SÍLABO DE MICROBIOLOGÍA CLÍNICA Y SANITARIA

Transcripción

1 SÍLABO DE MICROBIOLOGÍA CLÍNICA Y SANITARIA I. DATOS GENERALES CÓDIGO CARÁCTER A0078 Obligatorio CRÉDITOS 4 PERIODO ACADÉMICO 2016 PRERREQUISITO Bacteriología HORAS Teóricas: 2 Prácticas: 4 II. SUMILLA DE LA ASIGNATURA La asignatura es de naturaleza teórico práctico; corresponde al área de especialidad. Tiene el propósito de aplicar y afianzar los conocimientos, habilidades y destrezas en el manejo de muestras clínicas, cuyos agentes etiológicos son los diversos grupos microbianos como bacterias, hongos, virus y parásitos. La segunda parte es la sanitaria, que está orientada a formar en el estudiante una cultura de conservación de un ambiente inócuo, libre de contaminación y/o alteración, tratando de prevenir o minimizar algún daño para la salud del hombre y los seres vivos, donde el agua y los alimentos juegan un papel importante en la transmisión de agentes microbianos causales de enfermedades infectocontagiosas, dando importancia a los procesos de tratamiento de aguas residuales, de desechos hospitalarios y domésticos y a la calidad microbiológica y seguridad de los alimentos y el agua. La asignatura contiene: Microorganismos patógenos en alimentos Microbiología del agua y del ambiente Urocultivos, Infección del tracto urinario Coprocultivos, Infección intestinal aguda y crónica diagnostico microbiológico de muestras de sangre, médula ósea, infecciones uretrales y vaginales diagnostico microbiológico de muestras del tracto respiratorio superior e inferior. Pruebas de susceptilibilidad e identificación automtizadas. III. COMPETENCIA GENERAL: Aplicar los conocimientos básicos de microbiología sanitaria características de los patologías producidos por los microorganismo más comunes a través de análisis de casos clínicos y para su determinación e identificación en el laboratorio, en el campo de laboratorio y en laboratorio de urgencia y emergencia ESPECIFICAS: Conocer las características de los microorganismos y diagnosticar los más relevantes, a través de análisis de casos clínicos. Aplicar los conocimientos de microbiología, bioquímica, genética e inmunología para su identificación en el laboratorio, a través de análisis de casos clínicos.

2 IV. ORGANIZACIÓN DE LOS APRENDIZAJES UNIDAD CONOCIMIENTOS PROCEDIMIENTOS ACTITUDES Generalidades del curso. Concepto de Microbiota Desarrolla técnicas, habilidades y Trabaja en equipo. del hombre: Ventajas y desventajas. El proceso de destrezas a través de la descripción e Desarrolla espíritu infección. Factores de virulencia microbiana. Fase Pre interpretación de los resultados crítico investigando analítica de un laboratorio de Microbiología Clínica: obtenidos en el laboratorio nuevas técnicas Obtención, criterios de rechazo de muestras y microbiológico para Fase Pre- Analítica. microbiológicas. procesamiento inicial de las muestras clínicas. Reconoce la importancia del transporte Participa Creación y se redacción del Manual de Procedimientos de muestras. Criterios de aceptación y activamente en de Toma de muestras en Microbiología Clínica rechazo de las muestras. (MAPROS). Práctica 1: Fase Pre- Analítica en Demostrará Seminario 1: Grupo 1 de práctica. Microbiología Clínica. I Agentes antimicrobianos y quimioterapia. Principios generales de la terapéutica anti-infecciosa. Toxicidad selectiva. Criterios microbiológicos y farmacocinéticos en la elección del antimicrobiano. Antimicrobianos de síntesis. Agentes antibacterianos: clasificación, modo de acción y espectro. Antibiograma. Principios, procedimientos y QC: Evaluadores de Métodos de Inhibición de Concentración Mínima Inhibitorias. Lectura interpretada del antibiograma: Fundamentos, beneficios y limitaciones. Identificación bacteriana Seminario 2: Grupo 2 de práctica. Resistencia Bacteriana. Conceptos básicos. Tipos de Resistencia Bacteriana: Intrínseca y Extrínseca. Mecanismos de Resistencia Bacteriana: Disminución de la Captación del Antibiótico, Remoción del Medicamento de la Célula, Inactivación o Destrucción del Agente Antimicrobiano Mediante Actividad Enzimática: ß lactamasas de espectro extendido (BLEES), Cefalosporinasas Mediadas Cromosómicamente. Lectura interpretada del antibiograma y detección de BLEEs por disco difusión. Desarrolla técnicas, habilidades y destrezas en el laboratorio microbiológico para Agentes antimicrobianos y quimioterapia. Realiza con destreza antibiogramas en base a cepas aisladas previamente conocidas. Realiza la interpretación de resultados de la práctica anterior. Práctica 2: Agentes antimicrobianos y quimioterapia. Desarrolla habilidades y destrezas en el laboratorio microbiológico para identificar Resistencias bacterianas en un antibiograma en base a cepas aisladas previamente conocidas. Realiza la interpretación de resultados de la práctica anterior Práctica 3: Identificación de Fenotipos de resistencia bacteriana. materiales equipos Laboratorio y del Trabaja en equipo. Desarrolla espíritu crítico investigando nuevas técnicas microbiológicas. Participa activamente en Demostrará materiales y equipos del Laboratorio.

3 II Seminario 3: Grupo 3 de práctica Infecciones de las vías respiratorias inferiores y superiores. Causas de infección, bacterias saprofitas y patógenas. Agentes etiológicos más frecuentes. Toma de muestra en vías respiratorias altas y bajas. Muestras clínicas. Diagnóstico microbiológico. Prevención y tratamiento. Microorganismos de interés clínico en IRAs: Staphylococcus sp, Streptococcus sp, Haemophylus influenzae, Bordetella pertusis, C. difteriae, Neisseria meningitidis, Klebsiella neumoniae, Micoplasma pneumoniae, micosis pulmonar. Informe de resultados. Seminario 4: Grupo 1 de práctica. Infecciones de las vías urinarias. Infecciones del aparato urinario. Causas de infección, bacterias saprofitas y patógenas. Infecciones endógenas. Enfermedades de transmisión sexual. Agentes etiológicos más frecuentes. Técnicas de toma de muestra de secreciones y úlceras genitales. Muestras clínicas. Diagnóstico microbiológico. Prevención y tratamiento. Informes e interpretación de Urocultivos. Seminario 5: Grupo 2 de práctica Infecciones de las vías genitales. Microorganismos de importancia clínica en ITS: Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis, Cándida albicans, Gardnerella vaginalis, Espiroquetas y bacterias espiriladas, Treponema pallidum, diagnóstico y tratamiento, Chlamydia trachomatis, Micoplasma y ureaplasma, Haemóphylus ducrey. Herpes virus. Seminario 6: Grupo 3 de práctica Infecciones de las vías gastrointestinales. Microbiota normal y patógena en el intestino, Infección del tracto intestinal, mecanismo de acción. Infecciones Desarrolla la destreza de realizar siembras de microorganismos de las vías respiratorias. Realiza siembras, recuento de colonias, métodos de aislamiento e identificación y antibiogramas para muestras de Hisopado faríngeo. Realiza la interpretación de resultados de la práctica anterior. Práctica 4: Estudio microbiológico de un exudado faríngeo. Desarrolla la destreza de realizar siembras de muestras de las vías urinarias. Realiza siembras, métodos de aislamiento, recuento de colonias e identificación de enterobacterias más frecuentes y antibiogramas para muestras de orina. Interpretación de resultados de la práctica anterior. Práctica 5: Estudio microbiológico de cultivo de orina aséptica. Desarrolla la destreza de realizar siembras de muestras de las vías genitales. Realiza siembras, métodos de aislamiento, recuento de colonias e identificación y antibiogramas para muestras de secreciones genitales. Interpretación de resultados de la práctica anterior. Trabaja en equipo. Desarrolla espíritu crítico investigando nuevas técnicas microbiológicas. Participa activamente en Demostrará materiales y equipos del Laboratorio. Trabaja en equipo. Desarrolla espíritu crítico investigando nuevas técnicas microbiológicas. Participa activamente en Demostrará materiales y equipos del Laboratorio.

4 del hígado: Bacterianas, Parasitarias y Virales. Agentes etiológicos más frecuentes. Muestras clínicas. Toma de muestra de coprocultivos. Estudio de Reaccion Inflamatoria. Coprocultivo de rutina: Gram negativos intestinales de interés clínico, prevención, diagnóstico y tratamiento: Géneros Salmonella y Shigella, Escherichia, Vibrio Cholerae, Campilobacter, Yersinia, y Rotavirus. Informe de coprocultivo. Seminario 7: Grupo 1 de práctica Infecciones del sistema nervioso y otros fluidos biológicos. Infecciones de las meninges. Infecciones del tejido nervioso. Agentes etiológicos más frecuentes. Muestras clínicas. Diagnóstico microbiológico. Prevención y tratamiento. Líquidos de punción. Criterio de aceptación o rechazo de muestras de fluidos biológicos. Examen citoquímico bacteriológico del LCR. Cultivo y aislamiento de bacterias en LCR. Exudados y trasudados, diferencia. Cultivo de otros líquidos de punción. Seminario 8: Grupo 2 de práctica. Infecciones de piel, tejido óseo y tejidos blandos. Infecciones cutáneas bacterianas, parasitarias y fúngicas. Infecciones oculares. Infecciones articulares. Infecciones óseas. Agentes etiológicos más frecuentes. Muestras clínicas. Diagnóstico microbiológico. Prevención y tratamiento. Secreción purulenta de heridas. Criterio de aceptación o rechazo de muestras.toma de la muestra. Cultivo para bacterias aerobias. Cultivo para bacterias anaerobias, Gram negativos y Gram positivos. Interpretación de resultados. Seminario 9: Grupo 3 de práctica. EVALUACIÓN PARCIAL Práctica 6: Estudio microbiológico de cultivo de Secreción vaginal y uretral Desarrolla la destreza de realizar siembras de muestras de heces, realización de Coprocultivos e identificación bioquímica de los microorganismos aislados. Pruebas inmunológicas para la identificación de microorganismos. Serotipado de Salmonella sp. Interpretación de Práctica 7: Detección de portadores de Salmonella sp. Realiza el estudio microscópico directo de una muestra de la mucosa de cavidad bucal. Siembra e incubación en anaerobiosis. Estudio macro y microscópico de las colonias aisladas. Siembra de esputo. Interpretación de Práctica 8: Cultivo de esputo. siembra e identificación morfológica, macro y microscópica, de hongos dermatofitos. Interpretación de Práctica 9: Estudio microbiológico de muestras de piel y/o anexos cutáneos. Trabaja en equipo. Desarrolla espíritu crítico investigando nuevas técnicas microbiológicas. Participa activamente en Demostrará materiales y equipos del Laboratorio

5 III Infecciones Septicémicas. Conceptos básicos de bacteriemia y septicemia. Tipos de bacteriemia. Sepsis, Sepsis grave, Shock séptico, Falla multiorgánica. Microorganismos patógenos en sangre y médula ósea que originan sepsis. Significado clínico y variables que afectan su rendimiento. Medios de cultivo manual y automatizado. Seminario 10: Grupo 1 de práctica. Infecciones intrahospitalarias. Reservorio, causas de infección, alerta de brote, vigilancia. Infecciones causadas por el género Pseudomona sp, Acinetobacter sp y microorganismos emergentes hospitalarios. Clasificación. Patogenia. Clínica. Diagnóstico. Tratamiento. Discusión de casos clínicos: Docente del Curso. Microbiología Sanitaria. Enfermedades transmitidas por alimentos. (ETAs) Conceptos básicos y Normas Técnicas Sanitarias Peruanas que rigen el proceso de Inocuidad alimentaria. Aspectos microbiológicos del agua de consumo. Infecciones transmitidas por el agua. Agentes patógenos oportunistas relacionados con el agua. Organismos de efectos molestos. Persistencia en el agua. Dosis infecciosa. Indicadores microbianos de la calidad del agua. Métodos de detección. Epidemiología. Seminario 11: Grupo 2 de práctica Zoonosis: Contaminación de los alimentos por animales. La Zoonosis y su relación con los Alimentos. Procedimientos técnicos utilizados en el control microbiológico de los alimentos. Bacteriología de los alimentos cárnicos: Res, porcino, aves, pescado, huevos y derivados. Seminario 12: Grupo 3 de práctica microorganismos aislados de Hemocultivos en adultos y pediátricos. Interpretación de resultados de la práctica anterior. Práctica 10: Estudio microbiológico de Hemocultivos. l Genero Pseudomona aislado de Hemocultivos. Interpretación de Práctica 11: Estudio microbiológico de muestras intrahospitalarias. los microorganismos aislados de alimentos líquidos. Interpretación de Práctica 12: Estudio microbiológico de muestras de bebidas de consumo humano. Investigación de E. coli y enterococo en agua potable

6 IV Microbiología de los alimentos. Deterioro de los alimentos. Factores ambientales, factores intrínsecos Factores microbianos. Influencia de actividad del agua (A.W.) Conservación de los alimentos: Métodos, Físicos, químicos y biológicos, etc. Seminario 13: Grupo 1 de práctica Bacteriología productos lácteos. Limpieza y conservación de los establos Productores de leche, etc. Alimentación balanceada del ganado lechero para mejor rendimiento. Control Sanitario de la leche Seminario 14: Grupo 2 de práctica Conceptos básicos de Implementación y auditoria del sistema HACCP y de sus programas pre-requisitos: Buenas Prácticas de Manufactura (BPM), Higiene y Saneamiento, POE, POES, Rastreabilidad. Los parásitos como contaminantes del medio ambiente: Protozoos que contaminan los alimentos. Los Hongos venenosos y micotoxinas como contaminantes de alimentos: Mohos y Levaduras que contaminan los alimentos. Seminario 15: Grupo 3 de práctica EVALUACIÓN FINAL microorganismos aislados de alimentos en contacto con animales beneficiados para consumo humano. Interpretación de resultados práctica anterior Práctica 13: Estudio microbiológico de muestras de productos cárnicos, huevos y verduras. muestras de alimentos secos y procesados. Interpretación de resultados de la práctica anterior. Práctica 14: Estudio microbiológico de muestras de alimentos secos y embutidos. muestras de alimentos secos y procesados. Interpretación de resultados de la práctica anterior. Práctica 15: Estudio microbiológico de muestras de coliformes en quesos y yogurt.

7 V. ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS El tipo de enseñanza será de tipo deductivo, a través del trabajo en equipo, así como individual, contando para ello con una participación activa del alumno. Las técnicas pedagógicas serán las interrogativas dialogadas, expositivas e investigativas, con incidencia en el método socrático. La parte teórica del curso contará con exposiciones orales, presentación de seminarios por parte de los alumnos, así como discusión de casos clínicos y de artículos de investigación designados para cada grupo de práctica. La parte práctica se pondrá énfasis en formar las habilidades y destrezas de los Sres. alumnos para el trabajo en el laboratorio de Microbiología tanto Clínica como Sanitaria así como en la interpretación y el análisis de las pruebas microbiológicas observadas en las prácticas. Los alumnos desarrollarán pruebas de laboratorio microbiológico cortas, además de presentar un informe escrito individual de las actividades realizadas en cada práctica. MATERIALES: Los alumnos deberán vestir con implementos de bioseguridad: mandilón, guantes no estériles, lentes y mascarilla como requisito para poder ingresar al laboratorio. Para la práctica, se utilizará material propio del laboratorio. La preparación de materiales para la práctica, lavados de material, esterilización de material y obtención del material biológico necesario será de responsabilidad del grupo encargado de organizar la práctica, en caso de que no se pueda realizar alguna de las prácticas por la falta de material o negligencia del grupo, esta será declarada como dictada sin posibilidad de recuperación, con el consabido desmedro de la calificación en la parte práctica. VI. SISTEMA DE EVALUACIÓN RUBROS INSTRUMENTOS PESO Evaluación de entrada Prueba objetiva Requisito Consolidado 1 Ficha de avaluación de exposiciones Ficha de evaluación de informes 20% Evaluación Parcial Prueba de desarrollo 20% Consolidado 2 Ficha de avaluación de exposiciones Ficha de evaluación de informes 20% Evaluación Final Prueba de desarrollo 40% Evaluación de recuperación Fórmula para obtener el promedio: PF = C1 (20%) + EP (20%) + C2 (20%) + EF (40%) VII. BIBLIOGRAFÍA 7.1 BÁSICA MIMS, C.A., PLAYFAIR, H.L., ROITT, I.M., WAKELIN, D. AND WILLIAMS, R Microbiología Médica, 1ª ed. Mosby/Doyma. ROTGER, R. Microbiología Sanitaria y Clínica, 1ª ed. Ediciones Síntesis

8 MURRAY, P.R., KOBAYASHI, G.S., PFALLER, M.A. AND ROSENTHAL, K.S Harcourt Brace Ed. Koneman ET AL. Diagnóstico Microbiológico, texto y atlas color. Ed. Panamericana. Quinta edición. JEAN F. MAC FADDIN. Pruebas Bioquímicas para la identificación de bacterias de importancia clínica. Ed. Panamericana. Tercera edición. BROOKS, G., Microbiología Médica de Jawetz. Edit. Panamericana, 18 Edición, Argentina, (Signatura topográfica:cod B79 c.4) MURRAY, P., Microbiología médica, Edit. Panamericana, Argentina, 2002 (Signatura topográfica: COD M96 c.2) INS. Manual de procedimientos para la prueba de sensibilidad antimicrobiana por el método de disco difusión COMPLEMENTARIA BAILEY-SCOTT Diagnóstico Microbiológico, 7ª ed. Finegold S.M. y Baron E.J. Ed. Panamericana. KONEMAN, E.W., ALLEN. S.D., DOWELL, V.R., JANDA, W.M., SOMMERS, H.M. AND WINN, W.C. Diagnóstico microbiológico. Texto y atlas en color, 3ª ed. Ed. Panamericana MCCLANE, B.A., MIETZNER, T.A., DOWLING, J.N. AND PHILLIPS, B.A. (1999). Microbial pathogenesis. 1ª ed. Fence Creek Publishing, Madison. MURRAY, P.R., BARON, E.J., PFALLER, M.A., TENOVER, F. C. AND YOLKEN, R.H. (1995). Manual of Clinical Microbiology. 6th Edition. ASM Press. LENNETTE, B., Manual de Microbiología Clínica. Editorial Panamericana, Argentina, 2003 TORTORA,.FUNKE. CASE. Introduccion a la Microbiologia editorial Panamerica 9ª edición Buenos Aires Argentina RECURSOS DIGITALES Biblioteca Facultad de Medicina.UNMSM: medicina.unmsm.edu.pe/index.php/ / Biblioteca UPCH: OMS/HINARI Programa de Acceso a la Investigación para la Salud: Sociedad Científica Peruana de Microbiología: Instituto Nacional de Salud : American Society for Microbiology: LabMedica en Español: http.// Sociedad Española de Microbiología y Enfermedades Infecciosas: