A. Título del Proyecto B. Información de Contacto del Investigador Principal C. Información de Contacto de la Institución Administradora D.

Transcripción

1 A. Título del Proyecto Georreferenciación de las colecciones biológicas sistematizadas en el Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia B. Información de Contacto del Investigador Principal Nombre: Dr. Rodrigo Bernal Dirección: Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Colombia, Apartado 7495, Bogotá País: Colombia Teléfono: ext Fax: rgbernalg@unal.edu.co Website: C. Información de Contacto de la Institución Administradora Nombre: Instituto de Ciencias Naturales, Universidad Nacional de Colombia Dirección: Apartado 7495, Bogotá Persona Contacto: Director, Instituto de Ciencias Naturales Nombre: Dr. Jaime Aguirre Teléfono: ext Fax: inscien_bog@unal.edu.co Website: D. Respaldo La presente propuesta ha sido previamente presentada al Instituto Alexander von Humboldt, coordinador del Sistema de Información sobre Biodiversidad para Colombia y punto Focal de IABIN para Colombia. Las instrucciones de contacto son: Punto focal: Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Dirección: Diagonal 27 No Director: Dr. Fernando Gast, Director general. PBX: dirgeneral@humboldt.org.co, fgast@humboldt.org.co Persona Contacto: Ing. Ximena Franco, investigadora principal SIB. Dirección Persona Contacto: Cra. 13 No P-7 PBX: E mail Persona Contacto: xfranco@humboldt.org.go

2 Resumen El Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia alberga la mayor colección de especímenes biológicos colombianos que existe en el mundo. Esta colección está en proceso de sistematización, y en la actualidad hay ejemplares sistematizados y puestos a disposición del público en la página web del Instituto ( Estos especímenes incluyen plantas ( ), anfibios (40.000), aves (35.000), mamíferos (15.000) e invertebrados (17.000). A pesar del enorme valor de esta información, su utilidad se ve limitada por la falta de georreferenciación de la gran mayoría de los especímenes. La presente propuesta busca fondos para georreferenciar las colecciones y de esta manera valorizar la información. La georreferenciación se hará mediante la construcción de un gacetero a partir de los especímenes que ya están sistematizados, mediante la utilización de gaceteros disponibles en otras instituciones colombianas y extranjeras, y mediante el uso de la cartografía disponible. El trabajo será llevado a cabo por estudiantes de posgrado del Departamento de Geografía de la Universidad Nacional. Esperamos georreferenciar unas 2400 localidades, con las cuales calculamos que podríamos cubrir unos especímenes. El proyecto se desarrollará en un año, y tendrá un costo de USD Se solicitan USD a IABIN. Abstract The Instituto de Ciencias Naturales of Universidad Nacional de Colombia includes the world s largest collection of biological specimens from Colombia. This collection is in the process of computerization, and at the present time there are 235,000 specimens digitized and made publicly available at the Institute s website ( These specimens include plants (128,000), amphibians (40,000), birds (35,000), mammals (15,000) and invertebrates (17,000). In spite of the tremendous value of this information, its utility is hampered by the lack of a georeference in the vast majority of specimens. The present proposal looks for funds to georeferencing the collections, so that the value of the information can be enhanced. Georeferencing will be done by compiling a gazetteer out of those collections that already have a georeference, by using other gazetteers available at other Colombian and foreign institutions, and by using the available cartography. The work will be carried out by graduate students of the Department of Geography at the National University of Colombia. We expect to georeference 2400 localities, which we estimate would cover about 72,000 specimens. The project will be developed in one year, and its cost will be USD 24,200, of which USD 10,000 are requested from IABIN. 2

3 Antecedentes El Instituto de Ciencias Naturales de la Universidad Nacional de Colombia alberga la mayor colección de especímenes biológicos colombianos que existe en el mundo, con un número de especímenes cercano a Desde 2001, el Instituto ha venido avanzando en el proceso de sistematizar sus colecciones, y liberar la información a través de Internet. En la actualidad, el Instituto tiene sistematizados especímenes, incluyendo de plantas, de anfibios, de aves, de mamíferos y de insectos. Esta cifra representa el 28 % de toda su colección, y para los mamíferos, las aves y los anfibios representa el total de cada grupo. Para el herbario, la cifra sistematizada corresponde al 26% del total de las colecciones. Toda la información sistematizada está disponible en la página web del Instituto de Ciencias Naturales ( incluyendo una imagen digital de cada espécimen del Herbario Nacional Colombiano. Dado que los datos están sistematizados bajo estándares interoperables, la información se encuentra también visible a través de búsquedas distribuidas en el Sistema de Información sobre Biodiversidad para Colombia (SIB) y a través de GBIF. En cada una de estas instituticones, la información del Instituto de Ciencias Naturales constitutye el conjunto de datos colombianos más grande disponible hasta la fecha. Así pues, el Instituto se ha convertido en un pionero en la puesta a disposición de su información. Sin embargo, los enormes esfuerzos hechos hasta la fecha, y los cuales continúan, tienen una debilidad: la inmensa mayoría de los datos del Instituto carecen de georreferencia (coordenadas de latitud y longitud), lo cual restringe severamente su utilización para innumerables aplicaciones. El añadirle la georreferencia a cada uno de los especímenes, le agregará un enorme valor a los datos, pues permitirá mapear la distribución de las especies; la modelación de distribuciones potenciales de especies; el cálculo de áreas de ocupación y extensión de presencia; y todas las demás apicaciones relacionadas con el mapeo de distribuciones, necesarias en la toma de decisiones sobre manejo y conservación de especies. En la actualidad, hay dos instituciones colombianas que han abordado a profundidad el tema de la georreferenciación de especímenes biológicos: el Instituto Alexander von Humboldt, que tiene una unidad dedicada exclusivamente a los sistemas de información geográfica; y el Instituto Sinchi, que ha georreferenciado ya todos los especímenes de su Herbario Amazónico (COAH). El presente proyecto se apoyará fuertemente en la experiencia y la información acumulada por estas dos instituciones, con las cuales hemos venido trabajando mano a mano en la consolidación del Sistema de Información sobre Biodiversidad para Colombia (SIB). Asi mismo, hemos estado atentos a los desarrollos que sobre georreferenciación se están dando en otras instituciones, y esperamos incorporarlos a nuestro proceso cuando sea el momento apropiado. Así, por ejemplo, el desarrollo de Biogeomancer ( ofrecerá una potente herramienta para gorreferenciar nuestras colecciones. De igual manera, el Instituto de Ciencias Naturales ha venido discutiendo con el Instituto Humboldt, el Instituto Sinchi y el Instituto Geográfico Agustín Codazzi la consolidación de una estrategia conjunta de georreferenciación, que evite la duplicación 3

4 de esfuerzos entre las instituciones. Sin embargo, transcurrirá todavía algún tiempo antes de que el fruto de estos procesos esté disponible para nuestro uso. Entre tanto, es vital que el Instituto avance en su propio proceso de georreferenciación. Objetivos 1. Georreferenciar localidades de colección de los especímenes biológicos que han sido sistematizados hasta la fecha en el Instituto de Ciencias Naturales. 2. Crear un gacetero digital que sirva para la futura georreferenciación de otras colecciones. Metodología El proceso se desarrollará en tres fases sucesivas. 1. Creación de un gacetero inicial a partir de aquellas colecciones sistematizadas que ya tienen georreferencia Alrededor del 5% de las colecciones sistematizadas tienen datos de georreferencia. Con base en estos datos construiremos un gacetero, que se utilizará para georreferenciar otros especímenes provenientes de las mismas localidades, pero carentes de georreferencia. 2. Utilización de gaceteros de otras instituciones Se utilizarán los gaceteros digitales compilados por el Instituto Humboldt y el Instituto Sinchi, lo mismo que otros gaceteros disponibles en Internet o en forma impresa (p. ej. Paynter & Traylor ). 3. Se utilizará la cartografía disponible actualmente en Colombia para poner georreferencias a aquellas localidades que no se puedan georreferenciar mediante gaceteros. Los gaceteros se construirán utilizando la base de datos Specify, desarrollada por la Universidad de Kansas, y en la cual están almacenadas actualmente las colecciones del Instituto de Ciencias Naturales. En la medida que los procesos lo requieran, se utilizarán también tablas o bases de datos en Excel y en Access, para el manejo independiente de bloques aislados de información. Los datos a georreferenciar se ordenarán por departamentos, y se iniciará la georreferenciación por los departamentos andinos. Se han escogido los departamentos andinos porque los Andes son el área que ha sufrido una mayor alteración de sus ecosistemas y son, además, el área que tiene una mejor cobertura cartográfica. La disponibilidad de una cartografía detallada permitirá incorporar la información sistematizada al estudio de los procesos de cambio ecosistémico, a la modelación de distribuciones potenciales y al estudio y manejo de especies amenazadas. Adicionalmente, permitirá entrenar en el proceso a los georreferenciadores con 1 Paynter, R.A.& M.A. Traylor Ornithological Gazetteer of Colombia. Bird Departament, Museum of Comparative Zoology, Harvard University. 4

5 localidades más familiares, antes de pasar a las más obscuras; esto permitirá conseguir una alta calidad de los datos y desarrollar un método de monitoreo del proceso. El proceso de goerreferenciación será llevado a cabo por estudiantes del programa de maestría en Geografía, del Departamento de Geografía de la Universidad Nacional de Colombia, en Bogotá, los cuales trabajarán en el proyecto como pasantes por períodos de uno a dos semestres. El trabajo será supervisado por un profesor de ese Departamento, que ayudara a desarrollar protocolos para controlar la calidad de los datos. En total habrá una dedicación equivalente a la de un tiempo completo durante un año. Se estima que un pasante con dedicación de medio tiempo puede georreferenciar en promedio unas 25 localidades por semana. De esta manera, con dos pasantes de medio tiempo durante un año, esperamos georreferenciar alrededor de 2400 localidades. Dado que de manera conservadora estimamos en unos 25 el número de especímenes recolectados en cada localidad, al final del proyecto esperaríamos tener georreferencias para unos especímenes del Instituto. De esta manera, el costo promedio por localidad georreferenciada sería de USD 4.16 y el costo por espécimen sería de USD Sin embargo, estos estimativos son muy tentativos, y es posible que el uso de los gaceteros acumulados por las otras instituciones permita hacer aún más eficiente el trabajo. Cronograma El proyecto se desarrollará en un año Actividad MES Construcción de gacetero propio provisional x x Adquisición de gaceteros de otras instituciones x x Compilación de localidades a georreferenciar x x Georreferenciación x x x x x x x x Informe semestral x Elaboración de manual de mejores prácticas x Puesta a disposición de los datos x x Informe final (incl. construcción de tesauro) x Resultados Los datos que se procesen como resultado del presente proyecto se harán disponibles a través de IABIN mediante el software de proveedor de datos que se recibirá de IABIN. La puesta a disposición se hará al final del proyecto. Adicionalmente, se entregará un tesauro de los datos, con los nombres científicos de las especies que se procesen en el proyecto y los nombres comunes registrados en los especímenes. Se entregará, asimismo, un Manual de Mejores Prácticas detallando la metodología desarrollada y perfeccionada en el transcurso del proyecto. Además de los resultados esperados (2400 localidades georreferenciadas y unos especímenes con georreferencia), el proceso de georreferenciación permitirá también adquirir la experiencia y el entrenamiento necesarios para acelerar el proceso de georreferenciar las colecciones restantes. Además, fortalecerá el proceso conjunto que desarrollan actualmente el Instituto de Ciencias Naturales, el Instituto Humboldt y el Instituto Sinchi, tendiente a buscar protocolos nacionales de georreferenciación. 5

6 La disponibilidad de georreferencias para las colecciones permitirá iniciar el proceso de implementación de programas de mapeo. Desde ya estamos considerando el uso de la herramienta Berkeley Mapper ( La utilización de esta herramienta permitirá que los datos disponibles sean de un uso más amplio que el que actualmente tienen, pues además de los botánicos y zoólogos, podrán ser usados también por las agencias estatales y privadas que trabajan en conservación; por los tomadores de decisiones y por el público en general. Los datos que se georreferenciarán corresponden a especímenes recolectados en todo el territorio de Colombia entre 1783 y 2006, pero principalmente a partir de Los grupos a cubrir son plantas (Embryophyta), aves (Aves), anfibios (Amphibia), mamíferos (Mammalia), arácnidos (Arachnida) e insectos (Hexapoda). El Instituto de Ciencias Naturales tiene un estricto protocolo de actualización de la información en la base de datos cada vez que se hace un cambio en un espécimen, y de actualización de los especímenes, cada vez que los usuarios de la base de datos señalan cambios en ella. De esta manera, se logra que la base de datos y la colección física permanezcan siempre como un reflejo una de la otra. Los datos sistematizados hasta ahora por el Instituto de Ciencias Naturales están basados en el Estándar Mínimo para el Intercambio de Información, desarrollado por el SIB- Colombia, con la participación del Instituto de Ciencias Naturales. Este estándar sigue muy cercanamente el Darwin Core, lo que hace que los datos sean totalmente interoperables. De hecho, los datos son actualmente visibles a través de GBIF. De la misma manera, los metadatos de las colecciones sistematizadas están debidamente documentados en el Catálogo Nacional de Metadatos del SIB. El Instituto de Ciencias Naturales es miembro del Comité Técnico Directivo del Sistema de Información sobre Biodiversidad para Colombia-SIB, y en la actualidad es su mayor proveedor de datos. Como miembro del Comité Técnico, el Instituto de Ciencias Naturales, en particular el investigador principal de la presente propuesta, ha ayudado a definir varias de las políticas de intercambio de información en Colombia. Aunque el Instituto no ha tenido hasta ahora una relación directa con IABIN, sí ha tenido una estrecha colaboración con el Instituto Alexander von Humboldt, punto focal de IABIN en Colombia y coordinador del SIB. Indicadores de éxito Aunque se espera cumplir las metas propuestas en cuanto a cifras de localidades y especímenes georreferenciados, consideramos que el proyecto se podrá tomar como exitoso con los siguientes criterios: 1. Número de localidades georreferenciadas no inferior a Número de especímenes con georreferencia no inferior a Producción de un Manual de Mejores Prácticas 4. Compilación de un gacetero basado en las colecciones del Instituto de Ciencias Naturales. 6

7 Presupuesto (en USD) Item IABIN Universidad Nacional de Colombia Total 2 estudiantes de posgrado de tiempo parcial 12 meses a USD 300 por mes Cartografía digital y análoga, y software Costos de operación (mantenimiento de equipo de oficina, materiales de consumo) Coordinador de Sistematización en el Instituto 12 meses a 700 Asistente tiempo parcial 12 meses a por mes Computadores y otros equipos Total