Herramientas informáticas para acceder a la Información

Transcripción

1 Herramientas informáticas para acceder a la Información Biomédica Hospital Carlos G. Durand 14/11/07 Dr. Alejandro Mauro Residente de Informática MédicaM Hospital Italiano de Buenos Aires

2 Objetivos Conocer algunos de los problemas para acceder a la información biomédica Entender como se almacena la información en una base de datos bibliográfica Aprender porqué y para qué se utiliza un vocabulario controlado Adquirir conocimientos necesarios para utilizar la base de referencias bibliográficas MEDLINE

3 Necesidades de información En la práctica clínica surgen entre 1-2 preguntas por pacientes Más del 70% de las preguntas quedan sin responder Covell DG. Information needs in office practice Ann Intern Med 1985;103: Gorman PN. Can primary care physicians questions be answered using the medical journal literature? Bull Med Libr Assoc 1994;82:140-6

4 Sobrecarga de información La humanidad a generado más información en los últimos 30 años que en los pasados 5000 Una edición del The New York Times contiene más información que la que oyó una persona que vivió en el siglo XVII El conocimiento impreso se duplica cada 3.5 años Se publican internacionalmente más de 3000 libros por día El conocimiento ha crecido más allá de la capacidad retentiva de la memoria Wurman, RS, Information anxiety: What to do when information doesn't tell you what you need to know. 1st ed. 1989, New York: Doubleday. 356.

5 La era de la información Cada 2 años se duplica la cantidad de información digital Se estima que este año se generen 1.5 exabytes (1.5 x ) de información nueva en el mundo Quiere decir que un alumno que cursa su 4to año universitario, la mitad de lo que aprendió en el primer año quedará desactualizado cuando llegue al tercero. Se calcula que la información digital se duplicará cada 72hs en el año 2010

6 Como si fuera poco La literatura está repartida en varias fuentes y formatos Las herramientas que permiten acceder a la información son cada vez más complejas El lenguaje natural tiene muchos sinónimos El idioma predominante es el inglés Se necesitan herramientas para evaluar si la información es pertinente y válida

7 Las 55 s s INTERNET Las fuentes de información: Sístemas Sumarios Sinopsis Síntesis estudios Sistemas Informáticos de Soporte Libros de MBE Resúmenes de Artículos de MBE Revisiones sistemáticas/ GPC Estudios originales Haynes RB, ACP Journal Club, 2001 Mar-Apr;134:A11-A13

8 Internet es la solución? Salud es uno de los temas másbuscadosen Internet Existe 1 millón de sitios relacionados con salud El término health recupera 1960 millones de páginas El término salud recupera más de 40 millones y medio de páginas

9 Entonces qué camino tomar?

10 Herramientas de búsqueda Directorios de recursos (Yahoo) Motores de búsqueda (Google) Motores de búsqueda específicos (PubMed) Meta-buscadores (TripDatabase)

11 Si Internet fuera un libro. Directorios de Recursos Motores de Búsqueda

12 Yahoo! - Categorías as o

13 Google Googol = billones de búsquedas en google por mes Googlear= acción de buscar en motor de búsqueda de google información de internet (Diccionario Oxford, 2006) Google Trends: MBE en 2007

14 Características de Google No diferencia mayúsculas de minúsculas Cálculos Matemáticos Corrector ortográfico Diccionario On-Line Traductor Indiza millones de páginas 200 millones de búsquedas diarias Ranking según links (PageRank) Maneja múltiples idiomas Directorio de Recursos Páginas en caché Busca archivos tipo.pdf, doc, ppt, xls Busca imágenes. Voy a tener suerte

15 Servicios Google

16 Google - Imágenes

17 Google Scholar Subset de Google. Orientación académica. Rankea por relevancia de la cita. Contiene Libros Artículos Tesis Citas bibliográficas

18 Google Scholar

19 Google Scholar

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21 El modelo PICO Control tratamiento, examen, factor de riesgo, tiempo Paciente enfermedad y/o característica Resultado (Outcome) mortalidad, diagnóstico, calidad de vida Intervención tratamiento, examen, factor de riesgo, tiempo Richardson WS, Wilson MC, Nishikawa J, et al. ACP J Club 1995 Nov/Dec;123:A12-3.

22 Conceptos generales de búsqueda Frases Uso de comillas tratamiento del cólico del lactante Truncación Uso del asterisco * bacter*: bacteria, bacteriano, bacteriologico, etc. Stopwords Preposiciones, conectores Operadores lógicosl AND OR NOT Nidación Uso del ( ) ( ) fiebre AND ibuprofeno OR paracetamol

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24 Las 44 s s Las fuentes de información: Sístemas Sinopsis Síntesis estudios Información para la toma de decisiones Resúmenes Revisiones sistemáticas/ GPC Estudios originales Haynes RB, ACP Journal Club, 2001 Mar-Apr;134:A11-A13

25 Las 44 s s Sístemas Sinopsis Síntesis estudios Haynes RB, ACP Journal Club, 2001 Mar-Apr;134:A11-A13

26 Fuentes de información Bases de datos bibliografícas para recuperar estudios Herramientas para recuperar síntesis de la literatura Herramientas de resumen Sistemas para la toma de decisiones

27 Qué es Medline? Es la base de datos de referencias bibliográficas más conocida y consultada del mundo Resultado de la automatización del repertorio bibliográfico del antiguo Index Medicus Desarrollada y mantenida por la National Library of Medicine (NLM) 1997 acceso libre y gratuito a Medline a través de la interfaz PubMed Cubre los campos de: Medicina Odontología Enfermería Veterinaria Salud pública

28 Qué es una Base de datos?

29 Qué contiene Medline? Contiene 15 millones de referencias a artículos de publicaciones periódicas del ámbito de la biomedicina. Indiza citas desde 1966 a la fecha. (Old Medline ) Citas de más de 4800 publicaciones periódicas en 30 idiomas Cerca del 52% de las citas son originalmente publicadas en E.E.U.U. El 89% tiene como idioma de origen el inglés El 76% de las citas posee resúmenes escritos por los autores. Aproximadamente 8,000 referencias son ingresadas semanalmente a la base (400,000 al año aproximadamente).

30 Como organiza el contenido? Tipo de publicación: Journal article Título: Effects of computerized physician order entry on prescribing practices Autores: Autor 1: Teich J. M. Autor 2: Merchia P. R. Autor 3: Schmiz J. L. Autor 4: Kuperman G. J. Autor 5: Spurr C. D. Resúmen: BACKGROUND: Computerized order entry systems have the potential to prevent errors, to improve quality of care, and to reduce costs by providing feedback and suggestions to the physician as each order is entered. This study assesses the impact of an inpatient computerized physician order entry system on prescribing practices Dirección del autor: Department of Emergency Medicine, Brigham and Women's Hospital, 75 Francis St, Boston, MA Revista: Archives of Internal Medicine Año: 2000 Volumen: 160 Páginas:

31 Interfaz PubMed Acceso a todas las BD Acceso directo a #BD Casillero de búsqueda My NCBI Barra de menú Servicios Novedades

32 PubMed: primeros pasos

33 Inglés, por qué todo en inglés!! HONSelect Babel Mesh

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35 Qué sucede si no obtengo resultados?

36 Problemática del lenguaje Contracepción Inhibición de la fertilización Control de la fertilidad Control de la natalidad Métodos contraceptivos Planificación Fliar SINONIMOS Anticoncepción

37 Vocabulario controlado: MeSH Acrónimo: Medical Subject Headings Vocabulario médico y científico de terminología controlada de la NLM para sus diferentes bases de datos. Lista autorizada tanto para la indización como para la recuperación de las citas en las bases de la NLM. Los descriptores ( términos) tratan de representar los conceptos principales tratados en las citas. Permite que todos los términos estén representados por un solo descriptor. Se actualiza y revisa anualmente.

38 Ventajas de utilizar un vocabulario controlado

39 Ventajas de utilizar un vocabulario controlado

40 Que información n ofrece el MeSH database?

41 Cómo combinar dos términos MeSH?

42 Cómo combinar dos términos MeSH?

43 Menú de opciones Limits Acotar los resultados Preview/Index Combinar diferentes opciones History Bitácora Clipboard Selección de citas Details Visualización de estrategia My NCBI

44 Obtuve muchos resultados puedo limitar mi búsqueda? b PubMed OJO!!! Todas las búsquedas b se harán n con los limites establecidos

45 Limits Autor / Revista

46 Limits Más s opciones

47 Se me colgó la máquina m perdí todo?

48 Esta cita me interesa, puedo guardarla?

49 Esta cita me interesa, puedo guardarla?

50 Esta cita me interesa Puedo guardarla? Imprimir

51 Esta cita me interesa Puedo guardarla? Files

52 Esta cita me interesa Puedo imprimirla?

53 Solo una cita vale la pena,...tiene que haber más!!! m PubMed compara las palabras del título, abstract y MeSH de cada cita, las coincidencias son guardadas en un set precalculado Se muestran por un ranking de relevancia, con la cita de origen al principio Orienta en la búsqueda si no se encuentra lo términos adecuados Usarla siempre al encontrar la cita que mejor representa lo que se busca

54 La cita tiene resumen/abstract abstract? No tiene resumen Tiene resumen Texto completo Texto completo en PubMed Central

55 Servicios PubMed Se accede a ellos desde la barra de menú de la izquierda de la página de inicio del PubMed MeSH Database (palabras claves) Journal Database (publicaciones) Single Citation Matcher (citas) Clinical Queries (orientación clínica) My NCBI (servicios al usuario)

56 Journal Database

57 Single Citation Matcher

58 Clinical Queries Filtros clínicos Categoría de estudio Revisiones sistemáticas Genética médica

59 My NCBI Definir filtros para agrupar resultados Guardar búsquedas Alertas por de nuevo contenido Administrar Links a recursos web

60 Cómo accedo a MY NCBI?

61 Cómo me aseguro que conseguí el texto completo desde PubMed? My NCBI

62 Cómo guardo mi estrategia de búsqueda?

63 PubMed ofrece enlaces al texto completo, pero.. El problema...

64 Formas de acceder al texto completo GRATUITO Free medical journals PubMed Central Highwire Press SciELO

65 Acceso al texto completo por e-e mail

66 Como pedir un reprint Para: DIRECCION_ _AUTOR Tema: reprints, please Dear Dr. AUTOR: I would appreciate a copy of: AÑO : TITULO plus a sampling of your related reprints. Glad to reciprocate: my recent papers in SU_CAMPO are listed below. PDFs are preferred, as attachments, where available. If you have a web page for downloading or viewing papers, please let me know its url. Thanks! Best regards, SU_NOMBRE SU_DIRECCION_DE_ _INCLUYENDO _UN_LISTADO_DE_SUS_TRABAJOS_CON_EL_LINK_A_SUS_TRABAJOS

67 PubMed Central

68 Más s recursos

69 Más s recursos 878 journals 79,610 free, fulltext articles

70 Biblioteca HIBA

71 Lo que no nos debe pasar es

72 Curso de Acceso a Fuentes de Información n Biomédica

73 Grupo de HIBA

74 Resumen Buscar la palabra correcta en inglés desde MeSH database / BabelMesh / HonSelect Analizar el árbol del MeSH y evaluar utilizar concepto más sensible o más específico Combinar MeSH Realizar búsqueda Aplicar Límites Copiar al Clipboard > enviar resultados a MyNCBI Para preguntas básicas sobre etiología, diagnóstico, terapéutica, pronóstico, GPC: utilizar Clinical Queries

75 Dr. Alejandro Mauro Residente de Informática MédicaM Hospital Italiano de Buenos Aires Muchas Gracias