Estudio de la enfermedad en poblaciones acuáticas: Epidemiología Acuática. Ignacio de Blas Facultad de Veterinaria Universidad de Zaragoza

Transcripción

1 Estudio de la enfermedad en poblaciones acuáticas: Epidemiología Acuática Ignacio de Blas Facultad de Veterinaria Universidad de Zaragoza

2 Por qué Epidemiología? Directiva 2006/88 relativa a los requisitos zoosanitarios de los animales y de los productos de la acuicultura, y a la prevención y el control de determinadas enfermedades de los animales acuáticos Sistema de vigilancia zoosanitaria (Art. 10): cualquier aumento de mortalidad (según el tipo de producción) Enfermedades listadas (dependiendo de la presencia de especies susceptibles) (Anexo IV) en todas las explotaciones y zonas de cría de moluscos

3 Epidemiología Comparada Terrestres vs Acuáticos Pocas especies susceptibles Pequeñas pob. cultivadas Tamaño de población conocido Separación silvestre-granja Baja interacción con el ambiente Diagnóstico indirecto (serología) Muestreo no destructivo Muchas especies susceptibles Enormes pob. cultivadas Tamaño de población desconocido Mezcla silvestre-granja Alta interacción con el ambiente Diagnóstico directo Muestreo destructivo

4 Preguntas y Respuestas El patógeno está presente? Detección de enfermedad Vigilancia (status libre) Programas de erradicación Cuánta enfermedad hay? Cálculo de Prevalencia Programas de control Qué variables intervienen? Evaluación de factores de riesgo

5 Elementos en estudios epidemiológicos Muestreo Método de muestreo Tamaño de muestra Fiabilidad diagnóstica Cálculo de resultados

6 Deteción de Enfermedades

7 Métodos de muestreo Probabilísticos (aleatorios) No probabilísticos Probabilidad de detección

8 Muestreo de voluntarios

9 Muestreo de conveniencia

10 Muestreo consecutivo (snow-ball)

11 Muestreo por criterios objetivos

12 Decisión 2001/183 Para VHS e IHN: Las inspecciones clínicas deberán efectuarse durante el período comprendido entre octubre y junio o siempre que la temperatura del agua esté por debajo de los 14 C. Cuando las explotaciones deban ser inspeccionadas clínicamente dos veces al año, los intervalos entre ambas visitas deberán ser de un mínimo de 4 meses. Todas las unidades de producción (estanques, tanques, jaulas de red, etc.) deberán inspeccionarse para comprobar si hay peces muertos, débiles o que actúen de manera anormal. Deberá prestarse especial atención a la zona de desagüe, donde los peces débiles tienen tendencia a acumularse debido a la corriente de agua. Si hay truchas arco iris, toda la muestra estará compuesta de peces de esa especie.

13 Detección de enfermedad: tamaño de muestra n 1 d d = N 2 1 n: tamaño de muestra necesario Método de muestreo d: nº de enfermos esperado en la población no probabilístico N: tamaño de población

14 OIE: Manual de Pruebas de Diagnóstico para los Animales Acuáticos Un valor de prevalencia de diseño a nivel de animal (ej., prevalencia de los animales de una jaula) puede ser de: entre 1% y 5% para infecciones que se trasmiten de forma lenta, y más del 5% para infecciones más contagiosas. Para una concentración al primer nivel (ej. la proporción de piscifactorías de una zona), se considera como conveniente una prevalencia de hasta el 2%.

15 Detección de enfermedad n % 5% 2% N

16 Fiabilidad diagnóstica Máximo Valor Predictivo Negativo Máxima Sensibilidad

17 Fiabilidad diagnóstica Sensibilidad = P(Positivo Infectado) Gold standard Infectado Sano Total Test evaluado Positivo Negativo Total Verdadero Positivo Falso Negativo Infectado Falso Positivo Verdadero Negativo Sano Especificidad = P(Negativo Sano)

18 Fiabilidad diagnóstica Máximo Valor Minimizar Predictivo Negativo Falsos Negativos Máxima Sensibilidad

19 Causas de los Falsos Negativos Entender la evolución de la enfermedad Límite de detección diagnóstica Uso de pools

20 Evolución temporal de la enfermedad 1. Periodo de Latencia Ab Infección Diagnóstico 2. Periodo de Prepatencia Infección Infectante Liberación de patógenos 3. Periodo de Incubación Infección Enfermedad

21 Latencia > Incubación Latencia Infección Síntomas Diagnóstico Incubación Latencia < Incubación Latencia Infección Diagnóstico Síntomas Incubación

22 Latencia > Prepatencia Latencia Infección Eliminación Diagnóstico Síntomas Prepatencia Latencia < Prepatencia Latencia Infección Diagnóstico Eliminación Síntomas Prepatencia

23 Límite de Detección vs Sensibilidad Carga patógeno Límite de detección Resultados negativos Resultados positivoss Resultados negativos Tiempo Carga patógeno Límite de detección Resultados negativos Resultados positivos Resultados negativos Tiempo

24 Consecuencias del pooling Efecto de dilución disminuye Sensibilidad i.e. Nivel de detección = Factores a tener en cuenta: Nivel de detección Tamaño del Pool Carga patógenos en asintomáticos / enfermos Prevalencia =

25 Decisión 2001/183 E1 fluido ovárico o las partes de órganos de un máximo de 10 peces podrán recogerse en un solo tubo estéril que contenga al menos 4 ml de medio de transporte, para constituir una muestra conjunta. El peso del tejido de cada muestra deberá ser de 0,5 gramos como mínimo).

26 Cálculo de Prevalencia

27 Métodos de muestreo Probabilísticos (aleatorios) No probabilísticos Máxima representatividad

28 Métodos probabilísticos Muestreo aleatorio simple o puro Muestreo sistemático Muestreo estratificado Distribución proporcional Distribución significativa Muestreo de conglomerados Muestreo multietápico

29 Muestreo aleatorio simple

30 Muestreo aleatorio simple

31 Muestreo sistemático

32 Muestreo estratificado

33 Muestreo de conglomerados

34 Muestreo multietápico

35 Cálculo de prevalencia: tamaño de muestra P (1 P) n = E n: tamaño de muestra necesario Prevalencia desconocida P: prevalencia esperada Usar P = 0.5 (50%) E: error aceptado absoluto o precisión

36 400 n400 Cálculo de prevalencia: tamaño de muestra 20% 10% 5% ,25 0, , P

37 Medidas transversales Población en riesgo Casos Muertos Morbilidad Casos Población en riesgo Mortalidad Muertos Población en riesgo Letalidad Mortalidad Death Morbilidad Casos

38 Consideraciones para el cálculo Intervalos de confianza (tamaño de muestra) Impacto de fiabilidad diagnóstica Uso de pools

39 Cálculo de límites del IC95% Variable cualitativa p ± 1.96 p (1 n p) Depende del tamaño o de muestra p p (1 n p), p p (1 n p)

40 Valores predictivos Valor Pred. Positivo = P(Infectado Positivo) Gold standard Infectado Sano Total Test evaluado Positivo Negativo Total Verdader o Positivo Falso Negativo Falso Positivo Verdadero Negativo Positivos Negativos Valor Pred. Negativo = P(Sano Negativo)

41 Prevalencia verdadera vs Prevalencia aparente Pr ev verdadera = Pr ev aparente + Es Se + Es 1 1

42 Uso de pools: cálculo de prevalencia p = 1 1 pools positivos pools totales 1 tamaño de pool

43 Resumen

44 Diferencias metodológicas Método de muestreo Tamaño de muestra Fiabilidad diagnóstica Detección Enfermedad No probabilistico Criterios objetivos Mínima preval. Tamaño población Máxima Sensibilidad Cálculo Prevalencia Probabilistico Aleatorio/Sistemático Preval. esperada Precisión Sensib./Especif. conocidas Factores de riesgo

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