2015 ESTUDIOS MOLECULARES. [Seleccione la fecha]

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1 2015 ESTUDIOS MOLECULARES [Seleccione la fecha]

2 BIOMAKERS es una Institución especializada en estudios genéticos y moleculares para el cáncer y otras enfermedades complejas de la Argentina y Latinoamérica. Nuestro equipo de profesionales posee una amplia trayectoria en el ámbito científico, médico y de investigación clínica, características que nos permiten brindar tanto al médico como al paciente un servicio integral de diagnóstico y asesoría molecular. Desde los inicios, BIOMAKERS mantiene y promueve un compromiso con la Investigación & Desarrollo que se plasma en la búsqueda sistemática de metodologías de nueva generación para la determinación de nuevos biomarcadores. BIOMAKERS sienta sus bases como Institución sobre los valores de: Calidad Credibilidad Rigor Científico Profesionalidad -1-

3 ÍNDICE I. BIOMARCADORES ASOCIADOS A DISTINTAS PATOLOGÍAS 3 a. Biomarcadores en Cáncer de Pulmón 4 b. Biomarcadores en Cáncer Colorrectal 5 c. Biomarcadores en Cáncer de Mama 6 d. Biomarcadores en Cáncer de Tiroides 6 e. Biomarcadores en Melanoma 7 f. Biomarcadores en Tumores del Sistema Nervioso Central (SNC) 7 g. Biomarcadores en Leucemia Mieloide Aguda (LMA) 8 h. Biomarcadores en Leucemia Mieloide Crónica (LMC) 8 i. Biomarcadores en Tumores del Estroma Gastrointestinal (GIST) 9 II. BIOMARCADORES ASOCIADOS A ENFERMEDADES HEREDITARIAS 10 a. Biomarcadores de Cáncer de Mama y Ovario Hereditario (CMOH) 11 b. Biomarcadores en Poliposis Adenomatosa Familiar (PAF) 12 c. Biomarcadores en Síndrome de Lynch (HNPCC) 12 d. Biomarcadores en Neoplasia Endócrina Múltiple (MEN) 12 e. Biomarcadores en Cáncer Gástrico Difuso 13 f. Biomarcadores en Síndrome de Cowden 13 g. Biomarcadores en Alzhéimer 13 h. Paneles en Síndrome de Li-Fraumeni 13 III. PANELES DE BIOMARCADORES 14 IV. BIOMARCADORES ASOCIADOS A TOXICIDAD A DROGAS 16-2-

4 BIOMARCADORES ASOCIADOS A DISTINTAS PATOLOGÍAS -3-

5 Biomarcadores en Cáncer de Pulmón Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID EGFR De rutina Predictivo Mutaciones EML4-ALK De rutina Predictivo Rearreglos BRAF Recomendado Predictivo Mutaciones Fusiones de RET Recomendado Predictivo Rearreglos HER2 Recomendado Predictivo Mutaciones ROS-1 Recomendado Predictivo Rearreglos ckit Recomendado Predictivo Mutaciones KRAS Recomendado Pronostico Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores de Tirosina quinasa (TKI; Afatinib, Gefitinib, Erlotinib) Sensibilidad a inhibidores de ALK (Crizotinib, Ceritinib) Sensibilidad a inhibidores de BRAF (Vemurafenib, Dabrafenib) Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Vandetanib, Sunitinib, Sorafenib) Sensibilidad a TKI de segunda generación (Afatinib) Sensibilidad a inhibidores de ALK (Crizotinib) Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib, Sunitinib, Sorafenib y Nilotinib) Sensibilidad a anticuerpos anti-egfr (Cetuximab, Panitumumab) y Pronóstico de enfermedad S. Sanger PlEGsa FISH IHQ PlEMALfh PlEMALih S. Sanger PlBRsa qpcr FISH PlBRqp PlFRETfh S. Sanger PlHR2sa IHQ FISH PlRSih PlRSfh S. Sanger PlCKsa S. Sanger PlKRsa PI3KCA En Investigación Predictivo Mutaciones Resistencia a TKI y anticuerpos anti EGFR S. Sanger PlPIsa MET En Investigación Predictivo Amplificación DDR2 En Investigación Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores de MET y resistencia a TKI Sensibilidad a tirosina quinasas BCR/ABL, SRC, c-kit, varias quinasas Eph (Dasatinib) FISH PlMTfh S. Sanger PlDDsa PD-L1 En Investigación Predictivo Sobreexpresión Sensibilidad a anti-pdl1 y anti-pd1 IHQ PlPDih PTEN En Investigación Predictivo Sobreexpresión Resistencia a anticuerpos anti-egfr IHQ PlPTih -4-

6 Biomarcadores en Cáncer Colorrectal Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID KRAS De rutina Predictivo Mutaciones NRAS De rutina Predictivo Mutaciones EGFR De rutina Expresión Expresión BRAF Recomendado Predictivo Pronóstico MSI Recomendado Diagnóstico Mutaciones Inestabilidad Microsatelital PI3KCA En Investigación Predictivo Mutaciones PTEN En Investigación Predictivo Amplificación Sensibilidad a anticuerpos anti-egfr (Cetuximab, Panitumumab) Sensibilidad a anticuerpos anti-egfr (Cetuximab, Panitumumab) Sensibilidad a anticuerpos anti-egfr (Cetuximab, Panitumumab) Sensibilidad a anticuerpos anti-egfr (Cetuximab, Panitumumab). Pronóstico de enfermedad S. Sanger CcKRsa qpcr CcKRqp S. Sanger CcNRsa qpcr IHQ CcNRqp CcEGih S. Sanger CcBRsa qpcr CcBRqp Diagnóstico de enfermedad Genotipificación CcMSIgn Sensibilidad a anticuerpos anti-egfr (Cetuximab, Panitumumab) y Pronóstico de enfermedad Sensibilidad a anticuerpos anti-egfr (Cetuximab, Panitumumab) S. Sanger CcPKsa qpcr IHQ CcPKqp CcPTih -5-

7 Biomarcadores en Cáncer de Mama Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID BRCA1 y BRCA2 De rutina Predictivo Mutaciones somáticas Sensibilidad a inhibidor de PARP (Olaparib) NGS MoBA12ng HER2 De rutina Predictivo IHQ MoHR2fh Amplificación Sensibilidad a anticuerpo anti-her2 Pronóstico FISH MoHR2fh Receptor de Predictivo De rutina Estrógeno Pronóstico Expresión Sensibilidad a terapia hormonal IHQ MoREih Receptor de Predictivo De rutina Progesterona Pronóstico Expresión Sensibilidad a terapia hormonal IHQ MoRPih Ki-67 De rutina Pronóstico Expresión Marcador de proliferación celular IHQ MoK67ih p16 De rutina Pronóstico Expresión Diagnóstico de lesiones pre-cancerosas en el TGI IHQ MoP16ih Biomarcadores en Cáncer de Tiroides Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID BRAF Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar S. Sanger TrBRsa qpcr TrBRqp KRAS Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar, folicular y anaplásico S. Sanger TrKRsa HRAS Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar, folicular y anaplásico S. Sanger TrHRsa NRAS Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma papilar, folicular y anaplásico S. Sanger TrNRsa RET Recomendado Diagnóstico Rearreglos Carcinoma papilar FISH TrRTfh PAX8 Recomendado Diagnóstico Rearreglos Carcinoma folicular FISH TrPX8fh RET Recomendado Diagnóstico Mutaciones Carcinoma medular de tiroides S. Sanger TrMRETsa -6-

8 Biomarcadores en Melanoma Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID BRAF De rutina Predictivo Mutaciones ckit Recomendado Predictivo Mutaciones NRAS En investigación Predictivo Mutaciones Inhibidores de BRAF e Inhibiddores de MEK Sensibilidad a inhibidores Inhibidor multidiana tirosina quinasa (Imatinib, Sunitinib, Sorafenib y Nilotinib) Sensibilidad a la combinación Sorafenib-Tivantinib S. Sanger MlBRsa qpcr MlBRqp S. Sanger MlCKsa S. Sanger MlNRsa Biomarcadores en Tumores del Sistema Nervioso Central (SNC) Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID 1p19q De rutina Diagnóstico Rearreglos Diagnóstico de oligodendrogliomas FISH Sn1p19qfh IDH1/2 Recomendado Diagnóstico Mutaciones Diagnóstico de gliomas grado II y III y en GBMs secundarios S. Sanger SnIDsa MGMT Recomendado Predictivo Metilación promotor Respuesta a los agentes alquilantes Metilación / S. Sanger SnMGmtsa 10q23 En investigación Diagnóstico Deleción Diagnóstico de glioblastomas FISH Sn10q23fh -7-

9 Biomarcadores en Leucemia Mieloide Aguda (LMA) Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID AML1/ETO De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable qpcr LmaAMqp BCR-ABL1 De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico desfavorable qpcr LmaABqp CBFB/MYH11 De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable qpcr LmaCMqp CBFB/MYH11 De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable FISH LmaCMfh CEPBA De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaSEPsa ckit De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaCKsa 20q De rutina Pronóstico Deleción Factor de pronóstico favorable FISH Lma20qfh -5, 5q-, -7, 7q- De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico desfavorable FISH Lma5q7q 11q23 -non t(9;11) De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico desfavorable FISH Lma11q23fh FLT3 De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico desfavorable S. Sanger LmaFLsa NPM1 De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaNPMsa PML/RARA De rutina Pronóstico Rearreglos Factor de pronóstico favorable qpcr LmaLqp IDH1/2 De rutina Pronóstico Mutaciones Factor de pronóstico favorable S. Sanger LmaIDsa Biomarcadores en Leucemia Mieloide Crónica (LMC) Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID BCR-ABL1 BCR-ABL1 De rutina De rutina Diagnóstico Predictivo Diagnóstico Predictivo Rearreglos Mutaciones Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib) Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Dasatinib, Nilotinib y Bosutinib) qpcr qpcr LmcAB922qp LmcABqp -8-

10 Biomarcadores en Tumores del Estroma Gastrointestinal (GIST) Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Implicancia Terapéutica Metodología* Test ID ckit Recomendado Predictivo Mutaciones PDGFR-α Recomendado Predictivo Mutaciones BRAF Recomendado Pronóstico y Predictivo Mutaciones Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib) Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib) Alto riesgo de malignidad. Sensibilidad a inhibidores multidiana tirosina quinasa (Imatinib) S. Sanger GiCKsa S. Sanger GiPGsa S. Sanger GiBRsa -9-

11 BIOMARCADORES ASOCIADOS A ENFERMEDADES HEREDITARIAS -10-

12 Biomarcadores de Cáncer de Mama y Ovario Hereditario (CMOH) Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología * Test ID BRCA1 y BRCA2 De rutina Diagnóstico Mutaciones NGS MhBA12ng Paneles de biomarcadores Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología * Test ID Panel de mutaciones Judío Ashkenazí De rutina Diagnóstico Panel de Cáncer de Mama En investigación Diagnóstico Mutaciones Fundadoras: BRCA1 185delAG y 5382insC BRCA 2: 6174delT ACVR1B EP300 IRAK4 PBRM1 TP53 AKT1 ERBB2 ITCH PCGF2 TRAF5 ATM ERBB3 KMT2C PIK3CA WEE1 BAP1 ESR1 MAP2K4 PIK3R1 ZBED4 BRCA1 EXOC2 MAP3K1 PPM1L BRCA2 EXT2 MDM2 PTEN CBFB FBXO32 MUC16 PTGFR CDH1 FGFR1 MYC RB1 CDKN2A FGFR2 NCOR1 RET EGFR GATA3 NEK2 SEPT9 S. Sanger NGS MhPJAsa PtPCMng -11-

13 Biomarcadores en Poliposis Adenomatosa Familiar (PAF) Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID APC De rutina Diagnóstico Mutaciones S. Sanger PafAPCsa MYH De rutina Diagnóstico Mutaciones S. Sanger PafMYHsa Biomarcadores en Síndrome de Lynch (HNPCC) Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID MLH1 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LynL1ih MSH6 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LyS6ih MSH2 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LynS2ih PMS2 De rutina Diagnóstico Ausencia de expresión IHQ LynPM2ih Inestabilidad Microsatelital (MSI) Recomendado Diagnóstico Alteración en Microsatélites Genotipificación LynMSIgn Mutaciones MSH2 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynS2sa Mutaciones MLH1 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynL1sa Mutaciones MSH6 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynS6sa Mutaciones PMS2 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger LynPM2sa Biomarcadores en Neoplasia Endócrina Múltiple (MEN) Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología * Test ID RET Recomendado Diagnóstico Polimorfismos S. Sanger AzAE2qp -12-

14 Biomarcadores en Cáncer Gástrico Difuso Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID CDH1 Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger GdCDH1sa Biomarcadores en Síndrome de Cowden Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID PTEN Recomendado Diagnóstico Mutaciones germinales S. Sanger GdCDH1sa Biomarcadores en Alzhéimer Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID APOE e2 Recomendado Diagnóstico Polimorfismos qpcr AzAE2qp APOE e3 Recomendado Diagnóstico Polimorfismos qpcr AzAE3qp APOE e4 Recomendado Diagnóstico Polimorfismos qpcr AzAE4qp Proteína precursora amiloide (APP), presenilina-1 (PS1) y presenilina-2 (PS-2) Recomendado Diagnóstico Mutaciones S. Sanger AzAPSsa Paneles en Síndrome de Li-Fraumeni Panel Evidencia Tipo Alteración Molecular Metodología* Test ID Panel Tp53 Recomendado Diagnóstico Tp53 NGS PtPTP53ng -13-

15 PANELES DE BIOMARCADORES -14-

16 Paneles de Biomarcadores Panel Evidencia Tipo Alteración Molecular Enfermedad Asociada Test ID Panel Pulmón (22 genes) Panel de Cáncer Colorrectal (22 genes) Recomendado Recomendado Predictivo Predictivo Mutaciones en KRAS, EGFR, BRAF, PIK3CA, AKT1, ERBB2, PTEN, NRAS, STK11, MAP2K1, ALK, DDR2, CTNNB1, MET, TP53, SMAD4, FBXW7, FGFR3, NOTCH1, ERBB4, FGFR1, FGFR2 Mutaciones en KRAS, EGFR, BRAF, PIK3CA, AKT1, ERBB2, PTEN, NRAS, STK11, MAP2K1, ALK, DDR2, CTNNB1, MET, TP53, SMAD4, FBXW7, FGFR3, NOTCH1, ERBB4, FGFR1, FGFR2 Pronóstico de enfermedad en Cáncer de Pulmón Pronóstico de enfermedad en CCR Panel Tp53 Recomendado Diagnóstico Tp53 Li-Fraumeni PtPTP53ng ACVR1B EP300 IRAK4 PBRM1 TP53 AKT1 ERBB2 ITCH PCGF2 TRAF5 ATM ERBB3 KMT2C PIK3CA WEE1 Panel Cáncer de Mama En investigación Diagnóstico BAP1 ESR1 MAP2K4 PIK3R1 Clasificación del tumor en ZBED4 cáncer de mama BRCA1 EXOC2 MAP3K1 PPM1L PtPCMng BRCA2 EXT2 MDM2 PTEN CBFB FBXO32 MUC16 PTGFR CDH1 FGFR1 MYC RB1 CDKN2A FGFR2 NCOR1 RET EGFR GATA3 NEK2 SEPT9 Panel de enfermedades hereditarias-328 genes asociados a 700 enfermedades hereditarias En investigación Diagnóstico Consultar en el siguiente link: Diagnóstico de enfermedades hereditarias PlPPng CcPCng PtPEHng -15-

17 BIOMARCADORES ASOCIADOS A TOXICIDAD A DROGAS -16-

18 Biomarcadores asociados a Toxicidad a Drogas Biomarcador Evidencia Tipo Alteración Molecular Sensibilidad a Droga Metodología* Test ID DPYD Recomendado Predictivo Polimorfimos 5FU S. Sanger TxDPYD TYMS Recomendado Predictivo Polimorfimos 5' UTR 5FU S. Sanger TxTYMS5 TYMS Recomendado Predictivo Polimorfimos 3' UTR Metrotexato qpcr TxTYMS3 UGT1A1 Recomendado Predictivo Polimorfimos *28A Irinotecan S. Sanger TxUGT1A1 MTHFR Recomendado Predictivo Polimorfimos Metrotexato S. Sanger TxMTHFR ERCC1 En investigación Predictivo Expresión Cisplatinos IHQ TxERCC1 RRM1 En investigación Predictivo Expresión Gemcitabina IHQ TxRRM1-17-

19 La clasificación de los estudios moleculares disponibles actualmente ha sido supervisada por el equipo de especialistas de BIOMAKERS. Las recomendaciones aquí presentes no pretenden sustituir a las directrices de consensos de sociedades médicas o de las guías de tratamiento oncológico vigentes en la actualidad. * Metodología de Análisis: FISH: Hibridación in situ de fluorescencia IHQ: Inmunohistoquímica NGS: Next-Generation Sequencing qpcr: Real Time PCR S. Sanger: Secuenciación Sanger -18-

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