ANÁLISIS DE LIGAMIENTO
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- Clara Cano del Río
- hace 6 años
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1 ANÁLISIS DE LIGAMIENTO
2 EXISTENCIA DE LIGAMIENTO Paso 1: Hipótesis nula (Ho) y test de Chi-cuadrado para aceptar/rechazar esta Ho. Paso 2: Si se aceptara la Ho, entonces los genes son independientes y se acaba el ejercicio. Si se rechazara la Ho, se realizan dos pruebas de Chi-cuadrado (una para cada gen por separado) para ver si se ajustan a las segregaciones esperadas según las leyes de Mendel y se pasa al paso 3. Paso 3: Si los genes por separado se están heredando bien, entonces se realiza un Chi-cuadrado de ligamiento para extraer el error de segregación que pueda existir por estos genes. Si se sigue rechazando la Ho, entonces se puede decir que los genes está ligados.
3 Cálculo de Chi cuadrado en un cruzamiento de prueba Planteo de hipótesis: H0: la segregación de los genes es independiente. Las 4 clases fenotípicas en la descendencia se encuentran en proporciones iguales, de ¼ cada una. El valor de Chi cuadrado obtenido está dentro de las probabilidades (valor menor o igual al de tabla) H1: no se cumple la proporción de ¼ cada clase, y las proporciones observadas responden a otra causa. El valor de Chi cuadrado obtenido se aparta de las probabilidades (valor mayor o igual al de tabla).
4 Cálculo de Chi cuadrado Total Clases fenotípicas n observado n esperado (O-E) 2 /E Liso redondo 45 65,25 6,28 Rugoso redondo 91 65,25 10,56 Liso alargado 86 65,25 6,60 Rugoso alargado 39 65,25 10,56 Total 261 Х 2 34,00 Grados de libertad = clases fenotípicas 1 = 4-1 = 3 α = 0,05
5 No se cumple H0 Х 2 c 34,00 > Х 2 T 7,81
6 Х 2 (0,05,3)= 7,81 Х 2 c= 34,00
7 Por qué no se cumple H0? 1- Porque hay una variación en la segregación del gen liso-rugoso? 2- Porque hay una variación en la segregación del gen redondo-alargado? 3- Porque ambos genes están ligados?
8 Cálculo de Chi cuadrado Genes Individuales Cálculo de Chi cuadrado para el gen liso-rugoso Planteo de hipótesis: H0: la segregación de los alelos del gen liso rugoso responde a lo esperado según leyes mendelianas. Las 2 clases fenotípicas deben resultar ½ de cada una. H1: no se cumple la proporción de 1/2 cada clase. Las proporciones observadas responden a otra causa.
9 Cálculo de Chi cuadrado Genes Individuales Cálculo de Chi cuadrado para el gen liso-rugoso Clases fenotípicas n observado n esperado (O-E) 2 /E Liso = ,5 0,0019 Rugoso = ,5 0,0019 Total 261 Х 2 0,0038 Grados de libertad = clases fenotípicas 1 = 2-1 = 1 α = 0,05 Se cumple H0
10 Cálculo de Chi cuadrado Genes Individuales Cálculo de Chi cuadrado para el gen redondo/alargado Planteo de hipótesis: H0: la segregación de los alelos del gen redondo/alargado responde a lo esperado según leyes mendelianas. Las 2 clases fenotípicas deben resultar ½ de cada una. H1: no se cumple la proporción de 1/2 cada clase. Las proporciones observadas responden a otra causa.
11 Cálculo de Chi cuadrado Genes Individuales Cálculo de Chi cuadrado para el gen redondo/alargado Clases fenotípicas n observado n esperado (O-E) 2 /E Redondo = ,5 0,2318 Alargado = ,5 0,2318 Total 261 Х 2 0,4636 Grados de libertad = clases fenotípicas 1 = 2-1 = 1 α = 0,05 Se cumple H0
12 Cálculo de Chi cuadrado de Ligamiento Х 2 de ligamiento = Х 2 total Х 2 gen Liso/rugoso Х 2 gen redondo/alargado Х 2 de ligamiento = 34-0,0038 0,4636 = 33, 54 Grados de libertad = = 1 α = 0,05 No se cumple H0 Los genes están ligados
13 RESUMIENDO: CHI CUADRADO PARA 2 GENES Comprobar: 1- si la segregación gamética sigue las leyes de Mendel (1/4 de cada gameta) 2- si el locus A/a segrega correctamente: ½ A ½ a. 3- si el locus B/b segrega correctamente: ½ B ½ b. 4- restar la sumatoria de ambos Chi cuadrados al Chi cuadrado inicial.
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