CURSO DE POSTGRADO BIOLOGIA MOLECULAR PARA BIOMEDICINA. N o m b r e C u r s o. Programa de Biología Celular y Molecular, ICBM

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1 UNIVERSIDAD DE CHILE FACULTAD DE MEDICINA ESCUELA DE POSTGRADO CURSO DE POSTGRADO BIOLOGIA MOLECULAR PARA BIOMEDICINA N o m b r e C u r s o SEMESTRE 1º AÑO 2015 PROF. ENCARGADO DR. JULIO TAPIA PINEDA DR. GONZALO CABRERA N o m b r e C o m p le t o C é d u la I d e n t i d a d Programa de Biología Celular y Molecular, ICBM U N I D A D A C A D É M I C A TELÉFONOS jtapia@med.uchile.cl gcabrera@med.uchile.cl TIPO DE CURSO CLASES SEMINARIOS PRUEBAS TRABAJOS Básico ( B á s i c o, Av a n z a d o, C o m p le m e n t ar i o, S e m i n a r i o s B i b l i o g r á f i c o s, F o r m a c i ó n G e n e r a l) 18.0 HRS HRS HRS. Nº HORAS PRESENCIALES 48 Nº HORAS NO PRESENCIALES 132 Nº HORAS TOTALES 180 CRÉDITOS 6 ( 1 C r é d i t o E q u i v a le a 3 0 H o r a s S e m e s t r a le s ) CUPO ALUMNOS No hay (5 para modo lectivo) 25 ( N m í n i m o ) ( N m á x i m o ) PRE-REQUISITOS INICIO 7 de abril 2015 TERMINO 11 de junio 2015 DIA/HORARIO POR SESION Martes 14:00 a 17:30 hrs. DIA / HORARIO POR SESION Jueves 9:00 a 12:30 hrs. LUGAR Auditiorio Dra. Cristina Palma, 2º piso, Escuela de Postgrado, Sector F, FM, UCH E s c u e la D e P o s t g r a d o ( S a la a d e t e r m i n a r ) u o t r o lu g a r

2 METODOLOGÍA Clases teóricas (12). Cada una será de 1.5 h de duración, donde el profesor responsable expondrá los conceptos teóricos para entender el fundamento de una o varias técnicas moleculares relacionadas con el tema que le tocará desarrollar. Posteriormente en seminarios temáticos éstas se discutirán en mayor profundidad. Seminarios temáticos (13). Los seminarios, de 1.5 h de duración, serán dirigidos por un profesor invitado o por el profesor a cargo del tema a discutir en presencia del PEC. El objetivo será analizar una o varias técnicas moleculares relacionadas con las temáticas anteriormente expuestas en clases, discutiendo desde su ejecución hasta las ventajas y desventajas de las mismas. Si el profesor responsable del seminario lo requiriese, éste podría contemplar la exposición de algún(os) trabajo(s) científico(s) por parte de uno o varios alumnos. ( C l a s e s, S e mi n ar i o s, Pr á c t i c o s ) EVALUACIÓN (INDICAR % DE CADA EVALUACION) La nota de aprobación del curso es 4.0 según lo estipulado por la Comisión Coordinadora de Programas Académicos. Pruebas escritas (2). Tendrán una ponderación del 20% en la nota final (ie, 40% total). Éstas tendrán una duración máxima de 4 h y contemplarán principalmente los contenidos indicados en el programa, aunque subyacerá un carácter acumulativo en todas ellas. Prueba oral (1). Corresponderá a la tercera y última prueba con una ponderación del 30% en la nota final. Consistirá en una interrogación oral, de 1 h de duración, y que contemplará todos los contenidos del curso. Cada alumno se someterá a una comisión integrada por el PEC y profesores invitados, quienes en conjunto evaluarán su desempeño con una nota. Seminarios temáticos (13). Cada sesión terminará con la realización de una prueba escrita corta de min de duración. En el caso de haberse realizado una exposición por parte de los alumnos, ésta se evaluará con una nota promediada entre el profesor responsable y el PEC del curso. Finalmente, la nota resultante se promediará con la de la prueba corta. La ponderación de los seminarios corresponderá a un 30% de la nota final del curso. Examen final (1). Será una interrogación oral (1.5 h de duración) que se le exigirá a todos los alumnos que hayan obtenido una nota final de presentación igual a 3.5 e inferior a 4.0, así como a los alumnos que hayan obtenido una nota parcial inferior a 3.0 en alguna prueba o en el promedio de las notas de seminarios. La nota final del curso corresponderá a un 70% de la nota de presentación más un 30% de la nota del examen.

3 PROFESORES PARTICIPANTES (INDICAR UNIDADES ACADEMICAS) Aldo Solari, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: asolari@med.uchile.cl Diego Rojas, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: drojass@med.uchile.cl Eduardo Karahanian, Universidad Autónoma: eduardo.karahanian@uautonoma.cl Germaine Jacob, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: gjacob@med.uchile.cl Gonzalo Cabrera, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: gcabrera@med.uchile.cl Héctor Toledo, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: htoledo@med.uchile.cl Julio Tapia, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: jtapia@med.uchile.cl Marcelo Antonelli, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: mantonel@med.uchile.cl Julieta González, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: jgonzale@med.uchile.cl Mario Chiong, Fac. Cs. Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile: mchiong@ciq.uchile.cl Mercedes López, Inmunología, ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: melopez@me.com Nora Riveros, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: nriveros@med.uchile.cl Norbel Galanti, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: ngalanti@med.uchile.cl Oscar Cerda, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: oscarcerda@med.uchile.cl Remigio López, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: rlopez@med.uchile.cl Ricardo Armisen, Fisiopatología, ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: rarmisen@me.com Rodrigo López, Farmacología, ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: rodlopez@u.uchile.cl Steffen Härtel, Biol. Desarrollo, ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: shartel@med.uchile.cl Ulises Urzúa, Biol. Cel. y Mol., ICBM, Fac. Medicina, U. de Chile: uurzua@med.uchile.cl DESCRIPCIÓN El curso tiene como objetivo fundamental entregar a los alumnos los fundamentos básicos moleculares y los detalles experimentales de diversas técnicas de la biología molecular que son comúnmente utilizadas en el ejercicio de las ciencias biomédicas. Del mismo modo, se espera que en general el estudiante logre comprender para estas técnicas los ámbitos de su aplicación, así como discriminar tanto sus alcances como sus limitaciones. OBJETIVOS Conocer y manejar los conceptos básicos de la Biología Molecular, así como las técnicas moleculares comúnmente aplicadas a la investigación en Biomedicina. CONTENIDOS / TEMAS El curso se divide en 3 módulos que abordan las siguientes temáticas: I) GENES: replicación, reparación, transcripción e ingeniería genética; II) PROTEÍNAS: metabolismo, estructura y detección; III) FUNCIÓN: manejo y análisis de genes. El curso se desarrolla en torno al estado del arte de cada contenido, desde lo básico a lo actual.

4 BIOBLIOGRAFIA BASICA Alberts, B.; Bray, D. Lewis, J. Raff, M.; Keiths, R.; Watson, J.D.: Molecular Biology of the Cell Fifth Edition New York, Scientific American Books, W.H. Freeman and Company, (2008) Lodish, H., Baltimore, D., Berk, R., Zipurshay, S. L., Matsudaira, P. And Darnell, J. Molecular Cell Biology Fifth Edition, New York (2004) Nelson, DL and Cox, MM. Lehninger Principles of Biochemistry. Fourth Edition Worth Publishers (2005) Krebs, J. E.; Kilpatrick, S. T.; Goldstein, E. S.: Lewin's GENES XI Jones & Bartlett Learning; 11 edition (2012) BIBLIOGRAFIA RECOMENDADA Lodish, H., Baltimore, D., Berk, R., Zipurshay, S. L., Matsudaira, P. And Darnell, J. Molecular Cell Biology Fifth Edition, New York (2004)

5 CALENDARIO DE ACTIVIDADES (A continuación señalar : Descripción de la actividad, fechas, horas presenciales y no presenciales y Profesores a cargo) FECHA/HORA HORAS PRESEN CIALES HORAS NO PRESEN CIALES DESCRIPCION ACTIVIDAD PROFESOR CAPÍTULO I. GENES: replicación, reparación, transcripción e ingeniería genética Martes 7 abril Martes 7 abril Jueves 9 abril Jueves 9 abril Martes 14 abril Martes 14 abril Jueves 16 abril Jueves 16 abril Martes 21 abril Martes 21 abril Jueves 23 abril Jueves 23 abril Introducción al curso. CT1. Composición, estructura y síntesis de ácidos nucleicos. J. Tapia / G. Cabrera G. Jacob CT2. Replicación del DNA. A. Solari CT3. Reparación del DNA. G. Cabrera CT4. Transcripción del DNA. N. Riveros S1. RT-PCR y qrt-pcr: bases y su uso en biomedicina. S2. NB/SB/hibrid. in situ/race: diversas aplicaciones. R. López M. Antonelli S3. EMSA/ChIP: interacción DNA-proteínas. D. Rojas CT5. DNA recombinante e ingeniería genética. S4. Clonamiento: inserción de cdnas en distintos vectores. S5. Transducción adeno/lenti-viral: aplicaciones, ventajas/desventajas. S6. Microarreglos: bases y uso en análisis a gran escala. M. Antonelli J. Tapia M. Chiong U. Urzúa CAPÍTULO II. PROTEÍNAS: metabolismo, estructura y detección Martes 28 abril 14:00-18:00 h Martes 5 mayo 14:00-17:30 h Jueves 7 mayo Jueves 7 mayo Martes 12 mayo CT6. Traducción de mrnas en bacterias y eucariontes PRIMERA PRUEBA - ESCRITA (20%) H. Toledo CT7. Estructura de proteínas. N. Galanti S7. PAGE/2D-PAGE/Western-blot: bases y aplicación en proteómica. S8. Expresión ectópica de proteínas, PD, IP, reportero. H. Toledo J. Tapia

6 Martes 12 mayo Jueves 14 mayo Jueves 14 mayo Martes 19 mayo Martes 19 mayo Martes 26 mayo 14:00-17:30 h CT8. Enzimología. R.O. López CT9. Modificaciones post-traduccionales. J. González S10. Espectrometría de masas. O. Cerda S9. Microscopía confocal, FRAP, FRET. S. Härtel S11. FACS, bases y aplicaciones. M. López SEGUNDA PRUEBA - ESCRITA (20%) CAPÍTULO III. FUNCIÓN: manejo y análisis de genes Jueves 28 mayo Jueves 28 mayo Martes 2 junio Martes 2 junio Martes 9 junio 14:00-17:30 h Jueves 11 junio 09:00-13:00 h CT10. Silenciamiento de la expresión génica. E. Karahanian CT11. Análisis múltiple de genes. R. Armisen S12. Uso de sirnas, shrnas, mirnas y aptámeros en terapia génica. S13. Diseño y uso de ratones KO y transgénicos TERCERA PRUEBA - ORAL (30%) EXAMEN - ORAL E. Karahanian R. Armisen