' Abril<'2013' Taller práctico sobre uso, manejo y gestión de recursos genómicos. 22'<24'de. Presentación! Programa! Inscripción! Alojamiento! Acceso!

Transcripción

1 Taller práctico sobre uso, manejo y gestión de recursos genómicos 22'<24'de ' Abril<'2013' Centro'de'Supercomputación'y'Bioinformá5ca' Parque'tecnológico'de'Málaga' Presentación Programa Inscripción Alojamiento Acceso

2 Presentación' El uso e implementación de las nuevas tecnologías de secuenciación masiva (NGS) se ha generalizadoenlacomunidadcien@fica,permicendoelestudioycaracterizaciónagranescalade genomas,transcriptomasysusvariantestantoenprocariotasyeucariotas.estoestápermicendo grandes avances en los sistema de producción animal y vegetal sobre todo en la aplicación de estastecnologíasalaopcmizaciónymanejodelaproducciónylosplanesdeselecciónymejora. Unade las dificultades quese encuentranlos técnicose invescgadores que manejan datosde NGS radica en el gran volumen de información generado así como en la actualización de los procedimientos y herramientas necesarias para sacar el máximo rendimiento a los datos obtenidos. El objecvo de este taller es acercar de forma muy práccca las principales estrategias y herramientas deanálisis bioinformácco para elanálisis de NGS. Para ello, se uclizarán datos generadosenelproyectoaquagenetyseuclizaránlosequiposdesupercomputacióndelscbi. El taller será muy aplicadoydebe ser muy úcl para aprovechar toda la información que nos proporcionanlasngs. Manuel'Manchado' IFAPA,JuntadeAndalucia CoordinadorAQUAGENET

3 Primera'SESIÓN:'Día''22'de'Abril' 10:30X11:00 11:00X11:15 11:15X12:15 12:00X13:00 13:00X14:30 14:30X16:15 16:15X16:30 16:30X18:00 WelcomeDesk/RegistraCon Openingsession(M.#Gonzalo#Claros#&#Manuel#Manchado) HowtousethePABresources(Darío#Guerrero) BrowsingSoleaDB(Hicham#Benzekri)# Lunch RaConaleofreapreXprocessing(M.#Gonzalo#Claros) PracCsingSeqTrimNextfortranscriptomics(M.#Gonzalo#Claros) Coffeebreak SeqTrimNexPracCsingSeqTrimNextfortranscriptomicsII(M.#Gonzalo#Claros) DiscussionaboutSeqTrimNextresults(M.#Gonzalo#Claros)

4 Segunda'SESIÓN:'Día''23'de'Abril' 9:00-11:00 11:00X11:30 11:30X13:00 13:00X14:30 14:30X16:15 16:15X16:30 AssemblinglongXreadtranscriptomics(Rocío#Bau<sta) HowtouseMIRA3,EULERXSR,CAP3(Rocío#Bau<sta) Coffeebreak HowtouseBowCe,FullLengtherNext(Rocío#Bau<sta) UsesofFulLengtherNextinassemblies(M.#Gonzalo#Claros) Lunch AssemblingshortXreadtranscriptomics(Hicham#Benzekri)# Howuseoases,CDXHit,artefactscript(Hicham#Benzekri) Coffeebreak 16:30X18:00 AnnotaConintranscriptomics:Sma3svsBlast2GO(Pedro#Seoane) AnnotaConingenomics:Maker&MakerforConifers(Pedro#Seoane)' Tercera'SESIÓN:'Día''24'de'Abril' 9:00X11:00 AnalysingRNAXSeq(RocíoBau5sta) HowtouseSAMfiles,Robina(RocíoBau5sta) 11:00X11:30 Coffeebreak DifferenCalgeneexpressionusingRNAXSeq(RocíoBau5sta) 11:30X13:00 FuncConalinterpretaConofRNAXSeqresults(RocíoBau5sta) 13:00 Closingsession(M.#Gonzalo#Claros)#'

5 La'inscripción'se'realizará'en'la'siguiente'web:' hkp:// Para'cualquier'duda'se'puede'contactar'en'el'siguiente'teléfono:' +34X(671) Se'recomienda'que'cada'par5cipante'traiga'su'propio'ordenador'portá5l' La'inscripción'será'por'estricto'orden'de'llegada'de'los'e<mails'hasta'completar'un'máximo'de'20'personas.'' Se'enviará'un' 'de'confirmación'de'la'reserva''

6 1.'Hotel'Posadas'de'España***' C/GrahamBell,s/nParqueTecnologicoDeAndalucia,29590Campanillas(Málaga) hkp:// MalagaX4C15P155D562Z13340EF.htm' 2.'Hotel'Málaga'Centro****' C/Mármoles,6,29007oMálaga Tlf: hkp:// 3.'Hotel'Tryp'Alameda****' CentroComercialLarios.Avda.delaAurora,25,29002,Málaga Tel: hkp://es.melia.com/hoteles/espana/malaga/trypxmalagaxalamedaxhotel/home.htm 3.'Hotel'Don'Curro***' C/SanchadeLara,7o29015Málaga Tel: hkp://

7 ParaconseguirinformaciónprácCcasobreelParqueTecnológicodeMálagaylasestancias,porfavor, visitalossiguientesenlaces: Centro'de'Supercomputación'y'Bioinformá5ca' VerEdificiodeBioinnovaciónenGoogleMaps Aeropuerto'de'Málaga' Pincharaquí Estación'de'tren'María'Zambrano' Pincharaquí