Fundamentos y herramientas esenciales para trabajar en Bioinformática CHARLA INTRODUCTORIA
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- Nieves Blanco Acosta
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1 BIOLOGÍA MOLECULAR PARA PROGRAMADORES Fundamentos y herramientas esenciales para trabajar en Bioinformática CHARLA INTRODUCTORIA
2 SERES VIVOS
3 LA CÉLULA "No hay nada vivo más sencillo que una célula, y nada puede llegar a ser más complejo sin comenzar por ser una célula"
4 LA CÉLULA
5 LA CÉLULA
6 LA CÉLULA INFORMACIÓN
7 UN POCO DE HISTORIA Principios del siglo XX Primer cuarto del siglo XX La biología descubrió que la base celular de la información eran los cromosomas. Nace la BIOLOGIA MOLECULAR Ultimo cuarto del siglo XX Los biólogos se volcaron a colectar información genética primero de genes, luego de genomas completos Redescubrimiento de las leyes de Mendel Tercer cuarto del siglo XX Se definieron los mecanismos que utilizan las células para leer esta información y se desarrollaron las herramientas de DNA recombinante
8 LOS GENES Experiments in Plant Hybridization (1865) by Gregor Mendel Read at the meetings of February 8th, and March 8th, 1865
9 CROMOSOMAS En 1920 Thomas Hunt Morgan descubrió que los genes se hallan localizados en el interior de las celulas GENES --> CROMOSOMAS --> NUCLEO
10 GENES De qué se componen los genes? En 1940, el biologo Oswald Avery y sus colegas dieron una brillante y clara respuesta DNA Ácido desoxirribonúcleico INFORMACIÓN
11 DNA LINUS PAULING El hallazgo de Francis Crick, James Watson, Rosalind Franklin y Mauricie Wilkins fue el adelanto mas decisivo
12 DNA
13 CODIFICACIÓN DE LA INFORMACIÓN Resumiendo Toda la información que se hereda se encuentra almacenada en forma química en una molécula: el DNA Es un polímero lineal Construído a partir de cuatro monómeros: adenina, citosina, guanina y timidina (A, T, C y G) Cómo de la información codificada en el DNA se llega a construir un organismo completo?
14 DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR Describe el proceso en dos pasos (transcripción y traducción) por el cual la información genética lleva a la producción de proteínas: DNA RNA proteína
15 CÓDIGO GENÉTICO
16 DE LAS CADENAS A LOS SERES 3D LOCUS DEFINITION AB bp mrna linear PLN 09-JUN-2005 Glycine max mrna for beta-conglycinin alpha prime subunit, complete cds. 1 atcatcagga accagttcaa tatcctagta caccgtatta agaatttaag atatactatg 61 atgagagcgc ggttcccatt actgttgctg ggagttgttt tcctggcatc agtttctgtc 121 tcatttggca ttgcgtattg ggaaaagcag aaccccagtc acaacaagtg cctccgaagt 181 tgcaatagcg agaaagactc ctacaggaac caagcatgcc acgctcgttg caacctcctt 241 aaggtggagg aagaagaaga atgcgaagaa ggtcaaattc cacgaccacg accacaacac 301 ccggagaggg aacgtcagca acacggtgag aaggaggaag acgaaggtga gcagccacgt 361 ccattcccat tcccacgccc acgccaacct cgtcaagagg gagagcacga gcagaaggag 421 gaacacgaat ggcatcgcaa ggaggaaaaa cacggaggaa agggaagtga agaggaacaa 481 gatggacgtg aacacccacg cccacac 1 mmrarfplll lgvvflasvs vsfgiaywek qnpshnkclr scnsekdsyr nqacharcnl 61 lkveeeeece egqiprprpq hpererqqhg ekeedegeqp rpfpfprprq prqegeheqk 121 eehewhrkee khggkgseee qdgrehprph qphqkeeekh ewqhkqekhq gkeseeeeed 181 qdedeeqdke sqesegsesq reprrhknkn pfhfnskrfq tlfknqyghv rvlqrfnkrs
17 TECNOLOGÍA DEL DNA RECOMBINANTE O INGENIERÍA GENÉTICA Aislar fragmentos de DNA de interés unirlos en nuevas combinaciones e introducir el nuevo DNA (recombinado) en un organismo vivo.
18
19
20 EL RESULTADO...
21 La información acumulada no sólo es información genética (secuencias de DNA). Expresión de RNAs Interacción entre proteínas Estructuras tridimensionales Anulación sistemática de genes Etc, etc,... Cada vez más diversos estudios comienzan con el análisis de bases de datos. Cada vez más el trabajo de laboratorio termina en la acumulación de colecciones masivas de datos que deben ser luego analizados
22
23 La biología está siendo transformada en una ciencia de la información "LOS COMPUTADORES SON A LA BIOLOGIA, LO QUE LA MATEMÁTICA ES A LA FISICA"
24 BIOLOGÍA COMPUTACIONAL BIOINFORMÁTICA INFORMACIÓN GENÉTICA ESTRUCTURA MOLECULAR FUNCIONES FENOTIPO
25 International Tomato Sequencing Project Home Rice Bioinformatics Group
26 REFERENCIAS Online Book of Biology. MJ Farabee, Molecular Biology of the Cell, Alberts et al 4th Ed, 2002, Garland Publishing. Las raíces de la vida. M. Hoagland. Biblioteca Científica Salvat, El ABC de la Biotecnología. Fundación REDBIO Internacional y Foro Argentina de Biotecnología. NCBI, National Center for Biotechnology Information Lic. Virginia González
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