Análisis de imágenes en 3D y de redes anatómicas en vertebrados

Transcripción

1 Curso taller presencial Departamento de Biología Facultad de Ciencias

2 Intensidad horaria 40 horas Horarios Lunes a viernes de 8:00 a.m. a 12:00 m. y de 2:00 p.m. a 6:00 p.m. Objetivos General Actualizar y entrenar a especialistas en el uso de técnicas de punta para análisis de estructuras en morfología de vertebrados. Específicos Entrenar en técnicas de análisis de imágenes en 3D. Entrenar en técnicas de modelado y análisis de redes anatómicas. Demostrar posibilidades técnicas para descripción y análisis de estructuras en vertebrados. Propuesta de valor El aprendizaje en el uso de nuevas técnicas para análisis morfológico es esencial para que la comunidad científica Colombiana interesada en la morfología en general, y de vertebrados en particular, se integre en la comunidad científica internacional. Este curso introduce a los participantes en dos de estas nuevas herramientas: el análisis de imágenes en 3D, y el modelado y análisis de redes anatómicas (o AnNA, por su acrónimo en inglés). Al finalizar el curso, los participantes serán capaces de aplicar estas herramientas a sus propios estudios. La instrucción por parte de especialistas internacionales en el uso de estas técnicas de análisis en morfología de vertebrados, está enfocada a que los participantes adquieran una base de conocimiento suficiente para desarrollar sus propios proyectos de investigación usando estas técnicas. Dirigido a Biólogos o profesionales de carreras afines interesados en la morfología en general, o en la morfología de vertebrados en particular. Requisitos mínimos Estudiantes que estén haciendo sus trabajos de grado (Maestría o Pregrado) o Tesis de Doctorado en temas que signifique que el uso de estas técnicas les sea útil para la resolución

3 de sus problemas. De aquí en adelante, cualquier profesional que se esté desempeñando en el área de uso potencial o real de las técnicas. Preferiblemente con un nivel básico del manejo del paquete R. Metodología Será un curso-taller que se distribuirá de la siguiente manera: dos días y medio para el entrenamiento en imágenes en 3D, y dos días y medio para el trabajo en Análisis de Redes Anatómicas (AnNA). Presentación del programa El programa está dividido en dos partes: imágenes en 3D y análisis de redes anatómicas (AnNA). El resultado de este taller permitirá entonces una integración de dos técnicas de punta utilizadas hoy en día en morfología, complementando así las descripciones de las partes de los vertebrados. El uso de las técnicas 3D es relativamente reciente. Aunque, históricamente, el desarrollo de las reconstrucciones en 3D parte en el siglo XIX con modelos de secciones histológicas, el gran salto se comenzó a dar en los años 50 del siglo XX, ayudado por el desarrollo también de la tomografía computarizada (TC) y las imágenes de resonancia magnética. Evidentemente, el perfeccionamiento de las 3D ha tenido un avance impresionante desde los años 80 del siglo XX hasta nuestros días. Por su parte, el AnNA es una técnica mucho más nueva., propuesta hacia principios de la primera década del siglo XXI por los científicos españoles Diego Rasskin-Gutman y Borja Esteve-Altava, basados en las ideas de anatomistas franceses y alemanes de principios del siglo XIX acerca de la conexión de las partes anatómicas. Con base en estas, y en la ciencia de redes, las AnNA se han utilizado para estudiar la evolución y el desarrollo (EvoDevo en inglés) de partes anatómicas de vertebrados, principalmente del cráneo, identificando de este modo las restricciones del desarrollo de este último. Todo lo anterior muestra la importancia que tiene el conocimiento e implementación de estas técnica en el estudio de la morfología, tanto descriptiva como funcional, de los vertebrados. Contenidos Introducción: El uso de imágenes en el presente y futuro de la morfología de vertebrados. Módulo 1: Imágenes en 3D con el programa Avizo Nociones básicas de imágenes en 3D. Creación de un modelo de imágenes en 3D. Análisis de imágenes. Módulo 2: Análisis de Redes Anatómicas

4 Nociones básicas de R, RStudio y presentación del paquete igraph. Creación de un modelo de red de un sistema anatómico. Análisis de la estructura de la red. Análisis de modularidad Este temario puede tener variaciones, siendo una propuesta de capacitación flexible, que busque el máximo desempeño de los alumnos, de acuerdo con las necesidades específicas de los mismos. Conferencistas Julio Mario Hoyos Profesor Titular del Departamento de Biología de la Pontificia Universidad Javeriana. Sus actividades de docencia e investigación se han centrado en el estudio de la morfología, la sistemática y la biogeografía de vertebrados, con énfasis en anfibios y reptiles no aves. Sus intereses también van hacia el estudio del desarrollo de anuros (ranas y sapos) y de la utilización de caracteres anatómicos, principalmente de huesos y músculos, para establecer hipótesis de parentesco. Borja Esteve- Altava Morfólogo evolutivo y teórico, con Ph. D. en Biodiversidad. Sus investigaciones están enfocadas principalmente al estudio de la evolución de las formas. Particularmente interesado en cómo los seres vivos adquieren la organización modular por medio de la evolución. Su principal herramienta de estudio son las redes anatómicas, las cuales significan el análisis morfológico utilizando teoría de redes. Ha dictado varios curos internacionales (e.g. Washington D.C.) de este tipo de técnica y análisis. Maria Camila Vallejo Pareja Bióloga de la Universidad Nacional de Colombia y estudiante de Maestría del Department of Biological Sciences, Sam Houston State University Huntsville Texas. Actualmente se dedica al estudio del cráneo en lagartos. Sus investigaciones y publicaciones han estado centradas en el estudio de fósiles de mamíferos. Tiene experiencia docente llevada a cabo en la Universidad nacional y en la Universidad Sam Houston (Texas), donde estudia en este momento. Está entrenada en las técnicas de análisis 3D, las que usa para el desarrollo de su Maestría.

5 El comité académico se reserva el derecho de modificar la asignación de conferencistas. Certificación Se otorgará certificación a quién haya asistido por lo menos al 80% de las horas programadas. Nota: Las personas que se inscriban a través de cuenta de cobro recibirán este diploma de asistencia una vez la empresa haya realizado el pago.