Bode LIMS. Seguridad. Funcionalidad general. Administración y Configuración

Transcripción

1 Bode LIMS Bode LIMS es un Sistema de Control de la Información del Laboratorio creado por Bode para asistir en el manejo de las pruebas de ADN procesadas en un laboratorio. A continuación se citan sus funciones y requerimientos para el software. Seguridad Requiere únicamente identificación de usuario en la red local de la agencia. Autenticación de Directorio Activa Provee características que impiden el acceso no autorizado al sistema que incluyen: o Restricción de acceso por medio de Usuario y Contraseña. o Grupos de usuarios y permisos. o Log-out automático después de cierto tiempo de inactividad del usuario (controlado por administrador) o Activación e inactivación de la cuenta de usuario. La mayoría de los usuarios están inhabilitados para aumentar su nivel de acceso. El administrador puede restringir el acceso tanto de usuarios como de grupos a bases de datos. Funcionalidad general. LIMS provee al usuario con una amplia gama de datos ya sean numéricos, alfa o alfanuméricos que pueden ser ingresados al sistema como fechas, ya sean pasadas, actuales o futuras; capacidad para utilizar letras mayúsculas o minúsculas; formato del reloj en 12 o 24 horas. Asimismo los campos activos en la hoja de trabajo están resaltados para facilitar la tarea de ingresar datos y las listas de valores o tablas de configuración son definibles por el usuario. Adicionalmente el sistema alerta a los usuarios acerca de comandos o datos erróneos introducidos mediante mensajes claros y concisos. Administración y Configuración

2 Dentro del sistema, el administrador puede configurar clientes y usuarios así como los métodos de serología, extracción y cuantificación de ADN. También existe la posibilidad de controlae al arribo de muestras al laboratorio, el analista que la trabajará, y con qué métodos. Como administrador es posible revisar los comentarios y notas del analista al trabajar con la muestra. Recepción de caso, inventario y serología Con el sistema el usuario será capaz de mantener registro de la recepción y condiciones de la muestra al arribo de ésta al laboratorio y asociarla a la agencia que envió la muestra. Automáticamente se generan números y códigos de barras de caso, ítem y sub ítem para los elementos contenidos en el paquete. Adicionalmente se pueden ingresar atributos como tipo de caso, victima, sospechoso, descripción de la muestra, tipo de análisis, para cada elemento que contenga el caso. Se generan reportes de inventario y filas de muestras que requieran serología o análisis de ADN. El sistema captura los números de lote y fuente de los reactivos para serología así como los resultados del análisis, generando reportes. El usuario puede registrar comentarios durante todo el proceso. Extracción Análisis de ADN Los métodos de extracción son configurados por el Administrador. Agrupación de muestras para extracción al arribo del caso. Filas generadas por el usuario de muestras para extracción: agresión sexual, ADN de contacto, sangre, hueso, muestras de referencia, etc. Crea muestras control secuenciales. Asigna ID único para la muestra con cada extracción o re-extracción. Captura el numero de lote, volumen y fuente del reactivo. Captura atributos de la extracción configurables. (analista, fecha, testigo, equipo y pipeta, etc). Asigna ID de extracción único para cada grupo de muestras.

3 Crea reporte de la extracción. Cuantificación Métodos y estándares de cuantificación configurables por el administrador. Permite la agrupación flexible de muestras. Se generan hojas de trabajo a partir de las listas de Extracción para mantener orden de las muestras y su agrupación. Captura número de lote, volumen y fuente del reactivo. Captura atributos de la cuantificación configurables. (analista, fecha, testigo, equipo y pipeta, etc) Genera archivo de la placa para importar a 7000/7500 sin necesidad de introducir datos redundantes. Crea identificación única para la placa. Crea reporte de la cuantificación. ABI 7000/7500 (o equivalentes) exportan resultados a LIMS. Amplificación y electroforesis capilar El usuario puede exportar macros de Excel (provistas por Bode como parte de LIMS) que capturen todos los datos pertinentes de la corrida para incluir en el reporte de la muestra y el caso. Puede editar la información del electroferograma. Puede seleccionar muestras para cargar, amplificar, realizar extracción o concentrar nuevamente. Análisis de datos Los datos de Genemapper se importan a LIMS. Los usuarios pueden seleccionar y editar los resultados de Genemapper para seleccionar la información que desean que aparezca en un reporte final. Las tablas de alelos son creadas automáticamente y exportadas desde LIMS. Reportes y Hojas de trabajo Con LIMS usted puede crear reportes de:

4 Caso Forense. Evidencia recibida, cadena de custodia y discrepancia. Inventario. Serología, extracción y cuantificación. Análisis por placa, número de caso o controles. Reactivos Todos los reactivos críticos, definidos por el usuario llevan un seguimiento estricto. Se registra el numero de lote de todas las soluciones utilizadas. Las soluciones solo pueden ser utilizadas hasta haber pasado control de calidad. LIMS lleva registro de las fechas durante las cuales un reactivo puede ser utilizado. Durante el análisis, los usuarios seleccionan los números de lote para el control de calidad de los reactivos. Hardware/Software Nota: Soporta sistema operativo tanto de 32 como 64 bits. Nota: Soporta servidores virtuales si considerando que cumplan con las mínimas especificaciones. No se requiere Microsoft.Net 3.5/4 Framework si el servidor hospeda la base de datos únicamente. Servidor Web Procesador del servidor Xeon o Core i7 equivalente o de mayor potencia. RAM 6GB Windows Server 2008 Servidor de la Base de Datos Servidor Windows 2008 R2 SP1. Servidor SQL 2008 R2. Procesador basado en Quad Core. Procesador de 2.4 GHz. RAM 8GB. (4) 500GB 7.2K RPM Near-Line SAS 6Gbps 3.5in Hot-plug Hard Drive

5 Requerimientos adicionales Red basada en TCP/IP Qualtrax 4.2 utiliza un red basada en IP para todos los servidores y el cliente. Soporte DNS es opcional pero altamente recomendado. Acceso a servidor SMTP Se utilice ya sea un servidor Windows IIS SMTP interno o un servidor de mail externo como Microsoft Exchange. Servicio de Información de Internet en el servidor web, el tamaño depende de las opciones de instalación seleccionadas. Requerimientos de software y servidores. El servidor y software asociados no están incluidos como parte de la cotización y proveerlos es responsabilidad del usuario final. El servidor SQL y base de datos instalada para la aplicación de Bode LIMS serán asegurados y únicamente accesibles para el equipo de soporte de Bode. Bode requiere acceso remoto al servidor para soporte y una conexión confiable de internet para soporte y mantenimiento después de la entrega inicial. Bode proveerá soporte remoto únicamente. Se requiere que el usuario final tenga Microsoft Server Active Directory en su red interna para log in y credenciales de seguridad. En caso de no tenerlo esta cotización es inválida. La computadora, servidor para base de datos, servidor web y software relacionado debe ser adquirido por el usuario final y ser funcional antes de que el equipo de Bode acuda a las instalaciones del cliente. Si el servidor no está disponible durante la instalación, Bode no será responsable por retrasos y el cliente, en caso de ser necesario, deberá pagar por servicio extra del equipo de soporte de Bode.