PROGRAMA DE GENÓMICA, PROTEÓMICA Y BIOINFORMÁTICA CATÁLOGO DE OFERTA DE SERVICIOS GENÓMICOS

CENTRO DE INVESTIGACIÓN DEL CÁNCER DE SALAMANCA RED TEMÁTICA COOPERATIVA DE CÁNCER PROGRAMA DE GENÓMICA, PROTEÓMICA Y BIOINFORMÁTICA CATÁLOGO DE OFERTA DE SERVICIOS GENÓMICOS (ÚLTIMA ACTUALIZACIÓN: 10 MARZO 2008) 1. Información General NOMBRE DE UNIDAD: Unidad de Genómica y Proteómica CENTRO DE LA RED: Centro de Investigación del Cáncer RESPONSABLE DEL GENERAL DE LA UNIDAD: Xosé R. Bustelo TELÉFONO DE CONTACTO: 923-294802 E-MAIL DE CONTACTO: xbustelo@usal.es RESPONSABLE DIRECTO DE LA UNIDAD: Encarna Fermiñán NOMBRE DEL TÉCNICO DE SERVICIO: Encarna Fermiñán E-MAIL DE CONTACTO: encarnaf@usal.es TELÉFONO DE CONTACTO: 923-294816 FAX DE CONTACTO: 923-294743 DIRECCIÓN PARA FACTURACIÓN: NOMBRE: Antonio Mata (amata@usal.es) INSTITUCIÓN: Fundación para la Investigación del Cáncer en la Univ de Salamanca (FICUS) CALLE: CIC, Univ. Salamanca-CSIC, Campus Unamuno s/n CÓDIGO POSTAL: 37007 LOCALIDAD: Salamanca DIRECCIÓN PARA EL ENVÍO DE MUESTRAS: NOMBRE: Encarna Fermiñán (Laboratorio 16) INSTITUCIÓN: Centro de Investigación del Cáncer CALLE: Univ. Salamanca-CSIC, Campus Unamuno s/n CÓDIGO POSTAL: 37007 LOCALIDAD: Salamanca 1

2. Descripción de Servicios Ofertados SERVICIOS OFERTADOS TÉCNICO RESPONSABLE TIEMPO ESTIMADO DE SERVICIO (EN DÍAS) PRECIO DEL SERVICIO PRECIO DEL SERVICIO(Clientes no RTICC) Secuenciación ADN Estela Hernández 2 6 /muestra 8 /muestra Análisis de RNA por BioAnalyzer Estela Hernández 1 3 /muestra 4 /muestra Chips de Affymetrix** Encarna Fermiñán 15 461 /muestra* 536 /muestra* Extracción ADN plasmídico,. BACs, PACs... en biorobot Purificación de productos de PCR en biorobot Impresión de microarrays Eva García 1 6 /muestra 8 /muestra Eva García 1 6 /muestra 8 /muestra Eva García 2 240 /run+ 40 /porta 300 /run+ 60 /porta CGH array (1Mb) Eva García 2 300 /chip 375 /chip Hibridación y lavado automatizado de chips vidrio Scanning de chips vidrio Ajuste de red y extracción de datos en crudo para imágenes de arrays de vidrio Eva García 2 25 /muestra 35 /muestra Eva García 1 12 /muestra 18 /muestra Eva García 2-3 50 /imagen 75 /imagen *Precio para arrays humanos. Para otras especies o tipos, consulten la tabla de precios en la página siguiente. **Consultar tipos de arrays en páginas siguientes 2

LISTADO DE PRODUCTOS Y PRECIOS DE ARRAYS DE AFFYMETRIX (Clientes RTICC) LISTADO DE PRODUCTOS Y PRECIOS DE ARRAYS DE AFFYMETRIX (Clientes no RTICC) Descripción Coste por Array Descripción Coste por Array Human Arrays Gene Chip Human Exon 1,0 ST Array 478,00 Gene Chip Human Gene 1,0 ST Array 381,00 Gene Chip Human Genome U133 Plus 2,0 461,00 Gene Chip Human Genome U133A 2,0 405,00 Mouse Arrays Gene Chip Mouse Exon 1,0 ST Array 478,00 Gene Chip Mouse Gene 1,0 ST Array 381,00 Gene Chip Mouse Genome 430 2,0 461,00 Gene Chip Mouse Genome 430A 2,0 405,00 Rat Arryas Gene Chip Rat Exon 1,0 ST Array 470,00 Gene Chip Rat Gene 1,0 ST Array 381,00 Gene Chip Rat Genome 230 2,0 Array 453,00 Arabidopsis Array Gene Chip Arabidopsis ATH1 Genome Array 421,00 Drosophila Array Gene Chip Drosophila Genome 2,0 Array 405,00 Test Array Gene Chip Test3 Array 324,00 Yeast Arrays Gene Chjp S.pombe Tiling 1,0FR Array 415,00 Gene Chip Yeast Genome 2,0 Array 365,00 Bovine Arrays Gene Chip Bovine Genome Array 405,00 Medicago Arrays Gene Chip Medicago Genome Array 461,00 Poplar Arrays Gene Chip Poplar Genome Array 461,00 Porcine Arrays Gene Chip Porcine Genome Array 405,00 Canine Arrays Gene Chip Canine Genome Array 453,00 Maize Arrays Gene Chip Maize Genome Array 405,00 Rhesus Macaque Arrays Gene Chip Rhesus Macaque Genome Array 461,00 Rice Arrays Gene Chip Rice Genome Array 461,00 Soy Arrays Gene Chip Soy Genome Array 461,00 Wheat Arrays Gene Chip Wheat Genome Array 461,00 V, Vinifera Arrays Gene Chip V. Vinifera Genome Array 405,00 Human Mapping 500K System GeneChip Human Mapping 250K Nsp Array 370,00 GeneChip Human Mapping 250K Sty Array 370,00 PCR Adicional 10,00 Servicios Adicionales Dos Rondas 65,00 Amplificación RNA (sin hibridar array) 280,58 3 Human Arrays Gene Chip Human Exon 1,0 ST Array 553,00 Gene Chip Human Gene 1,0 ST Array 456,00 Gene Chip Human Genome U133 Plus 2,0 536,00 Gene Chip Human Genome U133A 2,0 480,00 Mouse Arrays Gene Chip Mouse Exon 1,0 ST Array 553,00 Gene Chip Mouse Gene 1,0 ST Array 456,00 Gene Chip Mouse Genome 430 2,0 536,00 Gene Chip Mouse Genome 430A 2,0 480,00 Rat Arryas Gene Chip Rat Exon 1,0 ST Array 545,00 Gene Chip Rat Gene 1,0 ST Array 456,00 Gene Chip Rat Genome 230 2,0 Array 528,00 Arabidopsis Array Gene Chip Arabidopsis ATH1 Genome Array 496,00 Drosophila Array Gene Chip Drosophila Genome 2,0 Array 480,00 Test Array Gene Chip Test3 Array 399,00 Yeast Arrays Gene Chjp S.pombe Tiling 1,0FR Array 490,00 Gene Chip Yeast Genome 2,0 Array 440,00 Bovine Arrays Gene Chip Bovine Genome Array 480,00 Medicago Arrays Gene Chip Medicago Genome Array 536,00 Poplar Arrays Gene Chip Poplar Genome Array 536,00 Porcine Arrays Gene Chip Porcine Genome Array 480,00 Canine Arrays Gene Chip Canine Genome Array 528,00 Maize Arrays Gene Chip Maize Genome Array 480,00 Rhesus Macaque Arrays Gene Chip Rhesus Macaque Genome Array 536,00 Rice Arrays Gene Chip Rice Genome Array 536,00 Soy Arrays Gene Chip Soy Genome Array 536,00 Wheat Arrays Gene Chip Wheat Genome Array 536,00 V, Vinifera Arrays Gene Chip V. Vinifera Genome Array 480,00 Human Mapping 500K System GeneChip Human Mapping 250K Nsp Array 445,00 GeneChip Human Mapping 250K Sty Array 445,00 PCR Adicional 15,00 Servicios Adicionales Dos Rondas 100,00 Amplificación RNA (sin hibridar array) 355,58

3. Breve Descripción De Los Servicios Ofertados Secuenciación de ADN contenido en plásmidos o de fragmentos de PCR utilizando un secuenciador ABI-3130 xl (Applied Biosystems). Este sistema permite también el genotipado y análisis de SNPs cuyo servicio es ofertado en otro programa de la Red. El precio sólo incluye los primers universal y/o reverso. El sistema BioAnalyzer de Agilent permite un estudio cuantitativo y cualitativo de muestras de RNA o proteína. En el caso de RNA, da una estimación exacta de la concentración, grado de degradación y grado de contaminación (por ejemplo, de rrna en muestras de mrna). Extracción de ADNs y purificación de productos de PCR automatizada empleando el Biorobot 3000 de QIAGEN. Impresión de microarrays en portas de vidrio usando el arrayer MGII (Biorobotics). Las muestras a imprimir deben ser proporcionadas por el usuario. El servicio incluye la generación de ficheros para el posterior ajuste y análisis de datos. Hibridación y lavado automático de hasta 12 chips mediante el sistema robotizado hs4800pro de Tecan. El uso de este equipamiento da resultados muy reproducibles y backgrounds más reducidos y homogéneos que la hibridación manual. El usuario suministra los chips y las muestras marcadas. Se ofrece el escaneado de chips de vidrio hibridados usando el scanner GenePix4000B (Axon) e integración de datos posterior (ajuste de la red y extracción de datos en crudo) mediante el software GenePix 4.0. Uso del acgh 1Mb array para estudios de CGH. Este array consta de 10.500 spots (3500 BAC- PAC clones humanos, cada uno de ellos por triplicado). Los clones seleccionados para este array están espaciados a lo largo de todo el genoma a intervalos de 1Mb. Además como controles negativos se incluyen diversos clones de D. melonogaster. Servicios con tecnología Affymetrix. Éstos incluyen los siguientes módulos de trabajo: 1 Análisis completo de expresión génica diferencial utilizando el sistema GeneChip de Affymetrix en diferentes organismos: -Gene Chip Human Genome U133 Plus 2.0 -Gene Chip Mouse Genome 430 2.0 -Gene Chip Rat Genome 230 2.0 Array -Gene Chip Arabidopsis ATH1 Genome Array -Gene Chip Drosophila Genome 2.0 Array -Gene Chip Yeast Genome 2.0 Array Más información sobre estos chips se puede encontrar en www.affymetrix.com El cliente tendrá que suministrar el RNA total (5 µg, puede ser menos). Recomendamos el uso del kit RNAeasy (Qiagen Cat # 74104 o similar). No se recomienda la obtención de RNA usando el método de Trizol o similares (si se ha purificado con Trizol, se necesita una segunda purificación con RNAeasy). Nuestra unidad se encarga de todo lo demás. 4

El precio incluye: 1) Análisis de cantidad y calidad de los RNA suministrados usando el BioAnalyzer (Agilent). 2) Síntesis de cdna. 3) Síntesis de crna biotinilado. 4) Hibridación con chips humanos, de ratón u otros. 5) Integración informática de los resultados obtenidos. 6) El cliente recibe los datos tanto en papel como en CD en un formato compatible con su uso en otros programas informáticos de análisis genómicos. Los datos que se suministrarán contendrán el listado total de genes con su detección (Presencia/Ausencia) y su señal. El servicio tarda por lo general 2-3 semanas si el cliente avisa con antelación del suministro de las muestras. Éxito garantizado. El precio incluido es por el servicio completo. Si el investigador suministra ya el crna marcado, los precios serán reducidos (contactar con servicio para precios de servicios parciales). En el CIC, a través de su Unidad de Bioinformática, puede también realizar, a petición del usuario, análisis estadísticos y de anotación funcional de los resultados obtenidos. Más información sobre este servicio adicional, que no se incluye en el precio de los chips dados en este catálogo, puede encontrase en la página web: http://ubioinfo.cicancer.org 2 Otros servicios que se ofrecen en la Unidad del Genómica del CIC Gene Chip Human Mapping 250K NspI/StyI Arrays Arrays para realizar análisis de polimorfismos SNPs y de variación del número de copias (Copy Number). Más información sobre este chip puede encontrarse en: www.affymetrix.com Para este servicio, el usuario deberá suministar 500 ng de ADN genómico, no degradado y sin contaminantes, diluído en reduced TE-EDTA buffer. La mitad de esta muestra se empleará para la hibridación del NspI-array. La mitad restante se utilizará en el StyI-array. Según el método estándar en uso, 250 ng de ADN genómico son digeridos inicialmente con las enzimas de restricción StyI o NspI, posteriormente ligados a un adaptador común usando la DNA ligasa de T4 y amplificados por PCR. Los productos de PCR una vez purificados y normalizados, son fragmentados con DNAsaI y finalmente marcados usando desoxinucleotidil transferasa, para posteriormente hibridar en el correspondiente 250 K array. Al cliente se le entrega un informe en papel y un DVD con todos los ficheros obtenidos, incluyendo los generados mediante el uso del software GTYPE. NOTA IMPORTANTE: Dada la complejidad del estudio bioinformático que conllevan estos estudios, la Unidad de Genómica del CIC dará como servicio sólo los datos en crudo (es decir los archivos.cel). El usuario deberá realizar el estudio final en su laboratorio o, alternativamente, contactar con la Unidad de Bioinformática del CIC (http://ubioinfo.cicancer.org). Gene Array System - Gene Chip Human Gene 1.0 ST Array - Gene Chip Mouse Gene 1.0 ST Array - Gene Chip Rat Gene 1.0 ST Array Nueva versión (2007) de arrays para estudios de expresión diferencial más completo y económico que los clásicos GeneChip Arrays. Más información sobre estos chips puede encontrarse en la página web: www.affymetrix.com 5

El cliente debe suministrar el RNA Total (aproximadamente 5 μl a una concentración de 100 ng/μl) Recomendamos el uso del kit RNAeasy (Qiagen Cat # 74104 o similar). No se recomienda la obtención de RNA usando el método de Trizol o similares (si se ha purificado con Trizol, se necesita una segunda purificación con RNAeasy). Nuestra unidad se encarga de todo lo demás. El precio incluye: 1) Análisis de cantidad y calidad de los RNA suministrados usando el BioAnalyzer (Agilent). 2) Síntesis de cdna. 3) Síntesis de crna 4) Síntesis de la cadena DNA con sentido DNA SS (+) 5) Hidrólisis y limpieza del DNA SS(+) 6) Fragmentación del DNA SS(+) 7) Marcaje del DNA SS (+) fragmentado 8) Hibridación con chips humanos, de ratón u otros 9) Integración informática de los resultados obtenidos. 10) El cliente recibe los datos tanto en papel como en CD en un formato compatible con su uso en otros programas informáticos de análisis genómicos NOTA: Desde la Unidad de Genómica sólo podemos ofrecer los datos en crudo (es decir los archivos.cel). El usuario deberá realizar el estudio final en su laboratorio o, alternativamente, contactar con la Unidad de Bioinformática del CIC (http://ubioinfo.cicancer.org). Exon Array System - Gene Chip Human Exon 1.0 ST Array - Gene Chip Mouse Exon 1.0 ST Array - Gene Chip Rat Exon 1.0 ST Array Permiten analizar expresión diferencial y splicing alternativo de genes. Para más información ver www.affymetrix.com El cliente debe suministrar el RNA Total (aproximadamente 5 μl a una concentración de 400 ng/μl). Recomendamos el uso del kit RNAeasy (Qiagen Cat # 74104 o similar). No se recomienda la obtención de RNA usando el método de Trizol o similares (si se ha purificado con Trizol, se necesita una segunda purificación con RNAeasy). Nuestra unidad se encarga de todo lo demás. El precio incluye: 1) Análisis de cantidad y calidad de los RNA suministrados usando el BioAnalyzer (Agilent). 2) Reducción RNA ribosomal 3) Análisis del RNA reducido usando el BioAnalizer (Agilent). 4) Síntesis de cdna 5) Síntesis de crna 6) Síntesis de la cadena DNA con sentido DNA SS (+) 7) Hidrólisis y limpieza del DNA SS(+) 8) Fragmentación del DNA SS(+) 9) Marcaje del DNA SS (+) fragmentado 10) Hibridación con chips humanos, de ratón u otros 11) Integración informática de los resultados obtenidos. 12) El cliente recibe los datos tanto en papel como en CD en un formato compatible con su uso en otros programas informáticos de análisis genómicos NOTA IMPORTANTE: Desde la Unidad de Genómica sólo podemos ofrecer los datos en crudo (es decir los archivos.cel). 6

El usuario deberá realizar el estudio final en su laboratorio o, alternativamente, contactar con la Unidad de Bioinformática del CIC; http://ubioinfo.cicancer.org Tiling Array System - Gene Chip S.pombe Tiling 1.0 FR Array Arrays para la identificación de zonas promotoras reguladoras a nivel genómico mediante immunoprecipitación (ChIP-on-chip). Como cubren todo el genoma de la levadura S. pombe, también sirven para muchos otros tipos de estudios de hibridación a nivel del genoma completo. Más información en www.affymetrix.com El cliente debe suministrar el RNA Total( 7 µg, en 7µl) Recomendamos el uso del kit RNAeasy (Qiagen Cat # 74104 o similar). No se recomienda la obtención de RNA usando el método de Trizol o similares (si se ha purificado con Trizol, se necesita una segunda purificación con RNAeasy). Nuestra unidad se encarga de todo lo demás. El precio incluye: 1) Análisis de cantidad y calidad de los RNA suministrados usando el BioAnalyzer (Agilent). 2) Síntesis del cdna 3) Fragmentación del cdna 4) Marcaje del cdna fragmentado 5) Hibridación con chips humanos, de ratón u otros 6) Integración informática de los resultados obtenidos. 7) El cliente recibe los datos tanto en papel como en CD en un formato compatible con su uso en otros programas informáticos de análisis genómicos NOTA: Desde la Unidad de Genómica sólo podemos ofrecer los datos en crudo (es decir los archivos.cel). El usuario deberá realizar el estudio final en su laboratorio o, alternativamente, contactar con la Unidad de Bioinformática del CIC; http://ubioinfo.cicancer.org 7

CENTRO DE INVESTIGACIÓN DEL CÁNCER DE SALAMANCA RED NACIONAL DE CENTROS DE CÁNCER PROGRAMA DE GENÓMICA Y PROTEÓMICA CATÁLOGO DE OFERTA DE SERVICIOS PROTEÓMICOS I. INFORMACIÓN GENERAL: NOMBRE DE UNIDAD: Unidad de Genómica y Proteómica CENTRO DE LA RED: Centro de Investigación del Cáncer RESPONSABLE DEL GENERAL DE LA UNIDAD: Xosé R. Bustelo TELÉFONO DE CONTACTO: 923-29-4802 E-MAIL DE CONTACTO: xbustelo@usal.es RESPONSABLE DIRECTO DE LA UNIDAD: Xosé R. Bustelo NOMBRE DEL TÉCNICO DE SERVICIO: E-MAIL DE CONTACTO: nibarrola@usal.es TELÉFONO DE CONTACTO: 923-294817 FAX DE CONTACTO: 923-294743 DIRECCIÓN PARA FACTURACIÓN: NOMBRE: Antonio Mata (amata@usal.es) INSTITUCIÓN: Fundación para la Investigación del Cáncer en la Univ de Salamanca (FICUS) CALLE: CIC, Univ. Salamanca-CSIC, Campus Unamuno s/n CÓDIGO POSTAL: 37007 LOCALIDAD: Salamanca DIRECCIÓN PARA EL ENVÍO DE MUESTRAS: NOMBRE: (Laboratorio 17) INSTITUCIÓN: Centro de Investigación del Cáncer CALLE: Univ. Salamanca-CSIC, Campus Unamuno s/n CÓDIGO POSTAL: 37007 LOCALIDAD: Salamanca 6

II. CATÁLOGO DE SERVICIOS OFERTADOS: SERVICIOS OFERTADOS Isoelectroenfoque (1ª Dimensión, tira de 7 o 13 cm) Isoelectroenfoque (1ª Dimensión, tira de 18 cm) SDS-PAGE (2ª Dimensión, 16x14 cm) SDS-PAGE (2ª Dimensión, 26x22 cm) SDS-PAGE (gel, 10x8 cm) Tinción Fluorescencia (SYPRO Ruby, Pro-Q) gel, 10x8 cm Tinción Fluorescencia (SYPRO Ruby, Pro-Q) gel, 16x14 cm Tinción Plata (gel, 10x8 cm) Tinción Plata (gel, 16x14 cm) Tinción Plata (gel, 26x22 cm) Tinción Coomassie (gel, 10x8 cm) Tinción Coomassie (gel, 16x14 cm) Tinción Coomassie (gel, 26x22 cm) Adquisición de imágen (gel, 10x8 cm y 16x14 cm) Adquisición de imágen (gel, 26x22 cm) Análisis de Imagen ( /hora) 1 a 8 muestras 9 a 32 muestras 33 a 64 muestras 65 a 96 muestras NOMBRE DE TÉCNICO RESP. TIEMPO ESTIMADO DE SERVICIO (EN DÍAS) PRECIO DEL SERVICIO /muestra (IVA no incluido) 7 45 7 50 7 35 4 45 7 25 7 55 7 85 4 66 1 70 1 80 4 21 1 38 1 80 1 8 1 10 5 90 7-15 62 7-15 45 15-20 40 15-20 35 7

SERVICIOS OFERTADOS Desalación y concentración por Zip-tip Adquisición de Espectros y Análisis NOMBRE DE TÉCNICO RESP. TIEMPO ESTIMADO DE SERVICIO (EN DÍAS) 1 22 PRECIO DEL SERVICIO /muestra (IVA no incluido) 7 220 Identificación de proteínas en muestras de baja complejidad <5 proteínas 10 220 Identificación de proteínas en muestras de mediana complejidad <50 10 700 Identificación de proteínas en 2D LC MS/MS (2-5 fracciones) 10 340 Identificación de proteínas en 2D LC MS/MS (>5 fracciones) 10 330 Identificación de proteínas mediante nano ESI-MS/MS 15 220 Identificación de modificaciones postraduccionales 15 consultar Cuantificación Proteica consultar consultar Análisis MALDI-ToF (Determinación masa molecular) 7 40 Separación por HPLC 3 50 Uso de aparatos de electroforesis bidimensional 4 54 III. BREVE DESCRIPCIÓN DE LOS SERVICIOS OFERTADOS: 1.- Electroforesis Bidimensional: 1.1-Separación de proteínas en primera dimensión por punto isoelectrico usando el sistema Ettan-IPGPhor, Amersham. 1.2-Separación de proteínas por SDS-PAGE usando las unidades de electroforesis Hoefer SE 600 Ruby y Ettan Dalt-6, Amersham. 2.- Tinción Fijación y tinción de las muestras proteicas usando Coomassie, nitrato de plata, SYPRO Ruby, ProQ Diamond, etc. 3.- Adquisición de imágen Para geles teñidos con fluorocromos (SYPRO Ruby, ProQ Diamond) se dispone del scanner FLA-3000, Fuji,. Para la adquisición de imágenes de geles teñidos con nitrato de plata, Coomassie, etc., la unidad cuenta con un escáner Epson Perfection, Epson. 4.- Identificación proteica mediante huella peptídica 8

Recorte de manchas o bandas proteicas en geles manualmente o usando el robot picador Proteineersp (Bruker), seguido de digestión tríptica manual o automática con el robot digestor Proteineerdp (Bruker) e identificación usando el espectrómetro de masas MALDI-ToF, UltraFlex, Bruker. 5.- Zip-tip Desalación y concentración de digestiones trípticas mediante C18 6.-Análisis y procesamiento de imágen Usando el software Melanie 5.0 7.- Identificación de proteínas por ESI-TRAMPA ionica Los procedimientos incluyen digestión tríptica en solución, purificación y análisis de resultados. 7.1- Identificación de proteínas en muestras de baja <5 o mediana complejidad <30 proteínas: separación mediante cromatografía micro-capilar de fase reversa acoplado al espectrómetro de masas de trampa iónica. 7.2- Identificación de proteínas en muestras complejas > 30 mediante fraccionamiento previo por cromatografía de intercambio iónico seguido de desalación y separación mediante cromatografía micro-capilar de fase reversa 7.3- Se utilizará nano-esi, cuando exista gran cantidad de material, para identificar proteínas en muestras de muy baja complejidad, caracterizar modificaciones postraduccionales o realizar secuenciación de novo de una proteína. Se dispone de un sistema de LC masas con columna microcapilar de fase reversa C18 acoplada a LCQ-DECA XP, Thermo-Finnigan. 8.- Análisis de modificaciones postraduccionales Dependiendo del tipo de modificación el procedimiento a seguir será distinto. En el caso de fosforilación, se realizará una primera aproximación por análisis de huella peptídica. Los péptidos fosforilados se enriquecerán por cromatografía de afinidad a metales (Fe, Ti, Ga). 9.- Cuantificación proteica Dependiendo del tipo de cuantificación que se quiera realizar se llevará a cabo una aproximación diferente: 9.1-Cuantificación absoluta de una proteína mediante la introducción de una cantidad conocida de un péptido marcado isotópicamente similar a un péptido único de la proteína a cuantificar (AQUA). 9.2-Cuantificación relativa de una/s proteína mediante la cuantificación del marcaje metabólico con isótopos estables de aminoácidos (SILAC), marcaje isotópico con O18 o ICAT. 10.- Obtención de pesos moleculares de proteínas mediante espectrometría de masas La unidad dispone de un espectrómetro de masas MALDI-ToF, UltraFlex, Bruker 11.- Separación por HPLC 9

10 11.1-Separación de muestras proteicas 11.2-Fraccionamiento de digestiones trípticas de mezclas complejas de proteínas, normalmente como paso previo para la identificación por LC- MS/MS Se dispone de un sistema de HPLC Agilent 1100 series, Agilent