CARTERA DE SERVICIO DE MICROBIOLOGÍA

Transcripción

1 CARTERA DE SERVICIO DE MICROBIOLOGÍA 2017 GAI Albacete

2 ÍNDICE 1. DETERMINACIONES ANALÍTICAS REALIZADAS MEDIANTE ESTUDIOS SEROLÓGICOS 2. INFECCIONES POR BACTERIAS 3. INFECCIONES CAUSADAS POR HONGOS 4. INFECCIONES CAUSADAS POR PARÁSITOS 5. INFECCIONES CAUSADAS POR MICOBACTERIAS 6. DETERMINACIONES ANALITICAS REALIZADAS MEDIANTE TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR

3 1. DETERMINACIONES ANALÍTICAS REALIZADAS MEDIANTE ESTUDIOS SEROLÓGICOS ANÁLISIS Detección de anticuerpos Virus Epstein Barr: VCA-M VCA-G EBNA Anticuerpos heterófilos Toxoplasma gondii: Ig M - Avidez Sífilis RPR LUE (ELISA) TPHA Mycoplasma pneumoniae Ig M Brucella Rosa de Bengala Ig M Virus herpes 1+2 Citomegalovirus Ig M y LCR y LCR y LCR y LCR y LCR y LCR y LCR y LCR y LCR

4 Legionella (ELISA) IFI Chlamydia pneumoniae Rickettsia conorii IFI Hidatidosis Hemaglutinación Virus de la rubéola Ig M Borrelia burgdorferi y LCR y M Coxiella burnetti (ELISA) Ig M (ELISA) frente a Ag de fase II (IFI) Ig M frente a Ag de fase II (IFI) Leishmania (IFI) Trypanosoma cruzi (Enfermedad Chagas) Parvovirus Ig M

5 Cryptococcus neoformans Virus hepatitis A Ig M Virus hepatitis B HBsAg Anti-HBs Anti-HBc Anti-HBc Ig M HBe Anti-HBe Virus hepatitis C HCAg IgG Inmunoblot Virus VIH Ag/Ac Inmunocromatografía HTLV IgG Virus de las Paperas Virus del Sarampión Virus de la Varicela Detección de antígeno galactomanano 2 días a la semana

6 2. DETERMINACIONES ANALÍTICAS PARA EL DIAGNÓSTICO DE INFECCIONES POR BACTERIAS ANÁLISIS Microorganismo del tracto gastrointestinal Coprocultivo Heces Indicar datos epidemiológicos del paciente Cultivo Helicobacter pylori Antígeno H. pylori Detección Virus en heces (Rotavirus, Adenovirus, Astrovirus y Norovirus) Biopsia gástrica Heces Heces Solo en paciente de atención especializada Se realiza sólo a menores de 5 años e inmunodeprimidos Cribado de Clostridium difficile toxigénico Heces Confirmatorio mediante prueba molecular (ver apartado 6) ANÁLISIS Microorganismo del tracto urinario Tinción de Gram Orina suprapúbica Solo se realiza tinción de Gram a orinas suprapúbicas Urocultivo Orina

7 ANÁLISIS Microorganismo del tracto respiratorio superior e inferior y ojos Tinción de Gram Cultivo aerobio Cultivo anaerobio Cultivo Bordetella spp. Cultivo Legionella spp. Cultivo Nocardia spp. Cultivo hongos Detección antígeno de S. pyogenes Detección antígeno VRS Detección antígeno Legionella spp. Detección antígeno S. pneumoniae Detección P. jirovecii (P. carinii) Muestras del tracto respiratorio superior e inferior y ojos Muestras del tracto respiratorio superior e inferior y ojos Muestras no contaminadas Exudado nasofaríngeo Muestras del tracto respiratorio inferior Muestras del tracto respiratorio inferior Muestras del tracto respiratorio superior e inferior y ojos Escobillón faríngeo Aspirado nasofaríngeo Orina Orina Muestras del tracto respiratorio inferior Esputos y aspirados traqueales: solo en los aptos para cultivo. Esputos y aspirados traqueales: solo en los aptos para cultivo. Esputos y aspirados traqueales: solo en los aptos para cultivo.

8 ANÁLISIS Microorganismos aislados en sangre Hemocultivos convencionales Hemocultivos pediátricos Hemocultivos de larga incubación Cultivo en frascos de hemocultivos Sangre en frasco de hemocultivos Sangre en frasco de hemocultivos Sangre en frasco de hemocultivos Liquído pleural, ascitico, articular y otros líquidos estériles Si el hemocultivo es positivo, se emitirá un informe preliminar. Si el hemocultivo es positivo, se emitirá un informe preliminar. En caso de ser negativo, a las 48 horas se emitirá un informe preliminar. Indicar sospecha clínica de patógenos de larga incubación o sospecha de endocarditis.

9 ANÁLISIS Microorganismo aislados en exudados, líquidos y tejidos Tinción de Gram Exudados, líquidos estériles, biopsias Cultivo aerobio Cultivo punta de catéter I.V. Cultivo de Brucella spp. Cultivo de Hongos Exudados, líquidos estériles, biopsias, y otras muestras de exudados. 6 cm. Punta de catéter Exudados, líquidos estériles, biopsias Exudados, líquidos estériles, biopsias.

10 ANÁLISIS Microorganismo aislados en el tracto genitourinario Estudio microbiológico de E.T.S. Detección Mycoplasma hominis/ Ureaplasma urealyticum Detección Trichomonas vaginales Cribado de portadoras de S. agalactiae (S. grupo B) Muestras del tracto genital Exudado cervicovaginal o uretral Exudado cervicovaginal Frotis vaginorrectal Identificar la localización en el escobillón: V=vaginal, C= Cervical Incluido en el estudio microbiológico de E.T.S. Incluido en el estudio microbiológico de E.T.S. ANÁLISIS Microorganismo anaerobios Cultivo anaerobio de muestras biológicas Muestras adecuadas para anaerobios Las torundas no son aptas para estudio de anaerobios. En los líquidos estériles siempre se realiza el estudio de anaerobios

11 ANÁLISIS Control de colonización de microorganismos multirresistentes Colonización Acinetobacter multiresistente Escobillones faríngeotraqueales/ aspirado spp. traqueal y frotis rectales Colonización Neisseria Escobillones faríngeos meningitidis Colonización Escobillones nasales, Staphylococcus aureus axilares e inguinales resistente a meticilina (SARM) mediante cultivo Estudio por PCR consultar apartado 6 Enterobacterias Escobillones rectales productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) Enterobacterias Escobillones rectales productoras de carbapenemasas Enterobacterias resistentes Escobillones rectales a cefalosporinas de 3ª generación Colonización por Escobillones rectales Enterococcus spp. resistente a glicopéptidos Colonización por Pseudomonas multirresistente Escobillones faríngeotraqueales y frotis rectales Solo en unidades de críticos (Proyecto resistencia zero)

12 ANÁLISIS Control epidemiológico Aguas de endoscopios, colonoscopios y broncoscopios Productos sanguíneos (aféresis leucocitos, aféresis de plaquetas, concentrado de hematíes, concentrado de plaquetas, plasma fresco congelado) Nutrición parenteral, preparados farmacéuticos estériles y colirio de suero autólogo Aguas de hemodiálisis Líquidos de lavado Productos sanguíneos en frasco de hemocultivos Líquido de nutrición parenteral, liquido farmaceutico y colirio Líquidos La solicitud se realiza con un volante del Centro de Transfusión de Albacete y Cuenca

13 3. INFECCIONES CAUSADAS POR HONGOS ANÁLISIS Diagnóstico de infecciones causadas por hongos Blanco de calcoflúor Cultivo Muestras para estudio de dermatofitos (escamas, pelos y uñas) Escamas, pelos y uñas ANÁLISIS Vigilancia contaminación ambiental Habitaciones de aislamiento de inmunodeprimidos, quirófanos y área de elaboración de preparados estériles farmacéuticos Aire aspirado

14 4. INFECCIONES CAUSADAS POR PARÁSITOS Dadas las características de estas infecciones es necesario proporcionar la máxima información epidemiológica para poder realizar un diagnóstico correcto. ANÁLISIS Diagnóstico de infecciones causadas por parásitos Examen parasitológico en heces Examen parasitológico en sangre Detección rápida de antígeno de Plasmodium spp. Examen parasitológico en muestras respiratorias Cultivo Leishmania spp. Examen parasitológico en orina Examen parasitológico mediante técnica de Graham Diagnóstico filarias cutáneas Diagnóstico filarias en sangre Heces en contenedor con conservante (SAF) o ecológico (total FIX) Sangre con anticoagulante (preferiblementedta) Sangre con anticoagulante (preferiblementedta) Muestras respiratorias en contenedor estéril Médula ósea, sangre (EDTA/ heparina/citrato), biopsia cutánea, aspirados Orina sin conservantes Cinta adhesiva sobre portaobjetos Pellizcos cutáneos Sangre con anticoagulante (EDTA/ heparina/citrato) Remitir 3 muestras de días no consecutivos. Seguir dieta previa. Microscopía en frotis fino y gota gruesa. Avisar en caso de muestra urgente. El estudio de malaria se completa con el examen microscópico. Indicar el estado inmunitario del paciente. Se emite informe parcial con el resultado del examen microscópico. Realizar la toma a mediodía tras leve ejercicio. El envío de 3 muestras aumenta la sensibilidad. Remitir en contenedor estéril con suero salino. Examen inmediato tras toma (avisar). Toma diurna/nocturna según origen del paciente (consultar)

15 Cultivo de larvas de nematodos Heces (sin conservantes y sin refrigerar) Previa petición telefónica expresa. Se recomienda el envío de 3 muestras de días no consecutivos. 5. INFECCIONES CAUSADAS POR MICOBACTERIAS ANÁLISIS Diagnóstico de infecciones causadas por micobacterias Examen microscópico: Tinción de auramina Tinción de Ziehl-Neelsen Cultivo Micobacterias Muestras para estudio de micobacterias Muestras para estudio de micobacterias Las cepas no tuberculosas se remiten para su identificación y antibiograma al CNM.

16 6. DETERMINACIONES ANALÍTICAS REALIZADAS MEDIANTE TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR ANÁLISIS Detección del Virus de la gripe (PCR) Carga viral de Citomegalovirus (PCR) Carga viral de virus BK (PCR) Detección de Mycobacterium tuberculosis complex con resistencia a isoniacida (PCR) Detección de SARM para estudio de colonización (PCR) Confirmación de C. difficile toxigénico (PCR) Detección Chlamydia trachomatis; Neisseria gonorrhoeae; Micoplasma genitalium (PCR) Exudado/aspirado nasofaríngeo (medio virus) Plasma (EDTA) y Orina Orina y Plasma (EDTA) Muestras respiratorias,aspirado gástrico, LCR y otros líquidos Frotis nasal, axilar,inguinal Heces Mujer: Exudado endocervical Hombres: orina Solo disponible en época epidémica. Disponible días laborables Disponible días laborables Disponible días laborables Solo disponible en días laborables para muestras positivas en el cribado No precisa escobillón especial, pero no puede ser de algodón ni de madera. PCR Bordetella Aspirado nasofaríngeo Disponible días laborables PCR bacterias/virus/hongos (filmarray) LCR