FORMULARIO DE PROPUESTA DE CURSOS

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1 UNIDAD DE POSGRADO Y EDUCACIÓN PERMANENTE UNIDAD DE ENSEÑANZA FORMULARIO DE PROPUESTA DE CURSOS 1. Datos generales del curso Por favor indique el Programa al que pertenece prioritariamente el curso y los cupos para estudiantes de diferentes programas: Programa Marque el programa al que el curso pertenece: Cupos para estudiantes de cada programa: Posgrado Académico x 30 Posgrado Profesional 10 Educación Permanente 10 Grado (optativos de 5to) 0 Cupo Total 50 Modalidad del Curso: x Presencial A Distancia En caso de ser curso de posgrado, indicar tipo de curso: Curso General (créditos pueden contar como obligatorios) para el programa de Maestría en Ciencias Agrarias Curso de la Opción de especialización de la Maestría (indicar opción): Bioestadistica, Ciencias Vegetales Obligatorio para el posgrado profesional (indicar programa): Temática opcional SERVICIO : DEPARTAMENTO O UNIDAD : Universidad de la República - Facultad de Agronomía Producción Vegetal; Biometría, Estadística y Computación NOMBRE DEL CURSO : Utilización de herramientas genómicas en vegetales: análisis de QTL, mapeo asociativo y selección genómica PALABRAS CLAVES (3): Mejoramiento genético, Genética, Estadística Genética

2 2. Equipo docente Para todos los docentes por favor incluir el título académico (p.ej., Ing. Agr., M.Sc., Ph.D) delante del nombre. En cargo especificar grado docente y dedicación horaria global (semanal). Docentes responsables : Nombre Ing. Agr. Ph.D. Ariel Castro Cargo Gr.5, 40 hs DT Nombre Ing. Agr. Ph.D. Lucía Gutiérrez Cargo Gr.4, 40 hs DT Docentes Participantes de la UDELAR : Nombre Especialistas invitados : Nombre Ph.D. Martín Quincke Cargo Investigador Principal Institución INIA - Uruguay Especialización Mejoramiento Genético de Trigo Docentes Extranjeros : Nombre Ph.D. Rex Bernardo Cargo Professor and Endowed Chair in Corn Breeding and Genetics in the Department of Agronomy and Plant Genetics. País de origen Estados Unidos Especialización Genomic Selection Institución o Universidad University of Minnesota Nombre Ph.D. Susan McCouch Cargo Professor of Plant Breeding and Plant Genetics País de origen Estados Unidos Especialización Rice Breeding Institución o Universidad Cornell University 3. Programa del curso DESTINATARIOS : Estudiantes de la Maestría en Ciencias Agrarias y de PEDECIBA. Estudiantes del Doctorado en Ciencias Agrarias, post-docs, investigadores y mejoradores. (Indique a quien va dirigido el curso citando disciplina y especialización)

3 OBJETIVOS: (Indique brevemente los objetivos principales del curso) Desarrollo de los conceptos referidos a la utilización de información genómica (marcadores moleculares, mapas de ligamiento) en el estudio de las bases genéticas de variables de interés con especial referencia a su aplicación en el mejoramiento vegetal. Desarrollo de capacidades en la aplicación de distintas herramientas de análisis de QTL y mapeo por asociación, y de los conceptos de selección genómica. Desarrollo de principios, conceptos y prácticas en el uso de marcadores moleculares para el mejoramiento de caracteres complejos en plantas. CONTENIDOS : Teóricos: (Indique brevemente los principales contenidos temáticos del curso) 1. Introducción general. Herramientas genómicas y mejoramiento genético. Objetivos de mejoramiento. Conceptos generales de mejoramiento genético. 2. Marcadores genéticos. Marcadores moleculares. Utilidades, limitaciones. Efectos de escala y utilización práctica. 3. Análisis de ligamiento, construcción de mapas de ligamiento. Relación mapas de ligamiento- mapas físicos. 4. Asociación marcadores-genes, análisis de regresión simple. Ejemplos clásicos de utilización de marcadores en selección asistida. 5. Análisis de poblaciones balanceadas. Generaciones avanzadas, generaciones tempranas y poblaciones doble haploides. Análisis de regresión simple, análisis de intervalo. 6. Análisis de intervalo compuesto. Alineamiento de mapas. 7. Limitaciones del análisis de QTL clásico. Precisión, resolución, efecto del tamaño de población. Calidad de datos. Uso de modelos mixtos. Interacción QTL x ambiente. 8. Estudio de poblaciones no balanceadas. Diversidad genómica, desequilibrio de ligamiento y estudios de asociación. Estructura de poblaciones 9. Revisión del mejoramiento vegetal, revisión de las estrategias en selección por marcadores, de poblaciones y genética cuantitativa. 10. Genome Wide association análisis Genome Wide association análisis Selección asistida por marcadores para QTL de efecto mayor, enriquecimiento de la F2, selección recurrente asistida por marcadores e introducción a la selección genómica. 13. Selección Genómica Selección Genómica Síntesis final. Integración de marcadores en un programa de mejoramiento aplicado. Prácticos: 1. Análisis de ligamiento. Ligamientos simples. Mapas de ligamiento. 2. Análisis de asociación marcador/gen. Uso de software estadístico de rutina para el

4 estudio de este tipo de asociaciones. 3. QTL1. Análisis de intervalo simple y compuesto. 4. QTL2. Modelos avanzados. 5. Asociación Asociación Estrategias de mejoramiento. Talleres Discusión de los métodos presentados en los prácticos. Discusión de los ejercicios. Presentaciones Se presentarán trabajos nacionales publicados recientemente, por sus autores Bibliografía Se dispondrá del material necesario (artículos científicos, software, etc.) en página web. Se presentará y discutirá software específico para eqtl y en R. METODOLOGÍA : CURSOS PRESENCIALES: Exposiciones x Trabajos Prácticos x Actividades Grupales x Otras (indicar cual/es) CURSOS A DISTANCIA: Video-conferencia Materiales escritos Internet En caso de utilizar videoconferencia: Localidad emisora Localidades receptoras SISTEMA DE EVALUACIÓN (en caso de realizarse evaluación de los estudiantes) : Entrega de Ejercicios Prácticos Presentación de trabajos científicos en forma de seminario. Los trabajos serán asignados por el responsable del curso y se discutirán en plenario (presentación de 15 minutos, 15 de discusión) BIBLIOGRAFÍA : Se dispondrá del material necesario (artículos científicos, software, etc.) en página web. Se presentará y discutirá software específico para eqtl y en R.

5 CRONOGRAMA DEL CURSO : Año: 2015 Semestre: Primero Bimestre (si es de posgrado):1 10, 11 y 12 de Febrero: EEMAC, Paysandú 23, 24, 25, 26 y 27 Febrero: CURE, Maldonado 9, 10, 11, 12 Marzo: FAGRO, Montevideo Frecuencia (anual, cada dos años, a demanda) : Cada dos años EVALUACIÓN : (Indicar si se realiza) DEL CURSO: (Por los cursantes) si (Por los docentes) (Por el responsable de Educación Permanente) DE LOS CURSANTES: (Por parte de los docentes) si INTERSERVICIO : Indique con cual / es : FECHA PROBABLE DE REALIZACION: A partir del 10/02/2014 HORAS TOTALES : 108 Por favor desglosar las horas totales en: Teórico, Teórico práctico, seminario, presentación oral y/o defensa de informes o 48 realización de evaluaciones Práctica de campo o laboratorio 30 Trabajo grupal o individual de preparación de informes 20 Excursiones, lectura domiciliaria de bibliografía obligatoria exigible en algún tipo 20 de evaluación y cuyos contenidos no hayan sido tratados en clase, pero formen parte de la estrategia docente del curso Un curso de posgrado puede otorgar hasta 6 créditos (salvo fundadas excepciones). Para la UDELAR, 1 crédito equivale a 15 horas de trabajo del estudiante (sumando presenciales y no presenciales). CRÉDITOS SUGERIDOS : 6 LOCALIDAD : SALÓN : EEMAC, Cure y Montevideo Para los cursos de Educación Permanente: MATRICULA : SI Monto matrícula : USD 500 Con el objetivo de mejorar el proceso de propuestas de cursos en forma coordinada agregue si desea comentarios, sugerencias o críticas al presente formulario. Muchas gracias.

6 No rellenar esta parte (para uso interno de la Unidad) Formulario completo Fecha recibido el formulario: / / Aval del coordinador de opción Aval del Director del Departamento o Unidad Aprobado por Comité Académico de Posgrados (fecha: / / ) Aprobado por Comisión de Enseñanza (fecha: / / ) Código del curso en BEDELÍA: Fecha límite de inscripción: / / Publicado en página web