Paneles de cáncer hereditario. guía para el médico

Transcripción

1 Paneles de cáncer hereditario guía para el médico

2 Las pruebas que ofrece Ambry están diseñadas para brindar opciones flexibles e integrales adaptadas a los antecedentes familiares y personales de sus pacientes. Qué son los paneles de secuenciación de próxima generación? Los paneles de secuenciación de próxima generación (NGS) son pruebas que analizan numerosos genes de manera simultánea a un costo menor que los métodos de secuenciación tradicionales. Ambry tiene la más amplia experiencia con los paneles multigenéticos de cáncer. Registramos miles de pruebas de panel de cáncer y contamos con una base de datos de evidencias considerable para analizar e interpretar las variantes. Nuestro experimentado equipo de orientadores genéticos, genetistas y científicos certificados ha diseñado nuestros exhaustivos informes para brindar resultados e interpretaciones claras y, cuando corresponda, información detallada sobre cualquier mutación y variantes de importancia desconocida identificadas. Beneficios de los paneles multigenéticos de cáncer VELOCIDAD Análisis simultáneo de numerosos genes Reduce la necesidad de numerosas consultas de seguimiento para conversar sobre pruebas adicionales RESPUESTAS Mayor probabilidad de identificar una mutación causal COSTO Un enfoque más rentable

3 BRCAplus/BreastNext BRCAplus y BreastNext son paneles multigenéticos que incluyen análisis integrales de 6 y 17 genes de susceptibilidad al cáncer de mama, respectivamente. mama riesgo de desarrollar cáncer de mama a lo largo de la vida por gen breastnext (%) ATM doble a cuádruple Mutación del gen BreastNext BARD1 BRCA1, BRCA2 BRIP1 hasta triple doble a triple de 45% a 87% CDH1 de 39% a 52% CHEK2 MRE11A, RAD50, NBN MUTYH NF1 doble hasta triple aumento* triple a quíntuple PALB2 de 33% a 58% hasta 50% RAD51C RAD51D hasta triple aumento* aumento significativo* *El riesgo de cáncer de mama relacionado a la mutación del gen MUTYH, RAD51D o es mayor en comparación con la población en general, pero no está bien definido. Candidatos para BRCAplus/BreastNext BRCAplus o BreastNext pueden aportar información si el paciente tiene antecedentes personales o familiares de cualquiera de las siguientes situaciones: 1. Cáncer de mama de aparición temprana (diagnosticado a los < 45 años de edad) 2. Cáncer de mama primario múltiple o bilateral 3. Cáncer de mama masculino a cualquier edad 4. Cáncer de mama y ovario en la misma mujer * En la misma rama familiar 5. Tres o más casos de cáncer de mama* 6. Tres o más casos de cáncer de mama, ovario o páncreas* 7. Tres o más casos de cáncer de mama, útero o tiroides* 8. Varios familiares con cáncer de mama y de otros tipos*

4 mama BRCAplus/BreastNext: genes y tipos de cáncer relacionados BRCAplus es una prueba multigenética que analiza 6 genes de susceptibilidad al cáncer de mama, todos con pautas de manejo médico (enumeradas en azul). BreastNext incluye 17 genes de susceptibilidad al cáncer de mama de riesgo alto y moderado (en azul y negro, respectivamente). GEN BRCA1, BRCA2* CDH1 PALB2* ATM* BARD1 BRIP1* CHEK2 MRE11A* MUTYH* NBN* NF1 RAD50* RAD51C* RAD51D TIPOS DE CÁNCER RELACIONADOS Mama, ovario, próstata, páncreas, mama masculino Mama, gástrico, colorrectal Mama, páncreas Mama, tiroides, útero, colorrectal, riñón Mama, sarcoma, cerebral, adrenocortical, leucemia, gastrointestinal, genitourinario Mama, páncreas Mama, ovario Mama, colorrectal Mama, colorrectal Mama, glioma óptico, SNC, GIST, PGL/FCC Mama, ovario Mama, ovario * Las mutaciones bialélicas de estos genes están relacionadas con enfermedades genéticas autosómicas recesivas que no están incluidas en esta tabla. SNC: sistema nervioso central GIST: tumor del estroma gastrointestinal PGL/FCC: paragangliomas/feocromocitomas

5 GYNplus/OvaNext GYNplus y OvaNext son paneles multigenéticos que incluyen análisis integrales de 9 y 24 genes de susceptibilidad al cáncer ginecológico, respectivamente. COLORRECTAL OVARIO MLH1* MSH2* MSH6* PMS2* EPCAM ÚTERO ovario/ útero BRCA1 BRCA2 MAMA OVARIO genes gynplus y tipos de cáncer relacionados BARD1 RAD51C RAD51D RAD50 BRIP1 NBN PALB2 MRE11A STK11 MUTYH BRCA1 BRCA2 CDH1 SMARCA4 MLH1* MSH2* MSH6* PMS2* EPCAM ATM NF1 MAMA CHEK2 ÚTERO * Fuentes recientes sugieren una mayor incidencia de cáncer de mama entre los portadores de mutación del gen reparador de desajustes (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2). Candidatos para GYNplus/OvaNext genes ovanext y tipos de cáncer relacionados GYNplus u OvaNext pueden aportar información si el paciente tiene antecedentes personales o familiares de cualquiera de las siguientes situaciones: 1. Cáncer de ovario a cualquier edad 2. Cáncer de útero de aparición temprana (diagnosticado a los < 50 años de edad) 3. Cáncer primario múltiple en una misma persona (p. ej. cáncer de útero y mama o tiroides) 4. Varios familiares cercanos con cáncer de ovario o útero y otros tipos de cáncer (de la misma rama familiar) 5. Antecedentes de cáncer que despierten sospecha tanto para el cáncer hereditario de mama y ovario como para el síndrome de Lynch

6 GYNplus/OvaNext: genes y tipos de cáncer relacionados GYNplus incluye 9 genes de susceptibilidad al cáncer de ovario y útero de riesgo alto con pautas de manejo claras (enumerados en azul). ovario/ útero OvaNext incluye 24 genes de susceptibilidad al cáncer de mama, ovario y útero de riesgo alto y moderado (en azul y negro, respectivamente). GEN TIPOS DE CÁNCER RELACIONADOS BRCA1, BRCA2* MLH1*, MSH2*, MSH6*, PMS2*, EPCAM ATM* BARD1 BRIP1* CDH1 CHEK2 MRE11A* MUTYH* NBN* NF1 PALB2* RAD50* RAD51C* RAD51D SMARCA4 STK11 Mama, ovario, mama masculino, próstata, páncreas Colorrectal, útero, estómago, ovario, intestino delgado, hepatobiliar, tracto urinario, cerebral, páncreas, sebáceo Mama, útero, riñón, tiroides, colorrectal Mama, sarcoma, cerebral, adrenocortical, leucemia, gastrointestinal, genitourinario Mama, páncreas Mama, ovario Mama, gástrico, colorrectal Mama, colorrectal Mama, colorrectal Mama, glioma óptico, SNC, GIST, PGL/FCC Mama, páncreas Mama, ovario Mama, ovario Ovario (carcinoma ovárico de células pequeñas, de tipo hipercalcémico) Mama, colorrectal, ovario, páncreas, intestino delgado * Las mutaciones bialélicas de estos genes están relacionadas con enfermedades genéticas autosómicas recesivas que no están incluidas en esta tabla. SNC: sistema nervioso central GIST: tumor del estroma gastrointestinal PGL/FCC: paragangliomas/feocromocitomas

7 ColoNext ColoNext es un panel multigenético que incluye análisis integrales de 17 genes de susceptibilidad al cáncer colorrectal. riesgo de desarrollar cáncer colorrectal a lo largo de la vida por gen colonext (%) Población general 5 Mutación del gen ColoNext Familiar hasta 20 APC hasta 100 BMPR1A, SMAD CDH1 aumento* CHEK2 doble GREM1 aumento MLH1, MSH2, EPCAM hasta 82 colon MSH MUTYH (bialélico) hasta 80 PMS POLD1, POLE aumento STK11 hasta 9 aumento* hasta 39 *El riesgo de cáncer colorrectal relacionado con la mutación del gen CDH1, GREM1, POLD1, POLE, o es mayor en comparación con la población en general, pero no está bien definido. Candidatos para ColoNext ColoNext puede aportar información si el paciente tiene antecedentes personales o familiares de cualquiera de las siguientes situaciones: 1. Cáncer colorrectal de aparición temprana (diagnosticado a los < 50 años de edad) 2. Cáncer primario múltiple en una misma persona (p. ej. dos cánceres colorrectales primario o cáncer colorrectal y uterino) 3. 3 o más familiares con cáncer colorrectal, de útero, de ovario o de estómago* 4. Varios familiares cercanos con cáncer colorrectal y de otros tipos* o más pólipos gastrointestinales a lo largo de la vida (pólipos adenomatosos, hiperplásicos, hamartomatosos o de otros tipos) 6. Pruebas genéticas previas de cáncer colorrectal hereditario poco informativas (negativa o variante de importancia desconocida, VUS) * En la misma rama familiar

8 ColoNext: genes, tipos de cáncer relacionados y características GEN CÁNCER(ES) SÍNDROME/CARACTERÍSTICAS ADICIONALES colon APC BMPR1A, SMAD4 CDH1 CHEK2 Colorrectal, intestino delgado, estómago, páncreas, tiroides, hígado, SNC Colorrectal, páncreas estómago Mama, gástrico, colorrectal Mama, colorrectal Poliposis adenomatosa familiar (PAF) PAF atenuada Síndrome de Gardner Síndrome de Turcot Síndrome de poliposis juvenil (SPJ) - Inicio en la niñez y la adolescencia - Telangiectasia hemorrágica hereditaria con SMAD4 Cáncer gástrico difuso hereditario - Cáncer gástrico difuso - Cáncer de mama lobular - Carcinoma de células en anillo de sello GREM1 Colorrectal Síndrome de poliposis mixta hereditaria (SPMH) MLH1*, MSH2*, MSH6*, PMS2*, EPCAM Colorrectal, útero, estómago, ovario, intestino delgado, hepatobiliar, tracto urinario, cerebral, páncreas, sebáceo Síndrome de Lynch Síndrome de Muir-Torre Síndrome de Turcot *Deficiencia constitucional de reparación de desajustes (CMMRD): síndrome de cáncer infantil con (dos) mutaciones bialélicas MUTYH Colorrectal, mama Poliposis asociada a MUTYH (MAP) con (dos) mutaciones bialélicas de MUTYH, Decenas a centenas de pólipos gastrointestinales POLD1, POLE Colorrectal Poliposis asociada a análisis de polimerasa (PPAP) Pólipos adenomatosos STK11 Mama, tiroides, útero, colorrectal, riñón Colorrectal, mama, intestino delgado, páncreas, ovario Mama, sarcoma, cerebral, adrenocortical, leucemia, gastrointestinal, genitourinario Síndrome tumoral hamartomatoso asociado a (PHTS) Síndrome de Cowden (SC) - Lesiones cutáneas (tricolemoma, queratosis acral, pápulas papilomatosas) - Macrocefalia y otros hallazgos clínicos - Enfermedad de Lhermitte-Duclos - Hamartomas gastrointestinales o ganglioneuromas Síndrome de Peutz-Jeghers (SPJ) - Hamartomas gastrointestinales y pigmentación mucocutánea de inicio en la niñez - Se observan tumores cervicales y gonadales Síndrome de Li-Fraumeni (SLF) - Cáncer infantil - Aumento de la sensibilidad a la radiación - Riesgo de tumores primarios múltiples

9 PancNext PancNext es un panel multigenético que incluye análisis integrales de 13 genes de susceptibilidad al cáncer de páncreas. penetrancia en comparación con prevalencia de genes pancnext Alto Genes PancNext RIESGO DE CÁNCER DE PÁNCREAS (PENETRANCIA) Moderado STK11 CDKN2A APC MLH1 MSH2 MSH6 PMS2 EPCAM Población general Muy infrecuente Infrecuente Frecuente FRECUENCIA DE LA MUTACIÓN (PREVALENCIA) páncreas Candidatos para PancNext PancNext puede aportar información si el paciente tiene antecedentes personales o familiares de cualquiera de las siguientes situaciones: 1. Cáncer de páncreas de aparición temprana (diagnosticado a los < 60 años de edad) 2. Cáncer primario múltiple en una misma persona (p. ej. cáncer de páncreas y colorrectal o de mama) 3. 2 o más familiares con cáncer de páncreas* 4. 3 o más familiares con cáncer de páncreas, de mama, colorrectal, de útero, de ovario o melanoma* 5. Varios familiares cercanos con cáncer de páncreas y de otros tipos* * En la misma rama familiar

10 PancNext: genes, tipos de cáncer relacionados y características GEN TIPOS DE CÁNCER RELACIONADOS SÍNDROME/CARACTERÍSTICAS ADICIONALES APC Colorrectal, intestino delgado, estómago, páncreas, tiroides, hígado, SNC Poliposis adenomatosa familiar (PAF) PAF atenuada Variante de Gardner Variante de Turcot ATM* Mama, páncreas Ataxia-telangiectasia* páncreas BRCA1, BRCA2* Mama, próstata, ovario, Cáncer de mama y ovárico hereditarios páncreas, mama - Cáncer de trompa de Falopio y peritoneal masculino primario - Cáncer de mama triple negativo (receptor de estrógeno, receptor de progesterona y gen HER2/neu negativos) relacionado con mutaciones del gen BRCA1 Anemia de Fanconi* Se conoce una mutación fundadora en muchas poblaciones (p. ej. judíos asquenazíes, portugueses, islandeses, daneses, entre otros) CDKN2A Melanoma, páncreas Síndrome de melanoma maligno cutáneo Síndrome de melanoma y lunares múltiples atípicos familiares (FAMMM) MLH1*, MSH2*, MSH6*, PMS2*, EPCAM Colorrectal, útero, estómago, ovario, intestino delgado, hepatobiliar, tracto urinario, cerebral, páncreas, sebáceo PALB2* Mama, páncreas Anemia de Fanconi * Síndrome de Lynch Síndrome de Muir-Torre Síndrome de Turcot *Deficiencia constitucional de reparación de desajustes (CMMRD): síndrome de cáncer infantil con (dos) mutaciones bialélicas STK11 Colorrectal, mama, intestino delgado, páncreas, ovario Síndrome de Peutz-Jeghers (SPJ) - Hamartomas gastrointestinales y pigmentación mucocutánea de inicio en la niñez - Se observan tumores cervicales y gonadales Mama, sarcoma, Síndrome de Li-Fraumeni (SLF) cerebral, adrenocortical, - Cáncer infantil leucemia, - Aumento de la sensibilidad a la radiación gastrointestinal, - Riesgo de tumores primarios múltiples genitourinario * Las mutaciones bialélicas de estos genes están relacionadas con los síndromes respectivos descritos en la columna Características adicionales.

11 RenalNext RenalNext es un panel multigenético que incluye análisis integrales de 19 genes de susceptibilidad al cáncer de riñón. riesgo de desarrollar cáncer de riñón a lo largo de la vida por gen renalnext (%) Población general 1.6 Mutación del gen RenalNext BAP1 FH FLCN MET aumento** hasta hasta 100 MITF MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM SDHB SDHA, SDHC, SDHD TSC1, TSC2 VHL al menos quíntuple 5-6% de riesgo de cáncer del tracto urinario superior* hasta aumento** aumento** hasta *** * Los cánceres del tracto urinario pueden incluir carcinoma de células renales y carcinoma de células transicionales. ** El riesgo de cáncer de riñón es elevado en la población en general, pero no está bien definido. *** Riesgo de cáncer de riñón dependiente del subtipo/genotipo de la enfermedad de von Hippel-Lindau. Candidatos para RenalNext RenalNext puede aportar información si el paciente tiene antecedentes personales o familiares de cualquiera de las siguientes situaciones: riñón 1. Cáncer de riñón de aparición temprana (diagnosticado a los < 46 años de edad) 2. Cáncer primario múltiple en una misma persona (p. ej. dos cánceres de riñón primarios o cáncer de riñón y tiroides) 3. 2 o más familiares con cáncer de riñón* 4. 3 o más familiares con cáncer de riñón y de otros tipos* 5. Varios familiares cercanos con cáncer de riñón y tumores neuroendócrinos* * En la misma rama familiar

12 RenalNext: genes, tipos de cáncer relacionados y características GEN TIPOS DE CÁNCER RELACIONADOS SÍNDROME/CARACTERÍSTICAS ADICIONALES BAP1 Riñón, melanoma, mesotelioma FH* Riñón Leiomiomatosis hereditaria y cáncer de células renales (LHCCR) Leiomiomas cutáneos Fibromas uterinos Posible riesgo de sarcoma uterino *Deficiencia de fumarato hidratasa FLCN Riñón Síndrome de Birt-Hogg-Dubé (BHD) MET Riñón Carcinoma renal papilar hereditario (CRPH) MITF Riñón, melanoma riñón MLH1*, MSH2*, MSH6*, PMS2*, EPCAM SDHA, SDHB, SDHC, SDHD Colorrectal, útero, estómago, ovario, intestino delgado, hepatobiliar, tracto urinario, cerebral, páncreas, sebáceo Mama, tiroides, útero, colorrectal, riñón PGL/FCC, riñón, GIST Mama, sarcoma, cerebral, adrenocortical, leucemia, gastrointestinal, genitourinario Síndrome de Lynch Síndrome de Muir-Torre Síndrome de Turcot *Deficiencia constitucional de reparación de desajustes (CMMRD): síndrome de cáncer infantil con (dos) mutaciones bialélicas Síndrome tumoral hamartomatoso asociado a (PHTS) Síndrome de Cowden (SC) - Lesiones cutáneas (tricolemoma, queratosis acral, pápulas papilomatosas) - Macrocefalia y otros hallazgos clínicos - Enfermedad de Lhermitte-Duclos - Hamartomas gastrointestinales o ganglioneuromas Síndrome de paraganglioma y feocromocitoma hereditario (PGL/FCC) Síndrome de Carney-Stratakis Posible síndrome similar al síndrome de Cowden Síndrome de Li-Fraumeni (SLF) - Cáncer infantil - Aumento de la sensibilidad a la radiación - Riesgo de tumores primarios múltiples TSC1, TSC2 Riñón, SNC Complejo de esclerosis tuberosa (CET) Rabdomiomas cardíacos VHL Riñón, SNC Enfermedad de von Hippel-Lindau (VHL) * Las mutaciones bialélicas de estos genes están relacionadas con los síndromes respectivos descritos en la columna Características adicionales. GIST: tumor del estroma gastrointestinal FCC: feocromocitomas PGL: paragangliomas SNC: sistema nervioso central

13 PGLNext PGLNext es un panel multigenético que incluye análisis integrales de 12 genes de susceptibilidad a paragangliomas o feocromocitomas (PGL/FCC). riesgo de desarrollar pgl/fcc a lo largo de la vida por gen pglnext (%) Población general FH MAX*, TMEM127 MEN1 NF1 <0.01 aumento aumento aumento hasta 7 Mutación del gen PGLNext RET hasta 50 SDHA, SDHC aumento SDHB SDHD* SDHAF2* hasta 100 VHL *El riesgo citado está relacionado con la herencia paterna. Candidatos para PGLNext PGLNext puede aportar información si el paciente tiene antecedentes personales o familiares de cualquiera de las siguientes situaciones: 1. Diagnóstico clínico de PGL/FCC a cualquier edad 2. Presencia de PGL/FCC con antecedentes personales o familiares de cáncer de riñón, tiroides o mama 3. Presencia de PGL/FCC con antecedentes personales o familiares de neurofibromas, tumores de riñón o tumores del estroma gastrointestinal pgl/fcc

14 PGLNext: genes, tipos de cáncer relacionados y características GEN TUMORES RELACIONADOS SÍNDROME/CARACTERÍSTICAS ADICIONALES FH* Riñón, PGL/FCC Leiomiomatosis hereditaria y cáncer de células renales (LHCCR), Leiomiomas cutáneos, Fibromas uterinos MAX FCC Herencia paterna, 60% bilateral Aumento del potencial metastásico de hasta el 25% MEN1 NF1 RET Paratiroides, tumores GEP, pituitaria, adrenal**, carcinoide Mama, glioma óptico, SNC, GIST, PGL/FCC Tiroides (medular) FCC Neoplasia endocrina múltiple tipo 1 (MEN1) Hiperparatiroidismo primario, angiofibromas faciales, colagenomas, lipomas Neurofibromatosis tipo 1 (NF1) - Lesiones cutáneas hiperpigmentadas - Neurofibromas - Nódulos de Lisch - Varias características adicionales Características de FCC: - 15% bilateral - Hasta un 9% de riesgo de malignidad Neoplasia endocrina múltiple tipo 2 (MEN2) potencial maligno <5%, 60% bilateral SDHA PGL/FCC, GIST PGL con bajo potencial maligno SDHAF2 PGL/FCC Herencia paterna PGL de cabeza/cuello con bajo potencial maligno SDHB PGL/FCC, riñón, GIST PGL con hasta 100% de riesgo de malignidad Posible síndrome similar al síndrome de Cowden SDHC PGL/FCC PGL con bajo potencial maligno SDHD PGL/FCC Herencia paterna, potencial maligno <5% TMEM127 PGL/FCC FCC con potencial maligno <5% 40% bilateral pgl/fcc VHL Riñón, FCC, SNC Enfermedad de von Hippel-Lindau (VHL) FCC con potencial maligno <5%, 40% bilateral * Las mutaciones bialélicas de FH causan la deficiencia de fumarato hidratasa. ** Incluye tumores adrenales y FCC GIST: tumor del estroma gastrointestinal FCC: feocromocitomas PGL: paragangliomas SNC: sistema nervioso central Tumores GEP: Tumores gastro-enteropancreáticos. Incluyen gastrinomas, insulinomas, tumores secretores de péptidos intestinales vasoactivos (VIPomas), y glucagonomas

15 CancerNext/CancerNext-Ampliada CancerNext y CancerNext-Ampliada son paneles multigenéticos que incluyen análisis integrales de 32 y 49 genes de susceptibilidad al cáncer, respectivamente. genes cancernext-ampliados y tipos de cáncer relacionados COLORRECTAL OVARIO BMPR1A, CDH1 GREM1, SMAD4 ÚTERO SMARCA4 BARD1, BRIP1, NBN, RAD50 CHEK2 RAD5IC, RAD51D, MRE11A MLH1*, MSH2*, MSH6*, PMS2*, EPCAM MAMA NF1 BRCA1, BRCA2 STK11 CDH1, CHEK2, MUTYH, MAMA ATM, PALB2 CDKN2A, CDK4 APC MLH1*, MSH2*, MSH6*, PMS2*, EPCAM PÁNCREAS CHEK2, MUTYH, POLD1, POLE RIÑÓN COLORRECTAL La figura muestra solamente riesgos de cáncer primario y no incluye otros cánceres importantes relacionados específicos del gen. *Fuentes recientes sugieren una mayor incidencia de cáncer de mama entre los portadores de mutación del gen reparador de desajustes (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2). Candidatos para CancerNext/CancerNext-Ampliada CancerNext o CancerNext-Ampliada pueden aportar información si el paciente tiene antecedentes personales o familiares de cualquiera de las siguientes situaciones: 1. Tumores primarios múltiples en una persona que son sospechosos para más de un síndrome de cáncer hereditario 2. Varios familiares cercanos con cáncer de aparición temprana son sospechosos para más de un síndrome de cáncer hereditario* 3. 3 o más familiares cercanos con cánceres que son sospechosos para más de un síndrome de cáncer hereditario* 4. Pruebas genéticas previas de cáncer poco informativas (negativa o variante de importancia desconocida) * En la misma rama familiar cáncer

16 CancerNext/CancerNext-Ampliada: genes y tipos de cáncer relacionados CancerNext incluye 32 genes de susceptibilidad al cáncer (enumerados en azul). CancerNext-Ampliada incluye 49 genes de susceptibilidad al cáncer (enumerados en azul y negro). GEN(ES) APC ATM* BARD1 BRCA1, BRCA2* BRIP1* BMPR1A, SMAD4 CDH1 CDK4 CDKN2A CHEK2 GREM1 MLH1*, MSH2*, MSH6*, PMS2*, EPCAM MRE11A* MUTYH* NBN* NF1 PALB2* CÁNCER(ES)/TUMOR(ES) RELACIONADOS Colorrectal, intestino delgado, estómago, hígado, tiroides, páncreas, SNC Mama, páncreas Mama, ovario, mama masculino, próstata, páncreas Mama, ovario Colorrectal, estómago, páncreas Mama, gástrico, colorrectal Melanoma Melanoma, páncreas Mama, colorrectal Colorrectal Colorrectal, útero, estómago, ovario, intestino delgado, hepatobiliar, tracto urinario, cerebral, páncreas, sebáceo Mama, colorrectal PGL/FCC, neurofibromas, GIST, mama, SNC, glioma óptico Mama, páncreas * Las mutaciones bialélicas de estos genes están relacionadas con enfermedades genéticas autosómicas recesivas que no están incluidas en esta tabla. cáncer GIST: tumor del estroma gastrointestinal FCC: feocromocitomas PGL: paragangliomas SNC: sistema nervioso central

17 Continuación: CancerNext/CancerNext-Ampliada: genes y tipos de cáncer relacionados GEN(ES) POLD1, POLE RAD50* RAD51C* RAD51D SMARCA4 STK11 BAP1 FH* FLCN MAX MEN1 MET MITF RET SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD TSC1, TSC2 TMEM127 VHL CÁNCER(ES)/TUMOR(ES) RELACIONADOS Colorrectal Mama, útero, riñón, tiroides, colorrectal Mama, ovario Mama, ovario Ovario (carcinoma ovárico de células pequeñas, de tipo hipercalcémico) Intestino delgado, colorrectal, páncreas, mama, ovario Mama, sarcoma, cerebral, adrenocortical, leucemia, gastrointestinal, genitourinario Riñón, melanoma, mesotelioma Riñón, PGL/FCC, leiomiomas Riñón FCC Paratiroides, tumores GEP, pituitaria, carcinoide, adrenal** Riñón Riñón, melanoma Tiroides (medular), FCC PGL/FCC, riñón, GIST Riñón, SNC, rabdomiomas cardíacos PGL/FCC Riñón, SNC, FCC * Las mutaciones bialélicas de estos genes están relacionadas con enfermedades genéticas autosómicas recesivas que no están incluidas en este folleto. **Incluye tumores adrenales y FCC GIST: tumor del estroma gastrointestinal FCC: feocromocitomas PGL: paragangliomas SNC: sistema nervioso central Tumores GEP: Tumores gastro-enteropancreáticos. Incluyen gastrinomas, insulinomas, tumores secretores de péptidos intestinales vasoactivos (VIPomas) y glucagonomas

18 Explicación de los resultados de la prueba genética Un paciente que se somete a una prueba genética recibirá uno de los tres posibles resultados: positivo, negativo o no concluyente (es decir, variante de importancia desconocida). RESULTADOS Positivo Negativo No concluyente EXPLICACIÓN Se halló una mutación en uno de los genes sometidos a la prueba. Existe un riesgo mayor de padecer ciertos tipos de cáncer específicos para la mutación del gen. Recomendaciones sobre exámenes para detección de cáncer y medidas preventivas específicas para el gen Se indicarán pruebas para los familiares en riesgo para la mutación específica. No se detectaron cambios genéticos clínicamente significativos en ninguno de los genes sometidos a la prueba. Los riesgos de desarrollar cáncer se basan en los antecedentes familiares y personales. Recomendaciones sobre exámenes para detección de cáncer y medidas preventivas basadas en antecedentes familiares Pueden o no indicarse pruebas genéticas para los familiares. Se detectó un cambio genético, pero no está claro si dicho cambio es benigno o causante de enfermedad. Los riesgos de desarrollar cáncer se basan en los antecedentes familiares y personales. Recomendaciones sobre exámenes para detección de cáncer y medidas preventivas basadas en antecedentes familiares Se pueden indicar estudios de familiares. Beneficios de las pruebas Saber que su paciente tiene un mayor riesgo de cáncer puede contribuir al manejo médico. Por ejemplo: 1. Opciones de prevención y vigilancia dirigidas específicas a la mutación del gen y al síndrome identificados Aumento de los exámenes de mamas para los portadores de mutación en genes de susceptibilidad al cáncer de mama: Exámenes clínicos mamarios más frecuentes Exámenes por imágenes de las mamas con mamografías y resonancias magnéticas de las mamas Iniciar los exámenes de detección a una edad más temprana Exámenes colorrectales de alto riesgo para los portadores de mutación en MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM, APC, MUTYH, STK11, BMPR1A y SMAD4: Colonoscopías más frecuentes Iniciar los exámenes de detección a una edad más temprana 2. Analizar las opciones de procedimiento de reducción del riesgo 3. Identificar los miembros de la familia que se encuentran en riesgo con pruebas genéticas dirigidas para desarrollar un programa individualizado de detección y prevención del cáncer 4. Asistir a las parejas en la toma de decisiones reproductivas

19 Índices de variantes de importancia desconocida y Programa de estudio de familiares Las variantes de importancia desconocida son más comunes en los paneles multigenéticos porque analizan numerosos genes de manera simultánea. A medida que se acumula información, se pondrán a disposición los índices actualizados de las variantes de importancia desconocida de inmediato. La posibilidad de obtener resultados no concluyentes justifica un diálogo exhaustivo en las sesiones de orientación antes y después de la prueba, especialmente en el caso de los paneles multigenéticos. En el informe de la prueba se incluye una interpretación detallada de cualquier variante de importancia desconocida. Ambry está trabajando en el análisis detallado y la reclasificación oportuna de las variantes de importancia desconocida. Si se identifica una variante de importancia desconocida, se ofrecerán pruebas complementarias de familiares que proporcionen información a través de nuestro Programa de estudio de familiares. El seguimiento familiar (estudios de segregación) puede ayudar a clarificar la naturaleza de la variante de importancia desconocida. Se notificará de inmediato a su médico clínico cuando se haya acumulado suficiente cantidad de pruebas para reclasificar la variante de importancia desconocida como causante de enfermedad o benigna. Hemos invertido mucho en colaboraciones tanto de investigación como clínicas para garantizar la calidad y precisión de nuestros análisis e interpretaciones de las variantes. Para obtener más información, visite: ambrygen.com/variantclassification Requisitos de la muestra Sangre: Recoger entre 6 cc y 10 cc de sangre en un tubo de tapa púrpura con EDTA (preferentemente) o de tapa amarilla con ácido cítrico. Almacenamiento: Entre 2 y 8 C y no congelar. Envío: Temperatura ambiente para envío de dos días. Para pacientes transfundidos: Esperar al menos dos semanas luego de una transfusión de concentrados o plaquetas y al menos cuatro semanas luego de una transfusión de sangre completa antes de extraer sangre. Mancha de sangre: No se aceptan manchas de sangre. Saliva: Llenar 2 tubos (1 tubo para BRCAplus y GYNplus) con saliva hasta la línea negra (1 cc de saliva) en un contenedor de recolección personal Oragene. Después de que se cierra el tubo, 1 cc de solución buffer se mezclará con la saliva en un volumen total de 2 cc. Almacenar a temperatura ambiente en una bolsa estéril. Envío: Temperatura ambiente para envío de dos días. ADN: 20 μg de ADN en TE (10mM Tris-Cl ph 8.0, 1mM EDTA); preferentemente 200 μl a ~100 ng/μl. Suministrar ADN con una relación de DO 260/280 (preferentemente entre 1.7 y 1.9) y enviar el gel de agarosa con el ADN genómico de alto peso molecular si está disponible. Almacenar a -20 C. Enviar congelado en hielo seco (preferentemente) o hielo.

20 Experiencia de Ambry soporte Los orientadores genéticos certificados, directores de laboratorios y directores médicos podrán ayudarlo a seleccionar las pruebas, revisar los casos e interpretar los resultados. seguro Tenemos contratos con la mayoría de los seguros comerciales y Medicare. Todos los pacientes que se encuentran fuera de la red son tratados como aquellos que se encuentran dentro para minimizar los costos no cubiertos. La cobertura de Medicaid varía según el estado y se recomienda hacer una verificación previa. plan de protección del paciente La política de facturación de Ambry es verificar previamente su cobertura del seguro (con o sin muestra del paciente) para las pruebas genéticas. Contactaremos al paciente después de haber recibido su muestra, si se estima que su costo en efectivo es mayor de $100. Estamos comprometidos a trabajar con usted y sus pacientes para hacer que el proceso de pruebas genéticas sea lo más simple y económico posible, y nuestro Departamento de Facturación responderá cualquier pregunta que su paciente pudiera tener. Puede comunicarse telefónicamente con nuestro Departamento de Facturación al o escribir a billing@ambrygen.com. acerca de ambry genetics Desde 2001, Ambry ha realizado cientos de miles de pruebas genéticas e identificado más de mutaciones en más de 500 genes diferentes. Ofrecemos un menú completo de soluciones diagnósticas y somos el proveedor líder de pruebas de cáncer hereditario en el mundo. Nuestro menú integral de más de 40 genes individuales del cáncer es el más grande que se encuentra disponible en los EE. UU. Para solicitar los kits de entrega de muestras gratuitos, comuníquese con: Ambry Genetics 15 Argonaut Aliso Viejo, CA EE. UU info@ambrygen.com Para obtener más información sobre estas pruebas, visite ambrygen.com Otros recursos clínicos y las referencias utilizadas para desarrollar el contenido clínico se encuentran disponibles en ambrygen.com 15 Argonaut, Aliso Viejo, CA USA Línea gratuita Fax _v5 SHCPCBRO