Abordaje integral al servicio de los pacientes. La respuesta en tus manos
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- Beatriz Casado Sevilla
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1 IntegraNEUROpediatría Abordaje integral al servicio de los pacientes La respuesta en tus manos
2 IntegraNEUROpediatría Dirigido al diagnóstico genético de los trastornos del neurodesarrollo y la epilepsia, a través de la utilización secuencial de los arrays CGH y la secuenciación masiva. Coste-efectividad NIMIntegra NEUROpediatría es un abordaje integral, preciso, rápido y fiable. Permite obtener un diagnóstico genético, especialmente en aquellos casos con resultados negativos previos. Rendimiento diagnóstico
3 IntegraNEUROpediatría Conocer y entender la causa de las enfermedades de origen genético es la clave Para dirigir el tratamiento y manejo del paciente Para el paciente y su familia Establecer un pronóstico. Anticipación a enfermedades asociadas. Evitar pruebas diagnósticas innecesarias. Adaptación a la enfermedad. Facilitar el Consejo Genético. Acceso a ayudas de fundaciones y servicios sociales. Las enfermedades genéticas de alta complejidad diagnóstica requieren una solución integral: NIMIntegra NEUROpediatría NIMGenetics dispone de un equipo multidisciplinar con experiencia acreditada en la interpretación clínica de las herramientas genómicas, proporcionando: Informe clínico de fácil interpretación Asesoramiento genético al especialista
4 IntegraNEUROpediatría Diagnóstico genético de la epilepsia y los trastornos del neurodesarrollo: un enorme reto. Se trata de un paciente con signos y síntomas característicos de un síndrome específico? No Trastornos del Neurodesarrollo (TND) Trastornos del Espectro Autista (TEA) Discapacidad Intelectual (DI) Retrasos del Desarrollo Sí Síndrome de X Frágil (*1) No patológico Estudio dirigido a síndrome específico Cariotipo Sanger MLPA No patológico No patológico Dirigido (*2) Clínico Trío
5 Se trata de un paciente epilepsia asociada a TND, alteraciones congénitas o espasmos infantiles? No Epilepsia Sí NIMGenetics ofrece diversas aproximaciones para poder dirigir el diagnóstico genético en función del fenotipo del paciente. (*1) No patológico Presenta el paciente una clínica compatible con encefalopatía epiléptica de inicio precoz, epilepsia nocturna del lóbulo frontal, malformaciones del SNC, epilepsia mioclónica juvenil, epilepsia mioclónica progresiva,...? Sí No Dirigido (*2) PLUS EpilepsiA (*1): Consultar diferentes aproximaciones de KaryoNIM / (*2): Consultar diferentes aproximaciones de ExoNIM Dirigido.
6 Array CGH para el diagnóstico genético Para qué? Diseños Propios y su familia Herramienta genética para la identificación de deleciones y amplificaciones a lo largo del genoma. Para quién? Asesoramiento especializado El array CGH es la tecnología de elección para la mayoría de los pacientes con 1-3 : Discapacidad intelectual Autismo Trastornos del desarrollo Síndromes polimalformativos Nuestra experiencia y nuestros diseños, al servicio del paciente neuropediátrico Por qué? Bajos tiempos de respuesta Elimina la subjetividad en la interpretación. Hace visible lo invisible a las técnicas convencionales. Optimiza los tiempos de respuesta.
7 Ponemos el foco donde interesa NIMGenetics adapta los diseños y la resolución de los arrays CGH a las necesidades de cada paciente. 60k 180k 180k Autismo Indicaciones Fundamento Síndromes polimarfomativos con o sin DI 308 regiones OMIM y otras regiones genéticas Resolución Síndromes polimarfomativos con o sin DI y otros TNDs Incremento de la resolución las regiones seleccionadas en KaryoNIM Postnatal 60K + genes TEA TEA y TNDs KaryoNIM Postnatal 180K genes asociados a TEA Resolución media mínima Regiones sindrómicas 100 kb 75 kb 75 kb Genes críticos 50 kb 40 kb Dismorfología: 40 kb TEA: 15kb Resto del genoma 350 kb 100 kb 100 kb NIMGenetics dispone KaryoNIM Postnatal 400K para cuando sean necesarios estudios de alta resolución, con una capacidad de detección media mínima de 25 Kb en todo el genoma.
8 140 genes asociados a TEA incluidos en KaryoNIM Postnatal 180k autismo Cromosoma Gen Nº OMIM 1 CAMTA RERE RIMS ZSWIM5-1 AGBL NFIA RBM8A CAMSAP1L DISC CHRM PXDN SNTG MYT1L SPAST NRXN CNTNAP NCKAP EPC MBD GPD SCN7A SATB MAP DOCK TM4SF Cromosoma Gen Nº OMIM 3 CNTN CNTN TBC1D ATXN FOXP NLGN TNIP ARHGAP DAPP SEMA5A CTNND NIPBL MEF2C MCC NSD DUSP KHDRBS NXPH ICA AUTS LEP FOXP CADPS GRM POT Cromosoma Gen Nº OMIM 7 DPP MCPH MSR CHRNB CHD VPS13B EXT ZNF517-9 KANK SLC24A ANXA ASTN EHMT STXBP TSC UPF BTAF DYDC DYDC2-10 PTEN FGFBP3-10 ATRNL ELP DAGLA NRXN
9 140 genes asociados a TEA incluidos en KaryoNIM Postnatal 180k autismo Cromosoma Gen Nº OMIM 11 GRM CNTN SNX19-12 CDKN1B SOX SLC16A PTPN PCDH PCDH GPC CHD PRKD GPHN NRXN CYFIP TUBGCP SNRPN TRPM ARHGAP11B CHRNA UBL BBS CIB CHD CREBBP Cromosoma Gen Nº OMIM 16 RBFOX RNPS KCTD CDH HYDIN GAN YWHAE SMG MYH NF SLC38A BAIAP TCF SAE LIN7B SYT ZNF PLCB PTPRT CECR GNB1L TBX LZTR UPB SHANK Cromosoma Gen Nº OMIM X ASMT X SYAP1 - X CDKL X DDX53 - X SYN X FGD X PHF X MAOB X ARHGEF X PCDH X DCX X SLC6A X AFF X MECP X TMLHE Para conocer el listado de sídromes y/o genes incluidos en toda la gama de KryoNIM Postnatal, consulte nuestra página web.
10 Secuenciación masiva del exoma para el diagnóstico genético Alta Rentabilidad Diagnóstica 4-6 Base de Datos propia basada en >1000 exomas Análisis orientado clínicamente, a partir de bases de datos profesionales y la literatura reciente. Para quién? Para el diagnóstico de enfermedades mendelianas genéticamente heterogéneas. Para qué? Identifica la mutación o mutaciones que explican la enfermedad de un individuo o, en ocasiones, de toda una familia. La secuenciación del exoma es actualmente la tecnología de elección para el estudio de enfermedades caracterizadas por un fenotipo inespecífico o de alta heterogeneidad genética 4-6. Por qué? Facilita el diagnóstico diferencial de síndromes relacionados. Identifica mutaciones en pacientes con presentaciones parciales o atípicas. Acelera el estudio de enfermedades genéticamente heterogéneas.
11 Cuatro aproximaciones al diagnóstico de trastorno del neurodesarrollo y/o epilepsia. Optimizamos la rentabilidad diagnóstica A partir de los resultados de la secuenciación simultánea de los genes del paciente Dirigido Clínico Plus Epilepsia Trío Indicación Fenotipos asociados a múltiples genes* (*) consultar listado en nuestra web Diagnóstico diferencial de síndromes polimalformativos, TND y fenotipos inespecíficos Epilepsia sindrómica, no sindrómica, neurometabólica o mitocondrial TEA y enfermedades raras Análisis Genes asociados al síndrome a estudio (panel virtual) genes OMIM genes asociados a epilepsia genes Identificación de mutaciones en función del fenotipo del paciente y la información genética de los progenitores. Consideraciones especiales Gran flexibilidad para la combinación de múltiples paneles virtuales. Diseño de paneles ad hoc. Segunda opción de análisis tras ExoNIM Dirigido. Se puede combinar con ExoNIM Dirigido en casos de patologías concurrentes o fenotipos solapantes. Elevada rentabilidad diagnóstica NIMGenetics ha Identificado los genes causales en más del 40% de los casos. Ampliaciones a otros ExoNIM Clínico Plus Epilepsia Trío Trío Trío Los datos de secuenciación de los genes almacenados, permiten un re-análisis de la secuencia ante la aparición de nuevos síntomas, redefinición del fenotipo o la descripción de nuevos genes implicados en la patología de estudio.
12 Paneles virtuales* de ExoNIM Dirigido al diagnóstico genético de los TND y a la epilepsia: ExoNIM Dirigido* Nº de Genes incluidos Encefalopatía Epiléptica infatil de inicio precoz y/o espasmos infantiles 39 Epilepsia Nocturna del Lóbulo Frontal 4 Epilepsia asociada a malformaciones Cerebrales 18 Epilepsia mioclónica juvenil 5 Epilepsia mioclónica progresiva 28 Déficit Intelectual 59 Déficit Intelectual Ligado al cromosoma X 119 TEA (Incluye los genes MECP2, CDKL5, MEF2C y FOXG1 asociados al Sdr. De Rett) 89 Síndrome de Angelman y síndromes incluidos en el diagnóstico diferencial 24 Síndrome de Coffin-Siris 5 Síndrome de Cornelia de Lange 5 Esclerosis Tuberosa 2 Rasopatías 20 Síndrome de Kabuki 6 Síndrome de Donnai-Barrow 1 Microcefalia primaria hereditaria y Síndrome de Meier-Gorlin 18 Síndrome de Sotos y síndromes relacionados 4 Rubinstein-Taybi 2 Sindrome de Robinow 8 Síndrome de Sotos y síndromes relacionados 4 Síndrome de Bardet-Biedl 21 Sobrecrecimiento y macrocefalia 41 Ataxias 87 * Para listado completo de paneles virtuales o información relativa a los genes incluidos y coberturas, contactar con NIMGenetics. Pruebas complementarias disponibles en NIMGenetics: Estudio de portadores Estudios de gen único: Sanger, MLPA, expansión de tripletes. Otros estudios de NGS. Para listado completo de estudios disponibles, contactar con NIMGenetics.
13 Muestra y condiciones de envío Sangre periférica: dos tubos con EDTA. Para otras muestras, consulte con la Dirección Técnica. NIMGenetics recoge la muestra en el lugar de la extracción. Solicite información sobre nuestros centros concertados.
14 Bibliografía: 1. ACMG PRACTICE GUIDELINES. Genet Med 2013; 15: Consenso para la Implementación de los Arrays [CGH y SNP-arrays] en la Genética Clínica es/publicaciones/158/juan_c_cigudosa_pablo_lapunzina_coords_consenso_para_la_implementacion_de_los_arrays_ CGH_y_SNP_arrays_en_la_Genetica_Clinica. 3. Am J Hum Genet 2010, May 14; 86 (5): JAMA November 12; 312(18): doi: /jama Lee H et al 5. Eur J Paediatr Neurol Mar;19(2): van Nimwegen KJ et al 6. Genet Med Feb 4. Monroe GR et al 7. Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)
15 Por qué NIMGenetics La calidad de KaryoNIM y ExoNIM está certificada a través de Agilent y Thermo (Certified Service Providers). Más de pruebas realizadas de arrays CGH y secuenciación masiva. Informes de KaryoNIM y ExoNIM calificados como excelentes por líderes de opinión en Neuropediatría y Genética Clínica. Compañía liderada por un equipo multidisciplinar altamente cualificado, que sirve de apoyo al especialista, ofreciéndole asesoramiento pre y post-test. Miembros acreditados por la Asociación Española de la Genética Humana (AEGH) y participación activa en la Sociedad Española de Genética Clínica y Dismorfología (SEGCyD), la European Quality Assessment (CEQA) y la European Molecular Quality Network (EMQN). Soluciones integrales. NIMGenetics dispone de una amplia cartera de pruebas de genética molecular para cubrir las necesidades de cada paciente. Nuestra disponibilidad de pruebas crece con nosotros.
16 NIMGenetics es un centro de Diagnóstico Genético autorizado por la Consejería de Sanidad y Consumo de la Comunidad de Madrid, inscrito en el Registro correspondiente con el Nº CS CAT-01; Rev 01; 28/04/2016 MADRID Parque Científico de Madrid Faraday, 7 (Campus de Cantoblanco) Madrid Tel M
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