Una respuesta para el paciente y su familia

Transcripción

1 Una respuesta para el paciente y su familia

2 La secuenciación masiva del exoma: un abordaje global al diagnóstico genético Existen más de enfermedades mendelianas. La elevada heterogeneidad genética y/o fenotípica de estos síndromes, dificulta la priorización de los genes a estudiar y obliga a un análisis simultáneo de todas las mutaciones asociados a la enfermedad o discapacidad en un individuo. En los exones de un individuo, se localizan los cambios del ADN responsables del 85% de las enfermedades genéticas 1,2. La información hereditaria de nuestro organismo está contenida en genes, que constituyen nuestro genoma. Los exones son las regiones de los genes que contienen la información necesaria La identificación de los genes causales permite: Dirigir las pruebas diagnósticas y las medidas terapéuticas. Establecer un pronóstico. Dar asesoramiento genético al paciente y sus familiares. Entender al enfermedad, facilitando el acceso a ayudas públicas o privadas. para producir las proteínas, elementos fundamentales para que los organismos vivos se desarrollen normalmente. El exoma es el conjunto de todos los exones del genoma.

3 Aproximación al Diagnóstico Genético de las Enfermedades Mendelianas Evaluación clínica Historia familiar, antecedentes personales, signos, síntomas y pruebas complementarias. Sospecha de enfermedad genética caracterizada por: Aneuploidías, duplicaciones o deleciones de una región genómica Mutaciones asociadas a un fenotipo inespecífico y/o de alta heterogeneidad genética Número limitado de mutaciones recurrentes Cariotipo MLPA acgh Sanger NIMGenetics ofrece tres aproximaciones al análisis de los resultados de secuenciación. Dirigido Clínico Trío

4 La secuenciación masiva permite el análisis simultáneo de decenas a miles de genes de una manera rápida y económica. La genética médica está evolucionando de los paneles de genes hacia la secuenciación masiva del exoma debido a su alta potencia diagnóstica. El éxito de esta tecnología radica en su flexibilidad y en su capacidad de adaptación a las necesidades del paciente. A partir de la secuenciación del exoma, se pueden seleccionar los genes a analizar (diseños personalizados) y estudiar diferentes fenotipos simultánea o secuencialmente (re-análisis) 3-5.

5 ..a partir de la secuencia de genes, un análisis que se adapta al diagnóstico genético de tu paciente.

6 Algoritmo de análisis Secuenciación y análisis bioinformático Análisis orientado clínicamente Identificación y anotación de variantes Base de Datos propia >1.000 exomas Filtrado de variantes Comparación de las variantes identificadas frente a las bases de datos, permitiendo la selección de la información genética relevante. Priorización y Categorización Interpretación Clínica Validación Sanger de variantes patogénicas Predicción de patogenicidad con algoritmos bioinformáticos. Revisión de bases de datos de mutaciones y publicaciones científicas. Categorización de las variantes según los criterios del ACMG*. Integración de la información clínica. Determinación de la asociación entre el fenotipo y el genotipo. Definición del patrón de herencia de la variante. *American College of Medical Genetics

7 Informe Recomendaciones clínicas en relación al manejo del paciente, pruebas complementarias confirmatorias y estudios de segregación familiar. Resultados interpretados en el contexto clínico, con información relevante, obtenida en las bases de datos y bibibliografía consultadas. Re-clasificación de las variantes en función de nuevas evidencias. Interpretación de variantes siguiendo las recomendaciones del ACMG. Validación de variantes patogénicas y probablemente patogénicas mediante Sanger. Incluye información relativa a la calidad de la secuenciación y las coberturas de los genes estudiados. NIMGenetics indica y realiza los estudios de segregación necesarios para determinar la causalidad de la variante y facilitar el consejo genético. NIMGenetics dispone de un equipo multidisciplinar con experiencia acreditada informe clínico de fácil interpretación asesoramiento genético al especialista

8 dirigido Qué es? Exoma: secuenciación simultánea de los genes del paciente. Dirigido: a genes seleccionados por su asociación con el fenotipo del paciente. Indicaciones Síndromes con una presentación clínica característica y elevada heterogeneidad genética. Ventajas Re-análisis de la secuencia ante: 1) aparición de nuevos síntomas, 2) redefinición del fenotipo y 3) inclusión de nuevos genes implicados en la patología de estudio. En patologías concurrentes o fenotipos solapantes o inespecíficos, se pueden combinar los paneles disponibles. Diseños personalizados y adaptados a cada paciente. Ampliación a ExoNIM Clínico y ExoNIM Trío sin necesidad de secuenciar de nuevo la muestra del paciente. Al servicio del diagnóstico genético El exoma es una herramienta dinámica

9 ExoNIM Dirigido: trabajamos contigo donde nos necesites Neurología Pediatría Dermatología Vascular Inmunología Otorrinolaringología Digestivo Hematología Endocrinología Nefrología Un abordaje multidisciplinar Los diseños de ExoNIM Dirigido son actualizados periódicamente, en base a la literatura reciente. NIMGenetics ofrece asesoramiento para la elección del diseño de ExoNIM Dirigido más adecuado para tu paciente.

10 dirigido Diigestivo, endocrino y nefrología Colestasis intrahepática Déficit combinado de Hormonas Hipofisiarias e Hipotiroidismo Diabetes neonatal Diarrea congénita o crónica de inicio precoz Errores del metabolismo con hiperamonemia Fiebre recurrente Hipercolesterolemia familiar Neurocantocitosis, Enfermedad de Wilson y Enfermendad por depósitos de hierro Pancreatitis Crónica Pseudohipoaldosteronismo Síndrome de Alport Síndrome de Bartter y patologías asociadas a trastornos hidroelectrolíticos Trico-Hepato-Entérico Óseo, vascular, dermatológía e inmulogía Alteraciones genéticas de la aorta (Aneurismas y Disecciones) Síndrome de Coffin-Lowry Conectivopatías Cutis laxa Displasias Ectodermicas Displasias Oseas Hiperlaxitud Articular Ictiosis congénita Osteogénesis Imperfecta Osteopetrosis Síndrome de Hiperinmunoglobulinemia E Telangiectasia Hemorrágica Hereditaria VP110 VP74 VP86 VP85 VP76 VP80 VP94 VP78 VP47 VP100 VP109 VP81 VP18 VP75 VP65 VP103 VP99 VP68 VP37 VP33 VP24 VP66 VP107 VP52 VP46 Hematología Amiloidosis Eritorblastopenia congénita de Blackfan-Diamond Neutropenia congénita sindrómica y no sindrómica Síndrome hemolítico urémico Otorrinolaringológia Discinesia Ciliar Primaria Hipoacusias Familiares Síndrome del acueducto vestibular dilatado Sordera autosómica recesiva Síndromes polimalformativos con o sin deficit intelectual asociado Artrogriposis Cardiopatías congénitas Craneosinostosis Disostosis facial Enfermedad de Hirschsprung Esclerosis Tuberosa Fisura palatina y labio leporino Malformación de miembros Microcefalia Primaria Hereditaria y Síndrome de Meier-Gorlin Rasopatías Síndrome de Bardet-Biedl Síndrome de Coffin-Siris Síndrome de Cornelia de Lange Síndrome de Donnai-Barrow Síndrome de Kabuki Sindrome de Robinow Síndrome de Rubinstein-Taybi Síndrome de Sotos y síndromes relacionados Sobrecrecimiento y macrocefalia VP64 VP43 VP42 VP14 VP25 VP9 VP84 VP19 VP56 VP102 VP6 VP69 VP51 VP8 VP93 VP87 VP41 VP12 VP95 VP59 VP5 VP40 VP23 VP67 VP60 VP49 VP96

11 Neurología Polineuropatías hereditarias Charcot-Marie Tooth tipo 2 Charcot-Marie Tooth y neuropatías hereditarias sensitivo-motoras relacionadas Neuropatia Distal Hereditaria Alteraciones del movimiento Ataxia espinocerebelosa Ataxias Coreoatetosis Distonías Hemiplejia alternante de la infancia Migraña hemipléjica familiar Paraplejia Espástica Hereditaria Parkinson Leucodistrofias Angioma Cavernoso Familiar Atrofia Muscular Espinal Enfermedades peroxisomales y lisosomales Enfermedad de Fahr Enfermedades por trastorno del metabolismo del glucógeno Leucodistrofias Lipofuscinosis Cerebral Síndrome de Aicardi Goutieres Síndrome de Joubert Trastornos Congénitos de la Morfogenesis Cerebral VP32 VP3 VP11 VP2 VP36 VP73 VP57 VP97 VP101 VP26 VP58 VP35 VP82 VP63 VP62 VP105 VP27 VP72 VP1 VP22 VP17 Miopatías y Enfermedades neuromusculares Canalopatías Neuromusculares Distrofía Muscular de Cinturas (LGMD) Distrofias musculares Distrofinopatías Distroglicanopatias Esclerosis lateral amiotrófica y síndromes incluidos en el Diagnóstico diferencial Miastenia congénita Miopatia congénita de núcleos centrales Miopatia por desproporción de fibras y Síndrome de Shprintzen-Goldberg Miopatías Trastornos Hereditarios del Colágeno VI Demencias Alzheimer de inicio precoz Demencia Frontotemporal Trastornos del neurodesarrollo Autismo Déficit Intelectual Déficit Intelectual Ligado al cromosoma X Síndrome de Angelman y síndromes incluidos en el diagnóstico diferencial Enfermedades Mitocondriales Alteraciones mitocondriales secundarias a mutaciones del DNA nuclear dirigido VP21 VP39 VP61 VP55 VP71 VP48 VP70 VP31 VP30 VP50 VP20 VP28 VP91 VP83 VP7 VP79 VP98 VP10

12 clinico Qué es? Exoma: secuenciación simultánea de los genes del paciente. Clínico: análisis dirigido a más de genes OMIM 7. Indicaciones Síndromes difíciles de orientar clínicamente y caracterizados por: Alta heterogeneidad genética Alta heterogeneidad fenotípica o fenotipos incompletos Estudios previos dirigidos al diagnóstico diferencial no concluyentes Ventajas Análisis de todos los genes asociados a enfermedades mendelianas. Posibilidad de ampliación a ExoNIM Trío. Minimiza la identificación de hallazgos incidentales o la identificación de variantes en genes sin un fenotipo clínico asociado. Abriendo las puertas al diagnóstico

13 trio Qué es? Exoma: secuenciación simultánea de los genes del paciente. Trío: A través de la información genética de los progenitores, se seleccionan las variantes responsables del fenotipo del paciente, atendiendo tanto a la presentación clínica como al patrón de herencia. Indicaciones Síndromes con alta heterogeneidad genética y/o fenotípica. Diagnóstico diferencial de síndromes que comparten manifestaciones clínicas o de enfermedades raras. Primera elección en casos de TEA y TND tras array CGH negativo. Ampliación de ExoNIM Dirigido/Clínico negativo. Ventajas Permite identificar nuevos genes no incluidos inicialmente en el diagnóstico diferencial. Máxima rentabilidad diagnóstica, superior al 40%. Permite determinar el patrón de herencia de las variantes. Acelera el proceso diagnóstico y evita pruebas innecesarias. Un análisis de amplio espectro

14 Solicitud de ExoNIM Documentación necesaria: 1. Formulario de petición*. 2. Consentimiento informado*. (*): Disponibles en nuestra web o bajo petición a nuestros delegados. 3. Informe médico del paciente. Condiciones y envío de muestra Sangre periférica: 3-5 ml de EDTA. Para otras muestras, consulte con la Dirección Técnica. NIMGenetics dispone de centro de extracción concertados en toda España (consulte al delegado o en la central). Bibliografía: 1. Choi M et al. (2009). Proc Natl Acad Sci U S A 106(45): Pussegoda KA (2010). Clin Genet 78(1): Lee H et al. (2014). JAMA 312(18): Van Nimwegen KJ et al. (2015). Eur J Paediatr Neurol 19(2): Monroe GR et al. (2016). Genet Med [Epub ahead of print]. 6. Richards S et al. (2015). Genet Med 17(5): Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)

15 Por qué NIMGenetics La calidad de ExoNIM está certificada (Thermo Certified Service Provider). Informes de NIMGenetcs calificados como excelentes por líderes de opinión en Neurología, Genética Clínica y otras especialidades. Compañía liderada por un equipo multidisciplinar altamente cualificado, que sirve de apoyo al especialista, ofreciéndole asesoramiento pre y pots-test. Miembros acreditados por la Asociación Española de Genética Humana (AEGH) y participación activa en la European Molecular Quality Network (EMQN). Soluciones integrales. NIMGenetcs dispone de una amplia cartera de pruebas de genética molecular para cubrir las necesidades de cada paciente.

16 MADRID Parque Científico de Madrid Faraday, 7 (Campus de Cantoblanco) Madrid Tel M BRASIL Rua Elvira Ferraz, nº250, Cj Itaim - São Paulo, SP. CEP: Tel NIMGenetics es un centro de Diagnóstico Genético autorizado por la Consejería de Sanidad y Consumo de la Comunidad de Madrid, inscrito en el Registro correspondiente con el Nº CS CAT-03; Rev 01; 18/05/2016 MÉXICO Guanajuato 92, Of. 601, Col. Roma Norte Ciudad de México Tel