Epidemiología Molecular del VIH-1
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- José Ramón Montes Martin
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1 Epidemiología Molecular del VIH1 Dra. Lydia Gpe. Rivera Morales Laboratorio de Inmunología y Virología,Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Nuevo León
2 Número estimado global de adultos y niños a finales del 2001 Individuos viviendo con el VIH/SIDA 40 millones Nuevas infecciones por VIH en millones Muertes debidas a VIH/SIDA en millones
3 Resumen global de la epidemia VIH/SIDA, Diciembre 2001 Número de individuos viviendo con VIH/SIDA Total 40 millones Adultos 37.2 millones Mujeres 17.6 millones Niños < 15 años 2.7 millones Individuos nuevamente infectados con VIH en 2001 Total 5 millones Adultos 4.3 millones Mujeres 1.8 millones Niños < 15 años Muertes por SIDA en el 2001 Total 3 millones Adultos 2.4 millones Mujeres 1.1 millones Niños < 15 años E1 1 December 2001
4 Número estimado global de VIH/SIDA a finales del 2001 en niños <15 años Niños viviendo con VIH/SIDA 2.7 millones Nuevos casos de infección en el Muertes por VIH/SIDA en el E11 1 December 2001
5 Estadísticas por regiones del VIH/SIDA a finales del 2001 SubSaharan Africa North Africa & Middle East Epidemic started late 70s early 80s late 80s Adults & children living with HIV/AIDS 28.1 million Adults & children newly infected with HIV 3.4 million Adult prevalence rate * 8.4% 0.2% % of HIVpositive adults who are women 55% 40% Main mode(s) of transmission for those living with HIV/AIDS ** Hetero Hetero, IDU South and SouthEast Asia late 80s 6.1 million % 35% Hetero, IDU East Asia & Pacific late 80s 1 million % 20% IDU, Hetero, MSM Latin America Caribbean Eastern Europe & Central Asia late 70s early 80s late 70s early 80s early 90s 1.4 million million % 2.2% 0.5% 30% 50% 20% MSM, IDU, Hetero Hetero, MSM IDU Western Europe North America Australia & New Zealand TOTAL late 70s early 80s late 70s early 80s late 70s early 80s million million 0.3% 0.6% 0.1% 1.2% 25% 20% 10% 48% MSM, IDU MSM, IDU, Hetero MSM * The proportion of adults (15 to 49 years of age) living with HIV/AIDS in 2001, using 2001 population numbers ** Hetero: heterosexual transmission IDU: transmission through injecting drug use MSM: sexual transmission among men who have sex with men 00002E2 1 December 2001
6 Número estimado de adultos y niños viviendo con VIH/SIDA a finales del 2001 América del Norte Caribe América Latina 1.4 millones Europa Occidental Africa del Norte y Oriente Medio Africa Subsahariana 28.1 million Europa Oriental y Asia Central 1 million Asia del Sur y Sudoriental 6.1 million Asia Oriental y del Pacífico 1 million Australia y Nueva Zelanda Total: 40 millones 00002E4 1 December 2001
7 Número estimado de casos nuevos de infección por VIH en adultos y niños durante 2001 América del Norte Caribe América Latina Europa Occidental Africa del Norte y Oriente Medio Africa Subsahariana 3.4 million Europa Oriental y Asia Central Asia Oriental y del Asia del Sur y Sudoriental Pacífico Australia y Nueva Zelanda E5 1 December 2001 Total: 5 millones
8 Número estimado de adultos y niños fallecidos por causa del VIH/SIDA en 2001 América del Norte Caribe América Latina Europa Occidental Africa del Norte y Oriente Medio Africa Subsahariana 2.3 million Europa Oriental y Asia Central Asia Oriental y del Pacífico Asia del Sur y Sudoriental Australia y Nueva Zelanda 120 Total: 3 millones 00002E6 1 December 2001
9 Aproximadamente nuevos casos diarios de infección por el VIH en 2001 Mas del 95% se encuentran en paises en desarrollo 2000 de estos, son niños < 15 años de edad Cerca de son personas de 15 a 49 años, de los cuales: casi 50% son mujeres cerca 50% tienen años de edad 00002E10 1 December 2001
10 Epidemiología del SIDA en México Los casos acumulados de SIDA en nuestro país es de: 52, % de subregistro y 35% retraso en la notificación : 64,000 El número que se estima están viviendo con VIH1/SIDA es de: 304, 278 El número estimado de nuevos casos de SIDA por año es de:3,0004,000 Sistema de Vigilancia Epidemiológica de SIDA Fuente: Dirección General de Epidemiología SSA CENSIDA Información Actual hasta Marzo del 2002
11 Casos Acumulados de SIDA en México 1983 Marzo Sistema de Vigilancia Epidemiológica de SIDA Fuente: CENSIDA n = 52, 473
12 Casos Acumulados de SIDA en México EUA NORTE 7,074 MEXICO OESTE 12,099 CENTRO 11,912 ESTE 17,002 SUR 4,095 Fuente: CONASIDA Hasta Marzo, 2002
13 Casos de SIDA en México por año hasta finales del Sistema de Vigilancia Epidemiológica de SIDA Fuente: CENSIDA
14 Casos Acumulados de SIDA en México según factor de riesgo Homosexual Bisexual Heterosexual Drogas IV Perinatal Donadores Homo/Drogas Ocupacional Desconocido 0 Fuente: CONASIDA Hasta 31 Marzo 2002
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16 Familia Retroviridae FAMILIA RETROVIRIDAE SUBFAMILIA ONCORNAVIRINAE LENTIVIRINAE ESPUMAVIRINAE PATOGENIA NEOPLASIAS SIDA VIRUS HTLV I / II BLV FLV HIV I / II SIV FIV SFV
17 VIH1 Grupo M A C F G VIH1 Grupo O B D E CPZANT (VIS) VIH1 Grupo N YBF30 CPZGAB (VIS) AGMTYO (VIS) VIH2/VIS Grupos y Subtipos Genéticos del VIH1 Y su relación con VIH2 y VIS
18 VIH1 Grupo M Subtipo A. Oram, JD. ARHR 6(9): (1990) Subtipo B. WongStaal, F. Nature 313(6): (1985) Subtipo C. Gao, F. J. Virol 70(3): (1996) Subtipo D. Alizon, M. Cell 46(1):6374 (1986) Subtipo F1.Gao, F. J. Virology 72(7): (1998) Subtipo F2. Triques, K. ARHR 16(2): (2000) Subtipo G. Salminen, MO. ARHR 8(9): (1992) Subtipo H. Murphy, E. ARHR 9(10): (1993) Subtipon J. Laukkanen, T.ARHR 15(3):293297(1999) Subtipo K. Triques, KARHR 16(2): (2000) Formas Recombinantes Circulantes (CRF) CRFO1_AE Gao, F. J.Virology 70(10): (1996) CRFO2_AG Carr, JK Virology 247(1):2231 (1998) CRF03_AB Liitsola,K AIDS 12(14) (1998) CRF04_cpx Nasioulas, G. ARHR 15(8): (1999) Grupo O del VIH1 Gurtler, L.G. J. Virol 68(3): (1994) Grupo N del VIH1 Simon, F. Nature Med 4(9): (1998) 20 AÑOS DE VIH/SIDA VIH2
19 Organización Genómica del VIH1 5 LTR gag rev pro pol vpr nef 3 LTR env vif vpu tat p53 p65/51 p31 gp160 p24 p17 p9 p7 gp120 gp41
20 Gag Pol Arboles Env filogenéticos HIV Sequence Database
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22 VIH: gp120 V2 C2 C3 V3 V4 C4 V1 C1 C5 V5 El gene env del VIH codifica para un precursor: gp160, que es clivado en gp120 y gp 41. La gp 120 está formada por 5 regiones conservadas C1C5 y entre ellas se encuentran 5 regiones variables V1V5. La gp 120 contiene 18 residuos de cisteína altamente conservados, los cuales forman 9 uniones disulfuro (cinco asas o loops mayores).
23 Características del Asa V3 V2 C2 C3 V3 V4 Infectividad Viral Tropismo Blanco para anticuerpos C4 neutralizantes V1 C1 C5 V5
24 DEPARTMENT OF IMMNUNOLOGY AND INFECTIOUS DISEASES HARVARD SCHOOL OF PUBLIC HEALTH LABORATORIO DE INMUNOLOGIA Y VIROLOGIA FACULTAD DE CIENCIAS BIOLOGICAS UNIVERSIDAD AUTONOMA DE NUEVO LEON
25 Diagrama de Flujo Purificación de DNA Células 65 muestras de individuos seropositivos Por ELISA y confirmados por Western Blot Amplificación por PCR Secuenciación Clonación Obtención de DNA Plasmídico Análisis
26 1er. PCR Buffer, dntps, Primers (ED3/ED14), dh 2 O, Taq DNA polymerasa + Templado (DNA proviral) Amplificación por PCR (nido) Producto 2do. PCR Primers ED5/ED12 Programa ENV 57 M Kb Programa ENV 55 Electroforesis en Gel
27 SECUENCIACIÓN Clonación Amplificación por PCR Obtención de DNA Plasmídico Secuenciación Precipitación Secuenciación Automática ABI 373A Múltiple Alineamiento CLUSTAL W,v.1.7 Análisis Filogenético Phylips 3.5 y CLUSTAL W,v.1.7 Secuencias de DNA fueron ensambladas y editadas por Sequencher v.3 Arbol Filogenético (Njplot y Tree View)
28 Alineamiento del asa V3 69.2% HXB2: CTRPNNNTRKRIRIQRGPGRAFVRIGKIGNMRQAHC Mx?SH..YAT?IDI NL S?..YATDIDI J S?..YAT?IDI P S?..YAT?IDI Y?H..YAT?IDI Mx: Cd. de México J: Jalisco NL: Nuevo León Y: Yucatán P: Puebla
29 Variación en el asa V3 Estados Cd.de México No. de Muestras 20 Nuevo León 9 % GPGR Variaciones GPGG, GPGS, GPGA, GWGR, APGR GPGS, GPRR Jalisco GPGS, GPGK, HPGG Puebla GPGS, RPGR Yucatán GPGS, GPEG,GPGG, APGR
30 Relación Filogenética de sesenta y siete virus pertenecientes al VIH1 subtipo B provenientes de cinco estados de México basados en la región C2V5 del gene env D E F H * ** B * B * * 100 R * * ** * R 100 * 100 R R R R R 100 A G J C O * Yucatán Jalisco Puebla Nuevo León Ciudad de México R Referencias de VIH1 subtipo B
31 El VIH1 subtipo B es el virus predominante del SIDA en México. Las 65 secuencias genómicas se encuentran localizadas en la base de datos del Banco de Genes Encontramos dos nuevos tetrapéptidos: HPGG y GPEG localizados en el asa V3 presente en la región gp120 Nuestros resultados son limitados debido al pequeño número de virus estudiados. La presencia de otros subtipos no pueden ser excluídos.
32 Distribución Mundial de Subtipos de VIH1
33 Distribución Mundial de Subtipos de VIH A B C CRF01AE CRF02AG CRF03AB D F G H J K N O OTROS CRF
34 Localización geográfica de los subtipos de VIH1 de acuerdo a la vía de transmisión Subtipos Via de transmisión Region geográfica A B C D E Heterosexual Africa Subsahariana Sudeste de Asia + India + Homsexual y drogadicción Norteamérica + Europa Occidental + Sudeste de Asia + India + AIDS Etiology, Diagnosis, Treatment and Prevention Curran, Essex and Fauci
35 Formas Recombinantes Circulantes CRFs CRF01_AE CRF02_AG CRF03_AB HIV Sequence Database
36 Recombinantes CRF01 CRG02 CRF03 CRF04cpx CRF05 CRF06cpx CRF07 CRF08 CRF09 CRF10 CRF11cpx CRF12 CRF13cpx Formas Recombinantes Circulantes CRFs Cepas de Referencia CM240 IbNG Ka CY032 VI1310 BFP90 CN54 GX6F p2911 TZBF061 GR17 ARMA159? Subtipos A,E A,G A,B A,G,H,K,U D,F A,G,J,K B,C B,C? C,D A, CRF01, G, J B,F A, E, G, J, U HIV Sequence Database Autores Murphy et al Lee et al Howard and Rasheed.1996 Liitsola et al Lukashov.1999 Gao et al.1998 Lukkanen et al. Oelrichs et al Su, L. et al Piyasirisilp, S. et al McCutchan et al Koulinska et al. Paraskevis et al, 2000 Carr et al HIV Sequence Thomas Database Leitner CRF14? B, G Rafael Najera (España)
37 Retos a considerar en el desarrollo de vacunas Variación antigénica del virus Tipo de antígeno seleccionado para la vacuna La inmunogenicidad del antígeno viral empleado Desarrollo de inmunógenos y adyuvantes efectivos Buen entendimiento de su vía de entrada y de su patogenicidad Inducción de una respuesta inmune preferentemente en mucosas Seguridad y eficacia de la vacuna
38 El SIDA PUEDE AFECTAR A TODOS
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