican mediante un asterisco (*) las determinaciones incluidas en el alcance de la acreditación tras la última auditoria. Añadir Identificación de otras micobacterias distintas de M. tuberculosis (espectrometría de masas)* Detección de Astrovirus, Norovirus por ICT en heces Detección de Parechovirus por PCR Detección de Neisseria gonhorroeae por PCR tiempo Detección de Bordetella pertussis y Bordetella parapertussis por PCR tiempo Detección de Pneumocystis jiroveccii por PCR tiempo Detección de S aureus meticilin sensible y meticilin resistente por PCR a tiempo en hemocultivos positivos Detección de Plasmodium spp por PCR tiempo Suprimir de la sensibilidad a antivíricos en VIH de la CMB por microdilución en caldo Identificación de otras micobacterias distintas de M. tuberculosis (convencional) de la sensibilidad de micobacterias no tuberculosas por difusión, E-test y microdilución en caldo Aglutinación de Bordetella, Escherichia coli 0157, Legionella, Listeria a partir de aislado. Detección por PCR de: Coronavirus 229E, Coronavirus OC43, Poliomavirus: virus JC, Gripe C, Parainfluenza 1,2,3,4, Adenovirus, Rinovirus, Sarampión, Rubéola, Parvovirus B19, Herpes 7, Herpes 8, Borrelia burgdorferi, Leishmania de la sensibilidad a antifúngicos por difusión en agar (hongos levaduriformes), y por etest (hongos filamentosos y levaduriformes) COPIA nº 1 asignada al Servicio de Microbiología Este documento es propiedad del Servicio de Microbiología del Hospital Universitario Miguel Servet. La información en él contenida no podrá reproducirse total ni parcialmente sin autorización escrita del Responsable. Las copias no registradas no se mantienen actualizadas a sus destinatarios.

6 Página 6 de 29 Esta cartera de servicios tiene la finalidad de proporcionar al solicitante información de los servicios ofrecidos en el Servicio de Microbiología del Hospital Universitario Miguel Servet. Con el fin de ayudar en la interpretación de su contenido se aportan algunas definiciones, junto con consideraciones internas. Nos comprometemos a mantener permanentemente actualizado este documento a partir de las necesidades y sugerencias manifestadas por nuestros clientes, así como a partir de la evolución de la ciencia y de la tecnología. Por ello, establecemos cauces de comunicación eficaz con los clientes que permitan recoger y trasladar sus recomendaciones a nuestros servicios. Definiciones: Servicio: Resultado que ofrece el Laboratorio a requerimiento de sus diversos clientes. : Prueba o conjunto de pruebas de tipo físico, químico o biológico que conducen a un resultado. La determinación puede constituir un servicio por sí misma. Una determinación puede estar constituida por una o varias pruebas. Técnica: Forma genérica de izar una determinación y obtener el resultado de la misma entre posibles alternativas y que refiere a equipamiento, método o materiales utilizados. Método: Modo de hacer un ensayo sistemáticamente y con un orden

7 Página 7 de 29 Consideraciones 1. Se pretende aportar las posibilidades del Servicio de Microbiología respecto a la ización de servicios y determinaciones. 2. Se pretende, igualmente, trasladar los plazos de tiempo necesarios para la ización de cada servicio o determinación. 3. Tiempo máximo de determinación es el plazo en que el solicitante tendrá el informe con el resultado final de cada servicio. En el caso de varios servicios solicitados, este tiempo puede estar condicionado por la combinación de los mismos o por el resultado parcial obtenido de algunos de los servicios solicitados. 4. El valor de este plazo se ha establecido atendiendo a la mayoría de las muestras analizadas, pudiendo darse desviaciones en muestras concretas. 5. Los tiempos reflejados en el documento hacen referencia al momento de la expedición del informe por parte del Servicio de Microbiología. Para algunos destinatarios este plazo puede verse incrementado en función de la organización de la distribución. 6. En la valoración de los plazos se consideran días hábiles. 7. Se indica, mediante asterisco, las determinaciones incluidas en el alcance de acreditación (disponible en el apartado de Entidades Acreditadas de:

8 Página 8 de 29 ÍNDICE 1. SERVICIO DE TÉCNICAS DIAGNÓSTICAS 1.1 EXÁMENES DIRECTOS 1.2 DETECCIÓN DE ANTÍGENOS MICROBIANOS 1.3 MICROBIOLOGÍA MOLECULAR 1.4 CULTIVOS 1.5 DETECCIÓN DE ANTICUERPOS 2. SERVICIO DE LABORATORIO DE REFERENCIA 2.1 IDENTIFICACION ANTIGENICA 2.2 IDENTIFICACION BIOQUIMICA 2.3 OTRAS DETERMINACIONES 2.4 SENSIBILIDAD ANTIBIOTICA 3. SERVICIO DE INTERCONSULTAS 4. SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCIÓN NOSOCOMIAL 5. SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCIÓN DE LA COMUNIDAD 6. OTROS SERVICIOS 7. OTRAS ACTIVIDADES

9 Página 9 de SERVICIO DE TÉCNICAS DIAGNÓSTICAS 1.1 Exámenes directos EXÁMENES EN FRESCO Exámenes en Fresco: Bacterias respuesta (días) Chancro sifilítico Genitales <1 Exudados Exámenes en Fresco: Hongos respuesta (días) Examen con KOH Pelo, piel, uña 5 Hongos Examen KOH s hematológicas <1 Hongos Exámenes en Fresco: Parásitos respuesta (días) Examen en fresco Parásitos o fragmentos Heces, Vómicas, Parásitos Ectoparásitos Larvas (miasis) Estructuras parasitarias, 1 Otras muestras Schistosoma Orina, Biopsia 2 Orina Trichomonas Ex. vaginal 1 Exudados Test de Graham (Oxiuros) Papel de celo 2 Parásitos

10 Página 10 de 29 Tinciones respuesta (días) Tinción Gram* Todas 1 Todas Tinción Tinta china LCR 1 Hemocultivos Tinción Kinyoun* Todas 1 Micobacterias Tinción Ziehl-Neelsen* Todas 1 Micobacterias Tinción Auramina* Todas 2 Micobacterias Tinción de Gram acreditada para muestras de sección Exudados, hemocultivos, muestras respiratorias con cultivo cultivo cuantificado y orinas. Tinciones parasitarias Tinción ácido resistente Cryptosporidium, Cyclospora, Isospora Heces, respiratorias, biliares. respuesta (días) 2 Parásitos Tinción Microsporidium Heces 2 Parásitos Gota gruesa Plasmodium Sangre (EDTA) 2 Parásitos Microfilarias Sangre (EDTA), ojo <2 Parásitos Leihsmania Biopsia de piel, Raspados,Punción medular 2 Parásitos 1.2 Detección de antígenos microbianos Detección de antígenos: Bacterias Técnica respuesta (días) Legionella pneumophila ICT Orina 1 Respiratorio Streptococcus pneumoniae ICT Orina LCR 1 Respiratorio Hemocultivos Detección de antígenos: Hongos Técnica respuesta (días) Aspergillus fumigatus (antígeno galactomanano) ELISA Suero 5 Serología Cryptococcus neoformans Aglutinación LCR/suero 1 Hemocultivos

11 Página 11 de 29 Técnica Pneumocystis (carinii) jiroveci respuesta (días) IFI Respiratorio 2 Respiratorio Detección de antígenos: Parásitos Técnica Entamoeba histolytica ELISA Heces 2 Parásitos Plasmodium spp ICT Sangre con EDTA 1 Parásitos T.cruzi (Chagas) ICT Suero 7 Serología Detección de antígenos: Virus Técnica Hepatitis B, antígeno e (HbeAg)* Hepatitis B, antígeno superficie (HbsAg)* automatizada Suero Serología automatizada Suero 2 Serología Hepatitis D ELISA Suero Serología Adenovirus IFI Respiratoria 1 Virus Influenza (Gripe) tipo A* IFI Respiratoria 1 Virus Influenza (Gripe) tipo B* IFI Respiratoria 1 Virus Metapneumovirus* IFI Respiratoria 1 Virus Parainfluenza 1* IFI Respiratoria 1 Virus Parainfluenza 2* IFI Respiratoria 1 Virus Parainfluenza 3* IFI Respiratoria 1 Virus Respiratorio sincitial * IFI Respiratoria 1 Virus Adenovirus ICT Heces 2 Gastrointestinal Astrovirus ICT Heces 2 Gastrointestinal Norovirus ICT Heces 2 Gastrointestinal Rotavirus ICT Heces 2 Gastrointestinal VIH (antígeno p24)* automatizada Suero 1 Serología

12 Página 12 de Microbiología Técnica VIH, carga viral (cuantificación)* Citomegalovirus carga viral (cuantificación)* Hepatitis B virus carga viral (cuantificación)* Hepatitis C virus carga viral (cuantificación)* Hepatitis C virus (genotipo) Epstein-Barr (carga viral) Poliomavirus: carga viral virus BK Herpes simplex Varicela Zoster Enterovirus Parechovirus Papilomavirus detección de alto riesgo* Papilomavirus, genotipado 16,18* Gripe A Gripe A nueva Subtipado gripe: H1, H3, H Gripe B Virus respiratorio sincitial A Virus respiratorio sincitial B Plasmodium spp Plasma, LCR Plasma, LCR Tiempo para ización determinación (días) PCR-RT Suero, plasma PCR-RT Suero PCR, lipa Suero, amplicón LCR, plasma, suero Plasma, suero Plasma,suero, LCR, humor vítreo, lesiones vesiculares Plasma,suero, LCR, humor vítreo, lesiones vesiculares LCR, plasma, LCR endocervical endocervical respiratoria respiratoria respiratoria respiratoria respiratoria respiratoria Sangre vírica molecular vírica vírica vírica vírica molecular molecular molecular

13 Página 13 de 29 Técnica Pneumocystis jirovecii Bordetella pertussis Bordetella parapertussis Meningitis bacteriana del niño: E.coli+S.agalactiae Meningitis bacteriana del adulto: H.influenzae+S.pneumoniae Listeria monocytogenes Chlamydia trachomatis Neisseria gonhorroeae Detección de S aureus meticilin sensible y meticilin resistente Detección de carbapenemasas Secuenciación 16S Secuenciación ITS Mycobacterium tuberculosis complex* Mycobacterium tuberculosis complex* Mycobacterium tuberculosis intra-complejo* Micobacterias no tuberculosas* Micobacterias: resistencias a Rifampicina e Isoniacida PCR+secuen ciacion PCR+secuen ciación Amplificación Hibridación Hibridación reversa Hibridación reversa Hibridación reversa Hibridación reversa respiratoria respiratoria respiratoria LCR LCR LCR Ex. Uretral, cervical, ocular Ex. Uretral, cervical, ocular Tiempo para ización determinación (días) molecular molecular Hemocultivos 1 Hemocultivos Aislado Aislado Aislado Todas menos sangre molecular Tipado molecular bacteriano Tipado molecular bacteriano Micobacterias Aislado Micobacterias Aislado Micobacterias Aislado Micobacterias Todas menos sangre Micobacterias

14 Página 14 de Cultivo Cultivo muestras de Aparato Genital y Urinario s genitales* Exudados: vaginal, endocervical, uretral, de pene, de glande 5 Exudados s genitales * Aspirado endometrial Exudados s genitales de gestantes * (Cribado Streptococcus agalactiae) Orina (Urocultivo)* Semicuantitativos: Estudio de prostatitis Exudado vaginal, anal 4 Exudados Micción media, orina de uréter, aspiración suprapúbica, punción sonda vesical, punción renal, nefrostomía. Semen, líquido prostático, orina 4 4 Urocultivos Urocultivos Cultivo: Heces Coprocultivo (Salmonella, Shigella, Yersinia, Campylobacter, Aeromonas)* Heces, hisopo rectal 4 Gastrointestinal

15 Página 15 de 29 Cultivo muestras Epidemiología Controles de esterilidad Control de portadores (SARM*, Bacilos Gram (-) multiresistentes, Salmonella, enterococos vancomicina resistentes...) Unidades formadoras de colonia Control bacteriológico Ambientales clínico Material 5 Epidemiología Exudado nasal, inguinal... Heces... 4 Epidemiología Agua de dialisis 5 Epidemiología Hemoderivados negativo 15 contaminado o positivo Epidemiología Cultivo muestras Exudados Biopsias* Exudado de lesiones profundas y abscesos con búsqueda de anaerobios* Renal, cutánea Pulmonar Heridas profundas, absceso pulmonar, cerebral, mamario, mediastínico, hepático, renal Exudados* Hemocultivos Respiratorio 7-14 Exudados Hisopos periféricos de recién nacido, Exudado conjuntival, ótico, nasal, faríngeo y umbilical 3 Exudados Exudado de lesiones superficiales sin búsqueda de anaerobios* Heridas y lesiones superficiales 5 Exudados s óseas* Punción/aspiración con aguja fina (PAAF)* Esternal, vertebral, tibial, cubital, femoral, radial...injertos e implantes óseos Renal, Hepática, Pulmonar y Ganglionar 7-14 Exudados 7-14 Exudados* Respiratorio

16 Página 16 de 29 Cultivo: Hemocultivos y catéteres Catéteres y otros dispositivos (Semicuantitativos: Maki) Alimentación parenteral, conexiones de catéter diálisis peritoneal 5 Hemocultivos Hemocultivo convencional* Sangre Hemocultivos Hemocultivo de infección específica: endocarditis, brucelosis, micosis* Sangre Hemocultivos LCR LCR 4 Hemocultivos Líquidos orgánicos estériles Sinovial*, ascítico*, biliar*, mediastínico, pericárdico, peritoneal, CAPD... Hemocultivos, Exudados* Cultivo s Respiratorio s respiratorias (cultivo convencional) s respiratorias estériles s respiratorias (cuantificado)* s respiratorias vías altas u otorrinolaringológicas Esputo, esputo inducido, aspirado bronquial, aspirado traqueal, Líquido pleural, PAAF pulmonar, biopsia Aspirados bronquiales lavado broncoalveolar cepillo telescopado esputo mucoviscidosis EPOC bronquiectasias Exudado nasal, faríngeo, ótico Punción/aspiración de senos 5 3 Respiratorio Respiratorio Respiratorio Respiratorio s oculares Exudado conjuntival 3 Respiratorio s oculares Raspado corneal, humor vítreo, humor acuoso Cultivo Bacterias especiales Respiratorio Actinomyces Pleural, conjuntival, abscesos 14 Respiratorio, Exudados

17 Página 17 de 29 Bordetella Ex. nasofaríngeo (pernasal) (toma en el laboratorio) Respiratorio Aspirado nasofaríngeo E. coli O:157 H:7 Heces 4 Gastrointestinal Helicobacter Mucosa gástrica 10 Gastrointestinal Legionella s respiratorias 10 Respiratorio Micobacterias* Nocardia Ureaplasma, Micoplasma Biopsias, huesos, LCR, sangre, líquidos orgánicos, piel, orina, esputo, jugo gástrico.. s respiratorias, abscesos s urogenitales, Aspirado bronquial Negativos 80 Positivos Micobacterias Respiratorio, Exudados Respiratorio, Exudados, Urocultivos Vibrio cholerae Heces 4 Gastrointestinal Cultivo Hongos Hongos: levaduras s respiratorias, genitales y otras 7 Exudados, Hemocultivos, Hongos, Respiratorio Hongos: Miceliales s respiratorias y otras 21 Hongos Hongos dermatofitos* Pelo, piel, faneras Hongos Blastomyces dermatitidis, Cladophialophora bantiana, Coccidioides immitis, Histoplasma capsulatum, Paracoccidioides brasiliensis Otros s respiratorias Biopsias LCR Heces Hongos en relación con Centro Nacional de Microbiología Cultivo Parásitos Parásitos (larvas de nematodos) Parásitos (Amebas de vida libre) Heces 6 Parásitos s oculares Parásitos Parásitos (Trichomonas) s urogenitales Exudados

18 Página 18 de 29 Cultivo Virus Adenovirus s respiratorias, conjuntivales 15 Virus Citomegalovirus Sangre completa orina, respiratorias Virus Enterovirus (Echovirus, Coxsackie virus, Enterovirus, Poliovirus) Faríngea, heces, liq. pericárdico, LCR 15 Virus Herpes simplex 1 y 2 Frotis lesiones, líquido vesicular, muestras respiratorias. biopsia cerebral Virus Parainfluenza virus 1, 2 y 3 Asp. nasofaríngeo faríngeo 15 Virus Parotiditis virus Saliva, faríngeo 15 Virus Respiratorio sincitial virus Rinovirus Asp. nasofaríngeo, faríngeo Asp. nasofaríngeo, faríngeo Virus Virus Sarampión virus Faríngeo, orina 15 Virus Varicela-zoster virus Líquido vesicular LCR. 21 Virus Virus de la gripe (Influenza virus A y B)* Asp. Nasofaríngeo F. faríngeo 15 Virus 1.5 Detección de anticuerpos Detección de anticuerpos Bacterias Técnica Tipo de muestra Bartonella henselae IFI Suero 7 Serología Bartonella quintana IFI Suero 7 Serología Borrelia burgdorferii (Lyme) Borrelia burgdorferii (Lyme) Brucella ELISA Suero/LCR 7 Serologia Western-Blot Suero/LCR 7 Serologia Aglutinación, Coombs, Rosa de Bengala. Suero/LCR 3 Serología

19 Página 19 de 29 Técnica Tipo de muestra Chlamydia pneumoniae ELISA Suero 7 Serología Chlamydia psittaci ELISA Suero 7 Serología Coxiella burnetti (Fiebre Q fase I y fase II) IFI Suero 7 Serología Coxiella burnetti IgG e IgM ELISA Suero 7 Serología Legionella pneumophila (serogrupos 1 a 8) IFI Suero 7 Serología Rickettsia conorii(igg) IFI(IgG) Suero 4 Serología Treponema pallidum (no treponémicos) Treponema pallidum (treponémicos)* Treponema pallidum (treponémicos) Treponema pallidum (treponémicos) Yersinia enterocolitica (03 y 09 separadas) Yersinia pseudotuberculosis RPR, VDRL SueroLCR 3 Serología Ac totales (automatizada) FTA IgG Suero/LCR Suero Suero/LCR Suero 3 5 Serología Serología ELISA IgM Suero 7 Serología Aglutinación Suero 3 Serología Aglutinación Suero 3 Serología Detección de anticuerpos Parásitos Técnica Tipo de muestra Entamoeba histolytica IFI Suero 7 Serología Hidatidosis Echinococcus granulosus Hemaglutinación Suero 7 Serología Leishmania infantum IFI Suero 7 Serología Taenia solium (cisticercosis) ELISA Suero/LCR 10 Serología Toxoplasma gondii* IgG total automatizada Suero/LCR 3 Serología Toxoplasma gondii IgG IFI Suero/LCR 7 Serología Toxoplasma gondii* IgM Automatizada Suero 3 Serología Toxoplasma gondii Avidez Automatizada Suero 7 Serología Toxoplasma gondii IgA ELISA Suero 7 Serología Trichinella spiralis ELISA(IgG) Suero 10 Serología T.cruzi (Chagas) ICT Suero 7 Serología

20 Página 20 de 29 Técnica Tipo de muestra T.cruzi (Chagas) ELISA(IgG) Suero 7 Serología

21 Página 21 de 29 Detección de anticuerpos Virus Técnica Tipo de muestra Citomegalovirus* IgG Automatizada Suero 3 Serología Citomegalovirus* IgM Automatizada Suero 3 Serología Epstein Barr* IgM Automatizado Suero 3 Serología Epstein barr* IgG Automatizada Suero 3 Serología Epstein-Barr EBNA ELISA Suero 7 Serología Hepatitis A* IgM Automatizada Suero 3 Serología Hepatitis A* IgG Automatizada Suero 3 Serología Hepatitis B Diagnóstico* Automatizada Suero 3 Serología Hepatitis B Preoperat. Precat. Embarazo etc* Hepatitis B* Automatizada Suero 3 Serología Cuantificación post-vacuna automatizada Suero 3 Serología Hepatitis C* IgG automatizada Suero 3 Serología Hepatitis C Dot Blot (IgG Ac frente a proteínas) Suero 7 Serología Hepatitis D IgG o IgM ELISA Suero 10 Serología Herpes simple total* IgG Automatizado Suero 3 Serología Herpes simple total* IgM Automatizado Suero 3 Serología Herpes simple tipo 2 IgG (ELISA) Suero 7 Serología Herpes simple tipo 6 IgG (ELISA) Suero 7 Serología Herpes simple tipo 6 IgM (ELISA) Suero 7 Serología HTLV,1-2 IgG ELISA Suero Serología Parotiditis IgG (ELISA) Suero 7 Serología Parotiditis IgM ELISA Suero 7 Serología Parvovirus IgG IFI Suero 7 Serología Parvovirus IgM IFI Suero 7 Serología Rubéola* IgG automatizada Suero 3 Serología Rubéola* IgM automatizada Suero 3 Serología Sarampión IgG (ELISA) Suero 7 Serología Sarampión IgM ELISA Suero 7 Serología Varicela Zoster IgG (ELISA) Suero 7 Serología Varicela Zoster IgM (ELISA) Suero 7 Serología VIH 1,2,O* Automatizado Suero 3 Serología VIH( Ac frente a proteínas VIH-1+2) Western Blot (IgG) Suero 7 Serología VIH Antígeno* Semiautomatizada Suero 3 Serología VIH ( Ac frente a proteínas VIH-2) Western Blot (IgG) Suero 7 Serología

22 Página 22 de 29 Automatizada IFI: ELISA: WB (Western Blot): RPR VDRL: FTA IgG Técnica rápida: Quimioluminiscencia y derivados (electroquimioluminiscencia) Inmunofluorescencia Indirecta (manual) Enzimoinmunoensayo (manual) o semiautomatizada Ac frente a las proteínas específicas (semiautomatico) Ac no específicos de Treponema (manual) Inmunofluorescencia Indirecta con Ag treponémico (manual) Aglutinación en pocillo preparado comercial (manual)

23 Página 23 de 29 2 SERVICIO DE LABORATORIO DE REFERENCIA TÉCNICAS DIAGNÓSTICAS 2.1 Pruebas de identificación antigénica Técnica Tipo de muestra respuesta (días a partir de fecha de aislamiento) Neisseria meningitidis Aglutinación Aislado 1 Respiratorio Salmonella* Aglutinación Aislado 1 Gastrointestinal Shigella* Aglutinación Aislado 1 Gastrointestinal Yersinia enterocolitica Aglutinación Aislado 1 Gastrointestinal Streptococcus agalactiae Estreptococo betahemolítico (C, D, E, F,G) Mycobacterium tuberculosis complex* Aglutinación Aislado 1 Exudados Aglutinación Aislado 1 Todas Inmunocromatografía Aislado 1 Micobacterias 2. 2 Pruebas de identificación bioquímica u otros métodos Identificación bioquímica de bacterias* Identificación de bacterias mediante espectrometría de masas MALDI-TOF* Identificación de otras micobacterias distintas de M. tuberculosis (espectrometría de masas MALDI-TOF)* Identificación de hongos filamentosos (convencional) Identificación de hongos levaduriformes (convencional) Identificación de Entamoeba histolytica Identificación de virus por inmunofluorescencia directa, a partir de monocapa Cepa tras aislamiento respuesta (días) Aislado 2 3 Aislado, Hemocultivo positivo 1 Todas Todas Aislado 15 Micobacterias Aislado 15 Aislado 3 Parásito 1 Todas Todas Parásitos Aislado 1 Virus Identificación de virus por otras técnicas Aislado 21 Virus

24 Página 24 de Otras determinaciones Estudios epidemiológicos en Micobacterias Técnica RFLP, Spoligotyping Cepa tras aislamiento Área funcional Aislado 15 Micobacterias Identificación de Micobacterias PRA (PCR) Aislado Micobacterias 2. 4 Pruebas de sensibilidad antibiótica Antibiograma por difusión* Técnica Difusión disco placa Cepa tras aislamiento Aislado 2 Todas Detección de ß-lactamasa Disco Aislado 1 Todas de la CMI de antibióticos en caldo, método automatizado comercial* Microdilución Aislado 2 Todas de la CMI de antibióticos por difusión con tiras * de la sensibilidad de Nocardia por difusión con tiras de la sensibilidad de M. tuberculosis a antibacterianos de 1ª línea en medios líquidos fluorométricos (automatizada) de la CMI de antifúngicos por microdilución en caldo (manual o automatizada) (hongos levaduriformes) Difusión en placa Difusión en placa Medio líquido automatizado Aislado 2 Todas Área funcional Aislado 4 Respiratorio Aislado 10 Micobacterias Microdilución Aislado 3 Todas

25 Página 25 de SERVICIO DE INTERCONSULTAS Tipo respuesta (días) Preventivas 1 Todas Diagnósticas 1 Todas Terapéuticas 1 Todas Interpretación y valoración de los informes microbiológicos 1 Todas

26 Página 26 de SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCION NOSOCOMIAL 1. Colaboración en la implantación de programas de vigilancia y control de la infección hospitalaria. 2. Colaboración en el diseño, control y evaluación de la profilaxis antimicrobiana. 3. Colaboración en el diseño, control y evaluación de la política de antimicrobianos. 4. Colaboración en la detección e intervención en brotes epidémicos. 5. Detección y colaboración en la prevención de la aparición de microorganismos con resistencia de especial riesgo clínico. 6. Participación en la Comisión de Infecciones del Hospital. 7. Estudio de la prevalencia de la resistencia a los antimicrobianos en el hospital.

27 Página 27 de SERVICIO DE APOYO AL CONTROL DE LA INFECCION DE LA COMUNIDAD 1. Informes de aislamientos con significado epidemiológico. 2. Información de la prevalencia de la patología infecciosa en la comunidad. 3. Colaboración en la prevención de las enfermedades transmisibles en la comunidad. 4. Colaboración en la elaboración de protocolos.

28 Página 28 de OTROS SERVICIOS 1. Obtención de muestras especiales 2. Envío de muestras a laboratorios de referencia 3. Informes epidemiológicos 4. Informes estadísticos 5. Informes de gestión 6. Archivo y custodia de muestras biológicas y aislamientos microbianos

29 Página 29 de OTRAS ACTIVIDADES 1. Formación postgraduada - Residentes - Residentes de otros hospitales 2. Formación personal técnico 3. Programa de Formación Continuada 4. Participación institucional en Comisiones Clínicas hospitalarias 5. Línea de investigación consolidada en Mycobacterias con varios proyectos de investigación en desarrollo 6. Protocolos microbiológicos: De diseño propio Participación en estudios multicéntricos Protocolos clínicos hospitalarios