NUEVOS VIRUS RESPIRATORIOS?

Transcripción

1 Jornadas Otoño- Invierno Los Andes- Junio 2018 SOCHIPE- Filial Aconcagua NUEVOS VIRUS RESPIRATORIOS? Prof. Dr. Luis Fidel Avendaño PROGRAMA de VIROLOGIA. ICBM. Facultad de Medicina. Universidad de Chile

2 Virus respiratorios: aspectos a considerar 1. Aspectos moleculares: generan conocimiento sobre diagnóstico y patogenia; permiten desarrollar antivirales y vacunas. 2. Aspectos clínicos: se dispone de diagnóstico específico?, hay marcadores de gravedad?, hay tratamiento específico? 3. Aspectos epidemiológicos: cuántos virus respiratorios hay y varían? son endémicos o epidémicos? Se puede prevenir su infección?

3 Virus ADN: 6 familias

4 Virus ARN: 13 familias

5 Hay virus ADN y ARN: 6 versus 13 familias que afectan a humanos Serotipos versus genotipos: la polimerasa infiel Virus nuevos o antiguos: descubrimiento o re-emergencia Virus respiratorios: hay nuevos virus?

6 Serotipos y genotipos Adenovirus: más de 56 serotipos; 7 especies (A-G) Genotipos a j; Ej. 7h: h1,2,3 Poliovirus: 3 serotipos; muchos genotipos Sarampión: 1 serotipo; 23 genotipos (gen N) Rubéola: 1 serotipo; 10 serotipos (prot. E1) Virus papiloma: más de 200 genotipos; serotipos? Rabia: un serotipo; variantes en animales VRS: dos serotipos, muchos linajes y genotipos

7 Virus Emergentes nuevo que aparece y provoca alarma por la patología que produce. Ejemplos: virus VIH, SARS, MERS-CoV e influenza H1N1 (2009), influenza de animales. re-emergente: son virus que se han considerado controlados desde el punto de vista de salud pública, que por diversas circunstancias reaparecen en la población provocando alarma por su magnitud, gravedad o extensión geográfica. Ej: sarampión en Europa, polio en Africa; Zika, West Nile en América; Ebola en Africa antiguo, de reciente diagnóstico: virus detectados con nueva tecnología, pero que han estado presentes desde mucho tiempo: hantavirus, metapneumovirus, hepatitis C, hepatitis G, herpes 8, bocavirus, etc.

8 PCR multiplex - secuenciación bioinformática: automatización Expresion Library: screening cdna expression library Concensus PCR: partidores de zonas de concenso RDA: representational difference analysis RAP-PCR: Random primer PCR Dnasa-SISPA: Dnasaan RNA sequence independent single primer amplification PCR

9 CLART PneumoVir: diagnóstico in vitro para la detección y genotipado de 19 virus y su posterior visualización en arrays de baja densidad

10 LUMINEX xtag RVP Fast kit: 17 virus

11 Muchos virus respiratorios: hay viroma? diagnóstico molecular altamente sensible Rinovirus: A, B, C; > 100 serotipos Coronavirus: grupos alfa: 229E, NL63; beta: OC43 HKU1, SARS, MERS-CoV VRS: grupos A y B; linajes, genotipos. Metapneumovirus: A y B; subgrupos A1, A2, B1, B2 Adenovirus: 55 serotipos; muchos genotipos Influenzas : subtipos A, B, C; cepas. Parainfluenza: 1-4. Otros: bocavirus, enterovirus (D68), CMV, sarampión, varicela, hantavirus.

12 Los rinovirus Virus ARN desnudos, de fácil transmisión Hay más de 100 serotipos; circulan todo el año Diagnóstico restringido pues se requiere RT-PCR Recientemente se han detectado a veces con tecnología molecular - como agentes únicos en infecciones respiratorias bajas. No hay tratamiento específico, ni vacuna

13 Coronavirus Virus ARN con manto Producen infecciones respiratorias altas, tipo resfrío El SARS produjo una pandemia limitada de neumopatía aguda, principalmente en Europa en 2003, con mortalidad cercana al 10%, controlada con medidas epidemiológicas ( murciélagos?) El MERS-CoV (Meadle East Respiratory Synd.) produce desde 2012 neumopatías en península arábica, relacionado a personas con contacto con camellos. Mortalidad <10%

14 Metapneumovirus Virus ARN semejante al VRS descubierto el 2001 Patología semejante, menos frecuente y más benigna En Chile es más prevalente en primavera No hay tratamiento ni vacunas, todavía

15 Adenovirus Virus ADN desnudo, resistente al ambiente Hay más de 55 serotipos y muchos genotipos; los últimos serotipos se han detectado en inmunocomprometidos Comúnmente producen infecciones respiratorias altas Se han asociado a neumopatías graves en niños, especialmente en UCIs y en portadores de comorbilidades ( AD 7h?)

16 Virus parainfluenzas Virus ARN con manto, presenta serotipos Se detectan a lo largo de todo el año Se asocian a laringitis y en lactantes también a IRA baja No hay vacuna ni tratamiento específico El uso de corticoides y de intubación laríngea ha prácticamente eliminado la necesidad de traqueostomía

17 El VRS: estructura

18 Árbol filogenético de segmento de 266 nt de gen G de VRS A por NJ (MEGA) SAA1 GA2 Ab5076Pt01 GA5 GA5 GA1 GA7 GA4 GA3 GA6 33 VRS de Chile 250 VRS del mundo

19 VIGILANCIA DE VIRUS RESPIRATORIOS EN LACTANTES HOSPITALIZADOS POR INFECCION RESPIRATORIA AGUDA BAJA. Hospital R. Río. Santiago % Avendaño et. al. A DV V RS FLU PI Avendaño, Palomino, Larrañaga J Clin Microbiol 2003;41:

20 Vigilancia de virus respiratorios mediante inmunofluorescencia indirecta (IFI) Hosp. R del Río a SE 20 del 2013

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22 Factores de gravedad asociados a infección por VRS: el hospedero.

23 TRATAMIENTO: OXIGENOTERAPIA Bajo flujo: - No proporciona la totalidad del gas inspirado - Basado en mecanismo Venturi Cánula nasal Mascarilla simple - Mascarilla con reservorio de re-inhalación parcial o NO re-inhalación Alto flujo: - paciente respira la totalidad del gas suministrado - al ser respirado completamente se puede controlar temperatura, humedad y concentración - Mascarilla Venturi tienda facial halo (hood) Ventilación asistida

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25 Sarampión: epidemiología en Chile,

26 Resumen sobre VRS La experiencia en Chile muestra que la vigilancia de RSV es fácil, económica y de gran utilidad. La vigilancia debe hacerse todo el año; clínica y de laboratorio; en 4 niveles de gravedad: ambulatorio, hospitalizados, UCI, autopsias (centros centinelas). Debería agregarse en adultos. Alta transmisibilidad del virus; la variedad de técnicas de diagnóstico disponibles (IF, Icr, RT-PCR) es una ventaja La organización del sistema de salud aunque no se disponga de vacunas ni de antivirales permite reducir notablemente la letalidad ( hospitalización + oxígeno ), no así la incidencia del VRS.

27 Virus influenza Virus ARN con manto, prototipo de virus variable Tiene (1) ARN fraccionado en 8 segmentos, (2)una polimerasa infiel y (3) un amplio reservorio animal silvestre Es una constante amenaza de emergencia de nuevos virus, y la OMS lo sabe y vigila siempre Se dispone de vacunas y antivirales, de discutible alta eficacia

28 VIRUS INFLUENZA A-B Genoma: una hebra RNA (-), bases ARN pol infiel error en 1/ segmentos Codifica para 10 proteínas Manto: - hemaglutinina, HA,18 - neuraminidasa, NA, 11

29 Transmisión entre especies y Reservorios

30 Clasificación de Virus INFLUENZAS. Tipos A, B y C: NP o M1 Virus A : Subtipos H (18) N (11) En humanos H1N1, H2N2, H3N2, H1N2, En cerdos H1N1, H1N2, H3N2, H3N1, H2N3 Virus B : Dos linajes: Yamagata y Victoria. Virus C : Poca importancia clínica. Produce casos esporádicos.

31 Reordenantes en influenzas

32 Cepas de virus influenza A detectadas en humanos 1918 H1 N1 Española (USA) aviar 1957 H2 N2 Asiática (China) aviar, por cerdo 1968 H3 N2 Hong Kong (China) aviar, por cerdo 1976 Hsw1 N1 Fort Dix - USA cerdo 1977 H1 N1a Rusa (China) humano (aviar) 1995 H7N7 Inglaterra aviar 1997 H5 N1 Hong Kong (China) aviar 1999 H9N2 Hong Kong (China) aviar 2002 H7N2 Virginia, USA aviar 2003 H7N7 Holanda aviar 2003 H9N2 Hong Kong aviar 2003 H5N1c China, Sud Este aviar 2003 H1 N2 Europa, Asia, América humano 2003 H5N1c Asia, Africa aviar 2003 H7N2 New York, USA aviar 2004 H7N3 Canadá aviar 2004 H5N1c Thailandia, Vietnam aviar 2004 H10N7 Egipto aviar 2009 Hsw1N1 México/ USA cerdo

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35 Historia del Reordenamiento de la cepa Influenza A H1N Trifonov, V et al. NEJM, May 2009

36 Virus influenzas porcinos: reordenamiento 2009.

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41 CDC.gov: Influenza vaccines

42 The WHO recommends the following for the Northern Hemisphere's quadrivalent (four-strain) vaccines. WHO changes 2 strains for flu vaccine - For H1N1, an A/Michigan/45/2015-like virus - For H3N2, an A/Singapore/INFIMH /2016-like virus - For B Victoria, a B/Colorado/06/2017-like virus - For B Yamagata, a B/Phuket/3073/2013-like virus According to today's report, most recent H3N2 viruses from outbreaks are antigenicaly similar to cell-culture propagated vaccine viruses that are in the current Northern Hemisphere vaccine and Southern Hemisphere vaccine for However, they reacted poorly with egg-propagated clade 3C.2a viruses, and somewhat better to A/Singapore/INFIMH /2016-like virus, the new H3N2 component flu-vaccine

43 El Enterovirus-D68 puede causar síntomas respiratorios graves. Puede ser especialmente grave para los niños con asma u otros problemas de salud respiratoria. Algunos pueden requerir hospitalización. Se han descrito brotes aislados, como en USA y Canadá en 2014 Bocavirus. Virus ADN, de la familia Parvoviridae que infecta insectos y vertebrados, incluyendo al hombre. Se ha detectado en muestras respiratorios y digestivas de enfermos y controles sanos. Su patogenicidad es discutible.

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