Rol de las Bacterias Acéticas en la Pudrición Ácida de vides

Transcripción

1 Rol de las Bacterias Acéticas en la Pudrición Ácida de vides G. Figueroa M. Troncoso A. Figueroa P. Rivas A. Reyes

2 Contenidos de la Presentación Proyecto 1: FONTEC (FDA-INTA) Rol de las Bacterias Acéticas en la PA Proyecto 2: DI MULT 04/05-2 (INTA-Agronomía-Farmacia, UCh) Identificación n de Acetobacter aceti y de potenciales Biocontroles

3 Consenso: Instituto de Nutrición y Tecnología de los Alimentos Agentes causales de la Pudrición Ácida 1. El o los agentes son oportunistas (hongos, levaduras y algunas bacterias) 2. Cualquiera que sea el agente, no responde bien a los fungicidas tradicionales 3. La presentación de la PA ocurre entre la pinta y la cosecha 4. Un factor gatillante de la PA es la alta humedad ambiental

4 Agentes asociados a la Pudrición Ácida Hongos: Penicillium, Ulocladium, Cladosporium y Rhizopus, Aspergillus, Penicillium, Aerobasidium, Mucor, Rhizopus y Alternaria. Levaduras: Saccharomyces, Candida, Pichia, Issaschtenia y Zygosaccharomyces Bacterias: Acetobacter, Gluconobacter, Gluconoacetobacter

5 Agentes causales de la Pudrición Ácida No existe Consenso: 1. Respecto a cual(es) es o son los agentes que gatillan la patología. 2. Tampoco se conoce cual es la secuencia de aparición de cada uno de los potenciales agentes causales (hongos, levaduras y algunas bacterias) 3. Respecto a los mecanismos patogénicos involucrados 4. Respecto a medidas eficaces, preventivas o de control

6 Proyecto 1. FONTEC Rol de las Bacterias Acéticas en la PA Objetivo Aislar y caracterizar bacterias acéticas, en uvas enfermas de los cv Thompson seedless y Red globe provenientes de distintas regiones de Chile.

7 DISEÑO: Muestreos realizados Uvas con síntomas de PA : 172 Uvas sanas : 148 Muestras Ambientales* : 48 Total Muestras analizadas : 368 * Hojas, sarmientos y suelo.

8 DISEÑO: Muestreo por etapa fenológica Pinta : 59 Precosecha : 62 Cosecha : 71 Remanente de cosecha : 80 Poscosecha (*) : 74 Ambientales : 23 (*) Solo se analizó uvas sanas

9 DISEÑO: Distribución de Muestreos por Regiones REGIÓN TOTAL PA SANAS AMBIENTALES IV V M VI TOTAL

10 Material y MétodosM 1. Recuperación de bacterias acéticas Agar GyC Agar WL 37 C X 24 hrs 2. Recuento de Hongos filamentosos y levaduriformes Agar Papa Dextrosa 30 C X 48 hrs 3. Identificación de bacterias acéticas 4. Inoculación experimental a) Preparación de inóculos b) Proceso de inoculación c) Recuentos

11 RESULTADOS

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13 Prevalencia de bacterias acéticas en vides PA

14 Frecuencia de bacterias acéticas en vides con PA G. oxydans; 1% A. pasteurianus; 7% Asoc. A.aceti+G.hansenii; 6% G. hansenii; 15% A. aceti; 71%

15 Prevalencia de bacterias acéticas en vides con PA por Región 80% 70% 76% 64% 69% 60% 50% 51% 47% Tasa 40% 30% 24% 36% 31% 20% 10% 0% IV V RM VI Regiones Positivas Negativas

16 Especies de bacterias acéticas en uvas con PA por Región Tasa 100% 90% 80% 70% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0% 88% 73% 73% 68% 15% 18% 13% 13% 9% 10% 3% 4% 0% 0% 0% 0% 3% 4% 7% 0% IV V RM VI Tipo de muestra A. aceti G. hansenii G. oxydans A. pasteurianus Asoc. A.aceti+G.hansenii

17 Prevalencia de bacterias acéticas en uva con PA según n etapa productiva Tasa 90% 80% 70% 60% 50% 40% 30% 20% 10% 0% 17% 14% 8% 59% 74% 9% 0% 0% 3% 0% 79% Pinta Precosecha Cosecha Remanentes Etapa productiva Ambientales Enfermas Sanas 0%

18 Desarrollo de bacterias acéticas en agar WL

19 PCR: Identificación n de género g bacterias acéticas bp 600 bp Línea bp DNA ladder

20 Identificación n de especies de bacterias acéticas: Restriction Fragment Length Polymorphisms (RFLP) Línea bp DNA ladder Línea 2. Acetobacter aceti (870 bp) Línea 3. Acetobacter pasteurianus ( bp) Línea 4. Acetobacter aceti Línea 5. Acetobacter aceti Línea 6. Gluconoacetobacter hansenii ( bp) Línea 7. Acetobacter aceti Línea 8. Acetobacter pasteurianus Gel de Agarosa al 2% Enzima: TaqI Enviado a Publicación: Appl. Environ Microbiology, 2005

21 Proteínas de superficie de A. aceti Método de extracción ácida con glicina Línea 1. AC 38-1 Acetobacter aceti (Th V) Línea 2. AC 22-7 Acetobacter aceti (Rg M) Línea 3. AC Acetobacter aceti (Rg VI) Línea 4. AC 7-4 Acetobacter aceti (Rg IV) 31 PM: Marcador de peso molecular Electroforésis en Gel de Acrilamida al 12%

22 Recuento de bacterias acéticas, hongos y levaduras según n tipo de muestra (log UFC/g) PA

23 PA: Recuento de bacterias acéticas, hongos y levaduras según n etapa productiva (log UFC/g) * Uva sana *

24 Inoculación experimental A. aceti + 3 días después: Cryptococcus humicola Tº: 30ºC HR: 80% Día 5: baya decolorada, pérdida de turgencia. Día 8: pérdida de gran cantidad de exudado con fuerte olor a vinagre

25 Proyecto 2: DI MULT 04/05-2 Identificación n de Acetobacter aceti y de potenciales Biocontroles G. Figueroa, Lab. Microbiología, INTA, U. de Chile J.L. Henríquez, Dpto. Sanidad Vegetal, Fac. de Ciencias Agronómicas, U. de Chile L. López, Fac. de Ciencias Químicas y Farmacéuticas, U. de Chile

26 OBJETIVOS: 1. Caracterizar cepas de A. aceti aisladas de uva de mesa afectada por pudrición ácida. 2. Evaluar la capacidad antagónica de la bioflora natural de vides sobre bacterias acéticas. 3. Evaluar resistencia a antifúngicos en cepas de la bioflora de vides. 4. Evaluar susceptibilidad a antibacterianos en cepas la bioflora de vides.

27 METODOLOGÍAS 1. Caracterización de A. aceti mediante ERIC PCR (Versalovic et al, Nucleic Ac Res). Amplificación de secuencias íntergénicas repetitivas de consenso de enterobacterias: 17 cepas de A. aceti (Regiones V y Metropolitana). 2. Identificación de Biocontrol: Método de inhibición en placa - Pre-selección (BGA y E. coli) - Panel de cepas de A. aceti Agar Muller Hinton 30ºC Observación halos de inhibición (7 días) 3. Evaluación de actividad antifúngica y antibacteriana. Método de difusión en agar

28 Perfiles de ERIC-PCR de cepas de A. aceti aisladas de uvas con pudrición ácida Cepa Condición de la uva Variedad de uva Región Ladder IV RM Ladder V 1. Ac 7-4a 2. Ac 7-4b 3. Ac 22-7 Sana Sana Sana RG RG RG IV IV RM 4. Ac PA RG RM 5. Ac 80-8 PA RG RM 6. Ac PA TS RM 7. Ac PA TS RM 3000pb 8. Ac PA TS RM 1500pb 1200pb 9. Ac Ac PA PA TS TS RM RM 500pb 11. Ac Sana RG V 100pb 12. Ac PA RG V 13. Ac PA RG V 14. Ac PA TS V 15,Ac PA TS V 16. Ac PA TS V 17. Ac PA TS V

29 CONCLUSIONES Acetobacter aceti aparece como la principal especie de bacterias acéticas asociada a vides con pudrición ácida. En 5/17 cepas de A. aceti se detectó un mismo patrón de ERIC- PCR, todas ellas provenían de uvas con PA: - 2 cepas de la Región Metropolitana - 3 cepas de la V Región Perfil constituido por 3 bandas (700, 1200 y 1500 pb). Los perfiles restantes fueron diferentes entre si

30 RESULTADOS Preselección de Biocontrol: Actividad antibacteriana de cepas ambientales provenientes del ecosistema natural de vides Cepa blanco Nº positivas (%) halo Bacillus BGA (22) 10 mm E. coli ATCC (1) 15 mm Ambos (3) Total (26)

31 Actividad antagónica nica de 14 cepas ambientales frente a A. aceti. Biocontrol A. aceti 1 A. aceti 2 A. aceti 3 A. aceti 4 A. aceti Halos de inhibición > 4 mm *Todas las cepas inhibidoras pertenecían al Género Bacillus.

32 Evaluación n de actividad antagónica nica mediante ensayo de inhibición n en placa

33 Resistencia de cepas ambientales (N= 52) a Antibacterianos resist. 29% resist. 8% resist. 4% sens. 71% sens. 92% sens. 96% Ácido nalidíxico Ampicilina Cloramfenicol resist. 2% resist. 6% resist. 10% sens. 98% Gentamicina y Ciprofloxacino sens. 94% Cefalotina sens. 90% Estreptomicina, Tetraciclina y Eritromicina (Ampicilina (10 µg), Cloramfenicol (30 µg), Cefalotina (30 µg), Ácido nalidíxico (30 µg), Gentamicina (10 µg), Ciprofloxacino (5 µg), Tetraciclina (30 µg), Estreptomicina (10 µg) y Eritromicina (15 µg).

34 Resistencia de cepas ambientales a antibacterianos 4/52 (8%) de las cepas ensayadas presentaron resistencia simultánea a 3 o más antibióticos Una de ellas (bacilo Gram positivo) aislada de uva sana de la IV Región presentó resistencia a 8 antimicrobianos simultáneamente. 34/52 (65%) cepas presentaron resistencia entre 1 y 2 antibióticos Solo 14/52 (27%) fueron sensibles a los 9 antimicrobianos evaluados.

35 Inhibicion (% cepas) Efecto de fungicidas sobre bacterias de la bioflora natural de vides BC 1000 Benomilo Iprodione Kresoxym metil Ciprodinil + fludioxonil 10 ppm 100 ppm Fenhexamide + tebuconazole

36 Resistencia de cepas ambientales (n=48) a antifúngicos ngicos La mayoría de las cepas resultaron sensibles a los agroquímicos empleados. BC-1000 fue el fungicida que presentó una mayor actividad antibacteriana con un 50% de inhibición de las cepas ambientales, a 10 y 100 ppm i.a. Las mezclas de fungicidas C+F y F+T tuvieron actividad sobre un 22,9 y 16,7 % de las cepas, respectivamente. * Los fungicidas evaluados fueron BC 1000, benomilo, iprodione, kresoxym metil, ciprodinil + fludioxonil,(c+f) y fenhexamide + tebuconazole (F+T), en concentraciones de 0, 1, 10 y 100 ppm i.a.

37 Resistencia de cepas ambientales (n=48) a antifúngicos ngicos Iprodione inhibió el crecimiento de 4/48 cepas (8,3%), benomilo y kresoxym metil sólo una cepa. 36/48 (75%) cepas mostraron algún grado de inhibición a la mayor concentración del fungicida. 6/48 cepas (12,5%) evaluadas fueron resistentes a los fungicidas incluidos en el estudio.

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39 Material y MétodosM Inoculación experimental a) Preparación inóculos: Acetobacter 50 ml Caldo Schram Levaduras 50 ml Caldo BHI Incubación: 30 C X 24 hrs. Los inóculos se ajustan a DO = 0.260, equivalente a 8 X 10 8 UFC / ml b) Proceso de Inoculación: (condiciones) - Peso de racimos: gr. - Inóculo: 105 UFC / ml - Forma de inoculación: Inmersión