E. Resumen del Proyecto

Transcripción

1 A. Titulo de la Proputa Sistematización y visualización de la base de datos sobre depositadas en el Herbario Nacional Colombiano de la Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogotá B. Información de contacto Nombre: Lauren Raz Domicilio: Instituto de Ciencias Natural, Universidad Nacional de Colombia, A. A. 7495, Bogotá País: Colombia Teléfono: (57-1) ext Fax: (57-1) Correo electrónico: lraz@unal.edu.co y lraz.icn@gmail.com Página Web: C. Información de Contacto de la Institución Rponsable Nombre de la Institución: Universidad Nacional de Colombia Domicilio: Carrera 30 No Persona contacto en la Institución: Director, Instituto de Ciencias Natural Nombre: Jaime Aguirre Ceballos Teléfono: (57 1) ext D. Rpaldo La prente proputa ha sido revisada por Instituto Alexander von Humboldt, coordinador del Sistema de Información sobre Biodiversidad para Colombia y punto Focal de IABIN para Colombia (Ver carta adjunta pdf): Punto focal: Instituto de Invtigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt Dirección: Diagonal 27 No Director: Dra. Eugenia Ponce de León, Directora General (E). PBX: dirgeneral@humboldt.org.co Persona Contacto: Ángela Suárez Mayorga, Administradora líder de conteni SiB. Dirección Persona Contacto: Cra. 13 No P-7 PBX: ext. 122/ 109 E mail Persona Contacto: amsuarez@humboldt.org.co

2 E. Rumen del Proyecto El Instituto de Ciencias Natural de la Universidad Nacional de Colombia alberga la mayor colección de pecímen biológicos colombianos que existe en el mundo. Esta colección tá en proco de ación, y en la actualidad hay ejemplar y putos a disposición del público en la página web del Instituto ( y a través del Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia (SiB) Estos pecímen incluyen plantas ( ), anfibios (40.000), av (35.000), mamíferos (15.000) e invertebr (17.000). A par del enorme valor de ta información, su utilidad se ve limitada por la poca o nula disponibilidad de la gran mayoría de los pecímen, pecialmente de debido a que te grupo ha sido poco tudiado en nutro país, y a que hasta el momento el proco de ación del herbario se ha concentrado en las familias de plantas fanerógamas. El propósito del prente proyecto ar, ciar y posteriormente liberar información de cerca de ejemplar de depositadas en el Herbario Nacional Colombiano. Además, se documentarán los metadatos gener por el proyecto a través del Catálogo Nacional de Metadatos del SIB- Colombia. Toda ta información será puta a disposición en las páginas Web del ICN y a través de la red digital del IABIN, utilizando los medios que IABIN defina y el Sistema de Búsquedas Distribuidas del SiB- Colombia, coordinado por el punto focal de IABIN en el país. La liberación de tos datos se hará considerando la validación contra lenguaj control y siguiendo los tándar DarwinCore y Estándar para intercambiar información sobre biodiversidad al nivel de organismos, proputo por el SIB-Colombia. El proyecto se darrollará en 12 m y tendrá un costo total de USD $ de los cual se solicitan USD $ a IABIN. Abstract The Instituto de Ciencias Natural of Universidad Nacional de Colombia includ the world s largt collection of biological specimens from Colombia. This collection is in the procs of digitization, and at the prent time there are 235,000 specimens databased and made publicly available at the Institute s website ( The specimens include plants (128,000), amphibians (40,000), birds (35,000), mammals (15,000) and invertebrat (17,000). In spite of the tremendous value of this information, its utility is hampered by the lack of the available of the vast majority of specimens, pecially of cryptogams plants, due the group remain poorly understood in our country and the databasing procs of the herbarium has concentrated on fanerogam plant famili. The main goal of the project is to digitize, georeference and release through the web information of about specimens of cryptogams plants deposited in the Colombian National Herbarium. The metadata of the project will be generated, and controlled vocabulari will be used to increase the quality of the data. All the information will be available in the WebPag of the ICN, as same as through the IABIN network and the Distributed Search Engine of the SIB-Colombia, coordinated by the Colombian focal point. Data structure will follow the standards defined by IABIN, both the Darwin Core and the SIB-Colombia s Minimal Standards for Information Exchange. The project will be developed in 12 months and it will cost USD $64.043,78. The project requts USD $ from IABIN.

3 F. Rumen del Proyecto Las coleccion depositadas en el Instituto de Ciencias Natural cuentan con cerca de pecímen biológicos catalog y pecimen adicional en proco de catalogación. Toda ésta información reprenta la más valiosa documentación existente sobre la diversidad biológica de Colombia. Dde 2001, el Instituto ha venido avanzando en el proco de ar sus coleccion, y liberar la información a través de Internet. En la actualidad, el Instituto tiene pecímen, incluyendo de plantas, de anfibios, de av, de mamíferos y de insectos. Esta cifra reprenta el 28 % de toda su colección, y para los mamíferos, las av y los anfibios reprenta prácticamente el total de cada grupo. Para el herbario, la cifra ada corrponde al 26% del total de las coleccion.toda la información ada tá disponible en la página web del Instituto de Ciencias Natural ( incluyendo una imagen digital de cada pécimen del Herbario Nacional Colombiano. Dado que los datos tán bajo tándar interoperabl, la información se encuentra también visible a través de búsquedas distribuidas en el Sistema de Información sobre Biodiversidad para Colombia (SIB) y a través de GBIF. En cada una de tas institucion, la información del Instituto de Ciencias Natural constituye el conjunto de datos colombianos más grande disponible hasta la fecha. Así pu, el Instituto se ha convertido en un pionero en la puta a disposición de su información. Sin embargo, aunque se cuenta con una enorme cantidad de información, ta se caracteriza aún por prentar enorm vacíos, y no por la falta de ta, sino por la poca o nula disponibilidad. A par que la ación del Herbario Nacional un proco continuo, hasta el momento sólo se ha puto a disposición de la comunidad nacional e internacional una cuarta parte de los ejemplar allí deposit, y con énfasis únicamente en peci de plantas fanerógamas. Esto hace que el acco a la información de plantas se rtrinja exclusivamente a la consulta directa de las coleccion; en muchos casos, particularmente para invtigador fuera de la ciudad o del país, el acco a ésta se limita aún más debido a los costos de dplazamiento y permanencia. Con el darrollo de te proyecto se plantea remediar los actual vacíos en la información al hacer disponibl los datos e imágen de las coleccion biológicas con pecial énfasis en las peci de. Así mismo, se asegurará la disponibilidad e interoperabilidad de los datos a nivel nacional e internacional gracias a la cooperación con las red de Renata (Red Nacional Académica de Tecnología Avanzada), las red del Sistema de Información sobre Biodiversidad para Colombia (SiB), el Global Biodiversity Information Facility y la Red de Especi y Especimen de IABIN. Objetivo General Hacer disponibl e interoperabl datos biológicos sobre de Colombia deposit en el Herbario Nacional Colombiano de la Universidad Nacional de Colombia, a través de las páginas web del ICN, de la SSTN de IABIN y del SiB Colombia, siguiendo los tándar de bas de datos internacional y utilizando los lenguaj control taxonómicos y no taxonómicos existent a la fecha. Objetivos pecíficos 1. Sistematizar, ciar y digitalizar los datos biológicos de los ejemplar de deposit en el Herbario Nacional Colombiano de la Universidad Nacional de Colombia 2. Hacer disponibl los datos de los pecímen de deposit en el Herbario Nacional Colombiano a través de las páginas web del ICN, la SSTN de IABIN y la red nacional de información sobre biodiversidad en coordinación con el Punto Focal nacional, siguiendo tándar recomend por IABIN para bas de datos biológicos de acco libre y con la mayor calidad (entendida como potencial de uso).

4 Metodología Objetivo 1. Sistematizar, ciar y digitalizar los datos biológicos de los ejemplar de deposit en el Herbario Nacional Colombiano de la Universidad Nacional de Colombia. El proyecto cubrirá las peci de musgos, hepáticas, líquen y helechos prent en las coleccion del Herbario Nacional Colombiano (COL). La ación se realizará a partir de las imágen de cada uno de los pecímen. De cada pécimen se incluirá como mínimo la siguiente información: determinación (al nivel más pecífico posible, con toda su jerarquía, e incluyendo el autor del nombre), determinador, fecha de determinación (año, m, día), número de catálogo, colector, número de colector, fecha de colección (añom-día), país, departamento, municipio, localidad, elevación mínima, elevación máxima, latitud, longitud, incertidumbre, tipo de incertidumbre, datum, protocolo de cia, método de ciación y fecha de última modificación del registro. Cómo se cumplirá con los tándar de SSTN? La ación de la información se realizará en la aplicación Specify ( darrollada por la Universidad de Kansas e implementada en el ICN. El proco de ación cumple con el tándar DarwinCore y sus extension Curatorial y Geopacial ( utilizado en los diferent mecanismos nacional de información sobre biodiversidad como el Sistema de Información sobre Biodiversidad - Colombia (SiB) e internacional como el Global Biodiversity Information Facility (GBIF). Igualmente, para los procos de ación, fotografía y ciación de los pecímen de se cuenta con los protocolos y los Manual de Mejor Prácticas elabor por el Instituto de Ciencias Natural con el apoyo del Equipo Coordinador del Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia en el Instituto Humboldt, y con un laboratorio de fotografía tandarizado para pecímen botánicos. Estos procedimientos se llevan a cabo dde el 2004 y se ha fotografiado y ado el 25% del Herbario. Se fotografiarán, arán y ciarán pecimen de plantas de la colección de del Instituto de Ciencias Natural. Objetivo 2. Hacer disponibl los datos de los pecímen de depositadas en el Herbario Nacional Colombiano (COL), a través de las páginas web del ICN y la red del IABIN en coordinación con el Punto Focal nacional, siguiendo tándar recomend por IABIN para bas de datos biológicos de acco libre y con la mayor calidad (entendida como potencial de uso). La información ada de los pecímen de del proyecto se hará disponible a través de la página web del ICN, de la SSTN de IABIN y del Sistema Distribuido de Búsquedas del SiB, mediante el software de proveedor de datos que se recibirá de IABIN. De la misma manera, se documentarán los metadatos en el Catálogo Nacional de Metadatos del SIB, a través de la herramienta Cassia. Indicador de éxito Cómo se llevará a cabo el monitoreo y la evaluación? Qué indicador de cumplimiento y de impacto medirán? Un indicador de éxito del proyecto se medirá con número de registros y ci por m. Éste será a su vez el indicador de avance del proyecto. Esta información se sintetizará en report tandariz. Al final de la prente proputa se podrá medir: Total de pecimen (Mínimo ) y total de pecimen ci (Mínimo ) Qué medidas serán tomadas para asegurar la calidad de los datos? Mensualmente se verificará el 10% de la información a fin de consolidar su calidad.

5 Actividad Fotografía de ejemplar de MES pecíme pecíme pecíme pecíme pecímen pecímen pecímen n n n n fotografiad fotografiad fotografiad fotografiad fotografiad fotografiad fotografiad os os os os os os os Sistematización de pecímen de 4800 pecíme n 9600 pecíme n pecíme n pecíme n pecímen a pecímen a pecímen a pecímen a pecímene s ad os Georreferenciación de pecímen de 6000 pecíme n georrefere nci (15%) pecimen georrefere nci (30%) pecimen ci (45%) pecimen ci (60%) pecimen ci (75%) pecimen ci (90%) pecimen ci (100%) Este proyecto se inserta dentro del plan institucional de ación y construcción de una base disponible en Web de alta calidad sobre la biodiversidad colombiana. Este plan cuenta en la actualidad con varios proyectos como: convenio UN- Mellon Foundation a 2.5 años plan ALUKA, IABIN-PTN-UN a un año ación polinizador, Colciencias-UN a un año ación, Apoyo UN ación por tr años que implica las coleccion de otras sed de la UN. Qué experticia en informática y pecímen tiene nutra institución? Cómo interactúa ta institución con otras institucion en su país que manejan datos sobre pecímen y/o temas relacion? El Instituto de Ciencias Natural de la Universidad Nacional de Colombia ha ado y puto a disposición cerca de datos de ejemplar de animal y plantas a través del portal del ICN y de la red Rumbo y RENATA; para la colección de plantas del Herbario Nacional Colombiano ha ado cerca del 25% de la colección y se han obtenido imágen de cada uno de tos ejemplar; adicionalmente los datos del herbario se encuentran visibl a través del Sistema Distribuido de Búsquedas del Sistema de Información sobre Biodiversidad de Colombia (SIB) y del Global Biodiversity Information Facility (GBIF) y de IABIN. Estos procos atienden los tándar para el intercambio de información tanto para el SIB como para el IABIN, mediante los parámetros de Darwin Core y Estándar para intercambiar información sobre biodiversidad al nivel de organismos. Estas actividad han conllevado al darrollo de un conjunto de personas calificadas en el área así como de una infratructura básica para tas labor. Qué rol ha jugado ta institución en las actividad de IABIN? El proco de ación y liberación de la información de los pecímen deposit en el Instituto de Ciencias Natural ha sido apoyado parcialmente por becas de IABIN, una para la ciación de pecímen a través de la SSTN, y otra para la ación de los pecímen de polinizador (abejas y murciélagos) a través de la PTN. Qué relación tiene con el Punto Focal de IABIN en nutro país?el Instituto ICN miembro del Comité Técnico Directivo del Sistema de Información sobre Biodiversidad para Colombia-SIB que el nodo del IABIN en Colombia con lo cual se hace parte del proco internacional de hacer disponible la información de la diversidad biológica con un criterio de alta calidad académica y libre acco. Impacto del proyecto La necidad y pertinencia de la digitalización de la información, que muchas decision políticas y técnicas acerca del manejo del ambiente han requerido un gran fuerzo de parte de los rponsabl, por falta de información accible. Con frecuencia se recurre a invtigador extranjeros para conseguir

6 información acerca de la diversidad nacional, pu no se cuenta con documentación disponible. La liberación de información brinda la oportunidad de mejorar, aumentar y difundir el conocimiento sobre nutros recursos biológicos, y de ta manera tener herramientas base para su conservación y uso sostenible. El país necita urgentemente información acerca de su diversidad porque sólo así puede apropiarse de ella. Evidencia de to el frecuente uso por la población general de peci foráneas para trategias de recuperación ambiental o incluso como símbolos de la diversidad. En el nivel académico son muy frecuent los mapas de distribución continental que inexplicablemente mutran una discontinuidad en la distribución de peci que coincidente con los límit políticos del país. El impacto social y económico comienza con brindar un invaluable cuerpo de datos que llenará algunos vacíos de información referent a te grupo de organismos y posiblemente motivar a poner en red a otras institucion que tén iniciando o tengan ya algunos datos sobre tas peci. Además, será la base para proponer trategias de conservación, plan de manejo ambiental, programas de uso sostenible, producción y comercialización de las peci y de ésta manera hacer que la comunidad y el sector productivo se apropie y valore los recursos del país. Para to el Instituto de Ciencias Natural ha dirigido sus fuerzos en la vinculación de los saber y la generación de conocimiento con el fin de vincularse con la sociedad y las empras, al hacer que la información disponible sea la base para usar la biodiversidad a nivel tecnológico, productivo y educativo, entre otros. Como parte de ta labor y con el fin de que toda la información reunida en las coleccion sea de fácil acco tanto a la comunidad científica como a la sociedad en general, se ha puto a disposición en la página web del Instituto de Ciencias un Diccionario de los Nombr Comun de las Plantas de Colombia, mediante el cual los usuarios no pecializ pueden consultar el Herbario Nacional Colombiano. Por otro lado, se aprovecharan los recursos y las ventajas que ofrece IABIN para facilitar el acco y la visualización de los datos biológicos de datos de pecímen para la comunidad nacional e internacional. Estar conect a través de IABIN favorecerá el intercambio de información, permitirá mayor acco de nutros datos primarios de biodiversidad a la comunidad para apoyar los procos de invtigación, educación y darrollo y como el objetivo principal, fortalecer nutra capacidad de cooperación. Costo por unidad El costo por cada unidad será de USD $0.57 a la tasa de cambio vigente a Noviembre, El costo asumido por IABIN por cada unidad será de USD $0.25. Este valor se calculó a partir de la experiencia de ación de las coleccion del ICN. Cronograma Actividad MES Adquisición y adecuación equipos x x Sistematización de los pecímen de x x x x x x x x x Georreferenciación de los pecímen de x x x x x x x x Revisión y verificación de conteni x x x x x x x x x x Informe semtral x Elaboración de de los metadatos x x Puta a disposición de los datos x x Informe final x

7 G. Pruputo El costo de ingrar los datos de un ejemplar tará en los $1.320 pos colombianos (USD $0.57 según tasa de cambio Noviembre, 2008). Este valor se calculó a partir de la experiencia de ación de las coleccion del ICN. Rubro IABIN Contrapartida Universidad Nacional de Colombia Total Sistematización COL, registros USD $22.800,00 USD $ ,00 Coordinador de ciación (12 m- USD $538,84/m) USD $ 6.466,00 USD $ Coordinador de proyecto (12 m- USD $779, 67) USD $ 9.356,12 USD $ 9.356,12 Georreferenciador, registros USD $2.544,00 USD $ 2.631,58 Ingeniero de sistemas para transferencia y manejo de datos USD $ 1.386,10 USD $ 1.386,10 Material y suministros USD $ 990,00 USD $ 263,16 Computador USD $ ,89 USD $ ,89 Servidor de aplicacion USD $ 7.894,74 USD $ 7.894,74 Total USD $ ,00 USD $ ,84 USD $ ,84