ACERCA DE LA COMPAÑÍA ACERCA DE LA PRUEBA
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- Alejandro Acosta Quintana
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1 ACERCA DE LA COMPAÑÍA ACERCA DE LA PRUEBA Sequenom Laboratories, una subsidiaria de propiedad exclusiva de Sequenom, Inc. es un laboratorio de diagnóstico molecular que cuenta con la acreditación CAP y la certificación de la Enmienda de Mejoras de Laboratorio Clínico (Clinical Laboratory Improvement Amendment, CLIA) y se dedica a mejorar los resultados de los pacientes al ofrecer pruebas revolucionarias desarrolladas en el laboratorio para diversas afecciones prenatales. Sequenom Laboratories es pionero de NIPT con el lanzamiento de su prueba MaterniT21PLUS para detectar anormalidades fetales y ofrece un amplio menú de pruebas prenatales. SEQUENOM, MaterniT, MaterniT21 y Sequenom Laboratories son marcas comerciales de Sequenom, Inc. Todas las demás marcas comerciales pertenecen a sus respectivos propietarios. 201 Sequenom Laboratories. Todos los derechos reservados. La prueba MaterniT GENOME es una prueba desarrollada en el laboratorio que fue desarrollada, validada y realizada exclusivamente por Sequenom Laboratories. La prueba no ha sido autorizada ni aprobada por la Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. (FDA). A pesar de que hasta la fecha las pruebas desarrolladas en el laboratorio no han sido sometidas a la regulación de la FDA de EE. UU., se requiere la certificación del laboratorio en virtud de la Enmienda de Mejoras de Laboratorio Clínico (Clinical Laboratory Improvement Amendment, CLIA) para garantizar la calidad y la validez de la prueba. Sequenom Laboratories cuenta con la certificación de CLIA como laboratorio calificado para realizar pruebas de laboratorio clínico de alta complejidad y está acreditado por el Colegio Americano de Patólogos. Ninguna prueba es perfecta. Aunque los resultados de la prueba MaterniT GENOME son altamente exactos, pueden ocurrir resultados discordantes, incluyendo la predicción inexacta del sexo fetal, debido a: mosaicismo o neoplasma de la placenta, de la madre o del feto; gemelo evanescente; trasplante anterior de órganos de la madre u otras causas. Las pruebas de ADN libre de células (cfdna) no reemplazan la exactitud y la precisión del diagnóstico prenatal con CVS o amniocentesis. Una paciente con un resultado positivo de la prueba de MaterniT GENOME debe ser referida a orientación genética y se le debe ofrecer el diagnóstico prenatal invasivo para la confirmación de los resultados de la prueba. Una prueba de MaterniT GENOME no garantiza que el embarazo no esté afectado. Se puede reportar un resultado no informativo, cuyas causas pueden incluir, entre otras, insuficiente cobertura para la secuencia, ruido o artefactos en la región, sesgo en la amplificación o la secuenciación o fracción fetal insuficiente. La prueba MaterniT GENOME no está prevista para identificar embarazos en riesgo de defectos del tubo neural o defectos de la pared ventral. La prueba cfdna para detectar anomalías de cromosomas enteros (incluyendo los cromosomas sexuales) y anormalidades subcromosómicas podría conducir al descubrimiento potencial de ambas anormalidades genómicas, fetales y maternas, que podrían tener importancia clínica, importancia menor o ninguna importancia. La evaluación de la importancia de una prueba con resultado positivo o no reportable puede implicar la realización de pruebas prenatales invasivas y estudios adicionales a la madre. Las investigaciones pueden conducir a la detección de anormalidades cromosómicas y subcromosómicas maternas, las cuales en ocasiones pueden relacionarse con neoplasmas maternos benignos o malignos. Las pruebas de cfdna no pueden identificar con precisión la triploidía fetal, los reordenamientos balanceados ni la ubicación precisa de las duplicaciones subcromosómicas o deleciones; estos pueden ser detectados por el diagnóstico prenatal con CVS o amniocentesis. La capacidad de reportar los resultados puede ser afectada por el índice de masa corporal (BMI) materno, el peso materno y/o el lupus eritematoso sistémico (SLE) materno. Los resultados de esta prueba, incluso los beneficios y las limitaciones, se deben discutir con un proveedor de atención médica calificado. Las decisiones del manejo del embarazo, incluyendo la terminación del embarazo, no se deben basar únicamente en los resultados de esta prueba. REFERENCIAS Progenitest Olleros 211, Of. 302 Ciudad de Buenos Aires Argentina maternit21.com.ar 1. Di Gregorio E, et al. Large cryptic genomic rearrangements with apparently normal karyotypes detected by array-cgh. Mol Cytogenet. 201;7(82). 2. Zhao C, et al. Detection of fetal subchromosomal abnormalities by sequencing circulating cell-free DNA from maternal plasma. Clin Chem. 201 Apr;1(): R
2 LA CIENCIA DE UNA VISIÓN SIN PRECEDENTES x y x y Prueba prenatal no invasiva para detectar anormalidades cromosómicas de todo el genoma fetal 1 Laboratories 13 QUALITY OF SCIENCE 12 7
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4 17 3 SU OBJETIVO Y NUESTRO OBJETIVO: PRESTAR LA ATENCIÓN MÁS AVANZADA POSIBLE A CADA PACIENTE. Para ayudarle a cumplir ese objetivo: la prueba desarrollada en el laboratorio MaterniT GENOME, una nueva prueba prenatal no invasiva (NIPT) que analiza cada cromosoma del genoma. Ahora, por primera vez en la historia, hay una NIPT para brindarle esta visión sin precedentes, que permite un nuevo nivel de atención al paciente. La prueba MaterniT GENOME es la única NIPT de todo el genoma que proporciona una visión a nivel del cariotipo X Y MaterniT GENOME analiza cada cromosoma 1 1 Máximo de regiones cromosómicas analizadas por otras NIPT
5 OBTENGA MEJOR VISIÓN QUE NUNCA La prueba MaterniT GENOME empieza con la facilidad de una extracción de sangre ordinaria, que se puede tomar desde las 10 semanas de gestación. Aunque no es un cariotipo fetal, actualmente es la única NIPT que ofrece un nivel de información que anteriormente estaba disponible solo a través del análisis del cariotipo. Proporciona información sobre la ganancia o la pérdida de material cromosómico 7 Mb en todo el genoma. La prueba también analiza siete regiones de microdeleción de importancia clínica. Al combinar la profundidad de la secuenciación con la experiencia líder en la industria, MaterniT GENOME ofrece una amplitud de cobertura, a diferencia de cualquier otra prueba prenatal no invasiva disponible hasta la fecha. CIENCIA COMPLICADA. REPORTES SENCILLOS. La prueba MaterniT GENOME permite el análisis sofisticado del ADN en términos directos. El estilo sencillo de los reportes está diseñado para facilitar la comunicación entre usted y su paciente. Cada cromosoma objetivo recibe un resultado Positivo o. ÍNDICE RESULTADO ÍNDICE RESULTADO ANEUPLOIDÍAS AUTOSÓMICAS Trisomía 21 (ndrome de Down) Trisomía 18 (ndrome de Edwards) Trisomía 13 (ndrome de Patau) Otras aneuploidías autosómicas ANEUPLOIDÍAS DE CROMOSOMAS SEXUALES Sexo fetal Monosomía X (ndrome de Turner) XYY (ndrome de Jacobs) XXY (ndrome de Klinefelter) XXX (ndrome de Triple X) Congruente con sexo femenino VARIANTES DEL NÚMERO DE COPIAS EN TODO EL GENOMA 7 Mb Ganancias/Pérdidas 7 Mb Positivo MICRODELECIONES SELECCIONADAS Deleción 22q11 (asociada con el síndrome de DiGeorge) Deleción 1q11 (asociada con el síndrome de Prader-Willi/Angelman) Deleción 11q23 (asociada con el síndrome de Jacobsen) Deleción 8q2 (asociada con el síndrome de Langer-Giedion) Deleción p1 (asociada con el síndrome de Cri-du-chat) Deleción p1 (asociada con el síndrome de Wolf-Hirschhorn) ndrome de deleción 1p3 CR 1 Duplicación El reporte incluye un ideograma de cromosomas que incluye los resultados anormales para facilitar la comprensión p3.2 p3 p3.2 p33 p32.2 p3.3 p31.3 p3.1 p31.1 p3.3 p22.2 p3.1 p21 p32.3 p13.2 p12 p32.1 q11 p31.2 q21 q23.1 q23.3 p22.3 q2.1 q2.3 p22.1 q32.1 p13.3 q32.3 p13.1 p11 q2.1 q2.3 q12 q22 q23.2 q2 q2.2 q31 q32.2 q1 q2.2 q q3 Descripción: Se observó una ganancia aproximada de 1.3 Mb del material del cromosoma 1, que sugiere una duplicación en la región p3.3-p3.1.
6 VEA MÁS ALLÁ DEL CARIOTIPO PRENATAL La resolución del cariotipo prenatal a menudo es menor que la del cariotipo de sangre periférica. Las deleciones o duplicaciones crípticas mayores de 7Mb pueden pasar desapercibidas al realizar el cariotipo prenatal de rutina¹, y las consecuencias clínicas pueden ser mortales o conducir a anormalidades fetales complejas y graves. La prueba MaterniT GENOME ofrece una capacidad novedosa de pruebas no invasivas que identifican > 9 % de las deleciones o duplicaciones de todo el genoma 7 Mb. Esto permite la prueba cromosómica fetal no invasiva más completa que está disponible actualmente. Prueba de cariotipo fetal Prueba MaterniT GENOME Analiza cada cromosoma Requiere un procedimiento invasivo No Detecta traslocaciones grandes no balanceadas Entendemos que el reporte genético avanzado puede introducir desafíos para la orientación del paciente, especialmente cuando se necesita más contexto para un resultado en particular. Puede confiar en las consultas entre colegas con nuestros expertos asesores de genética para proporcionar el nivel más profundo de visión que necesite. Si tiene alguna pregunta sobre la prueba MaterniT GENOME o desea hablar con un asesor de genética sobre los resultados, comuníquese con nosotros a genome@sequenom.com. Detecta cromosomas marcadores Detecta traslocaciones o inversiones balanceadas Detecta ganancias o pérdidas de cromosomas hasta un mínimo de 7 Mb Detecta microdeleciones seleccionadas Detecta la triploidía No Se considera de diagnóstico No No No No
7 MANTÉNGASE A LA VANGUARDIA EN SU CAMPO La prueba MaterniT GENOME conjuga la tecnología líder con la visión sin precedentes para ofrecer la información científica más avanzada a partir de una prueba no invasiva. Es una herramienta de vanguardia que complementa su experiencia, lo que le permite mejorar su práctica y avanzar en su tratamiento del paciente.
8 LA HISTORIA DE INNOVACIÓN RESPONSABLE DE NIPT DE SEQUENOM LABORATORIES Primera NIPT Trisomía 21 Trisomía 18 Trisomía 13 Sexo fetal Gestaciones múltiples Aneuploidías de cromosomas sexuales Microdeleciones: 22q, 1q, p, 1p3 Trisomía 22 Trisomía 1 Microdeleciones adicionales: 11q, 8q, p Anormalidades cromosómicas de todo el genoma DESEMPEÑO CONFIABLE Sequenom Laboratories cuenta con una historia de innovación responsable, con cada nuevo avance en NIPT que se caracteriza por sus resultados confiables y el respaldo de estudios exhaustivos de validación. Las pruebas de validación de la prueba MaterniT GENOME se basan en esta historia, aumentando el trabajo anterior en el análisis de todo el genoma para garantizar resultados de alta precisión. DESEMPEÑO EN TODO EL GENOMA EVALUACIÓN DEL DESEMPEÑO Desempeño SENSIBILIDAD 100 % 92.9 % 80 % 0 % 0 % 20 % 0 % ESPECIFICIDAD > 99.9 % 98.1 % > 99.9 % 99. % > 99.9 % 7-10 Mb 11-1 Mb 1+ Mb EVENTOS SUBCROMOSÓMICOS DE TODO EL GENOMA Estudio inicial de todo el genoma El trabajo anterior 2 fue la primera incursión en el análisis de todo el genoma Se utilizó ADN genómico, mezclas de plasma materno Series de titulación para imitar la distribución de la fracción fetal Modelado extenso con datos de ISCA Se utilizó la base de datos de ISCA como fuente para > 2000 eventos Modelado in silico de estos eventos en >1000 secuencias de plasma materno Permitió más de 2 millones de análisis Ayudó a la comprensión del desempeño del algoritmo Validación analítica Se analizó veces más muestras de gdna que en el trabajo anterior Muestras con microarrays o eventos confirmados por cariotipo Series de titulación para imitar la distribución de la fracción fetal Desempeño medido confirmado en modelado in silico Tamaño del evento TRISOMÍAS 21, 18, 13, SCA Y SEXO FETAL Estudio de equivalencia Estudio de 8 muestras clínicas Doble profundidad de secuenciación que MaterniT21 PLUS Resultados de MaterniT21 PLUS comparados con los resultados de MaterniT GENOME para las trisomías 21, 18, 13, aneuploidías cromosómicas, clasificación del sexo fetal 100 % de coincidencia entre las dos pruebas
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