ÍNDICE ENFERMEDADES INFECCIOSAS... Virus... Bacterias... Resistencias bacterianas... Hongos y parásitos... Serología...

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2 ÍNDICE ENFERMEDADES INFECCIOSAS... Virus... Bacterias... Resistencias bacterianas... Hongos y parásitos... Serología CATÁLOGO INFECCIOSAS

3 Enfermedades Infecciosas CATÁLOGO INFECCIOSAS

4 VIRUS Adenovirus, Infecciones respiratorias, conjuntivitis y PCR a tiempo real 2270 Congelar detección gastroenteritis Bocavirus humano, detección Infección respiratoria aguda PCR a tiempo real 2155 Toma oral Citomegalovirus (CMV), detección Mononucleosis, retitinis, hepatitis y otras enfermedades infecciosas sobre todo en inmunodeprimidos PCR a tiempo real 2241 Toma oral Líq ammiótico Coronavirus, detección ARN Resfriado común, Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARS) PCR + Electroforesis mL 10 días Coriomeningitis Linfocitaria, detección ARN Virus Coriomeningitis linfocitaria PCR a tiempo real mL Coxsackie, detección ARN Virus Miocarditis, Pericarditis, Enfermedad de Bornholm, Fiebre aftosa humana PCR a tiempo real 2180 Congelar ÉbolaZaire, detección ARN Virus Fiebre hemorrágica del Ébola PCR a tiempo real 0218 Echovirus, detección ARN Infección neonatal, meningitis, infección respiratoria PCR a tiempo real 2190 Congelar Enterovirus, detección ARN Meningitis aséptica, Síndrome de pseudopolio, Síndrome piemanoboca, Conjuntivitis epidémica PCR a tiempo real 2160 Líq pericárdico 0, EpsteinBarr (EBV), detección Virus Mononucleosis infecciosa, linfoma de Burkitt y carcinoma nasofaríngeo PCR a tiempo real 2231 Toma oral Biopsia Líq ammiótico Gripe (A/H1N1), detección ARN Virus Nueva gripe PCR a tiempo real 2041 Congelar CATÁLOGO INFECCIOSAS

5 VIRUS Gripe tipo A (Influenza tipo A), detección ARN virus Nueva gripe PCR a tiempo real 2042 Congelar Gripe estacional A H1, detección ARN Gripe estacional PCR a tiempo real 0224 Congelar Gripe estacional A H3, detección ARN Gripe estacional PCR a tiempo real 0225 Congelar Gripe tipo B (Influenza tipo B), detección ARN virus Gripe PCR a tiempo real 2043 Congelar Hepatitis B, cuantificación Virus Seguimiento de la infección producida por el virus de la hepatitis B PCR a tiempo real 2091 Congelar Hepatitis B, detección Virus Detección de la infección producida por el Virus Hepatitis B PCR a tiempo real 2081 Congelar Hepatitis B, estudio de resistencias Estudio de resistencia a lamivudina, emtricitabina, adefovir, entecavir, telbivudina, tenofovir Secuenciación 2095 Congelar 10 días Hepatitis B, genotipo Virus Determinación del tipo vírico (A, B, C, D o E) y estudio de varientes resistentes a tratamiento Secuenciación 2060 Congelar 1 Hepatitis C, cuantificación ARN Virus Seguimiento de la infección producida por el virus de la hepatitis C PCR a tiempo real 2111 Congelar Hepatitis C, detección ARN Virus Detección de la infección producida por el Virus de la Hepatitis C PCR a tiempo real 2112 Congelar Hepatitis C, genotipo ARN Virus Hepatitis D, detección ARN Virus Determinación del tipo vírico y estudio de varientes resistentes al tratamiento con interferón Detección de la infección producida por el virus de la hepatitis Delta Secuenciación 2130 / plasma Congelar 10 días PCR a tiempo real 2205 / plasma Congelar Hepatitis E, detección del ARN Virus Detección de la infección producida por el virus de la hepatitis E PCR + Electroforesis 2285 / plasma Congelar CATÁLOGO INFECCIOSAS

6 VIRUS Hepatitis G, detección del ARN Virus Detección de la infección producida por el virus de la hepatitis G PCR + Electroforesis 2280 / plasma Congelar Herpesvirus 1 (HSV1), detección Herpesvirus 2 (HSV2), detección Herpes labial, que produce la estomatitis herpética Herpes genital que produce vesículas y úlceras genitales. PCR a tiempo real 2201 PCR a tiempo real 2211 Toma oral Toma oral Herpesvirus 6 (HHV6), detección Roseola infantum, exantema súbito de la infancia PCR a tiempo real 2251 Humor vítreo o acuoso 0, Herpesvirus 7 (HHV7), detección Roseola infantum, exantema súbito de la infancia PCR a tiempo real 2254 Herpesvirus 8 (HHV8), detección Sarcoma de Kaposi PCR a tiempo real 2255 Metapneumovirus humano (hmpv), detección ARN Infección respiratoria superior, bronquiolitis, síndrome bronquial obstructivo, neumonía PCR a tiempo real 0385 Exudado faríngeo Norovirus, detección de ARN Papilomavirus, detección y tipado Papilomavirus, detección y tipado (Secuenciación) Papilomavirus, detección y tipado en Citología líquida Parechovirus, detección de ARN Parotiditis, detección, ARN Virus Parvovirus B19, detección Poliomavirus BK, detección Gastroenteritis Detección precoz del cáncer de cervix Detección precoz del cáncer de cervix. Estudio de nuevas variantes del VPH Detección precoz del cáncer de cervix Gastroenteritis, infección respiratoria, encefalopatía, miocarditis Parotiditis (Paperas) Meningitis Eritema infeccioso (quinta enfermedad), hidropesía fetal Infección respiratoria o renal PCR + Electroforesis 2175 Refrigerar PCRRFLPs 2070 Secuenciación 2072 Biopsia (fresco) Biopsia (parafina) Biopsia (fresco) Biopsia (parafina) PCRRFLPs 2071 Citología líquida Tª ambiente PCR a tiempo real 2166 PCR a tiempo real 0207 Exudado faríngeo Exudado faríngeo PCR a tiempo real 2261 / plasma Congelar PCR a tiempo real 2291 CATÁLOGO INFECCIOSAS

7 VIRUS Poliomavirus JC, detección Infección respiratoria, renal, encefalopatía PCR a tiempo real 2290 Rotavirus, detección ARN Rubéola, detección ARN Virus Sarampión, detección ARN Virus Toscana, detección ARN Virus Varicela Zoster (VZV), detección Virus Gastroenteritis aguda Rubéola, Síndrome de Rubéola Congénita (SRC) Sarampión Meningitis Meningoencefalitis Meningitis linfocitaria Varicela y herpes zoster PCR a tiempo real 2170 Refrigerar PCR + Electroforesis 2150 PCR a tiempo real 2052 / plasma Líq amniótico Exudado faríngeo 2mL PCR a tiempo real 0209 PCR a tiempo real 2221 / plasma Toma oral Líq ammiótico 1mL VIH, cuantificación ARN Seguimiento de la infección por VIH RTPCR + PCR a tiempo real 2141 / plasma Congelar 10 días VIH, detección VIH, detección ARN VIH, Resistencias (Proteasa + retrotranscriptasa) Detección de de VIH síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA) en neonatos y primoinfección Detección de ARN de VIH causante del síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA) Determinación del tipo vírico y estudio de varientes resistentes al tratamiento con antivirales PCR a tiempo real 2145 PCR a tiempo real 2144 / plasma Congelar Secuenciación 2148 / plasma Congelar 20 días Virus Respiratorio Sincitial (RSV), detección ARN Infección respiratoria superior, bronquiolitis, síndrome bronquial obstructivo, neumonía PCR a tiempo real 0207 Exudado faríngeo Congelar Refrig / Tª amb XMRV, detección Infección por XMRV PCR + Electroforesis 2295 CATÁLOGO INFECCIOSAS

8 BACTERIAS Neumonía, bacteriemia, meningitis, Acinetobacter baumannii, detección infecciones del tracto urinario y de partes PCR a tiempo real 3376 Exudado blandas Bartonella sp., detección Bacteremia, endocarditis, angiomatosis bacilar, peliosis hepática, fiebre de las trincheras, enfermedad de Carrión PCR a tiempo real 0320 Bartonella henselae, detección Bacteremia, endocarditis, angiomatosis bacilar, peliosis hepatis, enfermedad por arañazo de gato PCR a tiempo real 0321 Bordetella parapertussis, detección Tos convulsiva o coqueluche o tosferina PCR a tiempo real 3318 Moco Toma nasal Aspirado nasal Bordetella pertussis, detección Tos convulsiva o coqueluche o tosferina PCR a tiempo real 3317 Exudado Borrelia burgdorferi, detección Enfermedad de Lyme, borreliosis, fiebre recurrente PCR a tiempo real 3313 / plasma Brucella melitensis, detección Brucelosis PCR + Electroforesis 3311 Médula ósea 150 µl Campylobacter, detección de Fiebre, dolor abdominal, y diarrea PCR a tiempo real 3430 Refrigerar Chlamydia ssp. y Chlamydophila ssp., detección (C. trachomatis, C. pneumoniae, C. abortus, C. psitacci, C. felis, C. muridarum, C. caviae, C. pecorum ) Infecciones genitales Infecciones oculares Infecciones respitatorias PCRRFLPs 3030 Exudado conjuntival Muestra veterinaria Biopsia Consultar Chlamydia trachomatis serovariedad "L", detección Chlamydophila pneumoniae, detección Citrobacter sp., detección de Coxiella burnetii, detección Escherichia coli, detección Linfogranuloma venéreo Neumonia y bronquitis Infecciones urinarias, meningitis neonatal y abscesos cerebrales Fiebre Q Infecciones intestinales y extraintestinales PCR a tiempo real 3032 Exudado PCR a tiempo real 3035 Esputo Congelar PCR a tiempo real 3420 Refrigerar PCR a tiempo real 3060 PCR a tiempo real 3360 CATÁLOGO INFECCIOSAS

9 BACTERIAS Escherichia coli O104:H4, detección Síndrome urémico hemolítico PCR + Electroforesis días Enterobacter cloacae, detección de Infecciones nosocomiales PCR a tiempo real 3415 Gardnerella vaginalis, detección Vaginosis bacteriana PCR a tiempo real 0324 Citología líquida Refrig / Tº amb Haemophilus ducreyi, detección Chancroide PCR a tiempo real 3017 Exudado Refrigerar Haemophilus influenzae, detección Klebsiella pneumoniae, detección de Legionella pneumophila, detección Listeria monocytogenes, detección Micobacteria atipica, detección Infecciones respiratorias, meningitis Infecciones del tracto urinario, neumonías, sepsis, infecciones de tejidos blandos, e infecciones de herida quirúrgica Legionelosis (enfermedad del legionario) Listeriosis Micobacteriosis PCR a tiempo real 3015 PCR a tiempo real 3440 Toma oral Muestras biológicas varias PCR a tiempo real 3401 Congelar PCR a tiempo real 3310 Exudado PCR a tiempo real 3004 Mycobacterium leprae (Bacilo de Hansen), detección Lepra o enfermedad de Hansen PCR + Electroforesis 3005 Biopsia Congelar Mycobacterium tuberculosis complex, detección Tuberculosis Identificación de las especies: M.tuberculosis, M.africanum, M.bovis, M. Microti, M.canetti, M.caprae y M. Pinnipedii PCR a tiempo real 3011 Jugo gástrico Mycoplasma genitalium, detección Uretritis, vaginosis bacteriana, cervicitis, enfermedad pélvica inflamatoria PCR a tiempo real 0325 Refrig / Tª amb Mycoplasma hominis, detección Mycoplasma pneumoniae, detección Pielonefritis, endometritis Neumonía bacteriana PCR a tiempo real 3452 Refrig / Tª amb PCR a tiempo real 3025 Congelar CATÁLOGO INFECCIOSAS

10 BACTERIAS Neisseria gonorrhea, detección Neisseria meningitidis (meningococo), detección Proteus mirabilis, detección Gonorrea Meningitis bacteriana Infecciones del tracto urinario, septicemia, neumonías PCR a tiempo real 3071 Refrig / Tª amb PCR a tiempo real 3070 PCR a tiempo real 3425 Pseudomonas aeruginosa, detección Rickettsia conorii, detección Salmonella sp., detección Infecciones oportunistas Fiebre botonosa mediterránea Salmonelosis, fiebre tifoidea, fiebre paratifoidea PCR a tiempo real 3375 Exudados PCR + Electroforesis 3045 / plasma Congelar 10 días PCR a tiempo real 0317 Refrigerar Salmonella sp., detección e identificación Salmonelosis Secuenciación 3100 Cultivo Refrigerar Serratia marcescens, detección de Infecciones nosocomiales, conjuntivitis, queratitis e infecciones en heridas, riñones y vías urinarias, infecciones respiratorias, meningitis y endocarditis. PCR a tiempo real 3410 Staphylococcus aureus (PVL), detección Infecciones nosocomiales PCR a tiempo real 3377 Muestras biológicas varias Staphylococcus aureus, detección Infecciones nosocomiales PCR a tiempo real 3372 Muestras biológicas varias Streptococcus agalactiae, detección Sepsis neumonía y meningitis neonatal. Infección grave en gestantes PCR a tiempo real 3435 Fluidos biológicos Cultivo CATÁLOGO INFECCIOSAS

11 BACTERIAS Streptococcus pneumoniae (neumococo), detec Neumonía bacteriana PCR a tiempo real 3080 / plasma Toxina A de Clostridium difficile, detección Colitis seudomembranosa PCR + Electroforesis 3406 Refrigerar Toxina B y toxina binaria de Clostridium difficile, detección Colitis seudomembranosa PCR a tiempo real 3405 Refrigerar Ribotipo 027 de Clostridium difficile Colitis seudomembranosa Secuenciación 3407 Refrigerar 10 días Treponema Pallidum, detección Tropheryma whipplei, detección Ureaplasma parvum, detección Ureaplasma urealyticum, detección Sífilis Enfermedad de Whipple Uretritis, cervicitis, enfermedad pélvica inflamatoria, prostatitis, infertilidad, complicaciones en el embarazo Uretritis, cervicitis, enfermedad pélvica inflamatoria, prostatitis, infertilidad, complicaciones en el embarazo PCR a tiempo real 3021 Refrig / Tª amb PCR a tiempo real 3349 PCR a tiempo real 0327 Biopsia Humor vítreo Citología líquida 0, Refrig / Tº amb PCR a tiempo real 3023 Exudado Refrig / Tª amb Vibrio fluvialis, detección e Identificación Gastroenteritis Secuenciación 3110 Cultivo Refrigerar 20 días CATÁLOGO INFECCIOSAS

12 RESISTENCIAS BACTERIANAS ampc ACC, detección PCR a tiempo real 3364 ampc CIT, detección PCR a tiempo real 3366 ampc DHA, detección PCR a tiempo real 3367 ampc EBC, detección blaimp, detección de PCR a tiempo real 3365 PCR a tiempo real 3370 blakpc, detección de PCR a tiempo real 3373 blandm1, detección de blaoxa48, detección de blavim, detección de BLEAS grupo CTXM1, detección de PCR a tiempo real 3374 PCR a tiempo real 3368 PCR a tiempo real 3369 PCR a tiempo real 3361 BLEAS grupo CTXM2, detección de PCR a tiempo real 3362 BLEAS grupo CTXM9, detección de PCR a tiempo real 3363 meca, detección de PCR a tiempo real 3371 Muestras biológicas varias CATÁLOGO INFECCIOSAS

13 HONGOS Y PARÁSITOS Acanthamoeba sp., detección Encefalitis y queratitis amébica PCR + Electroforesis 3350 Raspado de córnea Aspergillus fumigatus, detección Aspergilosis broncopulmonar en individuos inmunosuprimidos, alveolitis y rinitis alérgicas, asma, aspergiloma PCR a tiempo real 3092 Candida sp., detección e identificación Candidiasis PCR + Electroforesis días Candida sp., detección Candida albicans, detección Candida parapsilosis, detección Candida glabrata, detección Candidiasis Candidiasis genital, oral, urinaria y sistémica, esofagitis, onicomicosis, septicemia, granulomas Candidiasis en piel, mucosas, urinaria, sistémica y ocular, endocarditis, peritonitis Candidiasis urinaria y sistémica PCR a tiempo real 3091 PCR a tiempo real 0328 Citología líquida Moco PCR a tiempo real 0329 Citología líquida Tª ambiente PCR a tiempo real 0330 Citología líquida Tª ambiente Cryptococcus neoformans, Cryptococcus gattii Criptococosis PCR + Electroforesis 3325 Biopsia 10 días Filaria spp., detección Filariasis PCR + Electroforesis 3105 Histoplasma capsulatum var. Capsulatum, detección Histoplasmosis PCR + Electroforesis 3120 Médula ósea Biopsia 150 µl Leishmania donovani complex, detección Leismaniosis PCR a tiempo real 3041 Leishmania, detección Leismaniosis PCR + Electroforesis 3040 Muestra veterinaria consultar Refrig / congelar Leishmania, detección y genotipado Listeria monocytogenes, detección Leismaniosis Listeriosis Secuenciación 3042 Biopsia 10 días PCR a tiempo real 3310 Refrigerar CATÁLOGO INFECCIOSAS

14 HONGOS Y PARÁSITOS Plasmodium sp., detección Plasmodium sp., detección y genotipado Pneumocistis jirovecii, detección Paludismo, malaria Paludismo, malaria Neumonía PCR a tiempo real 3321 Secuenciación 3323 PCR a tiempo real 3051 Esputo Congelar Schistosoma mansoni, detección Esquistosomiasis o bilharzia PCR + Electroforesis 3340 Biopsia Taenia solium, detección Infección intestinal PCR + Electroforesis 3450 Toxoplasma gondii, detección Toxoplasmosis PCR a tiempo real 3001 Líq amniótico Líq cefalorraquídeo Trichomonas vaginalis Tricomoniasis urogenital PCR a tiempo real 0326 Citología líquida Refrig / Tº amb Trypanosoma cruzi, detección Enfermedad de Chagas PCR a tiempo real 3314 Exudado CATÁLOGO INFECCIOSAS

15 SEROLOGÍA Anticuerpos antivhc (immunoblot) Confirmación ELISA positivo / dudoso VHC Immunoblot μl Congelar Anticuerpos antivih1 (westernblot) Confirmación ELISA positivo / dudoso VIH1 Westernblot μl Congelar Anticuerpos antivih2 (westernblot) Confirmación ELISA positivo / dudoso VIH2 Westernblot μl Congelar CATÁLOGO INFECCIOSAS