Guía Docente ESCUELA POLITÉCNICA SUPERIOR TÉCNICAS AVANZADAS DE PROCESAMIENTO DE

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1 Guía Docente TÉCNICAS AVANZADAS DE PROCESAMIENTO DE IMÁGENES EN MEDICINA CURSO 1, SEMESTRE 1 MASTER EN ING. BIOMÉDICA MODALIDAD: PRESENCIAL CURSO ESCUELA POLITÉCNICA SUPERIOR

2 1. IDENTIFICACIÓN DE LA ASIGNATURA 1.- ASIGNATURA: Nombre: Técnicas avanzadas de procesamiento de imágenes en medicina Código: Curso(s) en el que se imparte: 1 Semestre(s) en el que se imparte: 1 Carácter: Optativa ECTS: 2.5 Idioma: Español Modalidad: Presencial Master(s) en que se imparte la asignatura: Ing. Biomédica Facultad en la que se imparte la titulación: Escuela Politécnica Superior 2.- ORGANIZACIÓN DE LA ASIGNATURA: Departamento: Tecnologías de la Información Área de conocimiento: Lenguajes y sistemas informáticos 2. PROFESORADO DE LA ASIGNATURA 1.- IDENTIFICACIÓN DEL PROFESORADO: Responsable de Asignatura Nombre: Tlfno (ext): DATOS DE CONTACTO JOSÉ ANGEL PINEDA PARDO joseangel.ppardo@gmail.com Despacho: hmcinac, Av Carlos V 70 Perfil Docente e Investigador Líneas de Investigación: INGENIERO BIOMÉDICO, PHD IMÁGENES Y SEÑALES BIOMÉDICAS, NEUROCIENCIA COMPUTACIONAL, ULTRASONIDO TERAPEÚTICO Profesores Nombre: Tlfno (ext): DATOS DE CONTACTO GUGLIELMO FOFFANI guglielmo.foffani@gmail.com Despacho hmcinac, Av Carlos V 70 Perfil Docente e Investigador Líneas de Investigación: INGENIERO BIOMÉDICO, PHD IMÁGENES Y SEÑALES BIOMÉDICAS, NEUROCIENCIA COMPUTACIONAL, NEUROESTIMULACIÓN 2

3 2.- ACCIÓN TUTORIAL: Para todas las consultas relativas a la asignatura, los alumnos pueden contactar con el/los profesores a través del , del teléfono y en el despacho a las horas de tutoría que se harán públicas, en el portal del alumno. Por otra parte, el profesor podrá convocar a tutorías al alumno para tratar de cualquier aspecto de la asignatura o para cualquier actividad de la misma, incluidas las de evaluación. 3. DESCRIPCIÓN DE LA ASIGNATURA Se introducirán los principios básicos del procesado de imagen médica, así como la generación de imágenes en RM, CT, PET y US, haciendo un breve repaso de sus bases teóricas. Tras ello la asignatura se centrará en el procesado de la imagen médica (optimización, registro, texturas, segmentación y visualización). La asignatura tendrá un enfoque práctico, donde se realizaran ejercicios muy vinculados a la investigación, con especial interés hacia la neuroimagen. Se espera que el alumno tenga conocimientos previos básicos de programación, preferiblemente Matlab. Tras cursar la asignatura de técnicas avanzadas de procesamiento de imágenes en medicina el alumno deberá ser capaz de manejar datos de la mayoría de las modalidades de imagen médica, transformando las imágenes crudas con el objetivo de extraer información para problemas de ámbito medico y de investigación. 1.- COMPETENCIAS: Código de la competencia CB7 CB9 CB10 4. COMPETENCIAS Competencias Básicas Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio. Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades. Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida auto dirigido o autónomo. Código de la competencia CO01 Competencias Optativas Aplicar técnicas avanzadas de procesado de señal biomédica. 2.- RESULTADOS DE APRENDIZAJE: Resultados de Aprendizaje Comprender el impacto económico y social de la tecnología biomédica. Evaluar la viabilidad tecnológica y económica de un plan de negocio en el sector biotecnológico. 3

4 5. ACTIVIDADES FORMATIVAS 1.- DISTRIBUCIÓN TRABAJO DEL ESTUDIANTE: Total Horas de la Asignatura 75 Código Nombre Horas Presenciales AF-1 Seminario 15 AF-2 Seminario de ejercicios-problemas 5 AF-3 Prácticas 10 TOTAL Horas Presenciales 30 Código Nombre Horas No Presenciales AF-5 Trabajo Autónomo del Estudiante DESCRIPCIÓN ACTIVIDADES FORMATIVAS: Actividad AF-1 AF-2 AF-3 AF-5 Definición Actividad formativa en el aula bajo la guía del profesor que utiliza la metodología expositiva, la resolución de problemas y la presentación de casos para fomentar el aprendizaje del alumno. Actividad formativa en el aula que, bajo la guía del profesor, se ordena a la resolución individual o cooperativa de ejercicios y problemas. Actividad formativa que involucra material de laboratorio adecuado y, que bajo la guía del profesor-tutor, fomenta el aprendizaje autónomo y/o cooperativo del estudiante a través de la realización técnica de prácticas o proyectos. Actividad formativa consistente en trabajo autónomo del estudiante fuera del aula. 6. SISTEMAS Y CRITERIOS DE EVALUACIÓN 1.- SISTEMAS Y CRITERIOS DE EVALUACIÓN: CONVOCATORIA ORDINARIA. EVALUACIÓN CONTINUA: Describir aquí el sistema de evaluación. Idealmente debería ajustarse a los siguientes porcentajes: S1: (examen tradicional): 35% de la nota de la asignatura S2: (trabajos, informes y presentaciones): 65% de la nota de la asignatura S1 Pruebas escritas Pruebas escritas de desarrollo o de elección de respuestas verdadero-falso, elección múltiple, emparejamiento de elementos 4

5 S2 Proyectos, informes y memorias de prácticas Realización y presentación escrita y oral de proyectos técnicos, que se realizarán semanalmente siguiendo el programa de la asignatura. CONVOCATORIA EXTRAORDINARIA: El alumno que no supere la asignatura en la convocatoria ordinaria tendrá la opción de presentarse a la convocatoria extraordinaria. Esta convocatoria constará de una prueba presencial única que determinará la calificación final de la asignatura, sin tener en cuenta su rendimiento académico en la convocatoria ordinaria. Al igual que en ésta, para superar la asignatura en convocatoria extraordinaria será necesario alcanzar el nivel mínimo establecido para cada resultado de aprendizaje. 1.- PROGRAMA DE LA ASIGNATURA: 7. PROGRAMA DE LA ASIGNATURA PROGRAMA TEÓRICO: detallar aquí el programa teórico; contenidos según verifica (a modificar según se crea conveniente) Fundamentos del la imagen médica Generación de imágenes médicas, con especial atención a las técnicas de resonancia magnética y tomografía por emisión de positrones Procesado morfológico de imágenes médicas Registro de imágenes Detección de características de la imagen médica: análisis de texturas y análisis multi-escala Detección de movimiento en imagen médica Segmentación de imágenes médicas Clasificación y cuantificación de imágenes médicas Visualización y fusión de imágenes médicas Medidas de calidad en imagen médica PROGRAMA DE PRÁCTICAS: Las prácticas seguirán en paralelo a las clases teóricas. Las prácticas se realizarán con las herramientas Matlab, ImageJ, 3DSlicer, ANTs y/o elastix. 8. BIBLIOGRAFÍA DE LA ASIGNATURA 1.- BIBLIOGRAFÍA BÁSICA: Biomedical Image Analysis. Rangaraj M. Rangayyan. CRC Press Biomedical Image Processing. (Biomedical and Medical Physics, Biomedical Engineering) Thomas M. Deserno, Springer 2.- BIBLIOGRAFÍA COMPLEMENTARIA: Biomedical Image Analysis: Tracking. Scott T. Acton and Nilanjan Ray. Morgan&Claypool Publishers Image processing, analysis and machine visión. Milan Sonka, Vaclav Hlavac and Roger Boyle. 4.- RECURSOS WEB DE UTILIDAD: 5

6 NORMAS DE COMPORTAMIENTO 1.- NORMAS: Las faltas en la Integridad Académica (ausencia de citación de fuentes, plagios de trabajos o uso indebido/prohibido de información durante los exámenes), así como firmar en la hoja de asistencia por un compañero que no está en clase, implicarán la pérdida de la evaluación continua, sin perjuicio de las acciones sancionadoras que estén establecidas. 6