Técnicas de Next Generation Sequencing y Paneles de Screening Preconcepcionales. Lic. Ignacio J. Chiesa

Transcripción

1 Técnicas de Next Generation Sequencing y Paneles de Screening Preconcepcionales Lic. Ignacio J. Chiesa

2 Indice: 1. Introducción 2. Screening de portador tradicional 3. Screening pre-concepcional (SPC) 4. Técnicas de Next Generation Sequencing 5. Paneles pre-concepcionales: ejemplos 6. Implementación Responsable - SPC 7. Aportes, limitaciones y desventajas 8. Secuenciación de exóma completo como SPC

3 1. Introducción Más de 1300 enfermedades genéticas hereditarias son recesivas (autosómicas o ligadas al cromosoma X) Estas enfermedades producen aprox. el 20% de muertes infantiles y el 10 % de hospitalizaciones pediátricas 1-2 en 100 parejas poseen riesgos de tener un hijo afectado con una enfermedad genética recesiva

4 1. Introducción Herencia autosómica recesiva (ambos padres portadores)

5 1. Introducción Herencia en desórdenes ligados al cromosoma X (madre portadora)

6 2. Screening de Portadores Tradicional Estudia la presencia, en individuos asintomáticos, de mutaciones en genes asociados a diversas enfermedades Screening basado en la etnia o en historia familiar

7 2. Screening de Portadores Tradicional Enfermedad Fibrosis Quística Población Caucásicos Fragilidad Cromosoma X Individuos seleccionados (con historia familiar) Beta Talasemia Chipre Cerdeña Israel Turquía Tay-Sachs / Canavan/ Neuropatía autosómica hereditaria Tipo 3 Judío - Ashkenazi

8 2. Screening de Portadores Tradicional En 1999: NIH National Institutes of Health ACMG American College of Medical Genetics ACOG American College of Obstetricians and Gynaecologist Estudio Pre - Concepcional Fibrosis Quística Sin embargo, este screening no se ofrece en muchos países y generalmente está restringido a familiares de pacientes con FQ y a portadores

9 2. Screening de Portadores Tradicional Screening preconcepcional Fuerte descenso en el número de casos de enfermedades hereditarias recesivas severas. Consejo genético Después de 40 años de screening preconcepcional en la población Judío-Ashkenazi (EEUU y Cánada) se redujo la incidencia de la enfermedad de Tay Sachs en un 90%

10 3. Screening Pre-Concepcional Nuevas tecnologías de Secuenciación Masiva Sociedad Multirracial Screening Pre-Concepcional Pan-Etnico Fuerte descenso de Costos de secuenciación de ADN

11 3. Screening Pre-Concepcional Secuenciación Masiva Permite realizar estudios preconcepcionales Analizando cientos de mutaciones en genes, asociadas a diversas enfermedades Sin importar la etnia de los individuos Screening de Portadores Expandido

12 4. Técnicas de Next Generation Sequencing

13 4. Técnicas de Next Generation Sequencing (Secuenciación por síntesis)

14 4. Técnicas de Next Generation Sequencing

15 4. Técnicas de Next Generation Sequencing (Secuenciación por ph)

16 5. Paneles Pre-Concepcionales: Ejemplos

17 5. Paneles Pre-Concepcionales: Ejemplos

18 5. Paneles Pre-Concepcionales: Ejemplos En total se estudian más de 120 enfermedades genéticas recesivas

19 6. Implementación responsable - SPC Aspectos a considerar: 6.1. Qué enfermedades y variantes genéticas se deben incluir en los paneles 6.2. En qué se basa la decisión de incluir o excluir genes en el panel? 6.3. Cuáles son las actitudes y preferencias, públicas y profesionales hacia los paneles de screening expandidos? 6.4. Cómo puede optimizarse la educación/ consejo genético pre y post estudio para facilitar la toma de decisión de acuerdo al resultado del informe?

20 6. Implementación responsable - SPC 6.1. Que enfermedades y variantes genéticas se deben incluir en los paneles? Tener una frecuencia de portador de 1 en 100 o mayor Tener un fenotipo bien determinado Poseer un efecto perjudicial en la calidad de vida Causar discapacidad intelectual o física Requerir cirugía o intervención médica Desarrollarse a temprana edad 6.2. En que se basa la decisión de incluir o excluir genes en el panel? No deben incluir condiciones asociadas con enfermedades que se desarrollan en el adulto (ejemplo: genes BRCA 1 y 2.)

21 6. Implementación responsable - SPC 6.3. Cuáles son las actitudes y preferencias, públicas y profesionales hacia los paneles de screening prenatal expandidos? Profesionales de la salud y sistemas de salud tradicional En general tienen una actitud positiva Sin embargo existen algunas barreras: impacto psicológico, falta de conocimiento, riesgo de estigmatización/ discriminación de ser un portador, condicionar la libertad de elección de una pareja y los costos Actitud del público El interés más alto se observó en personas en edad reproductiva En algunas comunidades, el screening de portadores es una práctica muy bien aceptada (ej: Judío Ashkenazi)

22 6. Implementación responsable - SPC 6.4. Cómo puede optimizarse la educación/ consejo genético pre y post estudio para facilitar la toma de decisión de acuerdo al resultado del informe? Si un individuo es portador de una condición específica, se debe ofrecerle a su pareja realizarse el estudio y obtener el asesoramiento de un médico genetista Si los dos individuos son portadores de una misma condición genética, deben recibir asesoramiento genético, y asesorarse en nuevas tecnologías de reproducción para disminuir el riesgo de tener hijos afectados

23 7. Aportes, limitaciones y desventajas En caso de que sean portadores, orientar a los pacientes para evaluar opciones como: Fertilización in vitro Selección de embriones Donación de espermatozoides u óvulos Adopción Abstenerse de tener hijos

24 7. Aportes, limitaciones y desventajas Al aumentar el número de desordenes estudiados, la probabilidad de identificar un portador aumenta No se estudian todas las mutaciones o alelos asociados a enfermedades Pueden producirse mutaciones de novo

25 8. Secuenciación de exóma como SPC Objetivos de trabajo: Investigar la secuenciación de exóma completo, como test pre-concepcional de una manera más amplia Desarrollar una estrategia de filtrado de datos, que pueda ser utilizada tanto para parejas consanguíneas y no-consanguíneas

26 8. Secuenciación de exóma como SPC Consejo genético previo al estudio. Secuenciación de exóma completo Seleccionar posibles variantes Aplicar filtros genéricos Comparar las variantes obtenidas de los dos individuos en genes superpuestos. Confirmar si las variantes son patogénicas o no y discutir con grupos multidisciplinarios Consejo genético post-estudio.

27 8. Secuenciación de exóma como SPC Conclusiones del trabajo: Se trata de un análisis rentable y posible de informar en un corto plazo Se pueden estudiar todos los genes asociados a enfermedades genéticas en lugar de algún panel acotado Alelos recesivos muy raros (baja frecuencia), asociados a enfermedades, pueden ser muy importantes para parejas consanguíneas y generalmente no están incluidos en los paneles ofrecidos

28 Preguntas?

29 Gracias!! Lic. Ignacio J. Chiesa