VAL GENETICS. Green Biotechnology. Especialistas en Vida Vegetal

Transcripción

1 VAL GENETICS Green Biotechnology Especialistas en Vida Vegetal CATÁLOGO DE SERVICIOS 2018

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3 Ciencia al servicio de la agricultura ValGenetics, laboratorio autorizado por la Conselleria de Agricultura, Medio Ambiente, Cambio Climático y Desarrollo Rural (Generalitat Valenciana) para el análisis de patógenos presentes, emergentes y de cuarentena, apostando por la calidad ofrece: Servicios y análisis genéticos exclusivos y únicos amoldados al mercado agrícola y biotecnológico de plantas. Equipo de técnicos e investigadores con gran experiencia científica. Desarrollos propios en I+D+i. Servicio de peritaje y asesoramiento técnico. Tratamiento eficaz y eficiente de las muestras. Trato personalizado y confidencial. Presupuesto adaptado.

4 ValGenetics está desarrollando tecnología de aplicación agraria constantemente. En nuestras instalaciones, situadas en el Parc Científic de la Universitat de València, realizamos: Análisis fitopatológicos mediante técnicas moleculares e inmunológicas. Identificación de microorganismos mediante taxonomía molecular. Análisis por secuenciación masiva de la microbiota en suelo, planta o agua. Ensayos de poder patógeno. Estudios de evaluación in vitro de fungicidas y bactericidas. Secuenciación masiva y estudios bioinformáticos. Análisis genéticos dirigidos a la diferenciación e identificación varietal. Mejora de cultivos con la obtención de nuevas variedades. Cultivo in vitro de plantas. Rejuvenecimiento y micropropagación. Saneamiento de plantas madre siguiendo los esquemas de certificación normalizados. Pruebas de germinación de semillas. Estudios de ploidía. Obtención de plantas triploides. Ensayos de enraizamiento de plantas. Transformación genética. Desarrollo de productos, tecnología y proyectos I+D+i a la carta.

5 ÁREA FITOPATOLOGÍA 1.1 Servicio de diagnóstico fitopatológico ValGenetics dispone de una amplia gama de plataformas diagnósticas. Aplicando los protocolos de la normativa española o comunitaria (OEPP/EPPO), basados en métodos moleculares ( PCR, PCR a tiempo real, Bio-PCR, Multiplex-PCR ) o inmunológicos (ELISA, inmunoimpresión-elisa, inmunofluorescencia) y siguiendo las normativas de calidad ISO 9001 y 17025, se pueden detectar e identificar los siguientes virus, viroides, bacterias, fitoplasmas, hongos y oomycetes: CULTIVO AFECTADO ALCACHOFAS ALIÁCEAS APIÁCEAS BRASSICAS CEREALES CÍTRICOS CUCURBITÁCEAS ESPÁRRAGO FRESA FRUTALES DE HUESO FRUTALES DE PEPITA FRUTOS ROJOS FRUTOS SECOS HIGOS HORTÍCOLAS DE HOJA KIWI LEGUMINOSAS MANGO OLIVO ORNAMENTALES SOLANÁCEAS VID VIRUS Alfalfa mosaic virus Apple chlorotic leaf spot virus Apple mosaic virus Arabis mosaic virus Cherry leaf roll virus Chrysanthemum stunt viroid Citrus bark cracking viroid Citrus bent leaf viroid Citrus dwarfing viroid Citrus exocortis viroid Citrus leaf blotch virus Citrus psoriasis virus Citrus tristeza virus Citrus variegation virus Citrus vein enation woody-gall virus Cucumber green mottle mosaic virus Cucumber leaf spot virus Cucumber mosaic virus Cucumber vein yellowing virus Cucurbit yellow stunting disorder virus Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor, repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate, albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso, grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas (berenjena, patata, pimiento, tomate).

6 CULTIVO AFECTADO ALCACHOFAS ALIÁCEAS APIÁCEAS BRASSICAS CEREALES CÍTRICOS CUCURBITÁCEAS ESPÁRRAGO FRESA FRUTALES DE HUESO FRUTALES DE PEPITA FRUTOS ROJOS FRUTOS SECOS HIGOS HORTÍCOLAS DE HOJA KIWI LEGUMINOSAS MANGO OLIVO ORNAMENTALES SOLANÁCEAS VID Grapevine fanleaf virus Grapevine fleck virus Grapevine leafroll associated virus I Grapevine leafroll associated virus III Grapevine virus A Grapevine virus B Hop stunt viroid Iris yellow spot virus Leek yellow stripe virus Lettuce mosaic virus Lettuce yellow mosaic virus Melon necrotic spot virus Moroccan watermelon mosaic virus Onion yellow dwarf virus Papaya ringspot virus Peach latent viroid Pepino mosaic virus Pepper mild mottle virus Pepper vein yellow virus Plum pox virus Potato spindle tuber viroid Potato Y virus Prune dwarf virus Prunus necrotic ringspot virus Raspberry bushy dwarf virus Raspberry ringspot virus Shallot latent virus Squash mosaic virus Strawberry latent ringspot virus Strawberry mild yellow edge virus Tobacco mosaic virus Tobacco rattle virus Tobacco ringspot virus Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor, repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate, albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso, grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas (berenjena, patata, pimiento, tomate).

7 CULTIVO AFECTADO ALCACHOFAS ALIÁCEAS APIÁCEAS BRASSICAS CEREALES CÍTRICOS CUCURBITÁCEAS ESPÁRRAGO FRESA FRUTALES DE HUESO FRUTALES DE PEPITA FRUTOS ROJOS FRUTOS SECOS HIGOS HORTÍCOLAS DE HOJA KIWI LEGUMINOSAS MANGO OLIVO ORNAMENTALES SOLANÁCEAS VID Tomato apex necrosis virus Tomato black ring virus Tomato bunchy top virus Tomato chlorosis virus Tomato leaf curl New Delhi virus Tomato mosaic virus Tomato ringspot virus Tomato spotted wilt virus Tomato torrado spp Tomato yellow leaf curl virus Watermelon mosaic virus Zucchini yellow mosaic virus BACTERIAS Y FITOPLASMAS Acidovorax citrulli Agrobacterium rubi Agrobacterium tumefaciens Agrobacterium vitis Aster yellows MLO Candidatus liberibacter spp. Candidatus liberibacter solanacearum Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis Erwinia amylovora Fitoplasma spp. Pseudomonas spp. Pseudomonas savastanoi pv. nerii Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi Pseudomonas syringae pv. Actinidiae Pseudomonas syringae pv. Aesculi Ralstonia solanacearum Rhodococcus fascians Spiroplasma citri (Stubborn) Xanthomonas spp. Aliáceas (ajo, cebolla, chalote, puerro); Apiáceas (apio, eneldo, hinojo, perejil, zanahoria); Brassicas (col, col de bruselas, coliflor, repollo); Cereales (cebada, centeno, maíz, trigo); Cucurbitáceas (calabaza, melón, pepino, sandía); Frutales de hueso (aguacate, albaricoque, cereza, ciruelo, melocotón); Frutales de pepita (manzana, membrillo, pera); Frutos rojos (arándano, frambueso, grosella); Hortícolas de hoja (acelgas, espinacas, lechuga, albahaca); Leguminosas (guisante, judía, lenteja); Solanáceas (berenjena, patata, pimiento, tomate).

8 CULTIVO AFECTADO ALCACHOFAS ALIÁCEAS APIÁCEAS BRASSICAS CEREALES CÍTRICOS CUCURBITÁCEAS ESPÁRRAGO FRESA FRUTALES DE HUESO FRUTALES DE PEPITA FRUTOS ROJOS FRUTOS SECOS HIGOS HORTÍCOLAS DE HOJA KIWI LEGUMINOSAS MANGO OLIVO ORNAMENTALES SOLANÁCEAS VID Xanthomonas arborícola pv. pruni Xanthomonas campestris pv. campestris Xanthomonas campestris pv. vesicatoria Xanthomonas citri subsp.citri Xylella fastidiosa Xylophilus ampelinus HONGOS Y OOMYCETES Alternaria spp. Colletotrichum spp. Didymella bryoniae Eutypa lata Fusarium graminearum Fusarium oxysporum Hongos de madera en vid Hongos productores de micotoxinas Macrophomina phaseolina Monilinia fructigena Phytophthora spp. Verticillium dahliae Rhizoctonia solani Rosellinia necatrix Stemphylium vesicarium Las tarifas varían dependiendo del número de muestras, patógeno analizado y la técnica de diagnóstico. Para consultar nuestros precios, tipos de análisis y bioensayos o la detección de patógenos no detallados en este catálogo, contáctenos en los teléfonos o o vía a valgenetics@valgenetics.com

9 1. 2 Desarrollo de metodologías de detección de patógenos vegetales Ofrecemos puesta a punto de metodologías de detección de patógenos ( PCR, PCR a tiempo real, BIO-PCR, Multiplex PCR, High Resolution Melting HRM, inmunoimpresión- ELISA ) ajustadas a las necesidades de las empresas agroalimentarias o biotecnológicas. 1.3 Servicio de evaluación in vitro de fungicidas y bactericidas Realizamos la determinación in vitro del potencial de substancias químicas, extractos vegetales o microorganismos antagonistas para el control de hongos y bacterias Ensayos de patogenicidad y test de resistencia a patógenos Desarrollamos estudios de patogenicidad o de resistencia a hongos, bacterias y virus en planta en condiciones controladas. Las plantas o semillas inoculadas se cultivan en sustratos estériles para posteriormente analizar la aparición de síntomas y el contenido de patógenos mediante técnicas moleculares Detección de células viables de microorganismos Disponemos de tecnologías que permiten la detección de células viables de microorganismos patógenos y no patógenos mediante técnicas de ADN, lo que aúna la especificidad y sensibilidad de las técnicas basadas en la detección de ADN con la funcionalidad de detectar solamente ADN que procede de células vivas Diagnóstico absoluto mediante taxonomía molecular Aplicamos la taxonomía molecular (análisis bioinformático de la secuencia del gen del ARNr 16S para bacterias o del gen ARNr 18S (ITS) para hongos) mediante la secuenciación masiva de todos los microorganismos componentes de una muestra. Estos estudios se aplican a la certificación de la ausencia de patógenos en plantas madre, estudios de la composición de la microbiota o análisis de la variación de la microbiota cuando se aplican biocidas o fertilizantes Diagnóstico específico de variantes de una especie viral o microbiana Realizamos el genotipado de cepas, razas o variantes genéticos de una misma especie viral o microbiana, diagnosticando diferencialmente la variante patogénica mediante análisis genéticos altamente específicos.

10 ÁREA GENÉTICA Genética Vegetal 2. 1 Identificación y diferenciación varietal Obtenemos marcadores moleculares específicos para especies y variedades de plantas y los empleamos para detectar polimorfismos a nivel de ADN, permitiendo la identificación varietal de forma precisa y la determinación de pureza varietal en semillas Asistencia en proyectos de mejora vegetal Ofrecemos asesoramiento y desarrollo de marcadores moleculares proporcionando un servicio completo de genotipado de las nuevas variedades de plantas. La huella digital de ADN permite la protección de los derechos del obtentor Obtención de nuevas variedades mediante irradiación de tejidos vegetales El uso de radiaciones ionizantes aumenta la variabilidad, lo que puede estimular rasgos agronómicos de interés en programas de mejora genética para la obtención de nuevas variedades vegetales. Implementamos el proyecto de mejora vegetal completo.

11 Genética Microbiana 3. 1 Identificación de hongos, bacterias y virus por taxonomía molecular La identificación del patógeno se lleva a cabo mediante la secuenciación tipo Sanger o tipo metagenómica de un fragmento de ADN o ARN. Igualmente, se realizan análisis genómicos de microorganismos empleando la secuenciación masiva ( Plataforma MiSeq o NextSeq de Illumina ) Caracterización de comunidades microbianas de muestras complejas Todos los microorganismos presentes en muestras de suelo, agua o cultivos vegetales enfermos se pueden identificar de forma conjunta en un único análisis mediante la secuenciación masiva de todo el ADN presente en la muestra y posterior análisis bioinformático. De este modo se pueden determinar las especies de microorganismos patológicos y beneficiosos, así como la concentración de los mismos en la muestra. ÁREA BIOTECNOLOGÍA VEGETAL 4. 1 Saneamiento y propagación El saneamiento in vitro de plantas madre de variedades vegetales seleccionadas permite la recuperación y posterior propagación de plantas sanas, libres de patógenos (virus, bacterias, hongos), los cuales causan una reducción del vigor y de la producción del cultivo.

12 CULTIVO SERVICIO Saneamiento Propagación Adelfa (Nerium oleander) X X PLAZO DE ENTREGA Chufa (Cyperus esculentus) X X Cítricos (Citrus) X X Dracaena (Dracaena, Cordyline) X X Fresa (Fragaria sp.) X X Frambuesa (Rubus idaeus) X X Granado (Punica granatum) X X Kiwi (Actinidia deliciosa) X X De 6 meses a 1 año (consultar en cada caso concreto) Planta crasa (Crassulaceae, Portulacaceae ) X X Vid (Vitis vinifera) X X Zarzamora (Rubus sp.) X X 4. 2 Ensayos de viabilidad in vitro En ciertos casos, es conveniente plantear ensayos iniciales in vitro para establecer la viabilidad de proyectos más amplios con determinadas especies vegetales. Esto permite acotar las condiciones de cultivo y alcanzar con mayor facilidad el objetivo planteado por el cliente Pruebas de germinación Analizamos la calidad de los lotes de semillas mediante pruebas de germinación ex vitro o in vitro, para determinar el vigor, la pureza y la calidad de la semilla de cada lote, según normativa ISTA Rescate de embriones En el caso de semillas con bajas posibilidades de germinación ex vitro o para la recuperación de todos los embriones de semillas poliembriónicas, realizamos el rescate y germinación de embriones individualizados in vitro Ensayos de microinjerto Mediante ensayos in vitro de microinjerto podemos comprobar la compatibilidad en el injerto patrón-variedad y además acelerar o incluso abaratar la obtención de planta.

13 4. 6 Ensayos de enraizamiento En determinados genotipos puede resultar necesario realizar una propagación de planta por enraizamiento in vitro, por ser inviable la propagación vegetativa o la proagación por semilla Análisis de la viabilidad del polen Podemos evaluar el porcentaje de viabilidad del polen mediantes distintas técnicas. Además, esta metodología se puede aplicar en programas de mejora genética dirigida a obtención de frutas sin semilla, ya que la generación de semillas se puede valorar analizando el polen antes de que la variedad fructifique, acelerando el proceso de análisis en invernadero Análisis de ploidía La determinación precoz de la ploidía mediante citometría de flujo permite identificar, en programas de mejora de plantas, los individuos con diferente grado de ploidía Transformación genética La transformación genética de plantas consiste en la transferencia de genes foráneos al genoma de una especie vegetal determinada. Esta técnica es útil para el estudio funcional de genes específicos o para la producción estable de metabolitos o proteínas en planta. ValGenetics dispone de la autorización oficial para el uso confinado de OMG, que le permite implementar la mejora genética de plantas.

14 ÁREA PROYECTOS I+D+i 5. Servicios I+D+i a la carta Acometemos proyectos de investigación y desarrollo empleando o combinando las técnicas disponibles en nuestros servicios de diagnóstico fitopatológico, taxonomía molecular, genética, biotecnología y cultivo de tejidos de plantas. Implementamos proyectos aplicados a la carta, exclusivos y adaptados a las necesidades de los clientes, con resultados rápidos y fiables a precios competitivos. El equipo científico de ValGenetics cuenta con más de 25 años de experiencia científica en el campo de la biotecnología de plantas, genética y el diagnóstico y control de los patógenos vegetales. Además, disponemos de un grupo interdisciplinar de asesores científicos internacionales. Nuestros laboratorios disponen de medios técnicos para el manejo de metodologías de investigación científica, desde las clásicas de análisis del material genético y cultivo de tejidos de plantas hasta las más punteras de genómica (secuenciación masiva), transcriptómica y proteómica, además de la expresión de sustancias de interés en plantas o edición de genomas. Así ofrecemos: Implementar proyectos adaptados a la problemática agraria planteada y adaptados a las necesidades del cliente. Posibilidad de cubrir todos los aspectos del control de patógenos y plagas desde el diagnóstico del patógeno a la obtención de plantas madres sanas o la protección del obtentor de nuevas variedades de planta.

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16 VALGENETICS S.L. PARC CIENTÍFIC UNIVERSITAT DE VALÈNCIA. Centro Universitario Empresarial (CUE), Edificio 3. Catedrático Agustín Escardino, Paterna (Valencia). Spain. Tel ; Especialistas en Vida Vegetal Laboratorio autorizado por el Servicio de Sanidad Vegetal de la Conselleria de Presidencia y Agricultura, Pesca y Alimentación para las actividades amparadas por el RD 58/2005. ValGenetics dispone de la autorización oficial de la Conselleria de Agricultura Medio Ambiente, Cambio Climático y Desarrollo Rural para el uso confinado de OMG expedida por el Comité Valenciano de Control de OMG.