Desarrollo profesional

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1 16:19 Página 1 JM Estrada-Lorenzoa y R Trueba-Gómezb abiblioteca bbiblioteca Agencia Laín Entralgo Madrid Hospital Universitario Príncipe de Asturias Madrid España Consejos prácticos PubMed es una base de datos anglosajona y, por tanto, todas las consultas deben realizarse a partir de términos en inglés, incluso para localizar artículos publicados en revistas españolas Cuantos más límites ( Limits ) se utilicen menos resultados se obtendrán, pero la búsqueda será más precisa y útil Ses é Si se ha identificado una referencia muy pertinente (ideal para el trabajo que nos ocupa) resulta muy práctico visualizar otras referencias similares mediante la función Related Articles (artículos relacionados) Si desea repetir una misma búsqueda en sucesivas fases de un trabajo de investigación, guarde la estrategia de búsqueda con la opción Save Search Si el número de referencias es Por qué puede ser útil una búsqueda bibliográfica? Una búsqueda bibliográfica permite, a partir de las referencias identificadas y localizadas en recursos de información científica, como pueden ser las bases de datos, recuperar y acceder a documentos de interés, generalmente artículos científicos La necesaria actualización de los conocimientos de todo profesional en salud requiere la búsqueda de la información más pertinente y precisa, de la forma más rápida y eficaz Por lo tanto, no sólo se requieren ciertas habilidades documentales (elaboración de la pregunta y manejo de la terminología médica apropiada), sino también conocer qué fuentes de información bibliográfica son las más oportunas y útiles para obtener la información que se precisa Y una de ellas es, sin duda, PubMed Qué es PubMed? Es una base de datos bibliográfica especializada en ciencias de la salud y accesible desde internet ( con gran implantación y uso entre todos los profesionales sanitarios, en buena parte por el volumen de su información, su gratuidad, su fácil manejo y su universal accesibilidad Los orígenes de PubMed se remontan al año 1966, cuando la National Library of Medicine de Estados Unidos desarrolló un sistema automatizado de recuperación y análisis de la bibliografía muy elevado, no pierda el tiempo seleccionando una a una Existen opciones en la función Limits que le permitirán reducir el resultado de una forma lógica (tipo de documento, fecha, subconjuntos, etc) Recuerde que PubMed ordena las referencias por fecha de publicación, apareciendo en primer lugar las referencias de los artículos recientemente publicados Puede utilizar Single Citation Matcher para localizar, con muy pocos datos (autor, revista, volumen, año, etc), una referencia concreta Si tiene alguna duda utilice las herramientas de ayuda (Help, FAQ, Tutorials) JANO 17 DE ABRIL 2009 Nº

2 16:20 Página 2 Figura 1 Buscando en lenguaje libre el término hodgkin el acceso en línea, y es cuando ya se puede hablar propiamente de la base de datos MEDLINE, cuyo uso se popularizó entre la profesión biomédica gracias al desarrollo y la difusión del CD-ROM Una década después, con el crecimiento de internet además de la gratuidad de su acceso, la base de datos se expandió definitivamente a través de su interfaz denominada PubMed En 2007, PubMed incluía más de 17 millones de referencias bibliográficas, procedentes de más de 5100 revistas científicas biomédicas, publicadas desde los años 1950 en cientos de países, preferentemente anglosajones (Estados Unidos, Reino Unido o Australia) Cómo trabajar en PubMed? médica, denominado entonces MEDLARS (MEDical Literature Analysis and Retrieval System) y creado a partir del repertorio bibliográfico impreso Index Medicus (publicado desde 1879 hasta 2004) En los años ochenta del siglo XX, se habilitó Figura 2 Aplicando la función Limits en una búsqueda 34 JANO 17 DE ABRIL 2009 Nº 1734 En la parte superior de la página principal de PubMed existe un rectángulo blanco (la ventana de consulta) que permite al usuario escribir cualquier término de búsqueda (p ej, hodgkin ) y obtener un número más o menos elevado de referencias bibliográficas en función del carácter más o menos genérico del término En este caso, PubMed ha identificado más de referencias (fig 1) Como el resultado obtenido parece excesivo, una primera opción es la de combinar este primer término ( hodgkin ) con otros en función de la pregunta a la que se debe dar respuesta Por ejemplo, si se busca información sobre el linfoma de Hodgkin familiar puede combinarse el término hodgkin con otros como lymphoma o family Para combinar estos términos es preciso recurrir a la utilización de los denominados operadores booleanos: AND (=Y), OR (=O) y NOT (=NO) Así, debería escribirse en la ventana de consulta: hodgkin AND lymphoma AND family Pero dado que el término familiar puede considerarse como nombre ( family ) o como adjetivo ( familiar ) es recomendable ampliar la búsqueda añadiendo más términos combinados con el operador booleano OR, resultando esta otra consulta: hodgkin AND lymphoma AND ( family OR familial OR familiar ), obteniéndose algo más de 800 referencias Puede simplificarse la redacción de esta estrategia utilizando el carácter de truncamiento (*) para el caso de los términos que comiencen con la misma raíz, como por ejemplo los 2 adjetivos que empiezan por famili Así, podría redactarse de nue-

3 16:20 Página 3 vo la estrategia de búsqueda de esta forma: hodgkin AND lymphoma AND ( family OR famili* ) (tabla I) Cómo limitar la búsqueda bibliográfica? Bien porque el número de referencias localizadas en la búsqueda sea muy elevado o bien porque se desee acotar el resultado a un idioma determinado o desde una fecha específica, PubMed permite mediante su función Limits (fig 2) reducir el número de las referencias bibliográficas obtenidas Así, puede limitarse la estrategia de una búsqueda por: Autor ( Search by Author ) Revista ( Search by Journal ) Fecha ( Date Published ): desde 30 días a 10 años; o especificando un rango ( Specifity date range ), por ejemplo, del año 2000 al 2005 Sujetos de estudio ( humans o animals ) o género ( male o female ); Idioma ( Languages ): english, spanish, french, etc Por tipo de documento ( Type of article ): review (artículo de revisión), clinical trial (ensayo clínico), etc Grupo de edad ( Ages ): infant (123 meses), child (6-12 años), adolescent (13-18 años), etc Un campo específico ( Default Tag ): Title (título), Title Transliterated (título original), etc Tabla I Búsquedas con operadores booleanos y truncamiento No de referencias Tipos de búsqueda Estrategia de búsqueda Lenguaje libre y término único hodgkin Lenguaje libre y términos combinados mediante operador booleano AND hodgkin AND lymphoma AND family 681 Lenguaje libre y términos combinados mediante operadores AND y OR hodgkin AND lymphoma AND ( family OR familial OR familiar ) 826 Lenguaje libre, operadores AND/OR y carácter de truncamiento hodgkin AND lymphoma AND ( family OR famili* ) cación ( review ) El resultado de aplicar estos 3 límites es demasiado escaso, pues con esta estrategia tan sólo se identifican 5 referencias (tabla II) Conviene entonces modificar la estrategia ampliando su campo de acción, para lo cual lo más útil es anular el límite más reductor (en este caso el idioma), y así obtener un mayor número de referencias bibliográficas con las que trabajar con más comodidad Cómo realizar búsquedas más precisas? En algunas ocasiones, cuando los términos de la búsqueda son muy genéricos ( can- Figura 3 Tesauro MeSH con el término Hodgkin Disease Para seleccionar uno o más límites no hay más que marcar con el ratón los cuadrados en blanco que acompañan a cada uno de ellos (fig 3) Se pueden emplear cuantos límites se consideren oportunos, con la precaución de que no sean excluyentes (p ej, al combinar la revista Atención Primaria y el idioma english el resultado será obviamente cero pues es una revista publicada en español) Asímismo, en aquellos límites que admiten varios opciones (idioma, tipo de artículo, grupos de edad, etc) es posible elegir varios ítems simultáneamente (p ej, spanish o english para obtener referencias en estos 2 idiomas) Si se desea localizar, por ejemplo, artículos de revisión en español publicados durante los últimos diez años sobre el linfoma familiar de Hodgkin habría que seleccionar los límites de idioma ( spanish ), fecha de publicación ( 10 years ) y tipo de publi- JANO 17 DE ABRIL 2009 Nº

4 Tabla II Búsquedas con la función Limits Tipos de límites Estrategia de búsqueda N o referencias Autor (p ej Smith) hodgkin AND lymphoma AND 11 author = smith Revista (p ej Lancet) hodgkin AND lymphoma AND 15 journal = lancet Fecha de publicación hodgkin AND lymphoma AND 423 (p ej ) published in the last 10 years Idioma (p ej español) hodgkin AND lymphoma AND 11 language = spanish Tipo de publicación hodgkin AND lymphoma AND 116 (p ej artículo de revisión) type of article = review Subconjunto hodgkin AND lymphoma AND 201 (p ej Core Clinical Journals) subset = core clinical journals Idioma + Fecha de publicación hodgkin AND lymphoma AND 5 + Tipo de publicación (p ej español spanish, published in the last 10 years, + revisión) review Fecha de publicación hodgkin AND lymphoma AND 65 + Tipo de publicación (p ej revisión) published in the last 10 years, review Campo específico hodgkin AND lymphoma AND 50 + Fecha de publicación (p ej Título/resumen default tag = title/abstract, published + 2 últimos años) in the last 2 years Principales funciones de PubMed DISPLAY = mostrar las referencias en diferentes formatos (p ej, abstract para ver su resumen) GO = ejecutar la búsqueda HISTORY = visualizar la estrategia de búsqueda línea a línea, con los resultados correspondientes INDEX = consultar los índices de la base de datos (p ej, autor o términos MeSH) LIMITS = delimitar por campos (p ej, fecha, idioma o tipo de publicación) MeSH DATABASE: consultar e identificar los términos MeSH o de materia cer, infection, hepatitis, lymphoma, etc), incluso aplicando los límites oportunos el resultado puede seguir siendo muy elevado Es oportuno recurrir entonces a la utilización de palabras más específicas (los denominados términos MeSH o descriptores, que utiliza PubMed para definir los contenidos de cuantos artículos se recogen en la base de datos) con el objetivo de obtener un número más reducido, pero muy pertinente, de referencias bibliográficas Estos descriptores o términos de materia se identifican y consultan en la base de datos MeSH ( Medical Subject Headings ), desde la página principal de Pub- Med Una vez identificados los MeSH necesarios, se puede construir una nueva estrategia de búsqueda con estos términos, la cual debería proporcionar unos resultados más pertinentes Así, en la búsqueda sobre el linfoma familiar de Hodgkin los términos de materia apropiados, identificados entre los términos MeSH, serían: Hodgkin Disease y Family (puesto que no existe un único término que identifique esta enfermedad es necesario combinar ambos) Cada término MeSH se encuentra siempre acompañado de una definición (fig 3), que facilita al usuario la elección del término más correcto Seleccionado el término, con la función Send to se envía a un borrador previo, pudiéndose inmediatamente ejecutar una búsqueda bibliográfica tras pulsar el botón Search Pub- Med Así, sucesivamente por cada uno de los términos de la estrategia planificada, en este caso: #1 Hodgkin Disease [MeSH] #2 Family [MeSH] Finalmente, con la función History es posible combinar estos dos términos MeSH, de tal forma que se obtendría una sentencia similar a: #1 AND #2, traducible como linfoma de Hodgkin familiar Activando el comando Go se ejecuta la búsqueda, que en este caso recupera 108 referencias (tabla III) También es posible obtener un número muy razonable y pertinente de referencias bibliográficas aplicando la opción Subsets (subconjuntos) en la función Limits Existen subconjuntos temáticos ( topics ), como Cáncer, Toxicología o sida, y subconjuntos de publicaciones, como Nursing Journals (revistas de enfermería), Dental Journals (revistas de odontología) y Core Clinical Journals (revistas médicas) Resulta de especial utilidad el subconjunto Core, que permite seleccionar las revistas biomédicas de mayor calidad y difusión (Lancet, New England, JAMA, etc), con la ventaja de que sus artículos además serán fácilmente localizables en cualquier biblioteca especializada Por ejemplo, del conjunto de 108 referencias obtenidas mediante la utilización de los términos MeSH ( Hodgkin Disease y Family ), la aplicación del subconjunto Core permite reducir este número a unas 20, un número mucho más manejable y de gran utilidad al comprobar los títulos de las revistas de donde proceden la mayoría de estas referencias (BMJ, Cancer, Ann Intern Med, etc) La aplicación de cualquier límite subsets tiene el inconveniente de desechar aquellas referencias que no pertenecen a las revistas incluidas en dichos grupos, y que pueden ser pertinentes Por ejemplo, si en una búsqueda se han localizado referencias de las revistas Atención Primaria o Medicina Clínica, la aplicación del límite Core las eliminará del resultado, ya que ambas revistas españolas no están incluidas en este subconjunto 36 JANO 17 DE ABRIL 2009 Nº 1734

5 Cómo gestionar las referencias? PubMed presenta las referencias resultantes de cualquier búsqueda agrupadas de 20 en 20 y distribuidas en una serie de pantallas sucesivas Estas referencias se pueden reagrupar en un número máximo de 500 mediante la función Show, lo que facilita su manejo y navegabilidad Las referencias aparecen también ordenadas por fecha de publicación, mostrándose en primer lugar las más recientes No obstante, es posible mediante la función Sort ordenarlas por revista ( Journal ), autor ( Author ) o título del artículo ( Title ) Así mismo, todas las referencias presentan una información básica (título, autores y revista) que responde a un formato predefinido por PubMed, el formato Summary Igualmente, es posible elegir otros formatos disponibles en la función Display si se quiere ver el resumen (formato Abstract ), las palabras-clave o términos MeSH ( formato Citation ) o el resumen y una selección de artículos relacionados (formato Abstract Plus ) Cómo guardar los resultados? Cuando el usuario haya quedado satisfecho con la búsqueda, puede almacenar su resultado de diversas formas La más inmediata, pero la más perecedera, es imprimir directamente las referencias seleccionando la función Send to y luego la opción de imprimir ( Print ) Más útil y conveniente es guardar las referencias para luego poderlas leer desde un programa de tratamiento de textos (Word o similares) Para ello basta con seleccionar en la misma función Send to el apartado File, lo que permitirá guardar las referencias en un archivo dentro de la unidad C, en un disquete o en una unidad extraíble Un segunda opción, también desde la función Send to, permite enviar dichas referencias por correo electrónico, para lo cual se requiere elegir el apartado Si la búsqueda es muy compleja y puede existir la necesidad de tener que repetirla en lo sucesivo al cabo de los meses o de los años, PubMed permite guardar la pregunta, esto es, la estrategia de búsqueda, mediante la opción Save Search Una vez guardada, esta Tabla III Búsquedas con términos MeSH Tipos de búsqueda Estrategia de búsqueda N o de referencias Primer término, #1 Hodgkin Disease [MeSH] en lenguaje controlado MeSH Segundo término, #2 Family [MeSH] en lenguaje controlado MeSH Combinación de ambos #1 AND #2 108 términos con operador AND estrategia puede ser activada en un futuro cuantas veces sea necesario mediante la función My NCBI Ello, lógicamente, permite optimizar el esfuerzo realizado en el momento de elaborar la estrategia y además posibilita la obtención periódica y sistemática de las nuevas referencias que vayan apareciendo sobre el tema de la búsqueda, sin necesidad de formular ex novo la estrategia cada vez que se necesite Para poder acceder de forma personalizada a My NCBI es necesario registrarse previamente de forma individual (función Register en la parte superior derecha de la página principal de Pub- Med) y con la clave y contraseña obtenidas identificarse como usuario en la función Sign in Consideraciones finales Las actualizaciones de la base de datos y la aparición de nuevas funcionalidades son constantes y reflejan la profesionalidad del equipo de trabajo de la National Library of Medicine de Estados Unidos así como la buena salud del propio Pub- Med, superando en la actualidad los 17 millones de referencias Por ello es recomendable un manejo periódico de la base de datos y la consulta de sus ayudas en línea, que permitirán un conocimiento actualizado de las potencialidades y funcionalidades de esta herramienta, cuyo acceso universal por internet ha permitido a los profesionales sanitarios familiarizarse con los mecanismos de la búsqueda y recuperación de la información Aunque tiene un evidente sesgo anglosajón, y apenas recoge una treintena de revistas españolas, es una fuente indiscutible de información, divulgación y prestigio internacional, de obligada consulta para todo profesional médico que necesite actualizar sus conocimientos J Principales funciones de PubMed (cont) MY NCBI = activar las estrategias de búsqueda guardadas SAVE SEARCH = guardar la estrategia de búsqueda SEND TO = imprimir, guardar o enviar las referencias (a un fichero o por correo electrónico) SHOW = agrupar las referencias en un número máximo de 500 por pantalla SINGLE CITATION MATCHER = identificar con rapidez una referencia bibliográfica SORT = ordenar las referencias por fecha de publicación, autor o revista Para saber más Barroso Espadero D, Fernández Rodríguez M, Orejón de Luna G Introducción a MEDLINE y a las búsquedas bibliográficas (I) Fundamentos sobre bibliografía médica y búsquedas MEDLINE en Internet PubMed y familia Rev Pediatr Aten Primaria 2003;5: Barroso Espadero D, Orejón de Luna G, Fernández Rodríguez M Introducción a MEDLINE y a las búsquedas bibliográficas (II) Guía de uso de PubMed Rev Pediatr Aten Primaria 2004;6: Dupras DM, Ebbert JO Clinicians guide to new tools and features of PubMed Mayo Clin Proc 2007;82:480-4 JANO 17 DE ABRIL 2009 Nº