Informe final de proyecto Predicción de valores genéticos para producción de leche e introducción de nuevos caracteres del esquema de selección en ovino lechero Centro: NEIKER Participantes: Eva Ugarte (eugarte@neiker.net) Andrés Legarra, Josune Arranz, Ignacia Beltrán de Heredia Entidades participantes: CONFELAC, ARDIEKIN Año 2006 1
Predicción de valores genéticos para producción de leche e introducción de nuevos caracteres del esquema de selección en ovino lechero 1.- Introducción El principal objetivo de este rpoyecto era el de la Predicción de los valores genéticos de la población autóctona de ovino lechero de las razas Latxa y Carranzana de la CAPV y Navarra para los caracteres productivos (cantidad y composición) que sustentan el programa de mejora genética y selección de dicha población y el testaje de moruecos jóvenes. Para ello se dispuesieron una serie de objetivos más específicos tales como la optimización del modelo de evaluación, el aumento de la precisión en la estima de valores genéticos, la valoración genética para nuevos caracteres y la elaboración de un índice combinado 2.- Actividades más destacadas y resultados obtenidos Las actividades desarrolladas dentro de este proyecto se diferencian en dos grandes apartados: por un lado la realización de las evaluaciones genéticas y por otro las labores de investigación encaminadas a optimizar dichas evaluaciones y a elaborar un índice combinado de selección que incorporado dentro del programa de la raza Latxa permita obtener un mayor progreso teniendo en cuenta tanto los caracteres de cantidad como de calidad y de morfología mamaría. Evaluaciones genéticas a) Lactación tipo Se han realizado, todos los años, las evaluaciones genéticas para lactación tipo correspondientes a pre-campaña (mayo) y a final de campaña (setiembre). Dichas evaluaciones se realizan con toda la información disponible de forma que en las evaluaciones que se realizan cada año se incorporan también datos de años precedentes. Así, en la última evaluación realizada se trabajó con el número de datos que se detallan en la siguiente tabla: 2 Tabla 1: Valoración genética 2006. RAZA* Nº Lactaciones Nº lactaciones 2006 Machos (IA y MNC) Hembras Hembras datos LCN- 465603 18969 12808 192805 183515 EAE LCN-NA 105850 7311 453 41206 39285 LCR 195195 15465 801 76603 72855 CAR 24092 780 84 12326 11563 * LCN-EAE: Latxa Cara Negra de la Comunidad Autónoma del País Vasco; LCN-NA: Latxa Cara Negra de la Comunidada Foral de Navarra; LCR: Latxa Cara Rubia; CAR: carranzana
También de forma sistemática, todos los años se realiza un análisis de las tendencias genéticas. En la último análisis realizado a final de la campaña del 2006 se confirma que el programa de mejora genética de la raza Latxa es un programa ya consolidado que manifiesta un progreso sólido y continuado superior al 2, 5% anual. Los datos medios de progresos fenotípicos (producción) y genéticos se detallan en la siguiente tabla: Tabla 2: progresos fenotípicos y genéticos (1990-2006) PRODUCCIÓN GENÉTICA MEDIA ELITE MEDIA ELITE LCN-EAE 1,8 4,3 3,3 3,3 LCN-NA 1,6 3,3 3,1 3,3 LCR 1,8 4,5 3,4 4,0 LCN-EAE: Latxa Cara Negra de la Comunidad Autónoma del País Vasco; LCN-NA: Latxa Cara Negra de la Comunidada Foral de Navarra; LCR: Latxa Cara Rubia Dichos progresos tienen reflejo directo tanto en la producción de leche como en las medias de valores genéticos: Tabla 3: valores medios de lactación tipo y de valores genéticos. Campaña 2006. PRODUCCIÓN (año 2006) GENÉTICA (nacimientos 2005) MEDIA ELITE DIFER MEDIA ELITE DIFER LCN-EAE 152 181 29 27,3 31,5 4,2 LCN-NA 151 176 25 24,6 28,0 3,4 LCR 142 207 65 27,8 42,1 14,3 LCN-EAE: Latxa Cara Negra de la Comunidad Autónoma del País Vasco; LCN-NA: Latxa Cara Negra de la Comunidada Foral de Navarra; LCR: Latxa Cara Rubia b) Caracteres de composición En el año 2003 se inició con la valoración sistemática de los caracteres de composición ( Kg. y % de grasa y proteína). La metodología del control de rendimientos aplicada al control cualitativo (solo en un grupo de rebaños) no permite la valoración simultánea de caracteres de cantidad y composición para el total de machos testados para producción de leche. Este aspecto ha sido controlado de forma detallada ya que el objetivo del programa es que todos los machos testados dispongan de evaluación 3
genética tanto para cantidad como para calidad. En la última evaluación realizada, correspondiente al final de campaña de 2006 se trabajó con 33578 lactaciones correspondientes a 16540 ovejas de LCN-EAE, 16721 lactaciones de 8886 ovejas de LCR y 9486 lactaciones de 5537 ovejas de LCN-NA. El número de hembras evaluadas por primera vez fue de 3184, 1898 y 226 para LCN-EAE, LCR, LCN-NA respectivamente. El análisis de los datos fenotípicos ofrece medias 5,20 y 5,16 para % de grasa y % de proteína respectivamente para LCN-EAE. Para LCR los valores son 5,54 y 5,00 y para LCN-NA de 5,81 y 5,11. Estos datos confirma la necesidad de trabajar a nivel genético para los caracteres de composición ya que se observa la tendencia descendente tanto a nivel fenotípico : 7 6,5 6 5,5 LC N -EA E LC R LC N -N A 5 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 % de grasa 7 6,5 6 5,5 LCN-EAE LCR LCN-NA 5 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 % de proteína como genético: 1,5 1 Vg 0,5 0-0,5-1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 Año KG KP PG PP 4
En cuanto al número de machos valorados para caracteres de cantidad y calidad, a final de la campaña de 2006, en el caso de LCR, el 83 % de los machos con más de 5 hijas, fueron evaluados para ambos tipos de caracteres, en el caso de LCN-EAE, el 75 % y en el caso de LCN-NA también fueron evaluados el 74 %. c) Caracteres de morfología mamaria La evaluación genética sistemática de los caracteres de morfología mamaria empezó a realizarse en la campaña del 2004. Aunque se evalúan de forma sistemática los cuatro caracteres: longitud y tamaño de pezón, y profundidad e inserción de ubre, en el catálogo de sementales solo se incorpora la información relativa a inserción de ubre y verticalidad de pezón ya que estudios previos indicaron que eran precisamente estos caracteres los que eran mas perjudicados por la selección realizada sobre lactación tipo. Actualmente, esta evaluación genética, al igual que lo que ocurre para los caracteres de composición, se encuentra ya totalmente implantada. A final de la campaña de 2006 se utilizaron un total de 25423 hembras calificadas en LCN-EAE y 14908 en LCR. La raza LCAN-NA se ha incorporado más tarde al control de la morfología mamaria por lo que todavía no dispone de evaluaciones genéticas sistemáticas. El número total de animales evaluados ha sido de 23807 (22918 hembras y 889 machos) y de 12755 (12201 hembras y 554 machos) pata LCN-EAE y LCR respectivamente. En el catálogo se han publicado datos de 51 machos para LCN-EAE y de 59 para LCR. El análisis de las tendencias genética indica que la selección fenotípica realizada al seleccionar los machos par entrar al centro de selección mantiene estos caracteres en unos niveles mejores de los que se esperaría de la correlaciones genética existente entre los mismos y la producción de leche. Esto se debe probablemente a la selección indirecta que sobre estos caracteres se realiza cuando se seleccionan los machos jóvenes para ser introducidos en el centro de selección e inseminación artificial. Al efectuar esta selección también se evalúan las características de la ubre de la madre, eliminando aquellos animales procedentes de madres con mala morfología mamaria. La siguiente figura muestra las tendencias genéticas para los caracteres de inserción de ubre y verticalidad de pezón: 0,2 0,15 0,1 Inserción de ubre Verticalidad de pezón 0,05 0-0,05-0,1 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 5
Optimización del modelo de evaluación y elaboración de un índice combinado a) Cálculo directo de la fiabilidad de las estimaciones de los valores genéticos En la campaña de final de 2004, se procedió a cambiar los programas que estiman los valores genéticos para poder calcular las fiabilidades con las que se estiman dichos valores. Los programas que se utilizaron con anterioridad solo permitían una aproximación. b) Elaboración de un índice combinado Este objetivo no se ha cumplido en su totalidad debido fundamentalmente al cambio de responsabilidades del jefe de proyecto que asumió nuevas responsabilidades como jefe de Departamento y por la baja de Andrés Legarra que dejó NEIKER para incorporarse al INRA de Toulouse. Para la consecución de este objetivo es necesario abordar dos aspectos. Por un lado la estimación de los componentes de varianza de los diferentes tipos de caracteres y por otro el análisis de modelos test-day frente a modelos lactacionales. Es, este último aspecto el que no se ha realizado impidiendo elaborar una propuesta de índice combinado. Para la estima de parámetros genéticos entre los caracteres de composición y de cantidad se ha aplicado un análisis multivariado de 5 caracteres aplicando un modelo animal con efectos permanentes. La ecuación de los modelos utilizados se corresponden en cada caso con la ecuación del modelo utilizada para realizar las valoraciones genéticas. Los resultados se muestran en las siguientes tablas: Tabla 4: Heredabilidades y correlaciones genéticas (encima) y fenotípicas (debajo) entre los caracteres de leche Leche(l) Grasa (kg.) Proteína (kg.) Grasa (%) Proteína (%) Leche(l) 0 20 0 88 0 93-0 45-0 51 Grasa (kg.) 0 85 0 16 0 88 0 02-0 36 Proteína (kg.) 0 96 0 84 0 18-0 28-0 15 Grasa (%) -0 21 0 29-0 14 0 14 0 41 Proteína (%) -0 25-0 12 0 02 0 25 0 38 6
Tabla 5: Heredabilidades y correlaciones genéticas (encima) y fenotípicas (debajo) entre producción de leche y caracteres de ubre Prof. U Inserc. U Vert. P Long. P Leche (l) Prof. U* 0.26-0.58-0.42-0.05 0.43 Inserc. U* 0.03 0.26 0.34 0.05 0.10 Vert. P* -0.26 0.33 0.40 0.31-0.25 Long. P* 0.16 0.07 0.25 0.40-0.10 Leche (l) 0.47 0.26-0.13 0.06 0.21 *prof. U: profundidad de ubre; Inserc. U: inserción de ubre; Vert. P: verticalidad de pezón; Long. longitud pezón Analizando los resultados obtenidos es evidencia la necesidad de incluir los caracteres de composición dentro del criterio de selección. El no hacerlo llevará a un empeoramiento de la calidad de la eche producida que se traducirá, a largo plazo, en una disminución del rendimiento quesero. Este aspecto también ha sido constatado al analizar las tendencias genéticas de los caracteres de composición. En cuanto a los caracteres de morfología mamaria, y como se ha mencionado anteriormente, la sección fenotípica que se realiza actualmente permitiría mantener en los niveles actuales estos caracteres impidiendo su empeoramiento. Publicaciones Científicas Internacionales Ugarte E, Legarra A. (2003). Scientific background of the selection program in the Latxa breed. Cahiers Options Méditerréennes. Vol, A55: 91-98 Ugarte E, Arrese F, Legarra A. (2003). Organisational changes in the latxa breeding programme to introduce selection for milk quality. Cahiers Options Méditerréennes. Vol A55: 141-146 Legarra, A., López Romero, P.; Ugarte, E.2005. Bayesian model of contemporry groups for BLUP genetic evaluation in Latxa dairy sheep. Livestock Production Science, 93: 205-212 Legarra, A., ; Ugarte, E. 2005. Genetic parameter of Udder traits, somatic cell Score and Milk Yield in Latxa Sheep. Journal Dairy Science, 88: 2238-2245 Alfonso, L.; Parada, A.; Legarra, A., Ugarte, E. Arana, A. 2006. Effects on genetic variability of selection against scrapie sensitivity in the Latxa Black-Faced sheep. Genetic selection evolution, 38(5): 495-512. 7
A. Legarra, M. Ramón, E. Ugarte, M.D. Pérez-Guzmán. 2007. Economic weights of fertility, prolificacy, milk yield and longevity in dairy sheep. Aceptado en Animal Journal. A. Legarra, M. Ramón, E. Ugarte, M.D. Pérez-Guzmán, J.Arranz. 2007. Economic weights of somatic cell score in dairy sheep. Aceptado en Animal Journal. Publicaciones Científicas Nacionales Ugarte, E.; Arranz, J. Arrese, F. 2003. Parámetros genéticos para el recuento de células somáticas en la raza Latxa. ITEA. X Jornadas de Producción Animal. Vol. Extra Nº 24: 510-512 Legarra A, Ugarte E & Arrese F. 2003. Análisis del progreso genético en el esquema de mejora de la raza Latxa. ITEA. ITEA, 99ª (3): 192-201. 8