Evaluación Genética y Genómica en Uruguay Presente y Futuro
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- Ana Belén Méndez Acosta
- hace 6 años
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2 Evaluación Genética y Genómica en Uruguay Presente y Futuro Ignacio Aguilar, Olga Ravagnolo, Rodrigo López Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria Programa Nacional de Investigación en Producción de Leche INIA Las Brujas, Uruguay iaguilar@inia.org.uy
3 Objetivo general de programas de mejora genética Obtener futuras generaciones de animales que producirán de manera más eficiente en futuras circunstancias de producción
4 Programa de Mejoramiento Genético Población Que mejorar $$$ Medir Que medir Usar animales superiores Evaluar genéticamente los animales Seleccionar
5 Mejora Genética Animal Valor de Cría: DEP Identificar animales con alto Mérito Genético para los caracteres de interés, para ser usados como progenitores de la siguiente generación, de manera de maximizar el mérito esperado de la progenie
6 Evaluaciones genéticas Evaluaciones genéticas usan información fenotípica y de genelogia para predecir valores de cría de rasgos de relevancia económica para la selección candidatos.
7 Marco Institucional en Uruguay : Convenios ARU/SCHU-FAGRO, INML-FAGRO : Convenio unificación de evaluaciones : Acuerdo entre FAGRO, INIA, ARU, INML y SCHU 2013: Convenio ARU-INML => CML 2013: Nuevo acuerdo con integración del INALE 2014: MU - Mejoramiento y Control Lechero Uruguayo
8 Evaluación Genética Nacional
9 Evaluaciones genéticas nacionales 1994 Cantidad de producto: Producción de leche (grasa) 1995 Características compuestas de tipo 2003 Cantidad y calidad de producto: grasa y proteína 2004 Características lineales de tipo 2012 Índice de Selección IEP Interbull - Evaluación Genética Internacional 2015 Fertilidad Tasa de preñez en hijas Modelo día de control 2016 Actualización Índice IEP (Fertilidad hembras)
10 Caracteres Evaluados Producción a 305 días Kg LECHE Kg GRASA % GRASA Kg PROTEINA % PROTEINA Fertilidad de hembreas Tasa de preñez en hijas
11 Caracteres Evaluados TIPO COMPUESTAS PUNTAJE FINAL GRUPA SIST MAMARIO PATAS FORMA LECHERA SISTEMA MAMARIO PROF UBRE TEXTURA UBRE LIG MEDIO INSERCION UA COL PEZ ANT LARGO PEZ ALT INS POST ANC INS POST COL PES POST GRUPA DEC GRUPA SEP ISQ FORT LOMO FORMA LECHERA ESTATURA ANCHO PECHO PROF CUERPO ANGULOSIDAD PATAS ANGULO PEZ CAL HUESO CURV PATAS LOCOMOCION
12 Evaluación Genética Holando en números Evaluación Producción (LGP) > 6.2 millones de controles de producción leche 39 % con informacion proteina y grasa 334,000 vacas (base de datos histórica) 794 tambos (65% con registros proteina y grasa) Evaluar 9900 toros (63% nacionales) Evaluación Tipo 52 mil calificaciones 275 tambos
13 Novedades en el Sistema de Evaluación Genética Nacional
14 Modelo día de control Hasta Modelo Lactancias 305 Días Registración faltante para componentes de leche (grasa, proteína, recuento células somáticas) A nivel de establecimientos A nivel de lactancias Necesidad de modelos de evaluación genética mas flexibles
15 Utilización de Lactancias Leche Proteína
16 Modelo día de control Utiliza información de cada control en forma individual Mejor ajuste de efectos ambientales (rodeo, días en lactancia, etc) Uso mas eficiente de información disponible (especialmente componentes) Utiliza Correlaciones genéticas y ambientales entre Leche, Grasa, Proteína
17 Evaluación Genética para Fertilidad Bases de datos histórica de información de fecha partos, servicios Intervalo interpartos -> Días Abiertos Estudios de correlaciones genéticas con otras características a nivel nacional, para incorporación en índice IEP Tesis Maestría Fac. Agronomía
18 Evaluación Genética para Fertilidad Carácter Tasa de preñez en hijas similar a DPR en EEUU porcentaje de hijas no preñadas que quedan preñadas durante cada período de 21 días Heredabilidad (4-5%) Existencia de variación genética Rango de DEP Percentil > 5% de tasa de preñez
19 Tendencia Genética Tasa de preñez en hijas
20 Tendencia Genéticas Leche y Proteína
21 Tendencia Genética Indice IEP
22 Sumario de padres Holando Abril 2016 Desde Abril 2013 Incorpora información de evaluación genética Nacional e Internacional Evaluación Genética Internacional desarrollada por Interbull
23 Evaluación genética internacional Qué es INTERBULL? Evaluación genética internacional desarrollada por el INTEBULL Centre (Suecia) INTERBULL (International Bull Evaluation Service) Subcomité de ICAR (comité internacional para la registración animal) Unifica evaluaciones genéticas de ganado lechero de diferentes países
24 Toros País A B C D Toros País B D Toros País A B F G Pedigri Mundial A B C D E F G H Evaluación Genética MACE Méritos genéticos de cada país Correlaciones genéticas entre países Toros País A B C D E F G H Toros País A B C D E F G H Toros País A B C D E F G H
25 Evaluación Internacional Utiliza información de las nacidas en evaluación nacional de toros extranjeros con Toros evaluados a nivel mundial con su a condiciones Uruguayas Mejoras en genetico para de potencial
26 Evaluación Internacional Cada país dispone de para cada carácter NO éxiste un UNICO ranking mundial!!
27 Toros en común con resto de paises ZAF 210 AUS 222 BEL 114 USA 708 CAN 370 CHE 128 SVN 33 SVK 109 CZE 235 PRT 305 DEU 289 POL 278 DFS 246 NZL 224 ESP 258 NLD 283 EST 47 LVA 93 KOR 209 JPN 188 ITA 273 ISR 27 IRL 144 HUN 268 GBR 311 HRV 53 FRA 192 FRR 0
28 Datos Evaluación Internacional Toros de paises Criterios de utilización de pruebas nacionales 10 o mas hijas 10 o mas rodeos Nacidos posterior 1986 toros evaluados de Uruguay con hijas solamente en Uruguay
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33 Tabla de Percentiles
34 Servicio- Disponible; 133 Toros Activos Disponible; 285 Servicio; 523
35 Evaluación Genetica Nacional Raza Holando Predicción de méritos genético en condiciones de Uruguay + de 15 años de evaluación genética nacional Padres nacionales e importados con hijas en tambos Uruguayos Rasgos productivos y de calificación lineal Integración evaluación internacional Interbull Baja proporción disponible para comercialización Establecer poblaciones de entrenamiento/calibración para SELECCIÓN GENOMICA
36 Selección genómica Incremento significativo de la ganancia genética debido al incremento de la precisión de los valores de cría a edades tempranas Mayores ganancias: rasgos medidos en un solo sexo: rasgos de expresión tardía Producción lechera, fertilidad
37 Selección Genómica Industria lechera Selección Toro Selección Hijos Selección nietos Selección Bisnietos Toro Nacimiento 1 año 2 años 5 años 10 años Selección DEP de padres Nacimiento de Hijas Toro Probado Prueba de progenie Hijo Probado Prueba de progenie En Uruguay entre 7 y 8 años Toro probado vs 5 años
38 Proceso para la implementación de la Genotipado de Padres con alta precisión: Estimación del efecto de los SNP usando una base de datos histórica de evaluación genética (producción de proteína, fertilidad, calificación lineal) y animales genotipados con un chip de SNP CALIBRACION selección genómica PREDICCIONES GENOMICAS en animales jóvenes: Estimación del mérito de un nuevo animal (sin información propia o de descendientes) utilizando el conocimiento de su genotipo, y de los efectos estimados para cada uno de los alelos en cada SNP en etapa de entrenamiento
39 Selección Genómica Parentesco de animales más preciso
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43 Hermanos enteros Padre Madre Ningun alelo IBD Un alelo IBD Ambos alelos IBD J. P. Steibel MSU
44 Proyecto: Incorporación de información genómica en la evaluación genética nacional de la raza Holando Establecimiento de población para calibración de SNP: Padres Holando evaluados genéticamente y con alta precisión en la población Holando de Uruguay Genotipado de población de calibración Disponer de Herramienta de Selección Genómica en condiciones de nacionales
45 En resumen Sistema de Evaluacion Genetica Nacional Generacion de informacion objetiva en base a datos nacionales Mejoras en la para disponible Permitiendo al productor lechero disponer de herramientas para visualizacion del de sus y de los
46 Muchas gracias por su atención
47 NUEVO ÍNDICE DE SELECCIÓN PARA LA RAZA HOLANDO INCORPORA FERTILIDAD EN HIJAS Jorge Urioste, Gabriel Rovere y Nicolás Frioni Depto. Producción Animal y Pasturas Facultad de Agronomía
48 INTRODUCCIÓN Mejoramiento genético en ganado de leche incluye muchas características Peligro: selección unilateral por una sola característica puede traer cambios negativos en otras (ej: selección por leche puede traer problemas de fertilidad y susceptibilidad a enfermedades). Solución: definición científica de objetivos y criterios de selección.
49 UNA IMPORTANTE DISTINCIÓN: o Objetivos de selección: Características con importancia económica directa en los rodeos comerciales (afectan ingresos y/o costos) o Criterios de selección: Características solo importantes porque aportan información sobre las características económicamente importantes (usadas para predecir el valor genético de los animales, las DEP producidas en la evaluación genética)
50 ACCIONES RECIENTES 2010: definición de objetivos de selección: leche, grasa, proteína, peso vivo, intervalo interparto 2012: Índice de selección: combinación de DEPs de leche, grasa y proteína Índice Económico de Producción (IEP): índice expresado en base : expansión del índice de selección, incluyendo información de fertilidad
51 VALORES ECONÓMICOS 2012 (US$/UNIDAD DE CAMBIO) V G P PV IIP Objetivo (US$) = x DEP (V) x DEP (G) x DEP (P) x DEP (PV) x DEP (IIP)
52 REPASANDO EL CONCEPTO DE ÍNDICE Índice: un solo valor que resume toda la información conocida, económica y genética, facilitando la selección Optimiza las características biológicas usadas en la toma de decisiones (no necesariamente es bueno descollar en una sola) Maximiza la rentabilidad ($).
53 QUÉ CRITERIOS SE USAN? Los datos disponibles a partir de la Evaluación genética nacional: estimaciones de DEP para los rasgos de producción (L, G y P) y fertilidad (TPH) Por el momento no se tiene información de peso vivo (PV)
54 CONSTRUCCIÓN DEL ÍNDICE Dekkers & Gibson, 1998 b = P -1 I G IH v Coeficientes de ponderación de las DEP de leche, grasa, proteina y tasa de preñez en hijas Varianzas y covarianzas genéticas entre DEP de las caract. en el índice Valores económicos (2012) Covarianzas genéticas entre las caract. en el índice y las caract. en el objetivo Sivanadian et al. (1998)
55 CÓMO SE HIZO? Valores económicos estimados previamente (Rovere y Urioste, 2012). Parámetros genéticos actualizados (Aguilar, 2016; Frioni, 2016). Para peso vivo: información bibliográfica. Varianzas y covarianzas entre las fuentes de información (DEPs) y los rasgos en el objetivo según Sivanadian et al. (1998). Repetibilidad del índice según Cole y Van Raden (2010)
56 ÍNDICES ÍndiceUS$-2012 = x DEP (leche) x DEP (Grasa) x DEP (proteína) o ÍndiceUS$-2016 = x DEP (leche) x DEP (Grasa) x DEP (proteína) x DEP (tasa de preñez en hijas) IEP= (Índice US$ - media base poblacional) x 10 /(Desvío estándar del índice US$) Recordar: Objetivo (US$) = x DEP (V) x DEP (G) x DEP (P) x DEP (PV) x DEP (IIP)
57 REPETIBILIDAD DEL ÍNDICE Según Cole y Van Raden (2010) Ponderación de las repetibilidades de cada característica según su valor económico relativo Proteína y leche predominan
58 CONSIDERACIONES FINALES Existe una tecnología ajustada a la nueva disponibilidad de información genética La investigación se transfiere rápidamente a los productores Existe una hoja de ruta que el equipo técnico va ejecutando de acuerdo a los recursos disponibles
59 MUCHAS GRACIAS!
- NOVIEMBRE 2007 GABRIEL ROVERE
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