Escaneando preparaciones. Generar preparaciones digitales

Transcripción

1 Simposio de Patología Digital Escaneando preparaciones. Generar preparaciones digitales Marcial García Rojo Hospital de Jerez, Cádiz Madrid, 29 de mayo de 2014

2 Desafíos que afronta la Patología Costes y Productividad Incremento carga trabajo Acortamiento de procesos Presión presupuestaria (no siempre hay posibilidad de incremento de plantilla) Procesos muy laboriosos (muy manuales) Gran nº biomarcadores Tiempo en procesos Presión por reducir el tiempo hasta obtención diagnóstico Dar al paciente la terapia más adecuada en el menor tiempo y en el momento adecuado Calidad Procesamiento de la muestra Control del proceso según buenas prácticas Errores en la entrada de datos y etiquetaje (trazabilidad) Calidad de la tinción/test y reproducibilidad (estándares) Fuente: Dako

3 Microscopía virtual digital Cambios en la organización Tres componentes/fases: 1. Digitalización: Escáner de preparaciones 2. Gestión de imágenes (almacenamiento) 3. Visualización: Interfaz máquina-hombre Visor (software) Manejo del ordenador ratón? (hardware) Monitor de alta calidad

4 Mejorando los procesos en Patología BPMN, LEAN, Business Process Modeling Notation (BPMN) 4 IHE: Integrating Healthcare Enterprise

5 ESCANEANDO GRANDES VOLÚMENES DE PREPARACIONES EN PATOLOGÍA (1) Gestionar eficientemente datos e imágenes para generar informes de anatomía patológica Técnicos de anatomía patológica: Identificación y gestión de pacientes y muestras (portas): Sistema de trazabilidad y control de flujo de trabajo en laboratorios. Automatización de tinción y montaje Colocar las preparaciones en racks ( Sakura )

6 ESCANEANDO GRANDES VOLÚMENES DE PREPARACIONES EN PATOLOGÍA (2) Técnicos de anatomía patológica: Comprobar los parámetros de escaneado: A qué aumento (20x, 40x) Cómo se detectan las áreas de tejido Adecuación del número de puntos de foco Posible uso de escaneado múltiples planos (eje Z) Valorar los resultados del escaneado Distribuir las preparaciones (SIAP)

7 ESCANEANDO GRANDES VOLÚMENES DE PREPARACIONES EN PATOLOGÍA (3) El patólogo: Integrar imagen y datos clínicos. Telepatología Ayuda a la toma de decisiones (correlación clinicopatológica y citohistológica, ayuda al diagnóstico, evaluación pronóstica, optimización terapéutica) Pretratamiento de datos para registro de tumores y biobanco o banco de tejidos. Control de calidad de procesos técnicos y de diagnósticos

8 Ventana Vantage Dako TruePositiveId Shandon SlideMate, Laser MicroWriter, ChessMate Leica Cerebro Vitro TRAVIS...

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10 Microtomía automatizada 200 preparaciones en 2 horas

11 Escáneres de preparaciones 3DHistech Panoramic (4) Aperio ScanScope (6) Digipath PathScope (2) Hamamatsu Nanozoomer (2) Huron Tissuescope (1) Claro (2) Leica SCN400 (2) Menarini D.Sight(2) MikroScan D2 (1) Olympus VS (3) Omnyx (2) Philips (1) Roche Ventana (2) Menarini D.Signt Ventana iscan HT Olympus VS800, VS120, VS110.slide 3D Histech Aperio Scanscope AT / XT / CS Omnyx VL4 Leica SCN400 Hamamatsu Nanozoomer 2 Philips

12 Image Tiling (fotograma) Captura y une imagenes adyacentes de una o varias áreas. Captured Image Tiles 1,000 tiles/slide (20x) Each tile corresponds to an image captured with an area scan camera with 752 x 480 pixels. 12

13 Escaneado lineal (Aperio) o de área (Hamamatsu) Tiras de imágenes escaneadas 15 stripes/slide (20x) ~ 2000 pixels 13

14 Fases del escaneado de preparaciones 1. Seleccionar preparaciones, comprobar su estado y decidir cómo se van a escanear 2. Introducirlas en los casetes ( racks ) 3. Seleccionar parámetros de escaneado 4. Desplazar una preparación a la platina 5. Obtener panorámica de la preparación 6. Localizar dónde hay tejido, cómo se va a enfocar y balance de blanco 7. Captura de imagen por cámara de alta resolución 8. Componer ( montar ) la imagen completa 9. Trocear la imagen para ajustarla al formato deseado 10. Comprimir el archivo (JPEG2000) 11. Enviar fichero al servidor 12. Devolver preparación al rack y seleccionar la siguiente Paso 4

15 Petición de imágenes microscópicas Paso 1. Crear petición de imagen en sistema de información desde el despacho del patólogo Paso 2. Enlazar con sistema de gestión de imágenes (portal de telepatología)

16 Gestión de imágenes microscópicas Paso 3. Digitalizar imagen: Escanear preparación digital o tomar foto digital Realizada Paso 4. Confirmar información en base de datos del escáner (Worklist) La imagen en enviada al PACS El S.I. cambia estado de la imagen a realizada

17 1 st European Scanner Contest. Vilnius 2010 Calidad Fabricante Escáner Media Escaneado 20x Olympus VS-110 2,26 Escan. 40x 0,23-0,25 µm/pixel 3D Histech Pannoramic 150 2,82 Escaneado 40x 0,16 µm/pixel Olympus VS-110 4,35 Masivo Fabricante Escáner Velocidad % enfocado Velocidad corregida foco Escan. H&E 20x Escan. H&E 40x Leica SCN min 99,8 0,53 cm 2 / min Leica SCN min 99,75 0,26 cm 2 / min

18 Es posible escanear toda la carga de trabajo (hasta preparaciones)

19 Múltiples sistemas disponen de cargadores de más de 150 preparaciones

20 Contraste de blancos: Evitar áreas con tejido Automático o manual?

21 Detección de tejido: Calidad de tinción y montaje de preparación

22 Tolerancia a errores: El sistema sigue escaneando en la preparación siguiente

23 Es posible revisar qué se va a escanear (miniaturas / thumbnails)

24 Flexibilidad en formatos de fichero (?) y en tipos de preparaciones

25 Control del proceso de escaneado Carga continua

26 Escaneado rápido de una sola preparación (casos urgentes, intras)

27 Control de los puntos de enfoque

28 Una o múltiples áreas de interés

29 Conclusiones Existen soluciones para escanear en un solo equipo hasta preparaciones en una jornada de trabajo. La calidad de la imagen obtenida está relacionada con la calidad de la técnica histológica. Las soluciones integradas de patología digital con el SIAP, trazabilidad y el almacenamiento centralizado de imágenes (PACS), mejorarán el trabajo cooperativo entre técnicos y patólogos, y el principal beneficiado (sistema sin errores) es el paciente.

30 Muchas gracias! 30