Diagnóstico Microbiológico de la Infecciones Respiratorias

Transcripción

1 Diagnóstico Microbiológico de la Infecciones Respiratorias Microbióloga. Catia Cillóniz Los procesos infecciosos de las vías respiratorias superiores constituyen seguramente la causa más frecuente de consulta en la práctica clínica diaria. Las infecciones del tracto respiratorio inferior se encuentran entre las enfermedades infecciosas más frecuentes y con mayores tasas de morbilidad y mortalidad. Sistema Respiratorio Superior Faringoamigdalitis Laringitiis y Epiglotitis Otitis Sinusitis Sistema Respiratorio Inferior Bronquitis aguda Agudización EPOC Derrame pleural y empiema NAC Neumonía nosocomial Sistema Respiratorio Superior Antibioterapia Edad Hospitalización Estado inmunológico Faringoamigdalitis: Inmunizaciones Microbiota Etiología: Estreptococos Estafilococos Micrococos Neisserias, Moraxella Catarrhalis Corinebacterias Streptococcus pneumoniae Haemophilus spp Porphyromonas Prevotella Fusobacterium Veillonela Peptostreptococcus Virus respiratorios : Rinovirus Adenovirus Virus respiratorio sincitial Virus influenza A y B Virus parainfluenza 1,2,3 Coronavirus Bacterias: Estreptococo b-hemolítico del grupo A (Streptococcus pyogenes) Estreptococos del grupo C y G Arcanobacterium haemolyticum N. gonorrhoeae Streptococcus pyogenes Bacilos gram negativos 1

2 Diagnostico microbiológico: Streptococcus pyogenes Exudado faringoamigdalar (frotis) *medio de transporte bacteriano Test rápidos de detección antigénica Streptococo grupo A (30 ) Técnicas moleculares: Sondas ADN (2h) PCR a tiempo real (1.5h) *N. gonorrhoeae La presencia de cualquier numero de colonias de este microorganismo en un frotis faringeo debe ser informado siempre Streptococcus pyogenes Cococea u ovoide Gram positiva Colonias blancas >5mm diámetro Beta hemolíticas Bacitracina positiva Laringitis y epiglotitis: Crup Laringotraqueobronquitis Laringitis aguda Afonía Tos perruna Estridor Dificultad respiratoria Obstrucción de la vía aérea superior Etiología: Diagnostico microbiológico: virus Aspirado nasofaríngeo Exudados nasofaríngeos Lavado faríngeo. Medio de transporte para virus viral Técnicas rápidas de diagnostico antigénico (IFI) Técnicas moleculares: PCR a tiempo real 2

3 Epiglotitis: Haemophilus influenzae tipo b Streptococcus pneumoniae Staphylococcus aureus Streptococcus pyogenes Diagnostico Microbiológico: Sangre para hemocultivo (95% bacteriemicos) *muestras faringeas, su cultivo servir ían para ver la colonización de vías respiratorias altas por Hib Haemophilus influenzae Coco bacilo Gram negativos Factores crecimiento x/v Otitis: Externa: S. aureus S. pyogenes P. aeruginosa Aspergillus sp. Media Aguda: S. pneumoniae H. influenzae Virus Diagnostico microbiológico: Muestra del canal interno del oído Aspiración de forúnculos Exudado o pus Extraído por aspiración Muestra canal interno, Exudado, Timpanocentesisus Tinción Gram. Agar sangre S. pneumoniae S. pyogenes Agar sabouraud S. Pneumoniae Cocos en parejas y cadenas gram positivos Catalasanegativa Colonias alfa hemolíticas Optoquina positiva Agar chocolate Aspergillus sp. H. influenzae Agar Mac Conkey S. aureus P. aeuriginosa 3

4 Sinusitis: Las vías respiratorias inferiores permanecen generalmente estériles! Disminución de las defensas Etiología: Rinovirus Virus influenza Virus parainfluenza Adenovirus Diagnostico microbiológico: Aspiración sinusal 10 4 UFC/ml (aguda) 10 3 UFC/ml contaminación Infección del Sistema Respiratorio Inferior Cambio cualitativo de la microbiota normal de la orofaringe Cambio cuantitivo Virulencia y tamaño del inoculo bacteriano aspirado S. pneumoniae H. influenzae S. aureus Bronquitis: Infección del Sistema Respiratorio Inferior Aspiración de microbiota residente de la orofaringe S. Pneumoniae BGN Diseminación sanguínea desde un foco infeccioso distante Inhalación de microorganismos aerolizados Legionella spp. Chlamydia spp., M. pneumoniae, Coxiella burnetii Aspergillus spp. Etiología Bronquitis aguda: Virus de la influenza A y B Parainfluenza 1,2,3 Rinovirus Coronavirus Virus Respiratorio Sincitial Etiología bacteriana: M. pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae Bordetella pertussis Bordetella parapertussis Etiología Bronquitis Crónica: Haemophilus influenzae Streptococcus pneumoniae Moraxella catarrhalis Diagnostico microbiológico: virus/bacterias Secreciones nasofaringeas obtenidas por aspiración Esputo Detección de antigenos virales (VRS, Influenza virus A y B) / IFI Detección rápidas para antigenos de Influenza virus A y B s bacterianos (B. pertussi) Serologia IgM (Mycoplasma, Chlamydia) Ac anti antigeno de raton, fluorescente Ac anti antigeno viral (raton) Ag viral Inmunofluorescencia Para virus respiratorios 4

5 Agudización de EPOC: Derrame pleural/empiema H. influenzae S. pneumoniae M. catharralis P. aeruginosa Diagnostico microbiológico: Cepa colonizante y su sensibilidad a los antibióticos Esputo (cultivo/aislamiento/antibiograma) Bacterias anaerobias Bacteroides fragilis Prevotella spp. Fusobacterium spp. Peptotresptococcus spp. Bacterias aerobias S. pneumoniae S. pyogenes H. influenzae Diagnostico microbiológico: Liquido pleural Tinción Gram/ Ziehl Nielsen (aerobias/anaerobias), Micobacterias Liquido pleural Absceso de pulmón: Etiologia Tinción Gram/ Ziehl Nielsen/Auramina Frecuentes: Menos frecuentes: aerobios anaerobios Medio Lowenstein- Jensen (micobacterias) PCR micobacterias Anaerobios de flora orofaríngea: Prevotella melaninogénica Fusobacterium Bacteroidesfragilis Peptostreptococcus Streptococcusmilleri Aerobios Staphylococcusaureus Mycobacterium tuberculosis Klebsiella pneumoniae Escherichia coli Proteus Pseudomonasaeruginosa Aspergillus Diagnostico microbiologico: de esputo BAL PSB Neumonía Adquirida en la Comunidad Frecuentes Menos Frecuentes P. <65 años Streptococcus pneumoniae Mycoplasma pneumoniae Chlamydophila pneumoniae Legionella Anaerobios (orofarinfe) Coxiella burnetii H. Influenzae S. Aureus Virus P. > 65 años (con enfermedad de base) Haemophilus influenzae BGN Moraxella catarrhalis S. Aureus Streptococcus agalactiae Virus Neutropenia: BGN: Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli Cocos gram positivos: S. aureus, S. viridans Bacilos gram positivos: Bacillus spp. Hongos: Aspergillus sp., Candida sp. Aspergillus 5

6 Diagnostico microbiológico: BAL / Esputo/Liq. pleural < 10 células epiteliales/ > 25 leucos Examen directo y cultivo Esputo Cepillo protegido/lavado broncoalveolar biopsia Lavado bronquial Hemocultivo Detección de antigenos Orina S. Pneumoniae L. Pneumophila serogrupo 1 Detección de anticuerpos Suero Mycoplasma Chlamydea Coxiella, Legionella Tinción Gram Calidad de la muestra Morfotipo presente 50% sensibilidad Tinción Ziehl Nielsen Presencia de bacilos acido alcohol resistentes (sugestivo de Mycobacterium / Nocardia) : Agar sangre Agar chococolate Agar Macconkey Liquido pleural 80% especificidad Aislamiento e identificación del microorganismo Antibiograma Hemocultivo Gram ( identificación) Antibiograma 20% - 30% identifica Orina(Antigenos) S. Pneumoniae Legionella 15 minutos 80/90% sensibilidad 70/90% especificidad Neumonía adquirida en la comunidad Diagnostico microbiológico definitivo Hemocultivo positivo liquido pleural positivo Antigeno urinario positivo para Legionella o neumococo positivo BAS >10 5 ufc/ml PSB >10 3 ufc/ml BAL >10 4 UFC/ML Aumento de 4 veces el titulo de Ac para: Mycoplasma Coxiella, Legionella, Chlamydea y virus respiratorios Diagnostico microbiológico presuntivo de esputo positivo Neumonía intrahospitalaria Infección del Sistema Respiratorio Inferior Aspiración de microbiota residente de la orofaringe S. Pneumoniae BGN Diseminación sanguínea desde un foco infeccioso distante Inhalación de microorganismos aerolizados Legionella spp. Chlamydia spp., M. pneumoniae, Coxiella burnetii Aspergillus spp. Sin ventilación mecánica TEMPRANO S. pneumoniae H. influenzae Con ventilación mecánica E. coli Bacilos gramnegativosentéricos sensibles o poco resistentes a los antibióticos S. aureussensible a meticilina TARDIO Microorganismos multiresistentes Pseudominaaeruginosa Acinetobacter spp Enterobacteriasresistentes S. aureusresistente a la meticilina 6

7 Diagnostico microbiológico: de muestras respiratorias: Esputo Hemocultivo Secreciones traqueales Orina (Ag) cuantitativos de muestras Técnicas no invasivas Hemocultivo Esputo Aspirado traqueal Técnicas invasivas Puncion aspirativa con aguja fina(paaf) Fibrobroncoscopia: BAL(10 4 ufc/ml), PSB (10 3 ufc/ml) 7