Diagnòstic microbiològic. Quan i com?

Tamaño: px

Comenzar la demostración a partir de la página:

Download "Diagnòstic microbiològic. Quan i com?"

Irene Paz Macías
hace 6 años
Vistas:

1 Gastroenteritis víriques: Diagnòstic microbiològic. Quan i com? Núria Rabella 27 maig Hospital de la Santa Creu i Sant Pau Gastroenteritis víriques. Diagnòstic

2 Virus causants de gastroenteritis Hospital de la Santa Creu i Sant Pau Gastroenteritis víriques. Diagnòstic

3 Virus causants de gastroenteritis * Els virus han de ser empassats * Resistir l àcid clorhídric de l'estómac * Resistir els àcids biliars del duodè * Trobar les cèl.lules susceptibles de l'intestí Persistència a pesar de les mesures de desinfecció que usualment eradiquen la contaminació bacteriana 3

4 Gastroenteritis vírica Etiologia Rotavirus Norovirus Sapovirus Astrovirus Adenovirus 40, 41 Coronavirus Torovirus Parechovirus Aichi virus Birnavirus Bocavirus 4

5 Etiologia de la gastroenteritis nosocomial Anys: Seguiment prospectiu de brots de gastroenteritis Avon County, Regne Unit Hospitals: 4 grans, 11 de petits / 238B / 122E / 61N (50%) Residències: 135 / 33B / 19E / 14N (74%) Lopman BA et al. Clinical manifestation of norovirus gasroenteritis in health care settings. CID

6 Etiologia de la gastroenteritis Lopman BA et al. Clinical manifestation of norovirus gasroenteritis in health care settings. CID Hospital de la Santa Creu i Sant Pau Gastroenteritis víriques. Diagnòstic

7 Etiologia de la gastroenteritis de la comunitat Bacteris enteropatògens 17 (2,4%) Virus 232 (21%) Norovirus 114 Rotavirus 52 Sapovirus 43 Adenovirus 27 Astrovirus 14 Paràsits 48 (6,8%) Toxines bacterianes 24 (7,8%) Total de diagnòstics 46% De Wit MAS et al. Sensor, a population-based cohort study on gastroenteritis in the Netherlands: Incidence and etiology. Am J Epidemiol

8 Reoviridae Rotavirus Sis grups antigènics. A-F A, B, C detectats en humans 7 P serotipus segons la VP4 de càpside Capacitat de recombinació del material genètic (11 fragments) Codifiquen una enterotoxina 8

9 Adenoviridae Mastadenovirus Adenovirus 40, 41 Sis subgrups: A-F Subgrup F associat a gastroenteritis Altres serotipus en pacients immunodeprimits No es detecta en cultius cel lulars Circula tot l any 9

10 Astroviridae Astrovirus Genogrup A: serotipus 1-5 i 8 Genogrup B: serotipus 6 i 7 12 genotipus No hi ha una completa correlació entre genotipus i serotipus. El més prevalent HAstV-1 No immunitat creuada Múltiples tipus circulant al mateix temps en una zona geogràfica 10

11 Astroviridae Astrovirus Diferències en virulència segons el genotipus. HAstV-3, particularment el genotipus IV implicat en casos de diarrea persistent de durada fins a 3 mesos Correlació entre la càrrega vírica i la durada de la diarrea Descobriment de que la càpside vírica te propietats similars a les enterotoxines que són dosi-depenents 11

12 Caliciviridae Norovirus Sapovirus 12 Hospital de la Santa Creu i Sant Pau Gastroenteritis víriques. Diagnòstic

13 Norovirus Genogrups I-II-IV, com a mínim 40 genotipus nombrosos subgrups Acumulació de mutacions puntuals i recombinació Expressió dels gens de la càpside en baculovirus per produir VLP Receptors: antígens de grup sanguini ABO, relacionats amb susceptibilitat Emergència de noves variants que substitueixen las anteriors: nova soca pandèmica cada 2-4 anys 13

14 Norovirus Únic hoste l home Dosi infectiva baixa (10-100) Transmissió: gotes, fomites, contacte persona-persona, contaminació ambiental. Casos secundaris:30% Excreció vírica abans símptomes i després (10 9 ) Virus manté la seva infectivitat en un ampli rang de temperatures des de la congelació fins 60ºC Degut a la gran diversitat de soques i a la falta d immunitat creuada les infeccions es repeteixen al llarg de la vida 14

15 Norovirus És la causa més comuna de gastroenteritis en els adults i la segona en nens: 5%-31% de pacients hospitalitzats per gastroenteritis 5%-36% de pacients que consulten al metge Patel MM et al. Systematic literature review of role of noroviruses in sporadic gastroenteritis. Emerg Infect dis

16 Norovirus Infecció nosocomial: 30%-50% brots epidèmics en hospitals i residències altament transmissible múltiples maneres de transmissió (seqüencial 7) resistent als desinfectants Complicacions Eliminació prolongada Infecció crònica: noves variants? Said MA et al. Gastrointestinal flu: norovirus in health care and long-term facilities. CID

17 Diagnòstic: Norovirus RT-PCR detecten la majoria de soques però no totes RT-PCR a temps real més sensible EIA molt específic per alguns genotipus, la sensibilitat és genotipus depenent. Útil en brots. Confirmació negatius amb RT-PCR Patel MM et al. Noroviruses : A comprehensive review. J Clin Virol

(picornavirus) Virus Aichi (picornavirus) 18 Hospital

18 Altres virus Coronaviridae Coronavirus Torovirus Birnavirus Bocavirus (parvovirus) Parechovirus (picornavirus) Virus Aichi (picornavirus) 18 Hospital de la Santa Creu i Sant Pau Gastroenteritis víriques. Diagnòstic

19 Una mostra tenia 7 virus diferents Les mesures que serveixen per eliminar els coliformes no serveixen pels virus 19 Hospital de la Santa Creu i Sant Pau Gastroenteritis víriques. Diagnòstic

20 Gastroenteritis vírica Transmissió a través de l aigua o dels aliments Transmissió persona a persona Transmissió nosocomial Alguns amb distribució estacional característica Afectació de nens i adults Incubació: 1 a 4 dies Durada: 2 a 7 dies Eliminació vírica més enllà del quadre clínic 20

21 Gastroenteritis vírica Diagnòstic etiològic QUAN? Gastroenteritis que requereixen hospitalització Brots epidèmics GEA de nova aparició en hospitals o residències 21

22 Gastroenteritis vírica Diagnòstic etiològic COM? Microscopia electrònica: poc sensible i laboriosa per moltes mostres Immunomicroscopia 22 Hospital de la Santa Creu i Sant Pau Gastroenteritis víriques. Diagnòstic

23 Gastroenteritis vírica Diagnòstic etiològic COM? Detecció d antigen: EIA, làtex, ICG poc sensible comercialitzats: rotavirus, adenovirus, astrovirus, norovirus 23

24 Gastroenteritis vírica Diagnòstic etiològic COM? Detecció d àcids nucleics: molt sensible PCR multiplex atenció a les diverses variants correlació amb infectivitat 24

25 Gastroenteritis vírica Conclusions 1) Alta freqüència, gran impacte social i sanitari 2) Recomanable fer un diagnòstic etiològic 3) Diversitat de reactius disponibles i només per alguns dels virus, amb sensibilitats i especificitats variables 4) No existeix cap tècnica per avaluar infectivitat 25

26 26

Documentos relacionados

Què és l herpes genital?

Què és l herpes genital? És una infecció de transmissió sexual molt estesa causada pel virus de l herpes simple (VHS): de tipus 2 (VHS-2) i de tipus 1 (VHS-1), que també és causa habitual de l herpes labial.