Guía Docente GENÓMICA CURSO 4 SEMESTRE 1º GRADO: BIOTECNOLOGÍA MODALIDAD: PRESENCIAL CURSO 2016/2017 FACULTAD FARMACIA
1. IDENTIFICACIÓN DE LA ASIGNATURA 1.- ASIGNATURA: Nombre: GENÓMICA Código: E443 Curso(s) en el que se imparte: 4º curso Semestre(s) en el que se imparte: 1 er semestre Carácter: Optativa ECTS: 3 Horas ECTS: 25 Idioma: Español Modalidad: Presencial Grado en que se imparte la asignatura: Biotecnología Facultad en la que se imparte la titulación: Farmacia 2.- ORGANIZACIÓN DE LA ASIGNATURA: Departamento: Química y Bioquímica Área de conocimiento: Bioquímica y Biología Molecular 2. PROFESORADO DE LA ASIGNATURA 1.- IDENTIFICACIÓN DEL PROFESORADO: Responsable de Asignatura Nombre: DATOS DE CONTACTO Dra. Gloria Terrados Aguado Tlfno (ext): 913724700 (Ext. 4779) Email: Despacho: Perfil Docente e Investigador Líneas de Investigación: gloriamaria.terradosaguado@ceu.es 108, Edificio C Doctor en Ciencias Biológicas (prog. Bioquímica y Biología Molecular) por la Universidad Autónoma de Madrid Regulación del metabolismo y bases moleculares de la patología Profesores DATOS DE CONTACTO Nombre: Dra. María Haro García Tlfno (ext): 913724733 (4733) Email: maria.harogarcia@ceu.es Despacho: 2.13, edificio C 2
2.- ACCIÓN TUTORIAL: Para todas las consultas relativas a la asignatura, los alumnos pueden contactar con el/los profesores a través del e-mail, del teléfono y en el despacho a las horas de tutoría que se harán públicas, en el portal del alumno. 3. DESCRIPCIÓN DE LA ASIGNATURA En esta asignatura se describen los conceptos básicos relacionados con la Genómica, así como las técnicas empleadas y las aplicaciones más relevantes de esta rama de la ciencia. 1.- COMPETENCIAS: 4. COMPETENCIAS Código CB1 CB2 CB3 CB5 CG1 CG4 CG5 CG12 Competencias Básicas y Generales Que el estudiante haya demostrado poseer y comprender conocimientos en un área de estudio que parte de la base de la educación secundaria general, y se suele encontrar a un nivel que, si bien se apoya en libros de texto avanzados, incluye aspectos que implican conocimientos procedentes de la vanguardia de su campo de estudio. Que el estudiante sea capaz de aplicar sus conocimientos a su trabajo o vocación de una forma profesional y posea las competencias que suelen demostrarse por medio de la elaboración y defensa de argumentos y la resolución de problemas dentro de su área de estudio Que el estudiante tenga la capacidad de reunir e interpretar datos relevantes (normalmente dentro de su área de estudio) para emitir juicios que incluyan una reflexión sobre temas relevantes de índole social, científica o ética. Que el estudiante haya desarrollado aquellas habilidades de aprendizaje necesarias para emprender estudios posteriores con un alto grado de autonomía Pensamiento analítico y crítico Uso de TICs, información y bases de datos Adaptación al entorno y creatividad Espíritu emprendedor e innovación Código CE6 CE7 CE12 Competencias Específicas Dirigir y trabajar en un laboratorio con material biológico y/o químico, según los más altos estándares de calidad vigentes, aplicando en cada caso las normas de bioseguridad y de eliminación de residuos correspondientes Manejar los medios instrumentales y aplicar los métodos y técnicas más relevantes y novedosos en las aplicaciones biotecnológicas (analíticas, bioquímicas, moleculares, inmunoquímicas y ómicas ), incluyendo la validación del ensayo, la recolección y manejo de datos y el análisis y evaluación crítica de los mismos Utilizar críticamente las técnicas actuales de la información y comunicación, accediendo y manejando las fuentes de información y bases de datos biológicos y/o de patentes, así como la literatura científica y técnica del área. 3
2.- RESULTADOS DE APRENDIZAJE: Código RB1 RB2 RB3 RB5 RA6 RA7 RA12 Resultados de Aprendizaje Posee y comprende conocimientos en un área de estudio que parte de la base de la educación secundaria general, y se suele encontrar a un nivel que, si bien se apoya en libros de texto avanzados, incluye aspectos que implican conocimientos procedentes de la vanguardia de su campo de estudio. Aplica sus conocimientos a su trabajo o vocación de una forma profesional y posee las competencias que suelen demostrarse por medio de la elaboración y defensa de argumentos y la resolución de problemas dentro de su área de estudio. Reúne e interpreta datos relevantes (normalmente dentro de su área de estudio) para emitir juicios que incluyen una reflexión sobre temas relevantes de índole social, científica o ética. Desarrolla habilidades de aprendizaje necesarias para emprender estudios posteriores con un alto grado de autonomía. Es capaz de dirigir y trabajar en un laboratorio con material biológico y/o químico, según los más altos estándares de calidad vigentes, aplicando en cada caso las normas de bioseguridad y de eliminación de residuos correspondientes. Maneja los medios instrumentales y aplica los métodos y técnicas más relevantes y novedosos en las aplicaciones biotecnológicas (analíticas, bioquímicas, moleculares, inmunoquímicas y ómicas ), incluyendo la validación del ensayo, la recolección y manejo de datos y el análisis y evaluación crítica de los mismos. Utiliza críticamente las técnicas actuales de la información y comunicación, accede y maneja las fuentes de información y bases de datos biológicos y/o de patentes, así como la literatura científica y técnica del área 5. ACTIVIDADES FORMATIVAS 1.- DISTRIBUCIÓN TRABAJO DEL ESTUDIANTE: Total Horas de la Asignatura 75 Código Nombre Horas Presenciales AF1 Clase Magistral 1 AF2 Seminario 14 AF3 Taller/Grupo de trabajo 5 AF4 Prácticas de laboratorio 16 AF5 Otras (exámenes) 2 TOTAL Horas Presenciales 38 Código Nombre Horas No Presenciales AF6 Trabajo Autónomo del Estudiante 37 4
2.- DESCRIPCIÓN ACTIVIDADES FORMATIVAS: Actividad Clase Magistral Seminario Prácticas Talleres Definición Actividad formativa orientada preferentemente a la competencia de adquisición de conocimiento (competencia 1 MECES) y representativa de las materias más teóricas. Prioriza la transmisión de conocimientos por parte del profesor, exigiendo al alumno la preparación previa o el estudio posterior Actividad formativa en el aula-seminario que, bajo la guía del profesor, fomenta el aprendizaje cooperativo entre los alumnos y se ordena al estudio de casos y de la cuestión a estudiar en detalle Potencia la participación del alumno en la interpretación razonada de los conocimientos y de las fuentes del área de estudio. Se orientada preferentemente a la competencia de aplicación de los conocimientos (competencia 2 MECES), así como a la capacidad de reunir, interpretar y juzgar información y datos relevantes (competencia 3 MECES). Actividad formativa orientada preferentemente a la competencia de aplicación de los conocimientos (competencia 2 MECES). Las clases prácticas se desarrollarán en el laboratorio durante 4 días en sesiones de 4 horas por día en un laboratorio convenientemente equipado que, bajo la guía del profesor-tutor, fomenta el aprendizaje autónomo y/o cooperativo del alumno y, donde cada alumno lleva a cabo experiencias prácticas que consoliden los conocimientos adquiridos en las clases magistrales y seminarios a través de la aplicación de los mismos. Una vez asignado el Turno de Prácticas correspondiente, no se permitirá ningún cambio salvo causa justificada. Actividad formativa en el aula-taller que, bajo la guía del profesor, se ordena a la resolución individual o cooperativa de ejercicios y problemas o a la ejecución de trabajos técnicos o artísticos. Orientada preferentemente a la competencia de adquisición de habilidades para la transmisión de conocimientos (competencia 4 MECES). Prepara al alumno para la comunicación escrita - oral y la transmisión de conocimientos. En esta asignatura se enfocará fundamentalmente al abordaje de las diferentes aplicaciones de la Genómica. Otras Tutorías académicas y examen de convocatoria ordinaria. 6. SISTEMAS Y CRITERIOS DE EVALUACIÓN 1.- ASISTENCIA A CLASE: Para poder acogerse al sistema de evaluación continua es precisa la asistencia al 75% de las clases de teoría (se realizarán controles de asistencia). Ya que el alumno puede faltar el 25% del total de las clases, no se admitirán justificaciones de ausencia. La asistencia a las clases prácticas es obligatoria en un 100%. 5
2.- SISTEMAS Y CRITERIOS DE EVALUACIÓN: CONVOCATORIA ORDINARIA (Evaluación Continua) 1 Código Nombre Nota mínima 2 Peso E1 Examen escrito tipo test 5 55 E22 Evaluación in situ de prácticas de laboratorio 5 7 E24 Evaluación de cuaderno de laboratorio (Prácticas) 5 8 E4 Presentaciones y exposiciones orales (Talleres) 5 30 CONVOCATORIA EXTRAORDINARIA Código Nombre Nota mínima 2 Peso E1 Examen escrito tipo test 5 55 E22 E24 E4 Evaluación in situ de prácticas de laboratorio Se aplicará la nota obtenida en la convocatoria ordinaria si ésta es 5 Evaluación de cuaderno de laboratorio (Prácticas) Se aplicará la nota obtenida en la convocatoria ordinaria si ésta es 5 Presentaciones y exposiciones orales (Talleres) Se aplicará la nota obtenida en la convocatoria ordinaria si ésta es 5 5 7 5 8 5 30 (1) En el caso excepcional del estudiante que por causa justificada no puede asistir a clase, mediante solicitud previa por escrito al profesor, el estudiante podrá presentarse al examen ordinario en el que será evaluado de las competencias de la asignatura y supondrá el 55% de la calificación final. (2) Nota mínima para poder aplicar los porcentajes. (3) El alumno que no se presente al examen final en convocatoria ordinaria o extraordinaria será calificado con "No Presentado", independientemente de que haya realizado cualquier actividad académica propia de la evaluación continua (4) La superación de las prácticas con una nota mínima de 5 es condición necesaria para aprobar la asignatura. 3.- DESCRIPCIÓN SISTEMAS DE EVALUACIÓN: Sistemas de Evaluación Examen escrito de tipo test Evaluación in situ de prácticas de laboratorio Presentación de cuaderno de laboratorio (Prácticas) Presentaciones y exposiciones orales (Talleres) Definición Preguntas tipo test con 5 opciones de las que sólo una es correcta. Se valorará durante la realización de las prácticas el trabajo realizado (esfuerzo, motivación, resultados, presentación y participación). Análisis y discusión de los resultados obtenidos durante las sesiones prácticas, plasmándolos individualmente en un cuaderno de laboratorio, el cual se entregará exclusivamente al profesor correspondiente, en la fecha y lugar que se indique. Presentación oral o escrita de los resultados obtenidos durante los talleres. 6
7. PROGRAMA DE LA ASIGNATURA 1.- PROGRAMA DE LA ASIGNATURA: PROGRAMA TEÓRICO: 1. Genómica: concepto y desarrollo histórico (Magistral) 2. Estructura y evolución del genoma (Seminario) 3. Secuenciación del genoma. Proyecto genoma humano y otros proyectos de secuenciación (Seminario y taller) 4. Anotación y bases de datos. (Seminario y taller) 5. Genómica comparativa. (Seminario y taller) 6. Genómica funcional.(seminario y taller) 7. Genómica estructural (Seminario) 8. Genómica computacional. Métodos experimentales avanzados en genómica. (Seminario y taller) 9. Genómica, transcriptómica y Epigenómica. (Seminario) PROGRAMA DE PRÁCTICAS: Extracción y purificación de cromatina Inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) Análisis de secuencias de ADN mediante PCR cuantitativa (Real-Time- PCR) 8. BIBLIOGRAFÍA DE LA ASIGNATURA 1.- BIBLIOGRAFÍA BÁSICA: Lesk A. (2012): Introduction to Genomics. 2nd edition. Oxford University Press. Canada. Pevsner J (2015): Bioinformatics and Functional Genomics. 3rd Edition. Wiley-Blackwell. 2.- BIBLIOGRAFÍA COMPLEMENTARIA: Lewin B (2008): Genes IX. McGraw-Hill Maria S. Poptsova (2014) Genome Analysis: Current Procedures and Applications Caister Academic Press Gibson & Muse (2011). A Primer of Genome Science, Third Edition 3rd Edition, Sinauer Associates 4.- RECURSOS WEB DE UTILIDAD: https://genome.ucsc.edu/encode/ Elementos funcionales del genoma humano. https://www.genome.gov/ Información acerca del Proyecto Genoma Humano. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/. National Center for Biotechnology Information. http://www.ebi.ac.uk/ European Bioinformatics Institut. https://omim.org/ Online Mendelian Inheritance in Man. http://www.expasy.org/ SIB Bioinformatics Resource Portal. 7
9. NORMAS DE COMPORTAMIENTO 1.- NORMAS: Las faltas en la Integridad Académica (ausencia de citación de fuentes, plagios de trabajos o uso indebido/prohibido de información durante los exámenes), así como firmar en la hoja de asistencia por un compañero que no está en clase, implicarán la pérdida de la evaluación continua, sin perjuicio de las acciones sancionadoras que estén establecidas. 8